• 제목/요약/키워드: R Shiny

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R의 Shiny를 이용한 시각화 분석 활용 사례 (Visualization analysis using R Shiny)

  • 나종화;황은지
    • Journal of the Korean Data and Information Science Society
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    • 제28권6호
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    • pp.1279-1290
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    • 2017
  • R의 {shiny} 패키지는 R 스크립트만으로 웹 어플리케이션을 제작할 수 있는 환경을 제공한다. Shiny는 별도의 웹 프로그래밍 언어에 대한 지식을 요구하지 않으며 그 개발이 매우 쉽고 간명하다. 또한 Shiny는 다양한 확장성을 가지고 있으며, 그 기능이 날로 확대되고 있다. 따라서 완성도 높은 결과물의 제시가 절실한 R 기반의 분석전문가들에게는 더 없이 훌륭한 도구이다. 본 논문에서는 Shiny를 활용하여 대용량 데이터를 분석한 실제 사례를 소개한다. 먼저, 공간 자료와 관계된 분석으로 등고선 등의 형태로 표현되는 지형자료를 분석하여 지질 이상대를 추출한다. 다음으로, 기상, 환경, 소셜미디어 정보를 이용하여 전국의 16개 시, 도별 주요 질환을 예측하는 모형을 구축한다. 이 과정에서 Shiny가 데이터의 시각화와 분석에 매우 효과적임을 보이고자 한다.

효율적인 생태계 모니터링을 위한 오픈 소스 소프트웨어 기반 통합 프레임워크 (An Open-Source Software-Based Unified Framework for Efficient Ecosystem Monitoring)

  • 오민우;이효혜미;이은주
    • Ecology and Resilient Infrastructure
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    • 제11권4호
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    • pp.165-176
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    • 2024
  • 생태계 모니터링은 생물종과 환경 데이터를 종이 야장에 기록하고, 이후 데이터를 전산화하여 분석하는 전통적인 방식으로 수행되어 왔다. 그러나 이러한 방법은 공간 정보 수집의 어려움, 데이터 입력 과정에서의 오류, 분석 준비에 소요되는 시간 등으로 인해 비효율적이라는 한계가 존재한다. 본 연구는 이러한 문제를 해결하기 위해 자유 오픈 소스 소프트웨어(QGIS, QField, PostgreSQL/PostGIS, R Shiny)를 활용하여 생태계 모니터링 데이터를 효율적으로 수집, 저장, 분석할 수 있는 통합 프레임워크를 제안한다. 이 프레임워크는 모니터링 조사 계획에 따라 QGIS로 생성한 지리 정보 시스템 프로젝트 파일을 바탕으로 모바일 지리 정보 시스템 수집기 QField를 통해 현장에서 공간 정보와 생물종 정보를 수집하며, 실시간으로 관계형 데이터베이스인 PostgreSQL/PostGIS에 저장된다. 또한 R Shiny 패키지를 이용해 데이터를 실시간으로 분석 및 시각화하여 결과를 즉시 확인할 수 있다. 이를 통해 기존의 방식에 비해 모니터링 데이터의 정확성, 시간 절약, 비용 절감 효과를 얻을 수 있으며, 연구자가 신속하게 데이터를 활용할 수 있는 기틀을 마련한다.

IVAG: An Integrative Visualization Application for Various Types of Genomic Data Based on R-Shiny and the Docker Platform

  • Lee, Tae-Rim;Ahn, Jin Mo;Kim, Gyuhee;Kim, Sangsoo
    • Genomics & Informatics
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    • 제15권4호
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    • pp.178-182
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    • 2017
  • Next-generation sequencing (NGS) technology has become a trend in the genomics research area. There are many software programs and automated pipelines to analyze NGS data, which can ease the pain for traditional scientists who are not familiar with computer programming. However, downstream analyses, such as finding differentially expressed genes or visualizing linkage disequilibrium maps and genome-wide association study (GWAS) data, still remain a challenge. Here, we introduce a dockerized web application written in R using the Shiny platform to visualize pre-analyzed RNA sequencing and GWAS data. In addition, we have integrated a genome browser based on the JBrowse platform and an automated intermediate parsing process required for custom track construction, so that users can easily build and navigate their personal genome tracks with in-house datasets. This application will help scientists perform series of downstream analyses and obtain a more integrative understanding about various types of genomic data by interactively visualizing them with customizable options.

오픈소스 기반 데이터 스크래핑 탐지 시스템 설계 및 구현 (Design and Implementation of Data Scraping Detection System based on Open Source)

  • 이지율;이용주
    • 한국전자통신학회논문지
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    • 제19권6호
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    • pp.1309-1318
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    • 2024
  • 데이터는 4차산업 혁명과 디지털 전환의 핵심 요소이다. 그러나 불법적으로 웹스크래핑을 통해 수집한 데이터는 소유자와 수집자간의 분쟁을 일으키고 있다. 데이터 소유자의 권리를 보호하기 위해 오픈소스를 기반으로 웹스크래핑을 탐지하는 시스템을 디자인하고 구현하였다. 선형회귀를 스크래핑 탐지 모델에 사용하였으며, 입력값으로 스크래핑을 시도하는 전후 시간 간격을 사용하였다. 반복적인 패턴은 선형회귀에서 일직선의 형태를 띄며 입력값이 많을수록 기울기는 0에 수렴하게 된다. 또한 선형회귀는 랜덤한 조회시간 간격의 범위를 쉽게 파악할 수 있다. 분석시스템은 DBMS간 실시간 데이터 동기화 기술을 사용한다. 이는 웹서버와 분석서버를 분리하여 부하를 분산시킨다. 데이터 분석 및 시각화 구현을 위해 R과 Shiny 패키지를 사용하는데, 이는 복잡한 분석 기능을 쉽게 제공하고 반응형 웹 대시보드를 제공한다.

A FIXED POINT APPROACH TO THE STABILITY OF THE FUNCTIONAL EQUATION RELATED TO DISTANCE MEASURES

  • Shiny, Hwan-Yong;Kim, Gwang Hui
    • Korean Journal of Mathematics
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    • 제24권2호
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    • pp.297-305
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    • 2016
  • In this paper, by using fixed point theorem, we obtain the stability of the following functional equations $$f(pr,qs)+g(ps,qr)={\theta}(p,q,r,s)f(p,q)h(r,s)\\f(pr,qs)+g(ps,qr)={\theta}(p,q,r,s)g(p,q)h(r,s)$$, where G is a commutative semigroup, ${\theta}:G^4{\rightarrow}{\mathbb{R}}_k$ a function and f, g, h are functionals on $G^2$.

빅데이터 기반 환자 간병 방법 분석 연구 (A Study on Big Data Based Method of Patient Care Analysis)

  • 박지훈;황승연;윤범식;최수길;이돈희;김정준;문진용;박경원
    • 한국인터넷방송통신학회논문지
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    • 제20권3호
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    • pp.163-170
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    • 2020
  • 정보통신기술의 발전과 함께 데이터의 생산량이 기하급수적으로 증가하면서 빅데이터에 대한 관심이 높아지고 있다. 빅데이터 관련 기술들도 발전함에 따라 여러 분야에서 빅데이터가 수집, 저장, 처리, 분석, 활용되고 있다. 특히 보건의료 분야에서의 빅데이터 분석은 사회경제적으로도 큰 영향력을 발휘할 수 있기 때문에 큰 주목을 받고 있다. 빅데이터 기술을 환자 진단 데이터 분석에 활용하여 간단한 병원 진료에 투여되는 막대한 비용을 절감할 수 있을 것으로 전망된다. 따라서 본 논문에서는 환자 데이터를 분석하여 병원에 가기 어려운 환자나 의학적인 전문 지식이 없는 간병인들에게 의사의 진단과 가까운 간병 가이드 정보를 제시하고자 한다. 먼저 수집된 환자 데이터를 HDFS에 저장하고, 하둡 환경에서 빅데이터 처리 및 분석 도구인 R을 이용하여 데이터를 처리한 후 분류분석을 한다. R의 다양한 기능들을 웹에 구현하기 위해 활용되는 R Shiny를 이용하여 웹 서버에 시각화를 한다.

콩 종피의 이화학적 특성과 광택과의 관계 (Physicochemical Characteristics of Soybean Seed Coat and Their Relationship to Seed Lustre)

  • 김선림;지희연;손종록;박남규;류수노
    • 한국작물학회지
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    • 제50권spc1호
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    • pp.123-131
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    • 2005
  • 콩 종피의 이화학적 특성과 종실광택과의 상호관계를 구명하고자 본 연구를 실시하여 얻어진 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 콩 종피 표면의 전자현미경으로 관찰 결과 L값이 높은 콩의 종피는 표면이 매끄럽고 pore의 크기가 작았으나 L값이 낮은 콩의 종피는 표면이 거칠고 pore가 비교적 큰 것으로 나타났다. 2. 종피두께가 $70{\mu}m$에 달할 때 까지는 종자의 광택이 증가되지만 그 이상에 달하면 오히려 종실광택이 감소되었고, 종피두께가 두꺼울수록 수분흡수율이 낮으며, 특히 수분흡수 초기에 경향이 뚜렷하였다. 3. 종실광택이 높을수록 수분흡수율은 증가되는데, 수분흡수 초기에는 종실광택의 영향이 작지만 시간이 경과됨에 따라 종실광택이 밝은 품종일수록 수분흡수율이 높았다. 4. 종피의 단백질은 종실광택과 부상관이 있었으나 단백질의 구성성분인 아미노산은 종실광택과 상관이 없었다. 5. 종피의 조지방은 종실광택과 부상관적 요인으로 작용하나 종피에 함유된 불포화지방산은 종피의 광택과 정상관이 있는 것으로 나타나 종피의 광택은 지방산중 불포화지방산의 조성비율이 높을수록 종실이 밝았다. 6.종피의 조섬유 함량은 종실광택과 이차선형관계가 인정되어 종실광택과 밀접한 관계를 맺고 있는 성분으로 판단되었다. 7. 종피의 중성단당류로는 fucose, rhamnose, glucose, mannose, galactose, arabinose, xylose가 함유되어 있었으며, 이들 중 arabinosefl xylose는 종실광택과 정상관이 있었으나 조성비가 가장 높은 galactose는 유의성이 없었다.

한반도 미기록 식물: 애기마디풀(Polygonum plebeium R.Br.; Polygonaceae) (Polygonum plebeium R.Br. (Polygonaceae): An Unrecorded Species in Korea)

  • 정수영;이유미;박수현;윤석민;양종철
    • 식물분류학회지
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    • 제40권4호
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    • pp.247-250
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    • 2010
  • 한반도 미기록 식물 Polygonum plebeium R.Br. (Polygonaceae)은 충청남도 부여군 금강 지역에서 처음 확인되었다. 그 외 경기도 구리시 갈매동 경작지 주변, 충청북도 제천시 한수면 충주호 주변에 대단위 군락이 분포하는 것으로 확인되었으며, 최근 옥천군 군북면 대청호, 대전광역시 대청호 일대에서도 확인되었다. 본종은 비교적 넓은 분포역을 가지고 자생하고 있으며, 근연분류군인 P. aviculare L. (마디풀)과 비교하여 소화경 중간위치에 관절이 있으며, 수과가 매끄럽고 윤채가 있는 특징으로 구별된다. 전체적으로 소형인 식물체로, 형태적 특징을 고려하여 한국명을 '애기마디풀'로 신칭하였고, 형태적 특징과 도해 및 생태사진을 제시하였다.

Monte Carlo Simulation of Plasma Caffeine Concentrations by Using Population Pharmacokinetic Model

  • Han, Sungpil;Cho, Yong-Soon;Yoon, Seok-Kyu;Bae, Kyun-Seop
    • EDISON SW 활용 경진대회 논문집
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    • 제6회(2017년)
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    • pp.677-687
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    • 2017
  • Caffeine has a long history of human consumption but the consumption of caffeine due to caffeinated energy drinks(CEDs) is rapidly growing. Marketing targets of CED sales are children, adolescents and young adults, possibly caffeine-sensitive groups and its effect for them can be significantly different from healthy adults. Caffeine-related toxicities among these groups are growing in number and a number of countries are recognizing severity of caffeine toxicities. Previous research showed prediction of maximal plasma caffeine concentration profiles after the single CED ingestion and the primary aim of this study is to visually predict plasma caffeine concentration after the single and multiple ingestion of standard servings of CED. Based on the population pharmacokinetic model using Monte Carlo simulation, prediction of caffeine concentration leading to caffeine intoxication in the sensitive groups is quantitatively presented and visualized. This research also broadens the perspective by creating and utilizing diverse open science tools including R package, Edison Science App and Shiny apps.

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대중음악 장르별 뮤직비디오 의상에 나타난 여성 관능미에 관한 연구 (A Study on Voluptuous Beauty of Females Found in Music Videos by Popular Music Genre)

  • 서은희;최정욱
    • 복식
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    • 제59권2호
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    • pp.154-168
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    • 2009
  • This study aims on providing a design technique that expresses aesthetical elements by arranging the analysis of sensual beauty into detailed elements of design from music video outfits by genre of pop music, by observing music videos of female vocalists chosen from each genre of pop music focusing on their fashion. The results of this study are the following. 1. In the genre rock, the sensual beauty of female were expressed with a boyish and neutral style using texture such as leather or denim, and such style had the effect of emphasizing their feminine side even more. 2. In the genre dance music, exposure is extensive compared to other genre using sexy or lingerie look, and I found an ambivalent style of feminism with clothes in the form of drapery using textures such as chiffon and silk, and femme fatale style with textures adhering to the body such as leggings, leotard, and bodysuit. 3. In the genre of rap and hip-hop, clothes from casual and costume-play style were found using training jersey, t-shirt, and denim pants, and emphasized the sensual beauty of women by showing a silhouette with short length and fitting style using shiny textures. 4. In the genre of R&B, there were diverse outfits that suits the characteristics of characters appearing in the stories, or the situation of the story since there are many dramatic representation in the form of story Especially in case of female characters, the feminine side was emphasized staging a feminine style by wearing dresses with the texture of chiffon and silk. Exposure was restrained compared to other genre.