Purpose: This study was to evaluate the expression pattern of CD 18(leukocyte adhesion glycoprotein) in ischemia-reperfusion injury of TRAM flap of rats. Through this study, we can obtain more information about ischemia-reperfusion injury. We want to develop specific medicine to improve the survival rate of TRAM flap in the future. Methods: A TRAM flap supplied by a single pedicle superior epigastric artery and vein was elevated on 60 Sprauge-Dawley rats. The rats were divide into 6 groups (each group n=10); Group O: sham, no ischemia-reperfusion injury, Group I: 2 hour reperfusion after 4 hour ischemia, Group II: 4 hour reperfusion after 4 hour ischemia, Group III: 8 hour reperfusion after 4 hour ischemia, Group IV: 12 hour reperfusion after 4 hour ischemia, and Group V: 24 hour reperfusion after 4 hour ischemia. This study consisted of gross examination for flap survival and flow cytometry study of CD18 on neutrophils. Results: The gross measurement of the flap showed different survival rate in group I(71%), II(68%), III(37%), IV(34%) and V(34%). All experimental groups showed an increase in the expression of CD18 compared to group O. The expression of CD18 was rapidly increased in ascending order in group I, II and III. But, the expression of CD18 was maintained in group IV and V. Conclusion: The results can be implemented in the study to develop drugs which are capable of reducing ischemia-reperfusion injury in microsurgical breast reconstruction.
Considerable research has been conducted concerning galectin-9 and carcinomas, but little information is available about any relation with the hepatocellular carcinoma. In this study, we employed a small interfering RNA (siRNA) targeting galectin-9 to down-regulate the expression in HepG2 cells. As a result, after galectin-9 expression was reduced, cell aggregation was suppressed, while other behaviour such as the proliferation, adhesion and invasion to ECM, cell-endothelial adhesion and transendothelial invasion of the cells were markedly enhanced. When tumors of 200 patients with hepatocellular carcinoma were tested for galectin-9 expression by immunohistochemistry, binding levels demonstrated intimate correlations with the histopathologic grade, lymph node metastasis, vascular invasion and intrahepatic metastasis (P<0.05). Moreover, survival analysis indicated that patients with galectin-9 expression had much longer survival time than those with negative lesions, and the Log-rank test indicated that this difference was statistical significant (P<0.0001). The Cox proportional hazards model suggested that negative galectin-9 expression in hepatocellular carcinoma represented a significant risk factor for patient survival. We propose that galectin-9 might be a new prognostic factor with antimetastatic potential in patients with hepatocellular carcinoma.
DEPs (diesel exhaust particles) like any other particles can be also inhaled into lung to participate in a damaging reaction to the organ. Possible damages might be apoptosis and inflammatory responses to the cells in respiratory track. The aim of this study was cytotoxicity evaluation of DEPs from five in-use diesel vehicles using a murine macrophage cell (RAW 254.7). We found that most DEPs have a considerable cytotoxicity compared to the control and SRM 2975. When measured by MTT assay and extents of apoptosis, DEPs of two highmileage vehicles had higher toxicity than those of the other three low-mileage vehicles tested. Although mRNA expression level of TNF-${\alpha$ somewhat explains the trend of cytotoxicity and apoptosis, that of IL-1$\beta$ did not. Correlation studies among the extents of MTT assay, apoptosis, and TNF-$\alpha$ expression showed that the extents between apoptosis and TNF-$\alpha$ expression was most highly correlated (r=0.96). These results suggest that cytotoxicity of various DEPs could be compared easily by measuring the extent of apoptosis or TNF-$\alpha$ expression by DEPs.
This paper introduces a new model based method for facial expression recognition that uses facial grid angles as feature space. In order to be able to recognize the six main facial expression, proposed method uses a grid approach and therefore it establishes a new feature space based on the angles that each gird's edge and vertex form. The way taken in the paper is robust against several affine transformations such as translation, rotation, and scaling which in other approaches are considered very harmful in the overall accuracy of a facial expression recognition algorithm. Also, this paper demonstrates the process that the feature space is created using angles and how a selection process of feature subset within this space is applied with Wrapper approach. Selected features are classified by SVM, 3-NN classifier and classification results are validated with two-tier cross validation. Proposed method shows 94% classification result and feature selection algorithm improves results by up to 10% over the full set of feature.
Journal of the Institute of Electronics Engineers of Korea CI
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v.42
no.1
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pp.1-7
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2005
Cluster analysis of microarray data has been often used to find biologically relevant Broups of genes based on their expression levels. Since many functionally related genes tend to be co-expressed, by identifying groups of genes with similar expression profiles, the functionalities of unknown genes can be inferred from those of known genes in the same group. In this Paper we address a novel clustering approach, called seed clustering, and investigate its applicability for microarray data analysis. In the seed clustering method, seed genes are first extracted by computational analysis of their expression profiles and then clusters are generated by taking the seed genes as prototype vectors for target clusters. Since it has strong mathematical foundations, the seed clustering method produces the stable and consistent results in a systematic way. Also, our empirical results indicate that the automatically extracted seed genes are well representative of potential clusters hidden in the data, and that its performance is favorable compared to current approaches.
Ab Mutalib, Nurul-Syakima;Lee, Learn-Han;Cheah, Yoke-Kqueen
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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v.15
no.21
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pp.9071-9075
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2014
Background: microRNAs are small non-coding RNA that control gene expression by mRNA degradation or translational inhibition. These molecules are known to play essential roles in many biological and physiological processes. miR-205 may be differentially expressed in head and neck cancers; however, there are conflicting data and localization of expression has yet to be determined. Materials and Methods: miR-205 expression was investigated in 48 cases of inflammatory, benign and malignant tumor tissue array of the neck, oronasopharynx, larynx and salivary glands by Locked Nucleic Acid in situ hybridization (LNA-ISH) technology. Results: miR-205 expression was significantly differentially expressed across all of the inflammatory, benign and malignant tumor tissues of the neck. A significant increase in miR-205 staining intensity (p<0.05) was observed from inflammation to benign and malignant tumors in head and neck tissue array, suggesting that miR-205 could be a biomarker to differentiate between cancer and non-cancer tissues. Conclusions: LNA-ISH revealed that miR-205 exhibited significant differential cytoplasmic and nuclear staining among inflammation, benign and malignant tumors of head and neck. miR-205 was not only exclusively expressed in squamous epithelial malignancy. This study offers information and a basis for a comprehensive study of the role of miR-205 that may be useful as a biomarker and/or therapeutic target in head and neck tumors.
Lin28a has diverse functions including regulation of cancer, reprogramming and regeneration, but whether it promotes injury or is a protective reaction to renal injury is unknown. We studied how Lin28a acts in unilateral ureteral obstruction (UUO)-induced renal fibrosis following unilateral ureteral obstruction, in a mouse model. We further defined the role of Lin28a in transforming growth factor (TGF)-signaling pathways in renal fibrosis through in vitro study using human tubular epithelium-like HK-2 cells. In the mouse unilateral ureteral obstruction model, obstruction markedly decreased the expression of Lin28a, increased the expression of renal fibrotic markers such as type I collagen, α-SMA, vimentin and fibronectin. In TGF-β-stimulated HK-2 cells, the expression of Lin28a was reduced and the expression of renal fibrotic markers such as type I collagen, α-SMA, vimentin and fibronectin was increased. Adenovirus-mediated overexpression of Lin28a inhibited the expression of TGF-β-stimulated type I collagen, α-SMA, vimentin and fibronectin. Lin28a inhibited TGF-β-stimulated SMAD3 activity, via inhibition of SMAD3 phosphorylation, but not the MAPK pathway ERK, JNK or p38. Lin28a attenuates renal fibrosis in obstructive nephropathy, making its mechanism a possible therapeutic target for chronic kidney disease.
Background: In breast cancer (BC), it has been suggested that nuclear overexpression of p53 protein might be an indicator of poor prognosis. The aim of the current study was to evaluate the expression of p53 BC in Kurdish women from the West of Iran and its correlation with other clinicopathology figures. Materials and Methods: In the present retrospective study, 231 patients were investigated for estrogen receptor (ER) and progesterone receptor (PR) positivity, defined as ${\geq}10%$ positive tumor cells with nuclear staining. A binary logistic regression model was selected using Akaike Information Criteria (AIC) in stepwise selection for determination of important factors. Results: ER, PR, the human epidermal growth factor receptor 2 (HER2) and p53 were positive in 58.4%, 55.4%, 59.7% and 45% of cases, respectively. Ki67 index was divided into two groups: 54.5% had Ki67<20% and 45.5% had Ki67 ${\geq}20%$. Of 214 patients, 137(64%) had lymph node metastasis and of 186 patients, 122(65.6%) had vascular invasion. Binary logistic regression analysis showed that there was inverse significant correlation between lymph node metastasis (P=0.008, OR 0.120 and 95%CI 0.025-0.574), ER status (P=0.006, OR 0.080, 95%CI 0.014-0.477) and a direct correlation between HER2 (P=005, OR 3.047, 95%CI 1.407-6.599) with the expression of p53. Conclusions: As in a number of studies, expression of p53 had a inverse correlation with lymph node metastasis and ER status and also a direct correlation with HER2 status. Also, p53-positivity is more likely in triple negative BC compared to other subtypes.
Background: Cancer of the gallbladder is a relatively rare neoplasm with a poor prognosis. The exact mechanisms of its genesis are not known and very little information is available on molecular events leading to labeling this as an orphan cancer. Materials and Methods: In this prospective case control study we evaluated the expression of p16, pRb and cyclin D1 by immunohistochemistry to study the G1-S cell-cycle check point and its possible role in gallbladder carcinogenesis. A total of 25 patients with gallbladder carcinoma (group I), 25 with cholelithiasis (group II) and 10 normal controls. were enrolled Results: Cyclin D1 expression was seen in 10 (40%) patients each with carcinoma and cholelithiasis while only in 2 (20%) of the normal gallbladders but differences were not statistically significant (p value=0.488). p16 was expressed in 12% patients of carcinoma of the gallbladder and 28% of cholelithiasis, however this difference was not statistically significant (p value=0.095). Retinoblastoma protein was found to be expressed in 50% of normal gallbladders and 6 (24%) of carcinoma and 8 (32%) of gallstones. The present study failed to demonstrate any conclusive role of cyclin D1/RB/ p16 pathway in carcinoma of the gallbladder. Conclusions: The positive relation observed between tumor metastasis and cyclinD1 expression and p16 with nodal metastasis suggested that higher cyclin D1/p16 expression may act as a predictive biomarker for aggressive behavior of gallbladder malignancies.
Proceedings of the Korea Contents Association Conference
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2004.05a
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pp.478-484
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2004
This study is a fundamental research for the developing 3D character contents about facial expression as a sort of non-linguistic signs, focusing on an expression of emotion factors of a person. It contributes a framework for symbolic analysis about Human's emotions along with a general review of expression. The human face is the most complex and versatile of all species. For humans, the face is a rich and versatile instrument serving many different functions. It serves as a window to display one's own motivational state. This makes one's behavior more predictable and understandable to others and improves communication. The face can be used to supplement verbal communication. A prompt facial display can reveal the speaker's attitude about the information being conveyed. Alternatively, the face can be used to complement verbal communication, such as lifting of eyebrows to lend additional emphasis to stressed word. The facial expression plays a important role under the digital visual context. This study will present a frame of facial expression categories for effective manufacture of cartoon and animation that appeal to the visual emotion of the human.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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