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Phylogenetic Analysis of Nuclear Ribosomal DNA Intergenic Spacer (IGS) I Region of Phellinus linteus

Nuclear Ribosomal DNA Intergenic Spacer(IGS) I 영역의 분석에 의한 목질진흙버섯의 계통분류학적 위치

  • Rew, Young-Hyun (Dept. of Agricultural Environment, Kyungbuk Agricultural Technology Administration) ;
  • Lee, Jin-Hyung (Dept. of microbiology, KyungPook National University) ;
  • Kim, Jong-Guk (Dept. of microbiology, KyungPook National University)
  • 류영현 (경상북도농업기술원 농업환경연구과) ;
  • 이진형 (경북대학교 미생물학과) ;
  • 김종국 (경북대학교 미생물학과)
  • Published : 2004.12.30
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Abstract

This study was carried out to elucidate phylogenetic relationship of a yellow lump, Phellinus linteus by comparing the nuclear ribosomal intergenic spacer (IGS) I region with that of other genera of basidiomycetes retrieved from Genbank. IGS I region of Phellinus linteus was 730 bp long and sequence homology was conserved in the 5' region, in particular $1{\sim}280\;bp$, and decreased in the direction toward the 3' end. ITS region was widely studied in phylogenies related to basidiomycetes, but IGS region was not well understood yet. Our study indicated that IGS region can be a good tool in phylogenetic study of basidiomycetes.

본 연구는 Phellinus linteus와 관련 담자균류 속간의 IGS I 영역의 분석에 기초한 분류체계를 정립하기 위해서 실시하였다. 실험에 사용된 Phellinus linteus 균주의 IGS I 영역은 730 bp였고 다른 담자균류의 IGS I 영역과 비교시 5' 말단부위의 $1{\sim}280\;base$까지는 각 균주들간의 보존성이 높게 나타났으며 3' 말단부위로 갈수록 보존성이 감소하다가 다시 증가하는 경향을 보였다. 담자균류의 IGS 영역에 대한 연구가 앞으로 진행된다면 ITS 영역의 비교와 더불어 새로운 계통분류지표로 이용될 수 있을 것이다.

Keywords

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