• Journal of Environmental Policy
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• v.5 no.3
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• pp.25-56
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• 2006

We reviewed and compared nationwide surveys conducted in advanced countries (i.e., Japan, Germany, USA, and UK) with those in Korea, including the third Nationwide Survey of Natural Environments, which began in 2006 and will proceed until 2010. Based on this comparative analysis, we suggest alternatives to the nationwide survey of natural environments that are suited to Korea. Given the focus on species abundances and distributions in previous nationwide surveys in Korea, surveys of habitats, ecosystems, and ecoregions are required to more effectively protect biological resources in Korea. Furthermore, their spatial distributions should be mapped using periodical satellite images and aerial photographs. In particular, satellite images can be used to survey species, habitats, and ecosystems. Natural resources monitoring and management specialists are needed to collect various data and improve survey results. The participation of community volunteers is also important to develop an awareness in local residents of natural environment conservation. Independent survey institute (i.e., a 'National Ecosystem Institute') should be established to develop a database and survey scheme for species, habitats, and ecosystems throughout Korea. Moreover, the survey institute could develop natural environmental policy through the data analysis to meet the objectives of the Convention on Biological Diversity. The establishment of a survey institute will allow the completion of a natural environment survey that considers various factors, including physical habitat conditions. This will allow us to detect subtle changes in species abundance and spatial distributions and provide accurate and timely information on natural environments.

• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 2006.06a
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• pp.73-75
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• 2006

생물체 내에서 중요 생물학적 기능을 수행하는 기본 단위인 단백질 및 이들의 상호작용 대한 많은 연구가 이루어져 다양한 생물체에 대한 단백질 상호작용 데이터베이스가 구축되었다. 본 논문에서는 효모에 대해 공개되어있는 단백질 상호작용 데이터를 이용하여 새로운 단백질 상호작용을 예측하는 방법을 제안한다. 논문에서는 문헌에서 연관 정보를 효율적으로 찾아내기 위하여 제안된 연관개념공간 탐색 방법을 확장하여 단백질 상호작용 예측에 사용한다. 단백질들은 각각이 가지는 다양한 속성들의 벡터로 간주되며, 상호작용은 해당 단백질들의 연관성을 통해 이루어지는 것으로 표현된다. 상호작용하는 두 단백질들의 속성은 단어의 공동 출현과 같이 고려되어 단백질 상호작용은 두 단백질 벡터의 요소로 표현되고 벡터의 요소 속성들 간의 연관성을 표현하기 위해 연관속성개념공간으로 사상되어 공간상의 거리 기반으로 연관속성을 추출한다. 추출된 연관속성을 최대로 포함하는 단백질들 간의 상호작용을 예측하는 방식으로 단백질 상호작용을 예측한다. 논문에서 제안한 방법은 효모의 단백질 상호작용 예측에 대해 평균 약 91.8%의 예측 정확도를 보여, 연관속성개념공간을 이용한 방법이 단백질 상호작용을 예측하는 또 다른 대안으로 사용 될 수 있음을 확인하였다.

• Proceedings of the Korea Society of Information Technology Applications Conference
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• 2002.11a
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• pp.479-484
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• 2002

In this paper consisted of thur steps for the research The first, The Database of Biological Resource Information are constructing for species Information and Content Information of based XML. The second The item of defined from the analysts and must be considered for national GSD(Global Species Database), Supply and Contracture of input System of based Component for the Efficient Local Information Database. The third, Information Service and Interoperability are using the GRM(Global Road Map) of based DADI. These are able to accomplish to Contracture for Database and Service structure of Biological Resources Information

• Proceedings of the Korea Society for Industrial Systems Conference
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• 2002.11a
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• pp.479-484
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• 2002

In this paper consisted of three steps for the research The first, The Database of Biological Resource Information are constructing for species Information and Content Information of based XML. The second, The item of defined from the analysts and must be considered for national GSD(Global Species Database), Supply and Contracture of Input System of based Component for the Efficient Local Information Database. The third Information Service and Interoperability are using the GRM(Global Road Map) of based DADI. These are able to accomplish to Contracture for Database and Service structure of Biological Resources Information.

• Ecology and Resilient Infrastructure
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• v.10 no.4
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• pp.171-183
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• 2023

Estuarine wetlands, which form a distinctive brackish water zone, serve as important habitats for organisms that have adapted to and thrive in this environment. Nonetheless, excessive development and utilization result in artificial disruptions that alter the distinctive functions and attributes of estuarine wetlands. To collect the basic data for the conservation of estuarine wetlands with excellent ecosystems, we investigated the vegetation distribution characteristics and biota status of the Taehwagang River Estuarine Wetland. Data from vegetation surveys have shown that 25 plant communities of six physiognomic vegetation types, including willow vegetation, lotic and lentic herbaceous vegetation, floating/submerged vegetation. In the upper reaches, where topographical diversity was high, various types of wetland vegetation were distributed. In terms of biodiversity, a total of 696 species, including 7 endangered wildlife species, were identified. Due to good ecological connectivity, tidal rivers are formed, brackish water species including various functional groups are distributed around this section. The inhabitation of various water birds, such as diving and dabbler ducks, were confirmed according to the aquatic environment of each river section. The collection of ecological information of the Taehwagang River Estuarine Wetland can be used as a framework for establishing the basis for conservation and management of the estuarine ecosystem and support policy establishment.

• Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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• 2002.11a
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• pp.385-388
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• 2002

인터넷과 첨단 기술의 발달로 생물학적 정보에 대한 온라인 데이터베이스들이 급증하고 있으나, 데이터가 방대하고 형식이 다양하여 생물학자들이 정보를 얻는데 많은 어려움이 있다. 본 논문에서는 단백질과 핵산 정보를 제공하는 NCBI에서, 사용자가 질의에 따른 웹 문서로부터 정보를 추출하여 사용자의 특성에 따른 데이터베이스를 구축, 관리하여 주는 시스템을 제안한다. 온톨로지를 이용하여 질의의 모호성을 보완한다. 웹 문서로부터 추출된 데이터를 저장하는 단계에서도 데이터의 특징, 사용빈도에 따라 테이블을 분류하여 관리함으로써 검색과 관리의 효율성을 높인다. 본 논문은 서열정보 분석을 하는 생물학 연구자들에게 데이터베이스를 쉽게 구축하고 서열정보를 분석하기 좋은 인터페이스를 제공하는 것을 목적으로 한다.

• Korean Journal of Environment and Ecology
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• v.22 no.4
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• pp.347-355
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• 2008

This study analyzed and modeled the relationships between the species richness of fish, plant, and bird and environmental factors such as climatic and geographical variables based on data collected from 109 major drainage systems in Japan from 1990 until 2005. As a result, the most parts of the distributions of the fish, plant, and bird species richness were clarified by the average annual atmospheric temperature, dimension of drainage areas, and annual rainfall, respectively. In addition, this study predicted the value of each organism species distributed in national drainage areas in Japan using GAMs(Generalized Additive Models) for each organism model created by environmental factors on a wide-ranging scale, and also mapped out the value. Mapping out the predicted value could make it easier for its managers to newly set up the areas needing to be protected to obtain diversity of the organism species and to assess their availability of conservation for bio-diversity.

• Journal of the Korea Society of Computer and Information
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• v.13 no.6
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• pp.41-49
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• 2008

In recent years, a life phenomenon using a workflow management tool in bioinformatics has been actively researched. Workflow management tool is the base which enables researchers to collaborate through the re-use and sharing of service, and a variety of workflow management tools including MyGrid project's Taverna, Kepler and BioWMS have been developed and used as the open source. This workflow management tool can model and automate different services in spatially-distant area in one working space based on the web service technology. Many tools and databases used in the bioinformatics are provided in the web services form and are used in the workflow management tool. In such the situation, the web services development and stable service offering for a sequence similarity search which is basically used in the bioinformatics can be essential in the bioinformatics field. In this paper, the similarity retrieval speed of biology sequence data was improved based on a Linux cluster, and the sequence similarity retrieval could be done for a short time by linking with the workflow management tool through developing it in the web services.

• Proceedings of the Korean Society for Bio-Environment Control Conference
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• 2001.11a
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• pp.178-180
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• 2001

작물의 엽면적 등 다양한 생육정보를 간편하고 비파괴적으로 추정할 수 있다면 작물의 생리 생태학적 모델에의 적용을 통하여 다양한 작물 연구에 중요한 공헌을 할 수 있다. 본 연구에서는 오이 개개 잎의 형태정보를 이용하여 오이의 개개 엽면적, 생체중 및 건물중 예측하는 것을 목적으로 하였고, 이를 위하여 엽면적은 5가지 모델을 사용하였고, 생체중 및 건물중은 6가지의 모델을 사용하여 분석하였다. 또한 신경회로망은 3 layer의 back propagation method를 사용하여 분석하였다. 각 모델들은 독립변수로는 Robinson ＆ Pharr이 사용한 개개 잎의 폭 및 길이를 사용하였다. 회귀모델에 의한 추정 결과, 모델의 정확성 및 정밀성은 엽면적 > 생체중 > 건물중 순 이었지만, 특히 건물중의 경우는 상대적으로 낮은 상관관계를 가지는 것으로 나타났다. 회귀모델을 사용하여 건물중 추정하는 것에는 한계가 있는 것으로 생각되며, 신경회로망도 이와 유사한 관계를 나타냈지만 다양한 변수 수정을 통하여 상관계수를 증가시킬 수 있을 것이라고 생각된다.

• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 2010.06b
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• pp.289-293
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• 2010

21C 현대 문명사회에서는 도시의 고밀도 및 팽창으로 인하여 도시 내 생태계가 파괴되면서 생물서식처의 환경 악화 및 엄청난 감소가 초래되었으며, 그 결과로 인하여 인간과 생물이 접촉할 수 있는 공간이 현저하게 줄어들고 있다. 또한 도시 영역의 확장을 위하여 산림 및 녹지의 감소, 녹지의 분절 및 단절화, 해안 매립 등이 계획 없이 무분별하게 진행됨으로써, 각종 동식물의 개체 수 감소 및 토양의 건조화 등이 발생하고 있으며, 그 영향으로 생물종의 다양성이 떨어지고, 도시 생태계의 교란이 심해지고 있다. 이러한 도시 생태계의 교란은 도시에 거주하고 있는 시민들의 생활의 질이 떨어지게 하고 많은 환경 문제들의 주원인이 되고 있다. 지속적이면서도 자연친화적인 도시발전을 위해서는 도시 내 자연생태계를 회복하고 생물서식공간을 종합적으로 보전하면서 복원해야 한다는 요구가 높아지고 있지만, 이를 체계적으로 이루기 위한 방법론의 부재에 시달리고 있었다. 이러한 가운데 유럽을 중심으로 생겨난 비오톱(Biotope)과 비오톱 지도화 방법이 생태계를 보전하며, 시민들에게 다양한 자연체험과 휴양 기회를 제공하고 친환경적인 도시계획을 위한 핵심적인 역할을 하는 것으로 인식되고 있다. 하지만, 기존의 비오톱 지도는 이미지 기반의 2차원 지도로 제공되고 있어, 거리 및 공간 분석에 취약하고 정보전달력이 부족하여, 익숙한 전문가가 아닌 경우 비오톱을 이해하는데 상당한 정도의 시간이 필요하였다. 이에 본 논문에서는 공간정보가 결여된 2차원 형태의 GIS 데이터를 기반으로 3차원 공간 데이터를 자동으로 생성하고, 위성영상과 DEM(Digital Elevation Model)을 이용하여 3차원 지형을 만들어 각 주제도별로 입체적인 분석이 가능하도록 하였다. 또한 동영상 녹화 기능과 3차원 객체 추가 기능을 이용하여, 자연생태계를 고려한 도시의 설계를 진행하는 경우 3차원적인 모델링을 제공함으로써 효과적이면서도 사용자의 이해도를 향상 시킬 수 있는 정보 전달력을 가질 수 있도록 설계 및 구현하였다.