• 제목/요약/키워드: Molecular-Dynamics Simulation

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Kinetic Monte Carlo Simulations for Defects Diffusion in Ion-implanted Crystalline

  • Jihyun Seo;Hwang, Ok-Chi;Ohseob Kwon;Kim, Kidong;Taeyoung Won
    • 대한전자공학회:학술대회논문집
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    • 대한전자공학회 2003년도 하계종합학술대회 논문집 II
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    • pp.731-734
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    • 2003
  • An atomistic process modeling, Kinetic Monte Carlo simulation, has the advantage of being both conceptually simple and extremely powerful. Instead of diffusion equations, it is based on the definitions of the interactions between individual atoms and defects. Those interactions can be derived either directly from molecular dynamics, first principles calculations, or from experiment. In this paper, as a simple illustration of the kinetic Monte Carlo we simulate defects (self-interstitials and vacancies) diffusion after ion implantation in Si crystalline.

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Nickel의 Embedded Atom Method 해석 (The Embedded Atom Method Analysis of the Nickel)

  • 정영관;김경훈;이근진;김종수
    • 한국정밀공학회:학술대회논문집
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    • 한국정밀공학회 1997년도 추계학술대회 논문집
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    • pp.572-575
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    • 1997
  • The embedded atom method based on density functional theory was developed as a new means for calculating ground state properties of realistic metal system by Murray S. Daw, Stephen M. Foiles and Michael I. Baskes. In the paper, we had corrected constitutive formulae and parameters on the nickel for the purpose of doing Embedded Atom Method analysis. And then we have computed the properties of the nickel on the fundamental scale of the atomic structure. In result, simulated ground state properties, such as the lattice constant, elastics constants and sublimation energy, show good agreement with Daw's simulation data and with experimental data.

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Molecular Dynamics Simulations for Transport Coefficients of Liquid Argon : New Approaches

  • Lee, Song-Hi;Park, Dong-Kue;Kang, Dae-Bok
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제24권2호
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    • pp.178-182
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    • 2003
  • The stress and the heat-flux auto-correlation functions in the Green-Kubo formulas for shear viscosity and thermal conductivity have non-decaying long-time tails. This problem can be overcome by improving the statistical accuracy by N (number of particles) times, considering the stress and the heat-flux of the system as properties of each particle. The mean square stress and the heat-flux displacements in the Einstein formulas for shear viscosity and thermal conductivity are non linear functions of time since the quantities in the mean square stress and the heat-flux displacements are not continuous under periodic boundary conditions. An alternative to these quantities is to integrate the stress and the heat-flux with respect to time, but the resulting mean square stress and heat-flux displacements are still not linear versus time. This problem can be also overcome by improving the statistical accuracy. The results for transport coefficients of liquid argon obtained are discussed.

450 mm Wafer Ashing Chamber 최적 구조 설계를 위한 유체해석 Simulation 연구

  • 김기보;김명수;이다혁;박세근
    • 한국진공학회:학술대회논문집
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    • 한국진공학회 2014년도 제46회 동계 정기학술대회 초록집
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    • pp.152-152
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    • 2014
  • 최근 반도체의 고집적화로 high dose implant 도입과 소자의 동작 특성 향상을 위한 low-k 물질 도입에 따라 다양한 주변 공정의 변화를 이끌고 있다. 이에 따라 반도체 제조의 핵심 공정 단계 중 하나인 ashing 단계에서 기존 성능 이상의 장비를 기대하고 있으며, 그것을 평가하기 위한 중요 요소로 uniformity와 fast stripping이 있다. 본 연구에서는 유체해석 시뮬레이션을 통해 450 mm ashing 챔버에서의 gas inlet baffle과 wafer stage 사이의 최적 거리를 예측했다. 우선적으로 시뮬레이션의 신뢰도를 높이기 위해 실험으로 측정한 300 mm ashing 결과와 유체해석 결과 molecular flux의 상관관계를 파악하여, 450 mm ashing 챔버의 최적 구조를 예측하였다. 선행 연구한 300 mm 시뮬레이션 결과를 바탕으로 이상적인 450 mm ashing 챔버를 설계하였다. 유체해석 결과는 동일한 형태의 수직형 구조 장비에서 baffle과 wafer stage 사이의 거리가 35 mm에서 60 mm일 때, 450 mm wafer surface 위에서 더욱 균일한 density 분포를 나타내었다. Reactant flux 분포는 거리가 60 mm에서 80 mm 사이일 경우 더 균일하게 나타났다. 그러므로, 450 mm 챔버에서 gas inlet baffle과 wafer stage 간격이 60 mm일 때 최적의 구조로 판단된다.

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DSMC Analysis of Pressure Effect on Low-Density Nozzle Flow

  • Chung, Chan-Hong;Kim, Kyung-Hoe
    • International Journal of Aeronautical and Space Sciences
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    • 제1권2호
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    • pp.1-8
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    • 2000
  • The flow in low-density plumes expanding into a region of finite pressure shows a quite different behavior from that observed in low-density plumes expanding into a vacuum. The flow structure in the plume varies depending on applied ambient and stagnation chamber conditions. In the present study, the direct simulation Monte-Carlo (DSMC) method based on molecular gas dynamics is employed in the analysis of low-density gas flows expanding through a small converging/diverging nozzle. Special attention has been paid to the effect of non-zero ambient and stagnation pressures on the flow structure which has rarely been studied using the DSMC method.

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자기조립 나노구조체의 단위체 구조 연구

  • 유영재;조영범;이민준;신석민
    • EDISON SW 활용 경진대회 논문집
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    • 제4회(2015년)
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    • pp.32-39
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    • 2015
  • 최근 펩티드를 포함한 다양한 물질들의 자기조립 (self-assembly) 나노구조체에 대한 연구들이 많이 진행되고 있다. 이는 이러한 분자들로 구성된 구조체들이 환경친화적이며, 생체 나노구조체를 묘사함을 통해 세포소기관의 기능 역시 모방할 수 있다고 기대되기 때문이다. 만약 분자 수준에서 자기조립을 형성하는 단위체를 살펴본다면 자기조립 나노 구조를 개발하는 방법에 대한 통찰을 얻을 수 있을 것이다. 본 연구에서는 최근에 Wen Li 그룹에서 개발한 쉽게 합성할 수 있는 자기조립 펩티드의 적합성을 분자 수준에서 규명하였다. 이를 위해 복제계-맞바꿈 분자 동역학 시뮬레이션 (replica exchange molecular dynamics simulation)을 통해 구조를 샘플링 (sampling)하였고, 얻어진 구조들을 평균 제곱근 편차 (root mean square deviation, RMSD)를 기준으로 클러스터링하였다. 그 결과로 매우 우세한 상대빈도를 보이는 하나의 구조를 얻었으며, 그 구조가 탄소 골격과 잔기의 배열의 측면에서 자기조립 펩티드로 사용되기에 적합함을 규명하였다.

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Kinetic Analysis of the MAPK and PI3K/Akt Signaling Pathways

  • Suresh, Babu CV;Babar, Sheikh Md. Enayetul;Song, Eun Joo;Oh, Eulsik;Yoo, Young Sook
    • Molecules and Cells
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    • 제25권3호
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    • pp.397-406
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    • 2008
  • Computational modeling of signal transduction is currently attracting much attention as it can promote the understanding of complex signal transduction mechanisms. Although several mathematical models have been used to examine signaling pathways, little attention has been given to crosstalk mechanisms. In this study, an attempt was made to develop a computational model for the pathways involving growth-factor-mediated mitogen-activated protein kinase (MAPK) and phosphatidylinositol 3'-kinase/protein kinase B (PI3K/Akt). In addition, the dynamics of the protein activities were analyzed based on a set of kinetic data. The simulation approach integrates the information on several levels and predicts systems behavior. The in-silico analysis conducted revealed that the Raf and Akt pathways act independently.

분자동역학에 기반한 멀티스케일 해석을 이용한 탄소나노튜브/고분자 복합재료의 특성 규명 (Characterization of CNT/Polymer Nanocomposites using MD-based Multiscale Method)

  • 유수영;양승화;조맹효
    • 한국전산구조공학회:학술대회논문집
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    • 한국전산구조공학회 2010년도 정기 학술대회
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    • pp.554-557
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    • 2010
  • 본 논문에서는 동일한 체적분율 가지는 탄소나노튜브 나노복합재의 기계적 특성을 규명하였다. 동일한 chirality를 가지는 서로 다른 크기의 탄소나노튜브를 이용하여 탄소나노튜브의 크기가 복합재의 물성에 미치는 영향을 규명하였다. 복합재료의 분자동역학의 결과 탄소나노튜브의 길이방향의 물성은 크게 증가하나, 전단특성의 물성 강화효과를 나타나지 않았다. 이는 통해 탄소나노튜브와 기지재료 사이의 상호작용력이 복합재료의 전단력을 전달하고, 변형을 유지할 만큼 강하지 않다는 것을 확인하였다. 이와 같은 분자동역학 결과를 바탕으로 멀티스케일 모델을 개발하여 복합재료에서 나타나는 현상을 묘사하였다. 제안된 멀티스케일 모델을 이용하여 다양한 조건의 복합재료에 대한 특성 예측이 가능하다.

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Excitation Energy Transfer Rate Constants in meso-meso Linked Zn(II) Porphyrin Arrays with Energy Accepting 5,15-Bisphenylethynylated Zn(II) Porphyrin

  • Ko, Da-Mee;Kim, Hee-Young;Park, Jin-Hee;Kim, Dong-Ho;Sim, Eun-Ji
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제26권10호
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    • pp.1505-1511
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    • 2005
  • The excitation energy transfer process occurring in energy donor-acceptor linked porphyrin array system is theoretically simulated using the on-the-fly filtered propagator path integral method. The compound consists of an energy donating meso-meso linked Zn(II) porphyrin array and an energy accepting 5,15-bisphenylethynylated Zn(II) porphyrin, in which the donor array and the acceptor are linked via a 1,4-phenylene spacer. Real-time path integral simulations provide time-evolution of the site population and the excitation energy transfer rate constants are determined. Simulations and experiments show an excellent agreement indicating that the path integration is a useful tool to investigate the energy transfer dynamics in molecular assemblies.

Growth and Dissolve of Defects in Boron Nitride Nanotube

  • Jun Ha, Lee;Won Ha, Mun
    • 한국반도체및디스플레이장비학회:학술대회논문집
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    • 한국반도체및디스플레이장비학회 2004년도 춘계학술대회 발표 논문집
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    • pp.59-62
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    • 2004
  • The defect formation energy of boron nitride (BN) nanotubes is investigated using molecular-dynamics simulation. Although the defect with tetragon-octagon pairs (4-88-4) is favored in the flat cap of BN nanotubes, BN clusters, and the growth of BN nanotubes, the formation energy of the 4-88-4 defect is significantly higher than that of the pentagon-heptagon pairs (5-77-5) defect in BN nanotubes. The 5-77-5 defect reduces the effect of the structural distortion caused by the 4-88-4 defect, in spite of homoelemental bonds. The instability of the 4-88-4 defect generates the structural transformation into BNNTs with no defect at about 1500 K.

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