Genetic variation in the human genome occurs on various levels; from the single nucleotide polymorphism to large, microscopically visible chromosome anomalies. It can be present in many forms, including variable number of tandem repeat (VNTRs; e.g., mini- and microsatellites), presence/absence of transposable elements (e.g., Alu elements), single nucleotide polymorphisms, and structural alterations (e.g., copy number variation, segmental duplication, inversion, translocation). Until recently SNPs were thought to be the main source of genetic and phenotypic human variation. However, the use of methods such as array comparative genomic hybridization (array CGH) and fluorescence in situ hybridization (FISH) have revealed the presence of copy number variations(CNVs) ranging from kilobases (kb) to megabases (Mb) in the human genome. There is great interest in the possibility that CNVs playa role in the etiology of common disease such as HIV-1/AIDS, diabetes, autoimmune disease, heart disease and cancer. The discovery of widespread copy number variation in human provides insights into genetic variability among populations and provides a foundation for studies of the contribution of CNVs to evolution and disease.
Objective : It has long been known about the osteogenic effect of CTF-HAS on bone tissues. However, it has not been determined the effect of CTF-HAS on cancer cells. The purpose of this study is to screen the CTF-HAS mediated differentially expressed genes in cancer cells such as HepG2 hepatoma cells lines. Oligonucleotide microarray approach were employed to screen the differential expression genes. Methods : CTF-HAS was prepared by boiling and stored at $-70^{\circ}C$ until use. Cells were treated with various concentrations of CTF-HAS(0.1, 0.5, 1.5, 10, $20mg/m{\ell}$) for 24 h. Cytotoxicity was tested by MTT assay. To screen the differentially expressed genes in cancer cells, cells were treated with $1.5mg/m{\ell}$ of CTF-HAS. For oligonucleotide microarray assay, total RNA was used for gene expression analysis using oligonucleotide genechip (Human genome U133 Plus 2.0., Affimatrix Co.). ResuIts : It has no cytotoxic effects on HepG2 cells in all concentrations (0.1, 0.5, 1.5, 10, $20mg/m{\ell}$). More than twofold up-regulated genes were 19 genes. The number of more than twofold down-regulated genes was 13. Discussion : This study showed the screening of CTF-HAS mediated differentially regulated genes using combined approaches of oligonucleotide microarray. The screened genes will be used for the better understanding in therapeutic effect of CTF-HAS on cancer field.
Licochalcone (LC), isolated from the roots of Glycyrrhiza inflata has multiple pharmacological effects including anti-inflammatory and anti-tumor activities. To date, Licochalcone C (LCC) has induced apoptosis and inhibited cell proliferation in oral and bladder cancer cells, but lung cancer has not yet been studied. In addition, no study reported LCC-induced autophagy in cancer until now. The present study was designed to investigate the effect of LCC on gefitinib-sensitive and -resistant lung cancer cells and elucidate the mechanism of its action. The 3-(4,5-Dimethyl-2-thiazolyl)-2,5-diphenyl-2H-tetrazolium bromide assay data showed that LCC significantly inhibited cell viability in non-small cell lung cancer (NSCLC) HCC827 (gefitinib-sensitive) and HCC827GR (gefitinib-resistant) cell lines. Interestingly, Annexin V/7-aminoactinomycin D double staining and cell cycle analysis showed an apoptosis rate within about 20% at the highest concentration of LCC. LCC induced G2/M arrest by reducing the expression of the cell cycle G2/M related proteins cyclin B1 and cdc2 in NSCLC cell lines. Treatment of LCC also induced autophagy by increasing the expression of the autophagy marker protein microtubule-associated protein 1 light chain 3 (LC3) and the protein autophagy-related gene 5 involved in the autophagy process. In addition, LCC increased the production of reactive oxygen species (ROS), and the cell viability was partially restored by treatment with the ROS inhibitor N-acetyl-L-cysteine. In western blotting analysis, the expression of cdc2 was increased and LC3 was decreased by the simultaneous treatment of NAC and LCC. These results indicate that LCC may contribute to anti-tumor effects by inducing ROS-dependent G2/M arrest and autophagy in NSCLC. In conclusion, LCC treatment may be useful as a potential therapeutic agent against NSCLC.
Lee, Yeo Jin;Son, Young Min;Gu, Min Jeong;Song, Ki-Duk;Park, Sung-Moo;Song, Hyo Jin;Kang, Jae Sung;Woo, Jong Soo;Jung, Jee Hyung;Yang, Deok-Chun;Han, Seung Hyun;Yun, Cheol-Heui
Journal of Ginseng Research
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v.39
no.1
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pp.29-37
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2015
Background: Panax ginseng (i.e., ginseng) root is extensively used in traditional oriental medicine. It is a modern pharmaceutical reagent for preventing various human diseases such as cancer. Ginsenosidesd-the major active components of ginsengd-exhibit immunomodulatory effects. However, the mechanism and function underlying such effects are not fully elucidated, especially in human monocytes and dendritic cells (DCs). Methods: We investigated the immunomodulatory effect of ginsenosides from Panax ginseng root on $CD14^+$ monocytes purified from human adult peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) and on their differentiation into DCs that affect $CD4^+$ T cell activity. Results: After treatment with ginsenoside fractions, monocyte levels of tumor necrosis factor (TNF)-${\alpha}$, interleukin (IL)-6, and IL-10 increased through phosphorylation of extracellular signal-regulated kinase (ERK)1/2 and c-Jun N-terminal kinase (JNK), but not p38 mitogen-activated protein kinase (MAPK). After treatment with ginsenoside fractions, TNF-${\alpha}$ production and phosphorylation of ERK1/2 and JNK decreased in lipopolysaccharide (LPS)-sensitized monocytes.We confirmed that DCs derived from $CD14^+$ monocytes in the presence of ginsenoside fractions (Gin-DCs) contained decreased levels of the costimulatory molecules CD80 and CD86. The expression of these costimulatory molecules decreased in LPS-treated DCs exposed to ginsenoside fractions, compared to their expression in LPS-treated DCs in the absence of ginsenoside fractions. Furthermore, LPS-treated Gin-DCs could not induce proliferation and interferon gamma (IFN-${\gamma}$) production by $CD4^+$ T cells with the coculture of Gin-DCs with $CD4^+$ T cells. Conclusion: These results suggest that ginsenoside fractions from the ginseng root suppress cytokine production and maturation of LPS-treated DCs and downregulate $CD4^+$ T cells.
No, Hun-Jeong;Jeon, Byeong-Hun;Mun, Gu;Mun, Seok-Jae
THE JOURNAL OF KOREAN ORIENTAL ONCOLOGY
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v.2
no.1
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pp.43-56
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1996
The sprig of Sojekbojungwhan(消積保中丸) has been used for curing as a traditional medicine without any experimental evidence to support the rational basis for their clinical use. This experiment was carried out to evaluate the possible therapeutic or antitumoral effects of Sojekbojungwhan extract against cancer, and to study some mechanisms responsible for its effect. The cytotoxic and antitumor effects were evaluated on human cell lines(A549, hep3B, Caki-1, Sarcoma 180) after esposure to Sojekbojungwhan extract using in ILS, colony forming efficiency and SRB assay which were regarded as a valuable method for cytotoxic and antitumor effects of unknown compound on tumor cell lines. The results obtained in this studies were as follows. 1. As a result of exposure to Sojekbojungwhan extract, the proliferation of A549, hep3B, Caki-1, good correlations were shown from the results of SRB assay and those of clogenetic assay. 2. The oral administration of Sojekbojungwhan extact showed significant effects of increase of MST(mean survival time) and ILS(increased life span) depending on the increasing concentration. 3. Against squamous cell carcinoma induced by MCA, Sojekbojungwhan decreased not only the frequency of tumor production but also the number and weight of tumors per tumor bearing mice(TBM). Sojekbojungwhan also significantly suppressed the development of 3LL cell-implanted tumors by frequency and their size, and some developed tumors were regressed by the continuous treatment of Sojekbojungwhan extract into TBM. 4. Sojekbojungwhan extract also increased NK cell activities. According to the above results, it could be suggested that Sojekbojungwhan extract has some antitumor effects.
Kim, Kil-Sub;Hwang, Young-Guen;Yoon, Cheol-Ho;Seo, Un-Kyo;Kim, Jong-Dae;Jeong, Ji-Cheon;Nam, Kyung-Soo;Kang, Jeong-Jun
The Journal of Internal Korean Medicine
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v.20
no.1
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pp.133-142
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1999
To clarifiy the effects of Scolopendrae corpus(S-C) on turmor promotion in two-stage carcinogenesis in mice was investigated. In vivo system, S-C were seen to gave an inhibitory activity on TPA-induced mouse ear edema. In addition, the S-C were proved to have antitumor-promoting activity in two-stage mouse skin carcinogenesis induced by DMBA and two-stage mouse lung carcinogenesis induced by 4-NQO as a initiator plus TPA and glycerol as a promoter. Moreover, S-C significantly exhibited an cytolytic effect in $HepG_2$ cells and showed significant antitumor activity against Sarcoma-180 bearing mice by oral administration. These results suggest that S-C could be effective in adjuvant chemotherapy for human cancer.
Long interspersed element-1 (LINE-1 or L1) is an autonomous retrotransposon, which is capable of inserting into a new region of genome. Previous studies have reported that these elements lead to genomic variations and altered functions by affecting gene expression and genetic networks. Mounting evidence strongly indicates that genetic diseases or various cancers can occur as a result of retrotransposition events that involve L1s. Therefore, the development of methodologies to study the structural variations and interpersonal insertion polymorphisms by L1 element-associated changes in an individual genome is invaluable. In this study, we applied a systematic approach to identify human-specific L1s (i.e., L1Hs) through the bioinformatics analysis of high-throughput next-generation sequencing data. We identified 525 candidates that could be inferred to carry non-reference L1Hs in a Korean individual genome (KPGP9). Among them, we randomly selected 40 candidates and validated that approximately 92.5% of non-reference L1Hs were inserted into a KPGP9 genome. In addition, unlike conventional methods, our relatively simple and expedited approach was highly reproducible in confirming the L1 insertions. Taken together, our findings strongly support that the identification of non-reference L1Hs by our novel target enrichment method demonstrates its future application to genomic variation studies on the risk of cancer and genetic disorders.
Journal of Physiology & Pathology in Korean Medicine
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v.32
no.4
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pp.261-270
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2018
The aim of this study was to evaluate the antitumor activities of Typhae pollen (TP) by confirming in vitro cytotoxicity and in vivo anti-tumor and immune-modulatory effect with anti-cachexia effect. The MTT assay is used in HepG2 cell to detect potential cytotoxic activities of aqueous extract of Typhae pollen (TPe). After HepG2 tumor cell implantation, eight mice per groups were assigned to six groups. Three different dosages of TPe (500, 250 and 125 mg/kg) were orally administered in the amount of $10m{\ell}/kg$ and sorafenib also administered 20mg/kg, every day for 35 days from 28 days after the tumor cell implantation. We observed the changes on body weights, tumor volume and weights, lymphatic organ, serum interferon $(IFN)-{\gamma}$ levels, splenocytes and peritoneal NK cell activity, splenic tumor necrosis factor $(TNF)-{\alpha}$, interleukin $(IL)-1{\beta}$, IL-10 contents. Periovarian fat weights, serum IL-6 levels, thicknesses of deposited periovarian adipose tissue and mean diameters were also detected to monitor the tumor-related anticachexic effects. In tumor masses, the immunoreactivities of cleaved caspase-3 and cleaved poly (ADP-ribose) polymerase (cleaved PARP) - apoptotic marks, cyclooxygenase-2 (COX-2), inducible nitric oxide synthases (iNOS) and tumor necrosis factor $(TNF)-{\alpha}$ were additionally observed by immunohistochemistry. The results were compared with sorafenib. Decreases of COX-2 were demonstrated in sorafenib and TPe treated mice and also increases of iNOS in tumor masses were observed in TPe, not in sorafenib. TPe increased periovarian fat pad weights compared with tumor-bearing controls and sorafenib treated mice. TPe showed increases of splenic $TNF-{\alpha}$, IL-10 and $IL-1{\beta}$, serum $IFN-{\gamma}$ and NK cell activities corresponding to increases of spleen weights, lymph node weights and non-atrophic changes of lymph nodes. Our results show oral treatment of TPe 500, 250 and 125 mg/kg has potent in vitro and in vivo antitumor activities through modest cytotoxic effects, immunomodulatory effects and apoptotic activities in HepG2 tumor cells. In addition, TPe can prevent cancer related cachexia.
Hwang, Jin Ki;Kim, Jeong Mi;Kim, Mi Seong;Kim, Ha Rim;Park, Yeon Ju;You, Yong Ouk;Kwon, Kang Beom;Lee, Young Rae
Journal of Physiology & Pathology in Korean Medicine
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v.27
no.6
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pp.782-788
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2013
Chrysanthemum zawadskii Herbich var. latilobum Kitamura (Compositae), colloquially known "Gujulcho" in Korea, has been used in traditional medicine for the treatment of various diseases, including cough, common cold, bladder-related disorders, gastroenteric disorders, hypertension, and inflammatory diseases, such as pneumonia, bronchitis, pharyngitis, and rheumatoid arthritis (RA) However, the effect of Chrysanthemum zawadskii var. latilobum on breast cancer invasion is unknown. In this study, we investigated the inhibitory effect of Chrysanthemum zawadskii var. latilobum extract (CZE) on 12-O-tetradecanoylphorbol-13-acetate (TPA)-induced matrix metalloproteinase-9 (MMP-9) expression and cell invasion, as well as the molecular mechanisms involved in MCF-7 cells. CZE were not cytotoxic up to 100 ${\mu}g/ml$ concentration in the MCF-7 cell line. CZE decreased MMP-9 expression. TPA substantially increased NF-${\kappa}B$ DNA binding activity. Pre-treatment with CZE inhibited TPA-stimulated NF-${\kappa}B$ binding activity and NF-${\kappa}B$ related protein expression. To identify invasion ability of MCF-7 cells decreased by CZE, we used martrigel invasion assay. As a result, it is significantly decreased cell invasion. These results indicate that CZE-mediated inhibition of TPA-induced MMP-9 expression and cell invasion involves the suppression of the NF-${\kappa}B$ pathway in MCF-7 cells. Chrysanthemum zawadskii var. latilobum may have potential value in restricting breast cancer metastasis.
Hwang-Bo, Hyun;Kwon, Da Hye;Kim, Min Young;Ji, Seon Yeong;Choi, Eun Ok;Kim, Sung Ok;Jeong, Ji-Suk;Hong, Su Hyun;Choi, Sung Hyun;Park, Cheol;Choi, Yung Hyun
Journal of Life Science
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v.29
no.1
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pp.112-117
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2019
Herbal medicines are widely used as therapeutic products in many countries. Corni fructus (CF), the dried ripe sarcocarp of Cornus officinalis Sieb. et Zucc (Cornaceae), has been used for thousands of years in traditional medicine and has been reported to be effective for the prevention and treatment of various diseases, such as kidney diseases and diabetes. Recent research on CF has documented a wide spectrum of therapeutic properties, which include anti-inflammatory, ant-oxidative, immunomodulatory, and anti-cancer effects. However, there is no information on its safety. Therefore, in this study, the toxicity of water extract of CF to ICR mice was investigated. The mice received a single dose of water extract of CF (1,000, 2,000, and 5,000 mg/kg of body weight) via the oral route. Mortality, clinical signs, body weight changes, gross findings, and weights of the principal organs after 14 d were then assessed. The results revealed no adverse effects of CF as determined by clinical signs, body weights, or organ weights and no gross pathological findings in any of the treatment groups. These results suggest that the 50% lethal dose and approximated lethal dose of CF extract is over 5,000 mg/kg. The findings provide scientific evidence for the safety of CFs.
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