A 1, 4-.betha.-D-xylanase, designated as xylanase II, was purified from the culture filtrate of Trichoderma koningii ATCC 251131 by column chromatography on Sephadex G-75, SP-Sephadex C-50, DEAE-Sephadex A-50 and Sephadex G-50 with an overall yield of 6.97%. It has a molecular weight of 21.000 and an isoelectric point of 9.4. The enzyme activity is optimal at pH 5.0 and at a temperature of 50.deg.C. Xylanase II is stable up to 50.deg.C, while 40 and 90% of its activity are lost after the incubation for 30 and 60 min at 60.deg.C. The enzyme degrades xylan with relatively high activity, as well as carboxymethylcellulose and Avicel. Its $K_{m}$ values for oat-spelt xylan, larchwood xylan and Avicel are 7.48, 1.98 and 13.33 mg/ml, respectively. The hydrolysis products of oat-spelt xylan by xylanase II are xylose, xylobiose, xylotriose and arabinoxylotriose, while the reaction products of larchwood xylan are xylose, xylobiose, xylotriose and small amount of higher oligomers. The action paterns of the enzyme demonstrate that xylanase II is endo-enzyme.
Xylan과 관련 다당류 (xylotriose, xylotetraose, arabinoxylotriose)에 대한 Trichoderma koningii ATCC 26113에서 분리된 xylanase II의 작용양상은 xylanase II가 endo-enzyme이고 transxylosidation의 활성을 가지고 있다고 보여진다. Xylanase II에 의해 형성된 반응산물을 $^1HNMR$ 분광법으로 분석한 결과는 본 효소에 의해 얻어진 xylooligosaccharides의 가수분해산물은 모두가 ${\beta}$-1,4-xylosidic linkage만을 가지고 있는 것으로 판명되었다. 본 효소를 iodoacetamide로 화학적으로 변형시켰을 때 효소 mole당 cysteine 잔기가 두 개가 활성에 필요한 것으로 보여졌으며, N-bromosuccinimide 로 처리하였을 때는 활성부위에 tryptophan 잔기가 여덟 개 존재하는 것으로 판명되었다.
본 연구에서는 Aspergillus niger KG79에서 두종류의 D-xylanase를 분리.정제하여 그 특성을 규명하였다. 이 두 종류의 D-xylanase의 물리화학적 및 동력학적 특성은 큰 차이가 없었다. 이들 Xylanase는 D-Xylan으로부터 Xylose, Xylobiose와 Xylotriose를 분해 생성하였다. 그러나 보리짚 Xylan을 기질로 사용했을 경우에는 Xylanase I 은 II보다 측쇄 arabinose를 상당히 빨리 분해하였다. 이들 효소에 의한 Xylan의 분해도는 기질의 종류에 따라 차이가 나서 보리짚 Xylan과 larchwood Xylan의 분해도는 각각 10%와 25%(환원당량) 정도로 나타났다. 순수정제된 Xylanase와 $\beta$-Xylosidase를 사용하여 재조합한 Xylanase계의 기질분해력을 비교한 결과 최적조건에서 보리짚과 larchwood Xylan은 각각 28%와 54%씩 분해 전환되었다. 이러한 결과는 Xylan의 효소분해도의 제한요소는 기질의 물리적 특성의 차이에 기인함을 추정할 수 있었다.
Xylanase(1, 4-beta-D-xylan xylanohydrolase` EC 3.2.1.8) II was purified from Penicillium verruculosum by using the techniques of two anion exchange chromatographies, and gel filtration. The molecular weight of this enzyme was about 22, 000 as determined by SDS-electrophoresis. The enzyme showed hydropytic activity toward xylan but did not catalyze hydrolysis of Rho-nitrophenyl-beta-D-xylopyranoside, Rho-nitrophenyl-beta-D-glucopyranoside, Rho-nitrophenyl-beta-D-cellobiopyranoside, and celluloses such as Avicel, cotton, filter paper, carboxymethylcellulose.
리그닌 분해 세균인 Pseudomonas sp. LG2는 lignocellulose 기질을 분해하여 APPL 화합물을 생성하는 균주이다. 이 균주를 BSG(brewer's spent grain)가 함유된 배지에서 배양한 배양액에서 APPL 화합물을 확인하였다. 세포외 조효소들의 유도에 관한 여러 가지 탄소원의 영향을 조사한 결과 glucose 배지에서는 xylanase의 효소활성만 확인 되었고 xylose, arabinose에서 배양한 조효소에서는 FAE 및 xylanase의 효소활성이 없었다. Oat spelt xylan, HBSG I(hydrolyzed brewer's spent grain I), HBSG II(hydrolyzed brewer's spent grain II) 및 AFBSG(autoclaved fraction from brewer's spent grain)를 탄소원으로 배양한 조효소에서는 FAE 및 xylanase의 효소활성이 확인됐다. Pseudomonas sp. LG2를 oat spelt xylan, HBSG I, HBSG II 및 AFBSG를 탄소원으로 사용하여 14일 동안 배양하면서 배양기간에 따른 세포외 효소들의 FAE와 xylanase 활성을 조사하였다. Xylanase의 최고 활성은 xylan을 탄소원으로 6일간 배양 했을때 5.3 U/mg으로 가장 높았으며, FAE의 최고 활성은 AFBSG를 탄소원으로 배양했을 때 배양 8일째 15.4 mU/mg으로 가장 높았다. Oat spelt xylan, HBSG I, HBSG II 및 AFBSG를 탄소원으로 사용하여 배양한 배지에 분리된 ferulic acid가 확인되었다. 세포외 효소의 FAE 활성은 methyl ferulic acid, methyl caffeic acid, methyl p-coumaric acid에 대해 esterase의 활성을 보였으나, methyl sinapinic acid, methyl vanillic acid 및 methyl gallic acid에 대해서는 esterase의 활성이 없었다.
Three kinds of xylanases, X-C, X-I, and X-II, were separated from culture filtrate of an alkalophilic bacteria, Bocillus licheniformis OR-1. Their molecular weights were estimated to be 29, 000, 50, 000, and 34, 000, respectively. They were most active at pH 6.0-6.5, and at temperature of 5$0^{\circ}C$. Mercurc ion and p-chloromercurybenzoate inhibited the xylanase activity of X-C and X-II remarkably, whereas X-I was not affected. Xylanase X-I hydrolyzed barley straw xylan liberating xylose, xylobiose, and arabinose, while X-C and X-II produced only xylobiose and xylotriose.
목재 저장소의 토양에서 분리된 호열성 세균인 Paenibacillus sp. DG-22로부터 xylanase를 생산하기 위한 배양조건을 최적화시키기 위해 연구를 수행하였다. Xylanase생산은 세포의 생장과 연관된 양상을 나타내었다. Xylanase 활성은 배양상청액에서만 발견된 반면 $\beta-xylosidase$활성은 주로 세포와 결합되어 있었다. Xylanase활성의 형성은 자일란에 의해 유도되었고 포도당과 자일로스에 의해서 억제되었다. 여러 상업적 자일란을 이용하여 xylanase의 생산양상을 조사한 결과 0.1-0.5%의 birchwood xylan에서 가장 높은 생산율을 나타내었다. 조사된 여러 질소 원들 중 효모추출물이 xylanase생산을 위하여 최적이었다. xylanase의 활성은 $Co^{2+},\; Cu^{2+},\; Fe^{3+},\; Hg^{2+}\;$ 와$\; Mn^{2+}$ 이온들에 의하여 억제된 반면 $Ca^{2+},\; Mg^{2+},\; Ni^{2+},\; Zn^{2+}$ 이온들과 DTT에 의해서는 촉진되었다. 수은은 5 mM의 농도에서 xylanase 활성을 완전히 파괴하였다. 자일란 가수분해의 주된 산물은 자일로바이오스, 자일로트라이오스 그리고 자일로 올리고당이었고 이것은 이 효소가 endoxylanase라는 것을 나타낸다.
An endo-${\beta}-1$,4-xylanase (${\beta}$-xylanase) from Trichoderma harzianum C4 was purified without cellulase activity by sequential chromatographies. The specific activity of the purified enzyme preparation was 430 units/mg protein on D-xylan. The complementary DNA (cDNA) encoding ${\beta}$-xylanase (xynII) was amplified by PCR and isolated from cDNA PCR libraries constructed from T. harzianum C4. The nucleotide sequence of the cDNA fragment contained an open reading frame of 663 bp that encodes 221 amino acids, of which the mature protein is homologous to several ${\beta}$-xylanases II. An intron of 63 bp was identified in the genomic DNA sequence of xynII. This gene was expressed in Saccharomyces cerevisiae strains under the control of adh1 (alcohol dehydrogenase I) and pgk1 (phosphoglycerate kinase I) promoters in 2 ${\mu}$-based plasmids, which could render recombinants able to secrete ${\beta}$-xylanase into the media.
고온, 호알칼리성 Bacillus K-17 균주에서 한가지 xylanase 유전자를 pBR322를 벡터로 이용하여 클로닝시켰다. Xylan을 함유하는 LB 한천배지에서 분해환을 형성하는 대장균 형질전환주에서 재조합 플라스미드 pAXl13을 분리하였으며, 본 pAXl13 은 pBR322와 고온, 호알칼리성 Bacillus K-17균주 염색체 DNA의 4.3Kb HindIII 절편으로 구성되어 있었다. Biotin으로 표식된 pAXl13을 probe로 하여 상동성시험을 하여 본 결과, pAXl13에 존재하는 4.3Kb Hind III 절편은 고온, 호알칼리성 Bacillus K-17 균주 유래임을 확인하였다. pAXl13 을 가지는 E. coli 균주가 생성하는 xylanase는 균체외에 존재하였으며 그 효소학적 성질은 고온, 호알칼리성 Bacillus K-17 균주의 xylanase I 과 II중에서 xylanase I과 동일하였다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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