• 한국균학회지
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• 제32권2호
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• pp.148-151
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• 2004

본 연구는 Phellinus linteus와 관련 담자균류 속간의 IGS I 영역의 분석에 기초한 분류체계를 정립하기 위해서 실시하였다. 실험에 사용된 Phellinus linteus 균주의 IGS I 영역은 730 bp였고 다른 담자균류의 IGS I 영역과 비교시 5' 말단부위의 $1{\sim}280\;base$까지는 각 균주들간의 보존성이 높게 나타났으며 3' 말단부위로 갈수록 보존성이 감소하다가 다시 증가하는 경향을 보였다. 담자균류의 IGS 영역에 대한 연구가 앞으로 진행된다면 ITS 영역의 비교와 더불어 새로운 계통분류지표로 이용될 수 있을 것이다.

• Journal of Microbiology
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• 제39권4호
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• pp.265-272
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• 2001

Variation within the intergenic spacer(IGS) of the ribosomal DNA gene for twenty-two strains of E. oxysporum and its formae speciales was examined by PCR, couped with RELP analysis. The length of the amplified IGS region was about 2.6 kb in all strains except F.oxysporum f. sp. cucumer-inum from Korea and F. oxysporum f. sp. niveum. Those two strains were 2.5 kb long. Restriction digestion of IGS-RELP regions by Eco RI, NruI, HincII, SAlI, SmaI, BalIi, HindIII, XhoI and KpnI gave rise to nine IGS hapoltypes among all strains. Cluster analysis based on the presence of absence of comigrating restriction reagments show the two groups based on 44% genetic similarity. These results demonstrated that analysis of IGS showed some difference within and between F. oxysporum formae speciales.

• 미생물학회지
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• 제38권1호
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• pp.7-12
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• 2002

Fusarium section Liseola에 속하는 균주들의 rDNA IGS 부위를 중폭하고 여러개의 제한 효소로 처리하였다. 증폭된 IGS 부위의 길이는 F. moniliforme 12 만이 약 2.9 Kb 이고 나머지 균주들은 모두 약 2.6 Kb였다. 제한 효소 EcoRI, HincII, SalI, PstI 등은 ICS 부위를 절단하여 11균주들에서 9 haplotypes을 확인할 수 있었다. 본 연구에서의 Section Liseola에 속하는 균주들에 대한 결과에 앞서 연구되어진 Section Elegans에 속하는 균주들의 결과를 종합하여 dendrogram을 그렸을 때, IGS 부위를 종내에서와 마찬가지로 종간, section 간의 관계를 밝힐 수 있는 가능성을 제시하여 주었다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제15권2호
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• pp.290-296
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• 2002

Serum immunoglobulins (Igs) from Israeli carp were purified using affinity chromatography. Fish were immunized with purified mouse IgG, and the specific fish antibodies were purified from the immune serum on a mouse IgG-immobilized agarose gel. Rabbit anti-Israeli carp Igs (R $\alpha$ I. carp Igs) antibodies were produced following hyperimmunization with mouse IgG specific carp antibodies. SDS-PAGE analysis under reducing condition showed that Israeli carp Igs were composed of two $\mu$-like heavy chains with about 82 and 50 kd, respectively, and one light chain with about 25 kd. On immunoblotting analysis, however, R $\alpha$ I. carp Igs failed to react with the light chain. When both protein A and protein G-purified normal carp Ig were compared with mouse IgG-specific Israeli carp Ig, no significant structural differences among them were observed. To investigate if there is any homology between other fish Ig molecules, cross-reactivity of R $\alpha$ I. carp Igs against Ig molecules from 6 different fish sera and mouse control serum was checked on immunoblotting analysis. As a result, R $\alpha$ I. carp Igs responded to Israeli carp, common carp, and tilapia Ig molecules. In flow cytometry study, however, R $\alpha$ I. carp Igs appeared to recognize 42.0%, 35.8% and <5% of Israeli carp, common carp and tilapia $Ig^+$ head kidney cells, respectively. The result suggests the heterogeneity between receptor Igs on B-like lymphocytes and soluble Igs in serum. It is crucial to obtain pure fish Igs to produce reagent antibodies as tools for the study on their specific immune responses.

• ALGAE
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• 제27권2호
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• pp.75-82
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• 2012

$Arthrospira$ $platensis$ and $Arthrospira$ $maxima$ are species of cyanobacteria used in health foods, animal feed, food additives, and fine chemicals. This study conducted a comparison of the 16S rRNA gene and $cpcBA$-intergenic spacer ($cpcBA$-IGS) sequences in $Arthrospira$ strains from culture collections around the world. A cluster analysis divided the 10 $Arthrospira$ strains into two main genotypic clusters, designated I and II, where Group I contained $A.$ $platensis$ SAG 86.79, UTEX 2340, $A.$ $maxima$ KCTC AG30054, and SAG 49.88, while Group II contained $A.$ $platensis$ PCC 9108, NIES 39, NIES 46, and SAG 257.80. However, although $A.$ $platensis$ PCC 9223 belonged to Group II-2 based on its $cpcBA$-IGS sequence, this strain also belonged to Group I based on its 16S rRNA gene sequence. Phylogenetic analyses based on the 16S rRNA gene and $cpcBA$-IGS sequences showed no division between $A.$ $platensis$ and $A.$ $maxima$, plus the 16S rRNA gene and $cpcBA$-IGS sequence clusters did not indicate any well-defined geographical distribution, instead overlapping in a rather interesting way. Therefore, the current study supports some previous conclusions based on 16S rRNA gene and $cpcBA$-IGS sequences, which found that $Arthrospira$ taxa are monophyletic. However, when compared with 16S rRNA sequences, $cpcBA$-IGS sequences may be better suited to resolve close relationships and intraspecies variability.

• Mycobiology
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• 제43권1호
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• pp.81-86
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• 2015

To promote the selection of promising monokaryotic strains of button mushroom (Agaricus bisporus) during breeding, 61 progeny strains derived from basidiospores of two different lines of dikaryotic parental strains, ASI1038 and ASI1346, were analyzed by nucleotide sequencing of the intergenic spacer I (IGS I) region in their rDNA and by extracellular enzyme assays. Nineteen different sizes of IGS I, which ranged from 1,301 to 1,348 bp, were present among twenty ASI1346-derived progeny strains, while 15 different sizes of IGS I, which ranged from 700 to 1,347 bp, were present among twenty ASI1038-derived progeny strains. Phylogenetic analysis of the IGS sequences revealed that different clades were present in both the ASI10388- and ASI1346-derived progeny strains. Plating assays of seven kinds of extracellular enzymes (${\beta}$-glucosidase, avicelase, CM-cellulase, amylase, pectinase, xylanase, and protease) also revealed apparent variation in the ability to produce extracellular enzymes among the 40 tested progeny strains from both parental A. bisporus strains. Overall, this study demonstrates that characterization of IGS I regions and extracellular enzymes is useful for the assessment of the substrate-degrading ability and heterogenicity of A. bisporus monokaryotic strains.

• 식물병연구
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• 제17권1호
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• pp.99-101
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• 2011

자낭균인 Taphrina wiesneri는 한국의 공원과 가로수에 주로 식재되는 왕벚나무에 빗자루병을 일으키는 병원균이다. 한국과 일본에서 분리한 13개의 병원균에 대해 18S rDNA 염기서열 분석을 통한 계통학적 분석과 rDNA-IGS 영역에 대한 RFLP 분석을 실시하였다. 18S rDNA 염기서열 분석을 통한 계통도 분석결과 병원균은 2그룹으로 분류되었다. Hha I 제한효소를 이용한 rDNA-IGS 영역에 대한 RFLP 분석결과 B, C, D, G 4개의 패턴으로 나타났으며, 그중 G 패턴은 새로운 패턴이었다.

• 한국진공학회:학술대회논문집
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• 한국진공학회 2011년도 제40회 동계학술대회 초록집
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• pp.368-368
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• 2011

최근에 보고된 양질의 고효율Cu(In,Ga)Se2 (CIGS) 태양전지는 CIGS광흡수층이 강한 (220:204) 우선배향성을 갖는 것으로 알려져 있다 [1]. 이러한 CIGS우선배향성은 Se 증착압력, Na농도, 기판온도 및 Mo후면전극의 표면상태에 영향을 받는 것으로 알려져 있지만 정확한 상호관계는 아직 명확히 알려져 있지 않으며, 특히 Mo후면전극의 영향에 대해서는 체계적인 연구결과조차 극히 드문 상황이다 [2]. 본 연구에서는 CIGS 박막의 우선배향성에 대해 Mo후면전극의 미세구조가 미치는 영향 및 이에 따른 cell특성의 변화에 대해서 연구하였다. Mo후면전극의 미세구조는 2 mTorr~16 mTorr까지 증착압력을 변화시켜 제어되었고, CIGS광흡수층은 이렇게 준비된 Mo후면전극상에 3단계 동시증밥법(3-stage process)을 사용하여 형성하였다. XRD를 통한 박막의 우선배향성 평가에서, Mo 증착압력에 대한 IGS I(300)/I(006) 및 CIGS I(220:204)/I(112)의 거동은 Mo 미세구조와 밀접한 관련이 있는 잔류응력(residual stress)의 변화 거동과 상당히 일치함을 보였다. 이에 반해, 높은 압력의 Mo위에 형성된 강한 (220:204) 우선배향성의 CIGS와 bare-glass위에서 형성된 강한 (112) 우선배향성의 CIGS내 Na농도는 서로 유사하였다. 상기의 결과는 Mo미세구조 그 자체가 CIGS 박막 우선배향성의 원인이 됨을 나타낸다. Selenized Mo시편의 XRD분석 및 IGS/Mo 시편의 TEM분석결과을 통해 MoSe2의 반응성이 잔류응력과 비례하는 Mo in-gain 밀도에 의존하는 함을 알 수 있었고, 이러한 MoSe2반응성(reactivity)과 IGS우선배향성 사이에 상당히 밀접한 관련이 있으며 이에 CIGS의 우선배향성이 결정됨을 확인하였다. 마지막으로, Mo변수에 의해 제작된 cell의 특성분석으로부터 cell의 효율이 주로 VOC의 증가에 기인하여 CIGS (220:204) 우선배향성의 정도에 비례하였다.

• 한국항행학회논문지
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• 제26권2호
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• pp.119-124
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• 2022

IGS (international gnss service)에서는 GNSS (global navigation satellite system) 위성의 항법메시지에 적용할 수 있는 RTS (real-time service) 궤도 및 시계 보정정보를 제공한다. 하지만, 인터넷 단절이 발생하면 RTS 값을 수신할 수 없으므로, 안정적인 PPP (precise point positioning)를 수행하기 위해 신호 단절이 발생한 경우 RTS 보정정보를 예측해서 사용해야 한다. 본 논문에서는 실시간으로 신호 단절 구간에서 LSTM (long short-term memory) 알고리듬으로 궤도 및 시계 보정정보를 예측하여 PPP를 진행하였다. 연산 처리 속도가 빠르지 않은 Raspberry Pi (RPI)에 LSTM 알고리듬을 구현하여 예측성능을 분석하였다. 다항식 예측기법과 비교하여 LSTM은 장기간 예측에서 우수한 성능을 보였다.

• 한국버섯학회지
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• 제12권3호
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• pp.145-153
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• 2014

Pleurotus has increased rapidly production and consumption because of highly nutritional value, natural healthy food and so on. The basic studies for Pleurotus need for development of mushroom industry. This study was to investigate the cultural characteristics among 15 strains of 6 species and to analyze their phylogenetic relationships. The cultural characteristics were investigated by mycelial growth activity at different media, temperature and pH. The optimum media for mycelial growth were YM and MCM in most species. The optimum temperature for mycelial growth were $25^{\circ}C$ and $30^{\circ}C$. The optimum pH for mycelial growth were widly range from pH 5.1 to 7.4. Through the RFLP (restriction fragment length polymorphism) of IGS (intergenic spacer) I region in ribosomal DNA, it was analyzed phylogeny of interspecies and intraspecies. Each species was discriminated well as isolates within each species formed clade to be distinguished other species. P. florida was highly similar to P. floridanus, and P. flabellatus was P. cornucopiae. P. fuscus var. ferulae was highly similar to P. eryngii but discriminated different species in analysis of RFLP of IGS I region and showed different characteristics in mycelial culture. RFLP of IGS I region was useful of studying phylogenetic relationships of species and population.