The reaction mechanism of the pyrolysis of sulphonyl oximes ($CH_3-C_6H_4-S(O)_2O-N=C(H)-C_6H_4Y$), in the gas phase is studied theoretically at HF/3-21G, ONIOM (B3LYP/6-31G**:HF/3-21G) and ONIOM (MP2/6- 31G**:HF/3-21G) levels. All the calculations show that the thermal decomposition of sulphonyl oximes is a concerted asynchronous process via a six-membered cyclic transition state. The activation energies (Ea) predicted by ONIOM (B3LYP/6-31G**: HF/3-21G) method are in good agreement with the experimental results for a series of tosyl arenecarboxaldoximes. Five para substituents, Y = $OCH_3$, $CH_3$, H, Cl, and $NO_2$, are employed to investigate the substituent effect on the elimination reaction. Linear Hammett correlations are obtained in all calculations in contrast to the experimental finding.
$6-31+G^{\ast}^{\ast}와\;6-311+G^{\ast}^{\ast}$의 기본조를 사용해서 이합체 분자착물 FH…FH, FH…CO, FH…OC 뿐만 아니라 $(HF)_2(CO)$의 형성가능한 두가지 삼합체 분자착물들에 대해서 HF-SCF, MP2 그리고 B3LYP 계산을 수행했다. 이 삼합체 분자착물들에 대한 여러 가지 바닥상태 성질들을 구하였으며, 대응하는 단위체들과 이합체들의 성질들과 비교하였다. FH…CO가 FH…OC에 비해 평균 0.85 kcal/mol 만큼 안정했고, F-H…F-H…C≡O가 F-H…F-H…O≡C 보다 1∼2 kcal/mol 만큼 안정한 것으로 계산되었다. 삼합체 분자착물 형성에 따른 C≡O stretching band 는 그들의 이합체들(FH…CO, FH…OC)에 비해 각각 24, $37\;cm^{-1}$만큼, H-F stretching band는 각각 $54, 353\; cm^{-1}$만큼 red shift 되는 것으로 평가되었다.
13C, 15N, and 29Si NMR chemical shifts have been computed for selected X-substituted silatranes (X=Cl, F, H, CH3) using Gauge-Including Atomic Orbitals (GIAO) and Continuous Set of Gauge Transformations (CSGT) at the Hartree-Fock level of theory. The isotropic 13C chemical shifts are largely insensitive to substituent-induced structural changes. In this study, the isotropic 13C chemical shifts GIAO and CSGT calculations at the HF/6-31G and HF/6-31G* levels are sufficiently accurate to aid in experimental peak assignments. The isotropic 13C chemical shifts X-substituted silatranes at HF/6-31G* level are approximately 4 ppm different from the experimental values. In contrast, the isotropic 15N and 29Si chemical shifts and the chemical shielding tensors are quite sensitive to substituent-induced structural changes. These trends are consistent with those of the experiment. The 15N chemical shift parameters demonstrate a very clear correlation with Si-N distance, especially when we use the polarization function. Changes in anisotropy, 3a as well as in the 15N isotropic chemical shifts are due primarily to changes in the value of a.. But in case of "Si the correlations are not as clean as for the 15N chemical shift.
The barrier heights of the internal rotations for ethyl halides calculated by ab initio methods differ from those of experiments by more than 0.2 kcal/mol. The use of basis sets larger than the $6-31G^{\ast}$ set and the inclusion of correlation do not improve the agreement between the calculated and experimental values. The zero-point vibration corrections are substantial in the HF calculations with $6-31G^{\ast}$ basis sets, but become negligible in the MP2 calculations with $6-311G^{{\ast}{\ast}}$ basis sets for $C_2H_5F\;and\;C_2H_5Cl$. It is shown that the rigid rotor approximation and the assumed shape of the potential curve as a cos2${\theta}$ curve could also be the sources of discrepancies between calculated and experimental values. Higher order perturbation corrections narrow the gap between experimental and theoretical values, but there still remains about 10% overestimate of 0.3 kcal/mol. Optimized geometries from the HF and MP2 calculations are in good agreement with those from experiments. Dipole moments calculated from the MP2 densities show slightly better agreement with experiments than those from the HF densities.
ab initio 방법을 이용하여 hexahydroxbenzene triscarbonate($C_9O_9$)와 이와 유사한 화합물($C_9O_9,C_9O_6S_3,C_9O_3S_9$)들의 평형구조(equilibrium geometry)와 에너지를 HF와 MP2 level에서 구하였다. 계산결과 이들 화합물은 모드 $C_{3v}$ bowl형 구조보다는 $D_{3h}$ 평면형구조가 더 안정함을 알 수 있었다. $HF/3-21G^*$ level에서 조화진동수(harmonic vibrational frequency)를 계산하였고 각각의 진동방식(vibrational mode)을 비교, 분석하였으며, $HF/63G^*$ level에서 구한 Mulliken population과 natural population을 이용하여 화합물들의 결합특성에 대하여 연구하였다. 또한 이들 화합물들의 열분해 의해서 생성되는 $C_6O_6$과 $C_6S_6$의 전자구조와 결합특성에 대한 연구를 HF와 MP2 level에서 하였다. 그리고 화합물들이 열분해하여 $C_6O_6,\;C_6S_6$, CO, 그리고 CS로 분리될 때의 필요한 에너지를 $HF/3-21G^*$ level에서 계산하여 열분해에 필요한 대략적인 에너지 장벽을 예상하여 보았다.
Electrophilic substitutions on β-position of 2,5-dimethyl pyrrole have been investigated theoretically. The electron donating methyl groups enrich electron densities on C-3, C-4 positions and π* interactions with methyl groups substituted on C-2 and C-5 positions pushed up the HOMO level of the pyrroles consequently induce rapid substitutions on C-3, C-4 sites. Substitution of phenylsulfonyl group on nitrogen stabilized LUMO levels through weak π bonding interactions. Unexpected deoxidation reaction underwent on the sulfonyl group substituted at C-3 position. The structures were solved by X-ray crystallography. Meanwhile, gas phase HF/6-31G* and density functional method (B3LYP/6-31G*) calculations gave favorable energies for 1-phenylsulfinyl pyrrole (6) over 3-phenylsulfinyl pyrrole (5) by 3.6-4.7 kcal/mol which is contrary to the experimental result. However the methods involve the effects of molecular polarizability and solvent, molecular dynamics (MD) and ab-initio self consistent reaction field (SCRF) calculations showed same trend as experiments. According to MD calculations, compound 5 is more stable than compound 6 by 4.15 kcal/mol and the SCRF, HF/6-31G* calculations gave more stable energy value for structure 5 than 6 by 0.03 kcal/mol.
The structures and complexation energies of penta-O-tert-butyl ester 1 of p-tert-butylcalix[5]arene toward a series of alkyl ammonium guests have been optimized by ab initio HF/6-31G method. The calculated complexation efficiencies of 1 for alkyl ammonium guests have been found to be similar to the values of previously reported debutylated-calix[5]arene 2. Calculation results show that both of the calix[5]aryl derivatives have much better complexation ability toward ammonium cation without alkyl group over other alkyl ammonium guests. The structural characteristics of the calculated complexes are discussed as a function of the nature of the alkyl substituents of the ammonium guests.
Isomers based on the RS and EZ geometrical isomerism of the neutral, deprotonated species of HMPAO and their complexes with zinc(Ⅱ) ion have been investigated by semiempirical AM1 optimization method. The Hartree-Fock energies on AM1 geometries o f HMPAO species were calculated with HF/6-31G* methods. Twenty-two isomers of the neutral and twenty isomers of the deprotonated species of HMPAO have been found. The presence of four EE-series isomers of both zinc(Ⅱ) complexes with the neutral and deprotonated HMPAO have been expected and the SREE typical isomer of both types of complexes is the most stable isomer. Energies of complexation of zinc(Ⅱ)/HMPAO isomers with AM1 geometries were calculated by HF/ 6-31G*method. Due to the complexations with zinc(Ⅱ), the structural reorganizations of some isomers of the neutral HMPAO have been occurred. The optimized geometrical parameters of the related conformations have been discussed in terms of their stabilities and existences.
The compound 3-(2-Mercaptopyridine)phthalonitrile has been synthesized and characterized by IR, UV-vis, and X-ray single-crystal determination. The molecular geometry from X-ray determination of the title compound in the ground state has been compared using the Hartree-Fock (HF) and density functional theory (DFT) with the 6-31G(d) basis set. The calculated results show that the DFT and HF can well reproduce the structure of the title compound. The energetic behavior of the title compound in solvent media was examined using the B3LYP method with the 6-31G(d) basis set by applying the Onsager and polarizable continuum model. Using the TD-DFT and TD-HF methods, electronic absorption spectra of the title compound have been predicted and good agreement with the TD-DFT method and the experimental determination was found. The predicted nonlinear optical properties of the title compound are much greater than those of urea. Besides, molecular electrostatic potential of the title compound were investigated by theoretical calculations. The thermodynamic properties of the compound at different temperatures have been calculated and corresponding relations between the properties and temperature have also been obtained.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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