Proceedings of the Korean Institute of Information and Commucation Sciences Conference
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2008.05a
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pp.776-779
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2008
It is expect that Microarray technique be direct classification and diagnosis of Genetic data have abnomal data value because DNA technique. It is necessary that many noses that is abnomal data in sampling genetic data. So in this paper reported sampling method in exiting study then suggests new data classific system and modeling method using EP by Matlab about three dataset.
내분비계 장애물질 중 에스트로겐성 특성을 지닌 것으로 알려진 bisphenol A에 폭로되었을 때에 나타나는 이상 증상과 selenoprotein N 결핍 증상은 유사성이 있는 것으로 관찰되었다. 이에 본 연구에서는 bisphenol A에 폭로된 생물체의 selenoprotein N 유전자 발현에 영향을 미치는지에 관해 연구하였다. 실험동물은 zebrafish (Danio rerio, wild type)의 수정란을 사용하였다. Zebrafish의 수정란은 서로 다른 농도의 bisphenol A (0.1, 1, 10 ppm)에 노출하였다. 각각의 폭로 환경에서 부화된 치어를 시료로 selenoprotein N 유전자 발현을 RT-PCR방법에 의해 알아보았다. 그 결과, bisphenol A는 척추이상과 심장이상이 나타나 selenoprotein N 이상시 나타나는 현상과 유사성을 보였다. Selenoprotein N 유전자 발현은 bisphenol A 폭로 농도가 높아짐에 따라 유전자 발현 농도가 낮아지는 것으로 관찰되었다. 특히 1 ppm 농도에서는 대조군이나 0.1 ppm 농도보다 catalase의 활성이 높게 나타나 특정 농도에서 bisphenol A에 의한 영향이 나타나는 것을 알 수 있었다.
이제까지 벌견된 SKI 유전자는 SKI2, SKI3, SKI4, SKI6, SKI7, SKI8의 5가지로서 이 중 SKI8만이 cloning된 상태이다. 본연구에서는 SKI3 유전자를 cloning한 후 이 유전자의 염기서열 분석을 통해 SKI3 유전자가 coding하는 단백질의 구조를 밝히고 SKI3 유전자의 killer효모 내에서의 분자생물학적 기능을 밝히고자 하였다.
고혈압에서 지질대사 이상은 빈번히 나타나는 현상으로, 지질대사 이상에 관여하는 유전자들은 고혈압의 발병원인을 규명하기 위한 후보 유전자로 인식되어 왔다. 이에 본 연구에서는 paraoxonase 2(PON2) 유전자에 존재하는 Cys311Ser다형성을 유전자 표지로 이용하여 한국인 집단에서 이 유전자 표지가 고혈압과 관련성이 있는 지를 조사하고자 하였다. 연구 대상은 총 195명으로, 이들 중에서 82명은 고혈압 환자 군이었고, 나머지 113명은 정상 혈압 군이었다. PON2 유전자의 Cys311Ser 다형성을 분석하기 위해서 중합효소 연쇄반응과 제한 효소인 Dde Ⅰ처리를 수행하여 유전자형을 결정하였다. 연구 결과, Cys/Ser이 형접합체를 갖는 사람들이 고혈압군에서 유의하게 높은 빈도로 나타났으며(P<0.05),다른 신체 계측치 및 혈청내 지질 농도와는 유의한 관련성을 나타내지 않았다. 본 연구에서 관찰된 이러한 관련성이 기능적인 연관인지 혹은 연관불평형에 의한 결과인지에 대해서는 보다 더 많은 연구 대상을 이용한 추시를 통해 밝혀질 수 있을 것으로 생각된다.
장기간 노출 시 발암 등 인체 유해성을 갖는 환경유래 내분비장애물질(endocrine disrupting chemicals, EDCs)에 대한 선택적이고 민감한 노출지표를 개발하기 위하여 본 연구에서는 DNA microarray를 이용하였다. 피험자는 아직 특별한 질환을 갖지 않는 18세 이상 연령, 성을 맞춘 EDCs고농도 노출군(N = 16)과 저농도군(N = 16)으로 구성되었다. 노출정도 구분은 10년 이상 거주지가 K산업폐기물 소각장과 2.5 km 반경 내, 외 인지에 따라 고노출군,저노출군으로 구분하였다. 피험자의 말초혈에서 total RNA를 분리, 각 군당 B인씩 pool로 cDNA를 합성하여 oligonucleotide DNA 칩에 적용하였다. 유전자발현의 차이를 GenePixPro 4.0 software를 이용하여 분석하였다. 총 3장의 칩을 이용하여 공통적으로 저노출군보다 고노출군에서 2배 이상 발현의 증가를 보인 유전자는 plasminogen activator(PLAT)등 12종이 관찰되었고, l/2이하로 발현의 감소를 보인 유전자는 kallikrein 3 (KLK3)등 29종이었다. 이 들 유전자는 PLAT등 면역계 반응에 관여하는 유전자 및 apoptosis, transport, G protein, chromatin, 암화, 발생 (development), 대사 등에 관여하는 유전자들이었다. 그러므로 KLK3등 본 연구에서 발굴한 유전자는 향후 확대된 인구에서 본 연구 결과의 확인을 통하여 EDCs특이적 노출지표로써, 나아가 암 등 EDCs관련 질병의 기전 및 병인학을 구명하는데 이용가치가 높다고 사료된다.
102 ESTs (Expressed Sequence Tags) were obtained by sequencing clones from a library of rainbow trout kidney cDNAs. Of the sequences generated, 55.8% of the ESTs were represented by 37 known genes. The 45 clones of unknown gene products potentially represent 40 novel genes. The genes involved in structural function (14.5%) and transcription/translation (11.6%) account for the major gene expression activities in the kidney Microarray experiment was conducted to compare gene expression of the unique ESTs in young and adult rainbow trout kidneys. While mitochondrion, cytochrome b, rho G, spastin protein, and three unknown genes were down-regulated in the mature fish kidney, calponin 1, calcium binding protein, histone deacetylase 1, and an unknown gene were up-regulated in the mature fish kidney. This research demonstrates the feasibility and power of functional genomics in rainbow trout.
The Journal of the Convergence on Culture Technology
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v.8
no.4
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pp.415-422
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2022
The heterogeneous Onju citrus genes (A=20.57, C=32.71, G=30.01, U=16.71%) and coffee genes (A=20.66, C=31.76, G=30.187, U=16.71%) have the same genetic ratio of 95% or more. It is known that gene compatibility is generally not possible with this group. However, it can be grafted if the conditions of Chargaff rule and Shannon Entropy are met with gene functional-similarity of more than 95%, and it becomes a new breed of Coffrange. We calculated the world's first BCJM matrix for DNA-RNA and published it in US patents and international journals. All animals and viruses are similar to human genes. Based on this, it was announced in June in the British matrix textbook by solving the genetic characteristics of COVID-19 and the human body. In plants, it is treated with BCJM-Transposon treatment, a technique that easily changes gene location. Simulation predicted that the matrix could be successful with Cut & Paste and Transpose.
E. coli에서 UV 및 다른 많은 화학 돌연변이원에 의해서 유발되는 돌연변이는 chromosome의 umuDC operon이 필요하며, 이 유전자는 DNA 손상을 복구하고 UV나 화학물질에 대한 저항성을 증가시카는 DNA repair 기능을 활성화 시킨다. umuDC operon은 chromosome에 산재해 있고 16개의 다른 유전자로 구성된 E. coli SOS regulation의 한 유전자인데, umu 유전자는 한 operon에 의해 조절되는 umuD와 umuC로 구성되어 있다. 본고에서는 SOS repair에 관여하는 유전자들 중에서 umuDC 유전자를 중심으로 분자생물학적인 연구과정 및 연구결과를 서술하였다.
Yoon-Joo SONG;Sung Won LEE;Hyun-Seok JIN;Sangwook PARK
Korean Journal of Clinical Laboratory Science
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v.56
no.1
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pp.66-72
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2024
Lipid metabolic disorders are commonly encountered in clinical practice. Dyslipidemia and its prevalence rate are strongly associated with the morbidity and mortality of cardiovascular disease worldwide. We conducted a genetic analysis to determine the association between genetic polymorphisms of the ABO gene in adults middle-aged (40~69 years) with dyslipidemia in the Korean population. A total of 6,750 subjects from the Korea Association REsource (KARE) were selected for this study. Using the genetic and epidemiologic data of 4,403 dyslipidemia cases and 2,347 normal controls from the KARE, single nucleotide polymorphisms (SNPs) in ABO gene were analyzed for their genetic correlation. Eleven SNPs out of the ABO gene demonstrated a statistically significant association with dyslipidemia. Among them, rs8176707 in ABO gene statistically showed the most significant correlation with dyslipidemia (P-value=0.002, odds ratio=0.82, 95% confidence interval=0.78~0.86). The minor allele of T polymorphism within the ABO intron genetic region was associated with a decreased risk of dyslipidemia. This study uncovered a significant association between genetic polymorphism in the ABO gene and dyslipidemia. This finding suggest that ABO SNPs markers have a genetic correlation with the etiology of dyslipidemia.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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