면역분석법(immunoassay)은 aflatoxin류, deoxynivalenol(DON), zearalenone(ZEA), fumonisin류 등을 포함하는 다양한 진균독소분석에 적용되고 있다. 이들 분석법을 이용하여 여러 종류의 matrix내에 존재하는 물질들을 분석할 수 있다. 그리고 많은 시료를 빨리 분석해야 하는 경우에 이 방법이 적용되고 있다. 상업적인 면역화학적 분석키트들은 흔히 검출감도(sensitivity), 특이성(specificity), 재현성(reproducibility), 비용(cost), 안정성(stability), 편리성(ease of use)등의 관점에서 평가된다. 실험실적으로 품질보증을 위하여 표준곡선과 양성대조구 등에 대한 사전 검토가 필수적이다. 또한 높은 농도의 분석물의 경우에는 matrix에서 기인한 간섭때문이 아닌지를 구분하는 것도 중요하다. 본문에서 곡류와 곡류가공품 및 특정의 감시대상물 질내 aflatoxin류, DON, ZEA 그리고 fumonisin류와 같은 진균독소의 분석에 면역화학적 방법을 사용하여 얻어진 공동연구의 결과에 대한 해석기준이 제시된다. 또한 yes/no로 구분해야 하는 정성시험의 결과해석에 필요한 기준이 제시된다. 진균독소의 면역분석법을 평가하기 위한 몇몇기준들과 그 방법들을 감시도구로 사용하는 예는, 식품중의 잔류농약을 검출하기 위한 접근방법과 유사한 모델로서 활용될 수 있을 것이다.