• 제목/요약/키워드: RNA/DNA ratio

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Food Effect on the Diel Variations and Starvation of the Melania Snail Semisulcospira gottschei Using RNA/DNA Ratios

  • Kim, Dae-Hee;Baek, Jae-Min;Lee, Jong-Ha;Kim, Bong-Rae;Yoon, Soon-Jae;Kim, Jin-Hyoung
    • Fisheries and Aquatic Sciences
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    • 제14권4호
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    • pp.411-416
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    • 2011
  • We investigated the nutritional status of the melania snail (Semisulcospira gottschei) using RNA/DNA ratios to evaluate the effect of feeding conditions (artificial versus natural) on the reaction times of the snails in a time course following starvation. In the short experiments (48 h), the RNA/DNA ratios of the artificial feeding groups were significantly higher than those of the natural groups. While two RNA/DNA ratio peaks were observed in the artificial food group during daytime, the natural food group showed a higher ratio at night. Under starvation conditions, the RNA content decreased whereas the DNA content was constant. The RNA/DNA ratios of the freshwater snail in both groups dramatically decreased after starvation and remained constant until the end of the experiment. We verified that the RNA/DNA ratio serves as an index of nutritional condition with respect to the effect of dietary differences. These results are important for understanding optimized aquaculture rearing conditions for this important commercial freshwater snail.

The Effects of Temperature, Starvation, and Kind of Foods on Growth, RNA/DNA Ratios and Protein Contents during the Early Life Stages of Olive Flounder (Paralichthys olivaceus)

  • Gwak Woo-Seok;Tanaka Masaru
    • Fisheries and Aquatic Sciences
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    • 제7권4호
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    • pp.192-203
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    • 2004
  • The effects of temperatures, starvation, and kind of foods on growth, RNA/DNA ratio and protein contents during metamorphosis and early juvenile stage of olive flounder (Paralichthys olivaceus) were examined. During metamorphosis, warm-acclimated fish showed higher RNA and DNA content than those of the cold-acclimated fish, excepting H stage (28 DAH) at which the ratio was higher at cold temperature. RNA/DNA ratio during metamorphosis showed similar values at two temperatures tested. However, after 42 DAH warm-acclimated juveniles had higher DNA content compared with cold-acclimated fish, resulted in marked decreases in RNA/DNA ratios. Higher RNA content at H stage of cold-acclimated fish was consistent with an increase in protein content. Growth of fish rearing at warm temperature was higher than those of fish at cold temperature during all experiments. In starvation experiment, contents of DNA, RNA and protein significantly decreased. Even though there were no significant differences in total length (TL) and body weight between the live mysid-fed and artificial pellet-fed fish at 35 mm TL, both RNA/DNA and protein/DNA ratios of the former group was significantly higher than those of the latter due primarily to lower DNA content of the live mysid-fed group. The results from this study suggest that temperature, starvation and kind of foods should be considered when RNA/DNA ratio applied to assessing the cultured larval and juvenile fish condition.

Studies on the Chromatin Isolated from the Organs of Animals Received Whole-body X-ray Irradiation

  • Han, Su Nam
    • 대한수의학회지
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    • 제7권2호
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    • pp.13-18
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    • 1967
  • 1. Within experimental chromatin, the total protein: DNA ratio did not vary in the same organs of control and irradiated rats. However, the amount of RNA and total protein associated with the DNA varied considerably among the different types of chromatin. In particular, the content of chromatin was the control tissue. RNA and total protein ratio of chromatins from brtain, liver, testis and spleen declined with experimental I organs. 2. There was the same quantitative relationship between the amount of RNA and the amount of histone-protein associated with DNA in chromatin. 3. RNA: DNA ratio of chromatin showed 1.5-2 times increas in the irradiated organs except brain. However, RNA: DNA ratio was decreased in chromatin by irradiation. 4. Histone-protein:residual protein ratio was greatly varied among the organs. However, the effect was not found by irradiation. 5. Priming activity of chromatin showed a higher value in testis and the activity was greater in organs with higher metabolic activity: 6. Inhibition of Actinomycin D is observable in chromatin from testis, liver, spleen and brain declined without relationship between irradiated and non-irradiated conditions. Ammonium sulfate showed increased priming activity by the electrostatic dissociation of DNA and histone in chromatin on the stimulation depending on property of chromatins. 7. It is suggested that the results support a proposal that testis and spleen of highly sensitive to irradiation should an increase in the priming activity whereas brain and liver of lower sensitivity decreased in the activity.

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Comparison of Total Protein, DNA, and RNA Contents by Corpus Luteum in Various Stages of Estrous Cycle and Pregnancy

  • K. S. Baek;Kim, Y. S.;Lee, C. N.
    • 한국동물번식학회:학술대회논문집
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    • 한국동물번식학회 2001년도 춘계학술발표대회
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    • pp.79-79
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    • 2001
  • This study was conducted to measure the total protein, DNA, and RNA contents of corpus luteum(CL) in various stages of estrous cycle and pregnancy. CLs were collected from a local slaughterhouse and stages of the estrous cycle of CL were classified as CL1~2, days 1 to 10; CL3(with/without central cavity), days 11 to 17; CL4, days 18 to 20 by method of Ireland et. al(1980) and stages of the pregnancy of CL were classified as P1~3, months 11~3: P4~6, months 4~6; P7~9, months 7~9 of pregnancy. CL3 with/without central cavity(CC) was identified as described by Kastelic et. al.(1990)-CL with CC, more than 2mm in diameter; CL without CC, less than 2mm in diameter. In total protein content, CL3 with CC was significantly lower than P7~9(p<.05). The total DNA content was lower in CL3 with CC than CL3 without CC and CL4(p<.05). In protein : DNA ratio, CL3 with CC was significantly lower than CL4(p<.05), CL3 without CC was significantly lower than P7~9(p<.05), CL4 was significantly lower than CL3 with CC, P1~3 and P7~9(p<.05). No differences were observed in RNA content, protein:RNA ratio, RNA/DNA of CLs in stages of estrous cycle and pregnancy.

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백서장기(白鼠臟器)에서의 Chromatin의 분리(分離)와 그 RNA 합성능(合成能)에 미치는 X-선전신조사(線全身照射)의 영향(影響)에 관(關)한 연구(硏究) (Studies on the Chromatin Isolated from the Organs of Animals Received Whole-body X-ray Irradiation)

  • 한수남
    • 대한핵의학회지
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    • 제1권2호
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    • pp.27-34
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    • 1967
  • 근년(近年) 고등동물세포(高等動物細胞)에 있어서 유전자(遺傳子)의 본체(本體)인 DNA에서 RNA를 경과(經過)해서 특이적(特異的)인 단백질(蛋白質)의 생합성(生合成)에 도달(到達)하는 경로(經路)에 대(對)해서는 많은 연구(硏究)에 의해서 확립(確立)되어졌으나 그 조절기구(調節機構)에 대(對)해서는 불명(不明)한 점(點)이 많다. 개체(個體), 기관(器管), 세포내구조(細胞內構造) 급(及) DNA의 준위(準位)에서의 방사선(放射線)의 장해(障害)에 대(對)해서도 연구(硏究)되고 있으나 소위(所謂) 방사선감수성(放射線感受性) 급(及) 비감수성(非感受性)의 각장기(各臟器)에서 분리(分離)한 Chromatin (DNA-Histone-잔여단백(殘餘蛋白)의 고차구조결합체(高次構造結合體)에 대(對)한 DNA, RNA, 전단백질(全蛋白質)과 유전수식체(遺傳修飾體)라고 생각되는 Histon-단백(蛋白)의 화학조성(化學組成)을 검출(檢出)했으며 겸(兼)해서 chromatin의 생물활성(生物活性)인 RNA 합성능(合成能)(priming activity)에 대(對)한 방사선(放射線)의 영향(影響)을 조사(調査)하는데 의의(意義)가 있다. 전리방사선(電離放射線) 조사(照射)에 의해서 생체(生體)의 DNA의 합성조해(合成阻害)가 잘 알려진 사실(事實)이나 분화(分化)한 생체조직(生體組織)에서의 DNA의 합성(合成)보다도 일반대사(一般代謝)에 중요(重要)한 역할(役割)을 한다는 것도 생각된다. 세포(細胞)의 대사(代謝)는 내분비계등(內分泌系等)의 "Effector-DNA-RNA-단백합성(蛋白合成)이라는 정보유전기구(情報遺傳機構)에 의해서 제어(制禦)되어 있다. 이 연구(硏究)는 방사선생물학상(放射線生物學上) 중요(重要)한 것은 논할(論) 필요(必要)도 없으며 방사선동위원소표지화합물(放射線同位元素標識化合物)을 사용(使用)하여 생화학적(生化學的)으로 추구(推究)하였다.

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경남 거제해역에 서식하는 감성돔(Acanthopagrus schlegeli)의 연간 RNA/DNA 및 혈액학적 특성 변화 (Seasonal Change of RNA/DNA Ratio and Blood Characteristics of Black Sea Bream Acanthopagrus schlegeli Habituated in Geojae Costal Area, Kyungnam Province, Korea)

  • 김수경;심나영;이도현;김대현;윤성종
    • 한국환경과학회지
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    • 제22권1호
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    • pp.37-45
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    • 2013
  • The monthly variations of blood characteristics and RNA/DNA of black sea bream, Acanthopagrus schlegeli, habituated in Geojae costal area were analysed to determine health condition of natural stocks in terms of gonad maturation and spawning season from March 2010 to February 2011. Spawning season determinated by gonadosomatic index is from June to August. RNA/DNA ratio of black sea bream muscle was strongly correlated with spawning season. During the gonad maturation RNA/DNA ratio in dorsal muscle tissue was decreased contrast to rapid increase during spawning season. Blood composition factors increased in terms of gonad maturation are aspartate aminotransferase, cholesterol, triglyceride, total protein, glucose, globulin, alkaline phosphatase and inorganic phosphate. Other blood factors increased during spawning season are alanine aminotransferase, blood urea nitrogen, uric acid and lactate dehydrogenase.

삼배체와 이배체 굴, Crassostrea gigas의 형태 및 생리학적 특성 비교 (Morphological and physiological comparison between triploid and diploid Pacific Oyster, Crassostrea gigas)

  • 김수경;심나영;이원영;최민섭;최은희;임현정
    • 한국패류학회지
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    • 제29권3호
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    • pp.217-223
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    • 2013
  • The morphological relations and physiological characteristics of the triploid and diploid oysters (Crassostrea gigas) in Taean area, west coast of Korea, were investigated from May 2012 to April 2013. Mophometric analysis indicated that the triploid oysters have the same shell length to shell height ratio but higher shell depth to shell height ratio than diploids. Consistent with morphological characteristics, triploid oysters showed greater values of fatness, condition index and RNA/DNA ratio during the period of experiment. The DNA concentration in adductor muscle and mantle of triploid were either lower or equal to the nucleic acids of diploid. However, RNA/DNA ratio were significantly higher than diploid. It appears that RNA/DNA ratio could be a useful indicator of health condition of triploid and diploid oysters when taken in correlation with the morphological indices.

수평망식 양식 굴, Crassostrea gigas의 산란기 이후 생태·생리학적 특성 변화 (Ecophysiological Characteristics Changes in the Pacific Oyster, Crassostrea gigas, after Spawning Season in Off-bottom Culture)

  • 김수경;최은희;한현섭;임현정
    • 한국패류학회지
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    • 제28권3호
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    • pp.215-223
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    • 2012
  • 한국 서해안 해역에서 2011년 9월부터 2012년 1월까지 수평망식으로 양성한 굴의 산란기 이후 생태 생리학적 변화를 조사하였다. 조사 지역은 충남 태안 연안의 의항, 신두리, 이원의 두 곳을 선정하여 생식소지수, 조직학적 분석, 생식소와 폐각근 내의 RNA/DNA의 양과 비, condition index (CI), 연체부지수 등을 분석하여 건강도를 판정하였다. 연구결과 의항에서 수평망식으로 양식한 굴은 다른 지역의 굴과 생리학적 차이를 보였다. 즉, 폐각근 내 RNA/DNA의 양 및 비가 조사기간 동안 지속적으로 감소하였고 가장 낮은 CI와 연체부지수를 보였다. 이원지역의 St. 1과 2에서 양식한 굴은 산란기 이후 빠른 회복력을 보여 RNN/DNA가 증가하였고, 연체부지수와 CI 또한 10월까지 급격히 증가한 이후 감소하는 것으로 나타났다. 신두리 지역의 굴은 연체부지수와 CI가 10월까지 급격하게 감소하였다. 그러나 이러한 건강도 판정요소와는 다르게 폐각근 내 RNA/DNA 비는 단백질의 증가 양상처럼 10월까지 지속적으로 증가하는 것으로 조사되었다. 특이한 점은 신두리와 이원의 St. 1에서는 12월까지도 부분방출기의 개체가 관찰이 되었다. 모든 결과를 종합하여 볼 때 본 연구에서 사용된 RNA/DNA 양과 비의 변화, 연체부지수, CI 등의 간단한 지표만으로도 양식 굴의 건강상태, 산란 후 회복과정에 관한 정보 취득이 가능하였다. 따라서 이와 같은 자료를 통하여 우량종패 생산을 위한 굴 어미관리가 가능하고, 또한 소비자들이 선호할 수 있는 양질의 굴 생산이 가능할 것으로 판단되므로 향후에도 다년간 연구조사가 필요할 것으로 생각된다.

환경유전자 연구를 위한 NCBI Nucleotide 데이터베이스에 등록된 국내 생물 목록 현황 (The List of Korean Organisms Registered in the NCBI Nucleotide Database for Environmental DNA Research)

  • 곽인실;지창우;김원석;공동수
    • 생태와환경
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    • 제55권4호
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    • pp.352-359
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    • 2022
  • 국내 서식하는 수서 생물(식물플랑크톤, 동물플랑크톤, 저서대형무척추동물, 어류)에 대한 eDNA 연구에 주요 이용되는 유전자인 12S rRNA와 16S rRNA, 18S rRNA, COI, CYTB를 대상으로 속(Genus) 수준의 등록 현황을 조사하였다. 그 결과 식물플랑크톤과 동물플랑크톤은 18S rRNA에서 가장 높은 등록 속 비율을 보였으며, 저서무척추동물은 COI에서 가장 높은 등록 속 비율을 확인하였다. 어류에서는 18S rRNA를 제외한 모든 유전자에서 90%에 가까운 높은 비율을 보였다. 분류군에 따른 우점 생물의 상위 20속에 대한 유전자 등록 현황은 식물플랑크톤은 18S rRNA에서 19속이, 저서무척추동물은 COI에서 18개 속이 등록되어 있었다. 어류에서는 12S rRNA, 16S rRNA, CYTB에서 상위 20의 모든 유전자 염기서열이 존재함을 확인하였다. 본 자료 분석을 통하여 각 분류군별 eDNA 연구에 적합한 유전자 데이터베이스의 양적인 정보를 파악하였다.

고려인삼이 흰쥐의 장기조직 핵산 함유량에 미치는 영향 (Effect of Ginseng on Visceral Nucleic Acid Content of Rats)

  • 김철;최현;김정진;김종규;김명석;허만경
    • The Korean Journal of Physiology
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    • 제5권1호
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    • pp.23-42
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    • 1971
  • 1. 인삼주정추출물이 흰쥐의 부신, 간, 비장 및 췌장의 핵산 함유량에 어떤 영향을 미치며, 인삼 투여를 받고 있는 동물이 스트레스(ACTH의 투여로 대신)를 받을 경우에 이들 장기 핵산 함유량에 어떠한 변동이 오는지를 알기 위하여 90마리의 흰쥐($150{\sim}200gm$) 수컷을 인삼군과 식염수군 및 정상군으로 나누고 이것을 각각 다시 둘로 쪼개어 인삼군, 인삼-ACTH군, 식염수군, 식염수-ACTH군, 정상군 및 정상-ACTH군의 여섯 작은 무리로 나누어 다음과 같은 실험을 하였다. 인삼군과 인삼-ACTH군에서는 몸무게 100gm에 대하여 인삼주정추출액(생리적 식염수 1ml속에 4mg의 인삼주정추출물이 포함된 용액)을 0.5ml의 비율로 매일 등뒤 피하에 5일동안 주사하였으며, 식염수군과 식염수-ACTH군에는 생리적 식염수를 몸무게 100gm에 대하여 0.5ml의 비율로 인삼군과 동일한 방법으로 주사하였다. 실험시작 제 5일째에 정상군과 식염수군 및 인삼군은 각각 전처치 없이 또는 인삼 혹은 식염수 주사후 2시간 만에 도살하고, 정상-ACTH군, 인삼-ACTH군 및 식염수-ACTH군은 각각 직접 또는 인삼이나 식염수를 투여한 다음 1시간 만에 ACTH를 주사하고, 그 시각부터 1시간후에 도살하여 부신, 간, 비장 및 췌장 조직의 핵산 함유량을 측정하였다. 이들 측정치를 지표로하여 인삼이 장기 핵산에 미치는 영향을 관찰한바 다음과 같은 결과를 얻었다. 1) 부신조직 RNA, DNA 및 RNA/DNA는 인삼군의 값이 정상군 및 식염수군의 그것보다 현저하게 많다. 인삼군의 값에 대한 인삼-ACTH군 값의 감소율은 정상군 및 식염수군에 대한 정상-ACTH군 및 식염수-ACTH군의 그것보다 현저하게 크다. 2) 간 조직의 RNA, DNA 및 RNA/DNA는 인삼군의 값이 정상군 및 식염수군의 값보다 현저하게 감소되었다. 인삼군 값에 대한 인삼-ACTH군 값의 감소율은 정상군 및 식염수군에 대한 정상-ACTH군 및 식염수-ACTH군의 그것 보다 적다. 3) 비장 조직의 RNA와 RNA/DNA는 인삼군의 값이 정상군의 그것 보다 현저하게 증가되며, 식염수군 보다는 감소된다. 인삼군의 DNA는 정상군에서 보다 감소되며, 식염수군의 그것 보다 증가된다. 인삼군 값에 대한 인삼-ACTH군 값의 감소율은 정상군에 대한 정상-ACTH군의 그것 보다 크며, 식염수군에 대한 식염수-ACTH군의 그것 보다는 작다. 4) 췌장 조직의 RNA와 DNA는 인삼군의 값이 정상군 및 식염수군의 그것 보다 현저하게 감소된다. 인삼군의 RNA/DNA는 정상군 및 식염수군의 그것 보다 증가된다. 인삼군에 대한 인삼-ACTH군의 RNA와 RNA/DNA 감소율은 정상군에 대한 정상-ACTH군의 그것 보다 적으나 식염수군에 대한 실염수-ACTH군의 그것 보다는 현저하게 크다. 인삼-ACTH군의 DNA는 인삼군의 그것 보다 증가되었으나, 정상-ACTH군 및 식염수-ACTH군의 DNA는 정상군 및 식염수군의 그것보다 감소되었다. 이상의 실험성적만으로 명확한 해석을 내리기는 어려우나 인삼은 장기의 RNA, DNA 및 RNA/DNA 비율에 현저한 영향을 미치는 것으로 보인다. 대체로 인삼은 부신의 RNA와 DNA 함유량 및 RNA/DNA 비율을 모두 증가시키나 다른 장기에서는 이들 값을 감소시키는 경향이 있다. 한편 인삼의 투여를 받은 동물에서는 ACTH투여후 조기에 부신 조직의 RNA, DNA 및 RNA/DNA의 감소율이 커지며, 간, 비장 및 췌장 조직의 RNA, DNA 및 RNA/DNA의 감소율은 적어지는 경향이 있다. 2. 인삼 및 ACTH의 투여에 의하여 부신, 췌장, 간 및 비장의 DNA와 RNA 함유량이 변동하는 모습을 화학적 방법으로 추적하여 얻은 전편의 성적을 형태학적 및 조직화학적 방법으로 입증할 목적으로 몸 무게 18~20gm의 마우스 수컷 40마리와 몸 무게 150~200gm의 흰쥐 수컷 20마리를 사용하여 각각 식염수군, 인삼군, 식염수-ACTH군 및 인삼-ACTH군의 4무리로 나누고 그중 마우스에서는 $^{3}H$-thymidine을 이용한 자기방사법을 써서 부신, 췌장, 비장 및 간등 4조직의 DNA 합성능을 비교 관찰하고, 흰쥐에서는 methylgreen pyronine 염색을 이용한 조직화학적 방법을 써서 위의 4조직의 RNA 함유량을 측정한 바 다음과 같은 결과를 얻었다. 1. 인삼 투여는 마우스의 부신피질과 비장 및 간의 표지 세포수를 식염수의 투여만을 받은 대조동물의 그것에 비하여 유의하게 증가시키나, 췌장에서 만은 오히려 표지 세포 수효를 감소시킨다. 그리고 인삼을 투여받은 흰쥐의 부신을 비롯하여 췌장, 비장 및 간 조직은 모두 methylgreen pyronine에 의하여 식염수군에서 보다 짙게 염색된다. 2. 식염수-ACTH군 및 인삼-ACTH군의 표지 세포수는 부신피질, 췌장, 비장 및 간 조직에서 모두 식염수군 및 인삼군에 비하여 감소되고, methylgreen pyronine으로 염색 할 경우에도 이들 조직은 식염수군 및 인삼군에 비하여 모두 묽게 염색된다. 3. 그러나 인삼-ACTH군의 표지 세포수는 부신피질, 비장, 췌장 및 간 조직에서 모두 식염수-ACTH군의 그것에 비하여 덜 감소되며, pyronine 염색에서도 4조직은 모두 식염수-ACTH군에서 보다 짙게 염색된다. 그러므로 인삼은 핵산 함유량에 현저한 영향을 미쳐 대체로 핵산의 생성을 촉진시키며, ACTH투여로 인하여 야기되는 조직 핵산 함유량의 감소를 어느 정도 억제한다.

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