TK6 was able to produce NAD+ dependent cyclohexanol dehydrogenase(CDH). The production of CDH was increased rapidly at the logarithmic phase and maintained constantly after that. In order to investigate the inductive production of CDH by various substrates, the bacteria were grown in the media containing alicyclic hydrocarbons and various alcohols as a sole crabon souce. CDH was induced most actively by cyclohexanol. Cyclohexanone and cyclohexane-1,2-diol also induced remarkable amount of CDH but it was induced weakly by 1-propanol, 1-butanol, 1-pentanol, 1-hexanol, 2-propanol, and 2-methyl-1-propanol. The dehydrogenase of the bacteria grown in the media containing cyclohexanol were weakly active for various alcohols, but the dehydrogenase activity for cyclohexane-1,2-diol was twice as much as that for cyclohexanol. Activity staining on PAGE of the cell free extract of Rhodococcus sp. TK6 grown in the media containing cyclohexanol reveals at least sever isozyme bands of CDH and we nominated the four major activity bands as CDH I, II, III, and IV. CDH I was strongly induced by cyclohexanol, cyclohexane-1,2-diok, but its activity was specific to cyclohexane-1,2-diol and 1-pentanol. CDH IV was strongly induced by cyclohexanol and cyclohexane-1,2-diol, and its activity was very specific to cyclohexane-1,2-diol.
PAH화합물의 하나인 benzo(a)pyrene의 쥐 태반 microsomes에 의한 대사활성화를 조사하였다. B(a)P대사물은 C18- $\mu$ Bondapak칼럼을 사용하여 고압액체크로마토그래피로 분석하였다. 그 결과 B(a)P를 투여한 쥐의 태반 microsomes에 의한 주 대사산물은 발암성이 강한 7,8-diol B(a)P였으며, 또한 적은량의 4,5-diol B(a)P와 quinone류가 검출되었다. 3-methyl-cholanthrene을 투여한 경우 hydroxy B(a)P 와 quinone화합물이 주 대사산물이었으며 Phenobarbital을 전처리했을 경우 7,8-diol B(a)P이 주 대사산물인 것으로 나타났다.
Long chain alkyl diols (LCDs)은 다양한 해양 환경 퇴적물에서 관측되고 있다. Rampen et al. (2012)은 해양 표층 퇴적물에서 분석된 LCDs 중 $C_{30}$ 1,15-diol, $C_{28}$ 1,13-diol, $C_{30}$ 1,13-diol를 이용하여 Long chain Diol Index (LDI)라는 고수온 프록시를 제시하였다. 일반적으로 LCDs의 정성 및 정량 분석은 CP-Sil5CB와 DB-5ms 컬럼을 사용해 GC-MS를 주 기반으로 한다. 본 연구에서는 서로 다른 해양환경(동해 및 서북극해)에서 획득한 해양퇴적물을 활용하여 특성이 다른 세가지 GC 컬럼(CP-Sil5CB, HP-5ms, DB-5)이 LCDs의 정량 분석에 미치는 영향을 검토하였다. 본 연구를 통해 일반적으로 CP-Sil5CB로 분석된 농도 결과가 HP-5ms와 DB-5로 분석된 농도 결과와 통계적으로 유의한 차이가 있는 것으로 확인되었다. 하지만 LDI로 복원된 표층수온의 컬럼 간 편차는 동해 퇴적물의 경우 $0.1-0.2^{\circ}C$, 서북극해 퇴적물의 경우 $0.2-0.7^{\circ}C$로 LDI의 calibration error 범위(${\pm}1{\sigma}$) 보다 작았다. 결론적으로 본 연구는 컬럼에 따라 LCDs의 정량 결과는 현저한 차이를 보일 수 있지만, LDI 프록시 값에 미치는 영향은 상대적으로 미비함을 보여 주었다. 따라서 LDI 프록시를 활용한 동해 및 서북극 해양 퇴적물의 고수온 복원에 특성이 다른 컬럼을 사용 할 수 있음을 시사하였다.
Poly(${\epsilon}$-caprolactone) (PCL) diol, with good biodegradation and biocompatibility, is one of the widely used soft segments (SSs) in composing bio-polyester-urethanes (Bio-PUs), which show great potential in both biomedical and tissue engineering applications. Properties of Bio-PUs are tunable by combining SS monomers with different molecular weights, structures, modifications, and ratio of components. Although numbers of research have reported many Bio-PUs properties, few studies have been done at the molecular scale. In this study, we use molecular dynamic (MD) simulation to construct atomistic models for two commonly used PCL diol SSs with different molecular weights 1247.58 Da and 1932.42 Da. We compare the simulation results by using two widely used classical force fields for organic molecules: Consistent Valence Force Field (CVFF) and CHARMM General Force Field (CGenFF), and discuss the validity and accuracy. Melt density, volume, polymer conformations, transition temperature, and mechanical properties of PCL diols are calculated and compared with experiments. Our results show that both force fields provide accurate predictions on the properties of PCL diol system at the molecular scale and could help the design of future Bio-PUs.
The methanolic extract of the marine sponge Raspilia hirsute collected from Keomun Island resulted in three types of sterols: a mixture of (24S)-Poriferasta-5, 25-diene-$3\beta$, 24-diol and (24R)-Stigmasta-5, 25-diene-$3\beta$, 24 -diol (1), 25,26,27-Trinorcholest-5-en-$3\beta$,24-diol (2), and Pregn-5-en-20-on-$3\beta$-ol (3). The isolation and structural determination of these sterols are reported here. Compound 1 showed moderate cytotoxicity against human Leukemia cell line K562.
Burkholderia cepacia strain G4 (pHG-2) containing toluene 2-monooxygenase and toluene dioxygenase, was able to grow on toluene and accumulate cis-3-methyl-3,5-cyclohexadien-1,2-diol (cis-toluene dihydrodiol) in the liquid culture. The cis-toluene dihydrodiol produced was identical to the authentic compound, as judged through mass spectrometry and nuclear magnetic resonance analysis. Our results indicate that pHG-2 provides an economical means to produce chemically-important chiral synthons while growing on toluene.
Lim Jin A;Kwang Jung Sook;Yu Byung Soo;Baek Seung Hwa
동의생리병리학회지
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제18권4호
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pp.1169-1172
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2004
The cytotoxic activity of 13(E)-labd-13-ene-8α, 15-diol (1) was evaluated against tumor cell lines. A comparison of IC/sub 50/ values of this compound in cancer cell lines showed that their susceptibility to this compound decreased in the following order: P388>B16{F10>MDA-MB-231>A549>KB>SNU-C4 by the MTT method. 13(E}-Labd-13-ene-8α, 15-diol (1) was the most effective growth inhibitor of P388 murine leukaemia cell lines, producing approximately 8.3㎍/mL of IC/sub 50/ in the MTT method.
Activity staining on the native polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) of a cell-free extract of Rhodococcus sp. TK6, grown in media containing alcohols as the carbon source, revealed at least seven isozyme bands, which were identified as alcohol dehydrogenases that oxidize cyclohexanol to cyclohexanone. Among the alcohol dehydrogenases, cyclohexanol dehydrogenase II (CDH II), which is the major enzyme involved in the oxidation of cyclohexanol, was purified to homogeneity. The molecular mass of the CDH II was determined to be 60 kDa by gel filtration, while the molecular mass of each subunit was estimated to be 28 kDa by sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE). The CDH II was unstable in acidic and basic pHs, and rapidly inactivated at temperatures above $40^{\circ}C$ . The CDH II activity was enhanced by the addition of divalent metal ions, like $Ba^2+\;and\;Mg^{2+}$. The purified enzyme catalyzed the oxidation of a broad range of alcohols, including cyclohexanol, trans-cyclohexane-1,2-diol, trans-cyclopentane-l,2-diol, cyclopentanol, and hexane-1,2-diol. The $K_m$ values of the CDH II for cyclohexanol, trans-cyclohexane-l,2-diol, cyclopentanol, trans-cyclopentane-l,2-diol, and hexane-l,2-diol were 1.7, 2.8, 14.2, 13.7, and 13.5 mM, respectively. The CDH II would appear to be a major alcohol dehydrogenase for the oxidation of cyclohexanol. The N-terminal sequence of the CDH II was determined to be TVAHVTGAARGIGRA. Furthermore, based on a comparison of the determined sequence with other short chain alcohol dehydrogenases, the purified CDH II was suggested to be a new enzyme.
To evaluate an effect of pathological liver damage on the conjugation of cyclohexane metabolites, rats were pretreated with 50% $CCl_4$ dissolved in olive oil (0.1 ml/100 g body weight) 10 or 17 times intraperitoneally at intervals of every other day. On the basis of liver function, the animals pretreated with $CCl_4$ 10 times were identified as acutely liver damaged ones and the animals pretreated with $CCl_4$ 17 times were identified as severly liver damaged ones. To these liver damaged animals, cyclohexane (a single dose of 1.56 g/kg body weight, i.p.) was administered at 48 hr after the last injection of $CCl_4$. The rats were sacrificed at 4 or 8 hr after injection of cyclohexane. The cyclohexane metabolites, cyclohexanol (CH-ol), cyclohexane-1,2-diol (CH-1,2-diol), cyclohexane-1,4-diol (CH-1,4-diol), and their glucuronyl conjugates and cyclohexanone were detected in the urine of cyclohexane treated rats. The urinary concentration of cyclohexane metabolites was generally more increased in liver damaged animals than normal ones, and the increasing rate was higher in $CCl_4$ 17 times injected rats than 10 times injected ones. And liver damaged.ats, especially $CCl_4$ 17 times treated ones, had an enhanced ability of glucuronyl conjugation to CH-ol analogues compared with normal group. Futhermore, CH-1,2 and 1,4-diol were all conjugated with glucuronic acid in $CCl_4$ 17 times injected animals. On the other hand, the increasing rate of activities of hepatic cytochrome P450 dependent aniline hydroxylase, alcohol dehydrogenase and urine diphosphate glucuronyl transferase was higher in 17 times $CCl_4$-treated rats compared with normal and $CCl_4$ 10 times injected animals. Taken all together, it is assumed that an increased urinary excretion amount of cyclohexane metabolites in liver damaged rats might be caused by an increase in the activities of cyclohexane metabolizing enzymes. And enhanced conjugating ability of CH-ol in liver damaged animals and novel finding of conjugating form of CH-1,2 and 1,4-diol might be caused by increase in the activity of hepatic diphosphouridine glucuronyltransferase.
에폭사이드 가수분해 효소를 이용하여 라세믹 에폭사이드 기질로부터 광학활성 에폭사이드 또는 vic-diol을 제조하는 동력학적 분할법은 이론 수율이 50%로 제한된다는 단점이 있다. 이러한 문제점을 해결하기 위하여 이론 수율 100%를 얻을 수 있는 다양한 생물전환 방법들이 최근에 개발되고 있다. 서로 상보적인 입체 및 위치특이성을 가진 에폭사이드 가수분해효소에 의한 광학수렴반응을 이용한 광학활성 vic-diol 제조법, 에폭사이드 가수분해효소가 촉발하는 cascade 반응을 통해 라세믹 haloalkyl 에폭사이드로부터 광학활성 epoxy alcohol 또는 THF를 제조하는 방법, ADH를 이용하여 haloketone을 환원시킨 다음 자발적인 cyclization 반응을 통해 광학활성 에폭사이드를 제조하는 방법들이 개발되었다. 이러한 방법들은 높은 광학순도를 가진 광학활성 물질들을 이론수율 100%로 제조할 수 있으므로 향후에 상업화 사례가 많아질 것으로 기대된다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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