최근 국내 수질오염에 대한 높은 관심과 개선의 필요성이 요구되는 가운데 물 환경 속의 약물의 잔류는 인체를 포함한 생태계의 약물 내성을 일으킨다는 점에서 지속적인 모니터링의 필요성이 제기되고 있다. 특히 약물 중 큰 비율을 차지하는 항생제의 잔류는 하천을 통해 빠르게 생태계의 내성균 확산을 일으킬 수 있다는 점에서 매우 큰 위험요소라고 할 수 있다. 따라서 본 총설에서는 물 환경 속의 항생제 분석이 실시간으로 가능한 신속한 센싱 플랫폼 기반 기술을 서술하고자 하며 이와 관련한 국내/외 연구현황과 발전가능성 및 그에 따른 산업/경제적 효과에 대해 논의하고자 한다.
The use of antimicrobials will be soon removed due to an increase of occurrence of antibiotic-resistant bacteria or ionophore-resistant Eimeria species in poultry farms and consumers' preference on drug-free chicken meats or eggs. Although dietary antimicrobials contributed to the growth and health of the chickens, we do not fully understand their interrelationship among antimicrobials, gut microbiota, and host immunity in poultry. In this review, we explored the current understanding on the effects of antimicrobials on gut microbiota and immune systems of chickens. Based on the published literatures, it is clear that antibiotics and antibiotic ionophores, when used singly or in combination could influence gut microbiota. However, antimicrobial effect on gut microbiota varied depending on the samples (e.g., gut locations, digesta vs. mucosa) used and among the experiments. It was noted that the digesta vs. the mucosa is the preferred sample with the results of no change, increase, or decrease in gut microbiota community. In future, the mucosa-associated bacteria should be targeted as they are known to closely interact with the host immune system and pathogen control. Although limited, dietary antimicrobials are known to modulate humoral and cell-mediated immunities. Ironically, the evidence is increasing that dietary antimicrobials may play an important role in triggering enteric disease such as gangrenous dermatitis, a devastating disease in poultry industry. Future work should be done to unravel our understanding on the complex interaction of host-pathogen-microbiota-antimicrobials in poultry.
In recent years, there has been an increase in consumer demand for bottled waters. There is a perception that consumption of natural mineral water represents a healthy life style and that these products are relatively safe. In this study, the microbiological quality of 39 samples of bottled water, purchased from retail store in Korea, was investigated during the 2005. Applying pour plate method, the 1 mL of water samples were analyzed for the presence and enumeration of total general bacteria and Pseudomonas spp.. Nineteen samples representing 9 brands of bottled water contained general bacteria ($1.54{\times}10^2$ CFU/mL). In addition four samples contained Pseudomonas spp. and Camamonas acidovorans. The susceptibility of the strains tested against 25 antimicrobial agents, Pseudomonas fluorescens were resistant to Lincomycin, Amoxacilin/Clavulanic acid and Cefazolin (> $100{\mu}g/mL$). Also Comamonas acidovorans were intermediate to Cephalothin and resistant to Cefoperazone.
As part of our attempt to discover novel active compounds against multi-drug resistant pathogens, we hereby report two new complexes of iron(III) with formulae: [Fe(L1)2(H2O)2]Cl3 and [Fe(L1)2(L2)(H2O)]Cl2 where L1 = 1,10-phenanthroline (C12H8N2) and L2 = guanide (C5H4N5O-). The synthesized complexes were characterized using spectroscopic analysis (ESI-MS, ICP-OES, FT-IR, and UV-Vis), cyclic voltammetry, CHN analysis, gravimetric chloride determination, melting point determination, and conductance measurement. Octahedral geometries are assigned to both complexes. In vitro antibacterial activity was tested on two Gram-positive (Staphylococcus aureus, Streptococcus epidermidis) and two Gram-negative (Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae) bacteria using the disc diffusion method. The complexes demonstrated appreciable activity against these pathogens. Interestingly, the [Fe(L1)2(L2)(H2O)]Cl2 complex manifested a higher degree of inhibition against the drug-resistant Gram-negative bacteria than the commercially available drug, namely erythromycin.
Early and accurate detection of pathogens is important to improve clinical outcomes of bloodstream infections (BSI), especially in the case of drug-resistant pathogens. In this study, we aimed to develop a culture-independent digital PCR (dPCR) system for multiplex detection of major sepsis-causing gram-negative pathogens and antimicrobial resistance genes using plasma DNA from BSI patients. Our duplex dPCR system successfully detected nine targets (five bacteria-specific targets and four antimicrobial resistance genes) through five reactions within 3 hours. The minimum detection limit was 50 ag of bacterial DNA, suggesting that 1 CFU/ml of bacteria in the blood can be detected. To validate the clinical applicability, cell-free DNA samples from febrile patients were tested with our system and confirmed high consistency with conventional blood culture. This system can support early identification of some drug-resistant gram-negative pathogens, which can help improving treatment outcomes of BSI.
Hanseob Shin;Yongjin Kim;Seunggyun Han;Hor-Gil Hur
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제33권3호
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pp.277-287
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2023
Since the first discovery of antibiotics, introduction of new antibiotics has been coupled with the occurrence of antibiotic resistant bacteria (ARB) and antibiotic resistance genes (ARGs). Rapid dissemination of ARB and ARGs in the aquatic environments has become a global concern. ARB and ARGs have been already disseminated in the aquatic environments via various routes. Main hosts of most of ARGs were found to belong to Gammaproteobacteria class, including clinically important potential pathogens. Transmission of ARGs also occurs by horizontal gene transfer (HGT) mechanisms between bacterial strains in the aquatic environments, resulting in ubiquity of ARGs. Thus, a few of ARGs and MGEs (e.g., strA, sul1, int1) have been suggested as indicators for global comparability of contamination level in the aquatic environments. With ARB and ARGs contamination, the occurrence of critical pathogens has been globally issued due to their widespread in the aquatic environments. Thus, active surveillance systems have been launched worldwide. In this review, we described advancement of methodologies for ARGs detection, and occurrence of ARB and ARGs and their dissemination in the aquatic environments. Even though numerous studies have been conducted for ARB and ARGs, there is still no clear strategy to tackle antibiotic resistance (AR) in the aquatic environments. At least, for consistent surveillance, a strict framework should be established for further research in the aquatic environments.
한우와 홀스타인의 분변으로부터 MRS 배지와 LAPT 배지를 이용하여 무작위 선발법으로 54균주의 유산균을 1차로 분리하였다. 1차로 분리된 54균주에 대해 내담즙성이 우수한 10균주를 분리한 다음 내산성을 조사한 결과 인공위액 pH 2.5에서 LS1, LS15 및 LL6 균주가 각각 66.5%, 82.6% 및 80.7%의 생존율을 나타내었다. Sal. typhimurium, Sta. aureus 및 Cl. perfringens의 병원균에 대해 가장 큰 항균력을 보인 균주는 LL6와 LL7이었다. API CHL kit로 동정한 결과 LS1, LS2 및 LMI 균주는 모두 L. fermentum, LL6와 LL7 균주는 L. acidophilus, LS3 균주는 L. plantarum으로 각각 동정되었고, 나머지 4균주는 Lactobacillus spp. 로 동정되어 분리된 10균주 모두 안전성 있는 유산간균임을 확인하였다. 10종류의 항생제에 대한 내성을 조사한 결과 ampicillin, amoxicillin과 erythromycin에 대해서는 감수성이 있으나 colistin과 ciprofloxacin에 대해 모두 내성을 나타내었다. LB1, LL6 및 LL7 균주는 gentamicin과 neomycin에 대해 내성을 보여 주었다. 분리 동정된 균주 중에 내산성, 내담즙성 및 병원성 균에 대한 특성을 기준으로 판단할 경우 probiotic 유산균으로 사용 가능성이 높은 것은 LL6인 L. acidophilus로 나타났다.
구름버섯 균사체를 12% 감귤 추출액에서 7일간 배양한 배양액을 열탕 추출한 후 균사체 잔사를 여과하여 제거하고, 동량의 ethyl acetate(1 : 1, v/v)로 재차 추출하였다. EA 추출물은 복합내성을 갖는 MRSA 균주인 S. aureus CCARM3230와 P. aeruginosa CCARM2171에 대해 현저한 생육저지 활성을 확인하였다. 본 추출물을 silica gel chromatography로 분획하였을 때 dichloromethane : methanol(9 : 1, v/v)의 용매조건으로 용출한 분획물의 항균활성이 가장 높았으며, 활성물질이 높은 순도의 단일 물질로 정제되었음을 HPLC 분석으로 확인하였다. 다제 내성 균주들에 대해 현저한 항균 활성을 보이고, 특히, 그람음성균인 P. aeruginosa CCARM2171과 그람양성균인 S. asures CCARM3230 균주 모두에서 현저한 항균활성을 나타낸 것은 본 추출물의 활성물질이 광범위 항균 스펙트럼을 갖는 신규의 항생물질로 개발될 수 있는 가능성을 보여주는 것으로 사료되었다.
세계보건기구(WHO)를 비롯해 세계 각국의 정부기관은 항생제 오남용에 따른 항생제 내성균 감염에 대해 심각하게 경고하며 이를 예방하기 위한 관리와 감시를 강화하고 있다. 하지만 감염을 확인하기 위한 감염균 배양에 수일의 시간이 소요되면서 격리와 접촉주의를 통한 감염확산 방지 효과가 떨어져 선제적 조치를 위한 신속하고 정확한 예측 및 추정방법이 요구되고 있다. 본 연구는 Electronic Health Records에 포함된 질병 진단내역과 항생제 처방내역을 neural embedding model과 matrix factorization을 통해 embedding 하였고, 이를 활용한 딥러닝 기반분류 예측 모형을 제안하였다. 항생제 내성균 감염의 주요 원인인 질병과 항생제 정보를 embedding하여 환자의 기본정보와 병원이용 정보에 추가했을 때 딥러닝 예측 모형의 f1-score는 0.525에서 0.617로 상승하였고, 딥러닝 모형은 Super Learner와 같은 기존 기계학습 모형보다 더 나은 성능을 보여주었다. 항생제 내성균 감염환자의 특성을 분석한 결과, 감염환자는 동일한 질병을 진단받은 비감염환자에 비교해 J01 계열 항생제 사용이 많았고 WHO 권고기준(DDD)을 크게 벗어나는 오남용 청구사례가 6.3배 이상 높게 나타났으며 항생제 오남용과 항생제 내성균 감염간의 높은 연관성이 발견되었다.
메치실린 내성 포도알균(methicillin resistant Staphylococci, MRS)는 인체 여러 부위에서 집락화 될 수 있으며 의료기관과 연관된 사람에서 흔히 분리된다. 이 연구는 밀접한 단체생활을 하는 일개 고등학교 한 개 반의 학생들 손과 그들이 사용하는 책상에서 MRS 균의 오염 정도를 평가하고자 하였다. Staphylococcus aureus가 28명의 학생의 손 중에서 2 균주가 분리되었으며 모두 메치실린에 감수성이었다. 응고인자 음성 포도알균(coagulase negative Staphylococci, CoNS)는 26 균주가(26/28, 92.9%) 분리되었으며 이들 균주 중 14 균주는 메치실린 내성균(MRCoNS)이었다. 14 MRCoNS 중 S. warneri가 가장 흔하였으며(8/14, 57%), 이들은 대부분의 $non-{\beta}-lactam$ 항생제에 감수성 이었다. 31개의 책상에서는 S. aureus는 분리되지 않았으나 26 CoNS (26/31, 83.9%)가 분리되었다. 손과 책상에서 분리된 포도알균 이외의 균은 Micrococcus와 Bacillus spp.이었다. 결론적으로 MRSA는 이번 연구에서 분리되지 않았으나 mecA 유전자를 갖고 있는 MRCoNS는 학생들의 손에서 높은 비율로 분리되었다. 손씻기와 같은 예방 교육을 강화할 뿐만 아니라 이들 균의 오염 및 보균율 등의 조사와 같은 능동적 감시 등이 이들 균의 감염예방과 전파 차단을 위해 필요할 것으로 사료된다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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