• Title/Summary/Keyword: SH3

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Root Initiation in Cut Alfalfa Stems by Treatment of IBA (IBA 처리에 의한 알팔파 줄기 절단면에서 뿌리 분화)

  • 손대영;김기용;장요순;이효신;원성혜;이병현;김미혜;조진기
    • Journal of The Korean Society of Grassland and Forage Science
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    • v.21 no.1
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    • pp.27-30
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    • 2001
  • When root initiation ratio of cut alfalfa (Medicago sativa L.) stems was examined in several medium conditions containing different IBA concentration, Highest root initiation ratio was confirmed at 1.0~1.5 mg/$\ell$ of IBA and the ratio was 70~75%. When the stems from regenerated shoots from callus were treated at 8 kinds of medium for 10 days, the root iniation result was 10 (50%) at 1/2 SH-0 medium, 10 (50%) at SH-0 medium, 12 (60%) at SH-0.5IBA medium, 15 (75%) at SH-1.0IBA medium, 15 (75%) at SH-1.5IBA medium. 10 (50%) at SH-2.0IBA medium, 9 (45%) at SH-2.5IBA medium and 8 (40%) at SH-3.0IBA medium.

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Effects of Silkworm Hemolymph on Cell Viability and hCTLA4Ig Production in Transgenic Rice Cell Suspension Cultures

  • Cheon, Su-Hwan;Lee, Kyoung-Hoon;Kwon, Jun-Young;Ryu, Hyun-Nam;Yu, Da-Hyun;Choi, Yong-Soo;Kim, Dong-Il
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • v.17 no.12
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    • pp.1944-1948
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    • 2007
  • Silkworm hemolymph (SH), prepared from fifth-instar larvae of Bombyx mori and heat-treated at $60^{\circ}C$ for 30 min, was used to improve cell viability and the production of human cytotoxic T-lymphocyte antigen 4-immunoglobulin (hCTLA4Ig) in transgenic Oryza sativa L. cell suspension cultures. Even though SH could not elevate cell viability at the concentrations up to 3% (v/v), addition of 0.3% (v/v) SH to a culture medium enhanced the production of hCTLA4Ig by 36.8% over an SH-free medium. Moreover, the production period of hCTLA4Ig could be shortened in a 0.3% (v/v) SH-added medium compared with that in an SH-free culture. As a result, addition of 0.3% (v/v) SH improved the productivity of hCTLA4Ig significantly in transgenic rice cell cultures.

effect of Nif A Overproduction on the Improvement of Nitrogenase Activity of Klebsiella oxytoca Strains (Nif A의 Overproduction에 의한 Klebsiella oxytoca 균주의 질소 고정력 증진 효과)

  • 서현창;유익동
    • The Korean Journal of Food And Nutrition
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    • v.5 no.2
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    • pp.137-143
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    • 1992
  • As a research for developing biofertilizers, Klebsiella oxytoca, an associative nitrogen fixer in the rhizosphere of rice plant in the soil of paddy field, was subjected to molecular breeding. The results obtained were as followings. 1). By transforming pbIC71A, Nif A overproducing plasmid, into Klebsiella oxytoca NGl3, Klebsiell6f oxytoca SH3l, and Klebsiella oxytoca SH161, nitrogenase activities in the absence of nitrogen source in the medium were increased 6.4, 17.2, and 13.5 times, respectively, in comparison with the parent strains. 2). Nitrogenase activity of Klebgiella oxytoca NGl3, Klebsiella oxytoca SH3l, and Klebsiella oxytoca SH161 was completely repressed In the presence of 15mM NH4+. But, nitrogenase activities of Klebsiella oxytoca NGl3/PMC71A, Klebsiella oxytoca SH3l /PMC71A, and Klebsiella oxytoca SH 161/pMC714 harboring PMC71A, were 13.7%, 7.7%, and 6.2% of the nitrogenase activities in the absence of nitrogen source in the medium, respectively.

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A study of MeSH Compatibility between Korea and Chinese (한국과 중국의 MeSH 호환성 연구)

  • Kwon, Young-Kyu;Lee, Byung-Wook
    • Journal of the Korean Institute of Oriental Medical Informatics
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    • v.11 no.2
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    • pp.65-82
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    • 2005
  • The findings from this study are summarized as follows: 1. Hangul 2004 has 16,023 Chinese Character codes. Among them, 15,231 Chinese Character codes are searched by DB, the others are unsearchable codes. 2. Among 15,231 Chinese Character codes of Hangul 2004, 2,471 Chinese Character codes are converted into 2,232 Simplified Chinese Character codes by Traditional and Simplified Chinese Character Converting program in Hangul 2004. 3. The 5th edition TCM-MeSH has 6,385 thesauruses and 2,142 kinds of Chinese Characters. 4. If we use Simplified Chinese Character of Hangul 2004 to search for TCM-MeSH, we will find 94.3% of TCM-MeSH. But If we use Traditional Chinese Character of Hangul 2004 to search for TCM-MeSH, we will find only 34.2% of TCM-MeSH.

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Molecular interaction between SH3 domain of PACSIN2 and proline-rich motifs of Cobll1

  • Yoo, Hee-Seop;Seok, Seung-Hyeon;Kim, Ha-Neul;Kim, Ji-Hun;Seo, Min-Duk
    • Journal of the Korean Magnetic Resonance Society
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    • v.26 no.3
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    • pp.34-39
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    • 2022
  • The SH3 domain found within a variety of proteins is comprised of generally 60 residues, and participated in protein-protein interactions with proline-rich motifs. Cobll1 was identified as a distinct molecular marker associated with CML progression, and PACSIN2 was discovered a novel Cobll1 binding partner through direct interaction between a SH3 domain of PACSIN2 and three proline-rich motifs of Cobll1. To understand the structural basis of interactions between PACSIN2 and Cobll1, backbone assignments of PACSIN2 SH3 domain were performed. Furthermore, three proline-rich peptides of Cobll1 were titrated to 15N-labeled PACSIN2 SH3 domain in various ratios. Our chemical shift changes data and conserved SH3 sequence alignment will be helpful to analyze fundamental molecular basis related to the interaction between PACSIN2 and Cobll1.

재래누룩에서 분리한 곰팡이를 이용한 탁주의 성분분석

  • 민경찬;이선희;박영심
    • Proceedings of the Korean Journal of Food and Nutrition Conference
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    • 2001.12a
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    • pp.122-122
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    • 2001
  • 쌀과 같은 곡류는 전분질을 당분으로 전환시켜 술을 제조하여야 하므로 미생물이 생성하는 효소가 필요한데 그 효소원이 누룩이며 누룩은 주류의 품질이나 생산량에 영향을 미치는 가장 중요한 요소라고 할 수 있다. 본 연구는 전국44개 지역의 누룩에서 순수 분리된 89종의 곰팡이 중 효소역가와 당화력이 비교적 뛰어난 10종(Aspergillus sp. SH-412 Heunghae, Aspergillus sp. SH-422 Ulsan, Rhizopis sp. SH-606 Imdeok, Aspergillus sp. SH-607 Yhesan, Aspergilus sp. SH-613 Wolseong, Rhizopus sp. SH-654 Uncheon, Aspergillus sp. SH-660 Jeonkok, Aspergillus sp. SH-667 Dongseong, Aspergillus sp. SH-669 Uncheon, Aspergillus sp. SH-696 Daecheon)과 대조균주로 Aspergillus kawachii CF1002 그리고 효모 Saccharomyces cerevisiae를 사용하셨으며 탁주제조 중 균주별 술덧의 산도, 환원당, 아미노산도와 제조된 완성주의 유기산, 유리아미노산, 유리당, 휴젤유 및 색도를 HPLC, GC Mass, 색차계로 측정한 결과 다음과 같은 결론을 얻었다. 균주별 술덧의 주정도는 모든 실험구에서 Aspergillus kawachii보다 높았으며 특히 Aspergillus sp. SH-422는 14.9%로 가장 수율이 좋았다. 환원당은 Aspergillus sp. SH-613이 0.49%로 가장 높았고 Aspergillus sp. SH-422는 0.37%로 가장 낮았으며 산도는 시간의 경과에 따라 감소했으며 술덧 발효중 아미노산도는 시간의 경과에 따라 약간 상승 후 다소 낮아지는 경향을 보였다. 각 균주별 술덧의 유기산은 tataric acid, malic acid, succinic acid, lactic acid, acetic acid가 검출되었으며 lactic acid 함량이 2.0∼3.2g/100ml로 가장 많이 검출되었다. 유기산은 Aspergillus sp. SH-669가 가장 높게 확인되었으며 Aspergillus sp. SH-607이 가장 낮게 분석되었다. 술덧의 주 아미노산은 histidine, alanine, glutamic acid, leucine, tryptophan순으로 검출되었으며 특히 alanine은 주류에 단맛을 주는 성분으로 모든 실험구에서 많은 양이 검출되었다. 각 균주별 술덧의 유리당은 glucose가 가장 많이 검출되었으며 Fusel oil은 iso-butyl alcohol과 iso-pentyl alcohol 이 가장 많이 검출되었다. 한편 균주별 술덧의 색차를 측정한 결과 L값은 63.33∼41.98, a값은 0.09∼-3.47, b값은 17.41∼4.90으로 나타났다.

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A Study on the Gene Expression of Adipogenic Regulators by an Herbal Composition (생약복합물에 의한 지방세포형성 조절자의 유전자 발현 연구)

  • Lee, Hae-Yong;Kang, Ryun-Hwa;Bae, Sung-Min;Chae, Soo-Ahn;Lee, Jung-Ju;Oh, Dong-Jin;Park, Suk-Won;Cho, Soo-Hyun;Shim, Yae-Jie;Yoon, Yoo-Sik
    • Journal of Life Science
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    • v.20 no.5
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    • pp.729-735
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    • 2010
  • In our previous study, it was reported that an herbal mixture, SH21B, inhibits fat accumulation and adipogenesis both in vitro and in vivo models of obesity. SH21B is a mixture composed of seven herbs: Scutellaria baicalensis Georgi, Prunus armeniaca Maxim, Ephedra sinica Stapf, Acorus gramineus Soland, Typha orientalis Presl, Polygala tenuifolia Willd, and Nelumbo nucifera Gaertner (Ratio 3:3:3:3:3:2:2). The aim of this study was to investigate the detailed molecular mechanisms of the effects of SH21B on various regulators of the adipogenesis pathway. During the adipogenesis of 3T3-L1 cells, SH21B significantly decreased the expression levels of central transcription factors of adipogenesis, such as peroxisome proliferator-activated receptor (PPAR)$\gamma$ and CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP)$\alpha$. To elucidate the detailed molecular mechanism of the anti-adipogenic effects of SH21B, we examined the expression levels of the various pro-adipogenic or anti-adipogenic regulators of adipogenesis upstream of $PPAR{\gamma}$ and C/$EBP{\alpha}$. The mRNA levels of Krox20 and Kruppel-like factor (KLF) 15, which are pro-adipogenic regulators, were significantly down-regulated by SH21B treatment, whereas the mRNA levels of C/$EBP{\gamma}$ and KLF5 were not changed. KLF2 and C/EBP homologous protein (CHOP), which are anti-adipogenic regulators, were significantly up-regulated by SH21B treatment. These results suggest that the molecular mechanism of the anti-adipogenic effect of SH21B involves both the down-regulations of pro-adipogenic regulators, such as Krox20 and KLF15, and the up-regulations of anti-adipogenic regulators, such as KLF2 and CHOP, which results in the suppression of central transcription factors of adipogenesis including $PPAR{\gamma}$ and C/$EBP{\alpha}$.

Identification of a Protein Interacting with Human Nebulin SH3 Domain by Yeast Two-hybrid Screening

  • Lee, Min-A;Kim, Ji-Hee;Min, Byung-In;Park, Soo-Ho;Ko, Han-Suk;Kim, Chong-Rak
    • Biomedical Science Letters
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    • v.7 no.2
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    • pp.59-64
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    • 2001
  • Nebulin is an unusually large actin-binding protein specific to the skeletal muscle of vertebrates. The correlation of nebulin size with thin filament length have led to the suggestion that nebulin acts as a molecular ruler for the length of thin filaments. An SH3 domain occupies the C terminus of nebulin, in the sarcomeric Z-disk and is preceded by a 120-residue stretch containing multiple putative phosphorylation sites. SH3 domain mediates protein-protein interaction involved in the subcellular localization of proteins, cytoskeletal organization and signal transduction. However the binding partner and physiological role of nebulin SH3 domains remains unknown. Using the yeast two-hybrid system, we identified supervillin, an actin-binding protein, as a nebulin SH3 domain-interacting protein. The SH3 domain of nebulin binds to the sequence encoding amino acids 977 to 1335 of supervillin. But the sequence encoding amino acids 977 to 1335 displays weaker binding than the sequence encoding amino acids 977 to 1788.

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재래누룩 곰팡이를 이용한 탁주의 향기성분 및 관능평가

  • 민경찬;이선희;박영심
    • Proceedings of the Korean Journal of Food and Nutrition Conference
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    • 2001.12a
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    • pp.123-123
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    • 2001
  • 주류는 미생물에 의한 효소작용으로 원료 성분이 분해됨으로서 생성되는 당분, 아미노산, 유기산등의 맛 성분과 발효과정 동안 생성되는 휘발성 성분들이 조화되어 상당히 다양한 성분들이 향미에 관여하므로 향기의 주성분 규명이나 향기성분을 이용한 품질의 규격화가 매우 어려운 문제로 보여진다. 술덧의 안전한 발효와 잡균오염을 방지하여 품질이 균일한 술을 생산할 목적으로 재래누룩과는 별도로 Aspergillus kawachii등의 균을 이용한 개량곡자(koji)가 술 제조시에 많이 이용되고 있으나 이러한 방법은 탁주의 대량생산과 수율은 증가시켰으나 다양한 품질이나 맛의 향상은 기대하기 어렵다. 본 실험은 재래누룩에서 분리된 곰팡이 10종과 대조균주로 Aspergillus kawachii CF1002 그리고 효모 Saccharomyces cerevisiae를 이용하여 술을 담금하여 그 제품의 headspace gas를 포집하여 GC/MS로 휘발성 향기성분을 분석하였으며 또한 관능평가를 실시하여 검토하였다. 각 균주별로 총 27∼40종의 향기성분이 확인되었으며 전체 시료에서 알콜(peak area% 52.3 9∼70.36%), 알칸류(3.49∼14.17%), 에스테르류(3.23∼7.37%), 유기산류(0∼2.85%), 알데히드류(0∼0.44%)의 순으로 함유량이 높은 것으로 나타났다. GC/MS를 통한 향기성분의 분석 결과 각각의 선발 균주로 제조된 술의 향기성분의 패턴이 서로 상이하였으며 이것은 통계분석에 의해 그 특징이 유의적으로 분석되어 Aspergillus sp. SH-607, Aspergillus sp. SH-613, Aspergillus sp. SH-667, Aspergillus sp. SH-696 그리고 Aspergillus sp. SH-412는 기호도가 높은 것으로 관찰되었다. 수집된 우수균주 10종과 Aspergillus kawachii등으로 담금하여 제조한 술 시료 11종류를 대상으로 하여 쓴맛, 미묘한 맛, 떫은 맛, 신맛, 좋은 맛의 정도를 5단계로 나누어 관능검사를 실시한 다음 자료를 Duncan's multiple range test로 분석한 결과 전체적으로 좋은 맛에 대한 기호도는 Aspergillus sp. SH-607 시료와 Aspergillus sp. SH-412, Rhizopus sp. SH-606, Aspergillus sp. SH-613, Rhizopus sp. SH-654, Aspergillus sp. SH-696 Aspergillus kawachii 시료가 유의성 있게 좋은 맛을 나타내 기호도가 높았으며 맛과 기호도가 가장 좋았던 것은 Aspergillus sp. SH-607 시료로 나타났다.

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Effect of Snake Venom Toxin from Vipera Lebetina Turanica on Neuroblastoma SK-N-SH Cells (Vipera Lebetina Turanica 사독의 신경아세포종 SK-N-SH 세포에 미치는 영향)

  • Sim, Jae-Young;Song, Ho-Sueb
    • Journal of Acupuncture Research
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    • v.25 no.3
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    • pp.53-69
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    • 2008
  • 목적 : 이 연구는 Vipera lebetina turanica의 사독약침액(蛇毒藥鍼液)(Snake venom toxin, SVT)이 인간 신경아세포종의 암세포주인 SK-N-SH 세포에서 암세포성장의 억제 및 그 기전에 대하여 살펴보고자 하였다. 방법 : SVT를 처리한 후 SK-N-SH의 성장억제를 관찰하기 위해 CCK-8 assay와 LDH assay를 시행하였고, apoptosis 평가에는 세포형태의 관찰과 DAPI, TUNEL, Annexin V-PI double staining assay 및 cell detachment assay를 시행하였다. 세포자멸사 관련 세포기전을 보기 위하여 세포주기, 세포내 칼슘량, 세포내 활성산소량 및 미토콘드리아의 세포막전위 변화를 측정하였고, DNA fragmentation assay를 시행하였으며, 세포자멸사 조절 단백인 Bax, Bcl-2, caspase-3, -9의 발현 변화 관찰에는 western blot analysis를 시행하였다. 결과 : SK-N-SH 세포에 SVT를 처리한 후, 신경아세포종 세포의 성장, Apoptosis의 유발 및 기전의 영향을 관찰하여 다음과 같은 결과를 얻었다. 1. SVT를 처리한 SK-N-SH 세포 관찰에서 세포독성은 농도의존적으로 증가하는 경향이 있는 반면 암세포성장의 유의한 억제는 $20{\mu}g/m{\ell}$ SVT에 의해서만 나타났다. 2. 세포자멸사 평가에서 SVT를 처리한 SK-N-SH 세포는 세포자멸사의 특징적 형태를 나타내었다. TUNEL assay에서는 세포자멸사 활성세포가 미약하게 나타난 반면 cell detachment assay와 Annexin V-PI double staining에서는 각각 세포박리와 세포자멸사 활성세포의 유의한 증가를 나타내었다. 3. 세포자멸사 관련 세포기전연구에서 SVT를 처리한 SK-N-SH 세포의 세포주기, 세포 내 칼슘양 및 DNA fragmentation에는 유의한 변화가 관찰되지 않은 반면 세포내 활성산소 양은 유의한 증가를 나타내었고, 그에 따른 미토콘드리아 세포막 전위의 유의한 변동이 관찰되었다. 4. SVT를 처리한 SK-N-SH는 세포자멸사 관련 단백 발현에서 Bax에 대해 유의한 증가를 나타내지 않았으나 caspase-3 및 caspase-9의 유의한 증가와 Bcl-2의 유의한 감소를 나타내었다. 결론 : 이상의 결과는 SVT가 세포 내 활성산소를 증가시킴으로써 미토콘드리아의 세포막전위에 변화를 일으켜 인간 신경아세포종 세포주인 SK-N-SH의 세포박리와 유관한 세포자멸사를 유발함으로써 증식억제 효과가 있음을 입증한 것이다.

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