• 제목/요약/키워드: water primer

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환경 DNA 메타바코딩을 활용한 멧돼지 및 육상 포유류 출현 모니터링 - 경기도 양평군 일대를 중심으로 - (Monitoring the presence of wild boar and land mammals using environmental DNA metabarcoding - Case study in Yangpyeong-gun, Gyeonggi-do -)

  • 김용환;한윤하;박지윤;김호걸;조수현;송영근
    • 한국환경복원기술학회지
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    • 제24권6호
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    • pp.133-144
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    • 2021
  • This study aims to estimate location of land mammals habitat by analyzing spatial data and investigate how to apply environmental DNA monitoring methodology to lotic system in Yangpyeong-gun, Gyeonggi-do. Environmental DNA sampling points are selected through spatial analysis with QGIS open source program by overlaying Kernel density of wild boar(Sus scrofa), elevation, slope and land-cover map, and 81 samples are collected. After 240 mL of water was filtered in each sample, metabarcoding technique using MiMammal universal primer was applied in order to get a whole list of mammal species whose DNA particles contained in filtered water. 8 and 22 samples showed DNA of wild boar and water deer, respectively. DNA of raccoon dog, Eurasian otter, and Siberian weasel are also detected through metabarcoding analysis. This study is valuable that conducted in outdoor lotic system. The study suggests a new wildlife monitoring methodology integrating overlayed geographic data and environmental DNA.

자동차 내장재용 열가소성 폴리프로필렌에 적용되는 선처리제용 친환경 수분산 폴리우레탄-우레아의 제조 및 성질 (Preparation and Properties of Eco-friendly Waterborne Polyurethane-urea Primer for Thermoplastic Polypropylene Applied to Automobile Interiors)

  • 신종섭;박진명;이영희;김한도
    • 청정기술
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    • 제20권3호
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    • pp.232-240
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    • 2014
  • 폴리염화비닐(polyvinyl chloride, PVC)은 자동차 내장재(도어 트림 및 대쉬 보드 등)에 아주 널리 사용되고 있으나 특정조건에서 유해물질을 배출하므로 규제가 되는 소재로 알려져 있다. 그러므로 열가소성 폴리올레핀계 고분자인 폴리프로필렌(polypropylene, PP)이 자동차 내장재 부분에서 PVC를 대체할 수 있는 중요한 재료로 부각되고 있다. PP(비정영역:0.855, 결정영역:$0.946g/cm^3$)의 또 다른 장점은 PVC($1.1{\sim}1.45g/cm^3$)에 비해 밀도가 낮으므로 자동차의 중량을 줄일 수 있다는 것이다. 한편 모든 부품은 표면보호와 미관상 코팅이 반드시 필요하며, 그들을 조립하는데 접착제가 필요하다. 지금까지 주로 사용해 온 용제-베이스의 접착제/코팅제의 경우 휘발성 유기화합물(volatile organic compounds, VOC)의 발생과 열악한 작업 환경으로 환경친화적인 수성 접착제/코팅제의 수요가 증가하고 있다. 이러한 맥락에서 본 연구에서는 소수성 고분자 PP에 적용되는 환경친화적인 다양한 수분산 폴리우레탄-우레아 선처리제(primer: 마감도료가 기질에 보다 잘 접착될 수 있도록 선처리하는 도료)를 이온성분 dimethyl propionic acid (DMPA) 함량별, 다양한 NCO/OH 몰비, 변성 실리콘 디올의 다양한 함량 및 소프트세그먼트 함량 등의 여러 배합으로 제조하였다. 제조된 시료 중 DMPA 함량 21 mol%, 소프트세그먼트 함량 73%, 변성 실리곤 디올 5 wt% 및 NCO/OH 몰비 1.2를 사용한 시료가 기질 PP 시트와의 접착력이 우수하였으며, 첨가제는 분산제 0.5 wt%, 레벨링제 0.5 wt%, 소포제 1.5 wt% 및 소광제 3.0 wt%가 가장 적합한 첨가 함량임을 알 수 있었다.

Tomato spotted wilt virus를 위한 간편한 식물바이러스 핵산진단법: Virion Captured/RT-PCR (VC/RT-PCR) (Convenient Nucleic Acid Detection for Tomato spotted wilt virus: Virion Captured/RT-PCR (VC/RT-PCR))

  • 조점덕;김정수;김현란;정봉남;류기현
    • 식물병연구
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    • 제12권2호
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    • pp.139-143
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    • 2006
  • VC/RT-PCR은 바이러스의 단백질과 PCR 튜브의 재질적 특성을 이용하여 바이러스 이병주의 즙액으로부터 핵산을 지니고 있는 바이러스를 polypropylene에 부착시키고 그 외 PCR 활성을 저해하는 식물 즙액은 PBST로 제거해 주므로써 정확하고 깨끗한 바이러스 진단이 가능하다. 이 방법은 바이러스에 대한 항혈청이 전혀 필요 없으며 포장 시료를 직접 이용해 30 분 이내에 바이러스 핵산을 획득할 수 있어 바이러스 진단이 빠르고 간편하며 경제적이고 감도 높은 실용적인 방법이다. TSWV 에 대한 VC/RT-PCR을 위해 다양한 마쇄 완충액을 시험한 결과 0.5%의 Sodium sulphite를 포함한 0.01M Potassium phosphate (pH 7.0)가 가장 안정적이었으며 VC/RT-PCR을 이용하여 TSWV에 대한 최적의 처리 과정을 확립하였다. TSWV에 최적인 완충액에 마쇄한 바이러스 감염 잎의 조즙액을 이용한 한계 희석 농도는 $10^{-5}$으로 높은 감도를 보여 낮은 농도의 바이러스를 보유한 기주로부터 정확하 게 바이러스를 감지해 낼 수 있게 되었다. 두가지 이상의 바이러스에 감염된 기주로부터 두 가지 이상의 프라이머를 이용해 바이러스를 감지해 내는 다중 진단을 위한 실험 중 식물체의 종류와 바이러스의 Primer의 종류가 진단결과의 정확도에 큰 영향을 미치며 이러한 결과는 식물체 즙액을 바로 이용하는 VC/RT-PCR 방법은 물론 식물체로부터 Total RNA를 따로 분리하여 RT-PCR을 이용한 결과에서도 동일하게 나타났다. 따라서 편리하고 실용 적인 VC/RT-PCR법의 정확성을 최대화시키기 위해서는 다중 진단을 저해하는 식물체적 원인과 Primer 사이의 간섭 현상에 대한 연구가 더 진행될 것이며 이러한 원인을 충분히 제거해 줄 수 있는 마쇄 완충액을 개발하고 프라이머 제작을 더욱 신중히 해야 할 것이다.

Identification of Differentially Expressed Genes (DEGs) by Malachite Green in HepG2 Cells

  • Kim, Youn-Jung;Song, Mee;Ryu, Jae-Chun
    • Molecular & Cellular Toxicology
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    • 제4권1호
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    • pp.22-30
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    • 2008
  • Malachite Green (MG), a toxic chemical used as a dye, topical antiseptic and antifungal agent for fish, is highly soluble in water, cytotoxic to various mammalian cells and also acts as a liver tumor promoter. In view of its industrial importance and possible exposure to human beings, MG possesses a potential environmental health hazard. So, we performed with HepG2, a human hepatocellular carcinoma cell line, to identify the differentially expressed genes (DEGs) related to toxicity of MG. And we compared gene expression between control and MG treatment to identify genes that are specifically or predominantly expressed by employing annealing control primer (ACP)-based $GeneFishing^{TM}$ method. The cytotoxicity $(IC_{20})$ of MG was determined above the $0.867{\mu}M$ in HepG2 cell for 48 h treatment. And the DEGs of MG were identified that 5 out of 6 DEGs were upregulated and 1 out of 6 DEGs was down-regulated by MG. Also, MG induced late apoptosis and necrosis in a dose dependent in flow cytometric analysis. Through further investigation, we will identify more meaningful and useful DEGs on MG, and then can get the information on mechanism and pathway associated with toxicity of MG.

Development and Practical Use of RT-PCR for Seed-transmitted Prune dwarf virus in Quarantine

  • Lee, Siwon;Shin, Yong-Gil
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제30권2호
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    • pp.178-182
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    • 2014
  • Among imported plants, seeds are the items that have many latent pathogens and are difficult to inspect. Also, they are the import and export items whose market is expected to expand. The biggest problem with seeds is viruses. Prune dwarf virus (PDV) is the virus that is commonly inspected in Prunus cerasifera, P. persica, P. armeniaca, P. mandshurica, P. cerasus, P. avium or P. serotina seeds. In this study, two RT-PCR primer sets, which can promptly and specifically diagnose plant quarantine seed-transmitted PDV, were developed; and nested PCR primers, where products amplify 739 and 673 nucleotides (nt), and an nested PCR-product, 305 nt, can be obtained as these products are amplified again, were developed. Also, a modified-positive control plasmid was developed, where the restriction enzyme XhoI, which can identify the contamination of samples from the control, was inserted. The method developed in this study has detected PDV in 18 cases since 2007, and is expected to continuously contribute to the plant quarantine in Korea.

Isolation and Identification of Short Term Drought-Induced Genes in Zea mays L. Leaves

  • Rahman, Md. Atikur;Lee, Sang-Hoon;Choi, Gi Jun;Ji, Hee Jung;Kim, Won Ho;Lee, Ki-Won
    • 한국초지조사료학회지
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    • 제37권3호
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    • pp.237-241
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    • 2017
  • Drought is one of the detrimental factors that impair plant growth and productivity. In this study, we applied annealing control primer (ACP)-based reverse transcriptase PCR (polymerase chain reaction) technique to identify differentially expressed genes (DEGs) in maize leaves in response to drought stress. Two-week-old maize seedlings were exposed to drought (DT) by suspending water supply. DEGs were screened after 3 days of DT-treated samples using the ACP-based technique. Several DEGs encoding 16.9 protein, antimicrobial protein, hypothetical protein NCLIV_068840, thioredoxin M-type were identified in maize leaves under drought stress. These genes have putative functions in plant defense response, growth and development. These identified genes would be useful for predictive markers of plant defense, and growth responses under drought stress in plants.

제주 정수장에서 출현한 깔따구과 유충의 형태 및 유전학적 분석 (Morphological and Genetic Species Identification in the Chironomidae Larvae Found in Tap Water Purification Plants in Jeju)

  • 곽인실;박재원;김원석;박기연
    • 생태와환경
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    • 제54권3호
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    • pp.240-246
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    • 2021
  • 깔따구(Diptera: Chironomidae)는 저서성 대형무척추동물로 환경 및 수질 변화에 민감한 영향을 받는 중요한 환경지표생물이다. 이러한 깔따구 유충이 정수장에서 본 연구에서는 제주 정수처리장에서 발견된 깔따구 유충의 종을 분류하기 위해 형태 사진 및 COI (cytochrome c oxidase subunit I) Primer로 증폭시킨 DNA의 염기서열을 계통수 분석을 통해 분석을 실시하였다. 정수장 내 수도꼭지와 소화관 등에서 채집된 17개체는 둥근깃깔따구(O. tamarutilus) 14개체, 타마긴털깔따구(P. tammaater) 3개체 총 2종으로 확인되었다. 각 깔따구 종의 형태적 특징은 두부, 하순기절, 대악, 안테나, 발톱의 형태적 특징의 분류기로 종 동정하였다. NCBI Genbank에 등록된 깔따구 19종 COI 염기서열을 기반으로 본 연구에서 조사된 17개체의 계통진화적 분석 결과 채집된 깔따구 COI 염기서열이 둥근깃깔따구(O. tamarutilus)와 타마긴털깔따구(P. tammaater) 2종으로 각각 계통군(clade)를 이루는 것이 확인되었다. 이러한 결과는 정수장 환경별 발견되는 깔따구 유충의 다양성의 확인과 형태적-유전적 종 동정 분류정보를 바탕으로 수환경 관리 및 평가를 위한 기반 정보로 활용될 것이다.

헥사메텔렌 디아민이 EVA/Itaconated EPDM 블렌드 발포체의 물성 및 접착강도에 미치는 영향 (I) (Effect of 1,6-Hexamethylenediamine Content on the Properties/Adhesive Strength of EVA/Itaconated EPDM Blend Foams (I))

  • 정현지;이영희;김정수;이동진;김성열
    • 한국염색가공학회지
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    • 제30권2호
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    • pp.107-116
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    • 2018
  • Simplification of the manufacturing process in shoe making is essential to improve productivity and reduce production costs. To improve the adhesion of EVA foam used as a midsole, EVA/itaconated EPDM(EPDM-g-IA)(80/20wt%) blend was prepared using Torque Rheometer-Plasti-Corder, and 1,6-hexamethylenediamine/crosslinking agent/foaming agent/additive were mixed, followed by amidation reaction and foaming to prepare EVA/EPDM-g-IA foam for shoe midsole. In this study, we investigate the effect of the content of 1,6-hexamethylenediamine(0, 0.5, 1.0, 2.0, 3.0) on the mechanical properties, water-contact angle and adhesion of EVA/itaconated EPDM foam. As the content of 1,6-hexamethylenediamine increased, mechanical properties such as tensile strength, tear strength, tensile elastic modulus, hardness, and water-contact angle were lowered, but elongation at break and compression set(%) were increased. Both normal type and non-UV type adhesive strength increased with increasing diamine content. In particular, it was found that the adhesion strength of the non-UV type adhesion increased sharply with increasing diamine content. As a result, an adherend rupture occurs in a foam sample having a content of 1,6-hexamethylenediamine of 3phr. From this, it can be seen that the EVA/itaconated EPDM foam for shoe midsoles, which can be used for non-UV adhesion without primer and UV treatments, have been developed.

Influence of nonthermal argon plasma on the shear bond strength between zirconia and different adhesives and luting composites after artificial aging

  • Pott, Philipp-Cornelius;Syvari, Timo-Sebastian;Stiesch, Meike;Eisenburger, Michael
    • The Journal of Advanced Prosthodontics
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    • 제10권4호
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    • pp.308-314
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    • 2018
  • PURPOSE. Plasma activation of hydrophobic zirconia surfaces might be suitable to improve the bond strength of luting materials. The aim of this study was to analyze the influence of nonthermal argon-plasma on the shear bond strength (SBS) between zirconia and different combinations of 10-MDP adhesive systems and luting composites after artificial aging. MATERIALS AND METHODS. Two hundred forty Y-TZP specimens were ground automatically with $165{\mu}m$ grit and water cooling. Half of the specimens received surface activation with nonthermal argon-plasma. The specimens were evenly distributed into three groups according to the adhesive systems ([Futurabond U, Futurabond M, Futurabond M + DCA], VOCO GmbH, Germany, Cuxhaven) and into further two subgroups according to the luting materials ([Bifix SE, Bifix QM], VOCO GmbH). Each specimen underwent artificial aging by thermocycling and water storage. SBS was measured in a universal testing machine. Statistical analysis was performed using ANOVA and $Scheff{\grave{e}}$ procedure with the level of significance set to 0.05. RESULTS. Surface activation with nonthermal plasma did not improve the bond strength between zirconia and the tested combinations of adhesive systems and luting materials. The plasma-activation trended to reveal higher bond strength if the self-etch luting material (Bifix SE) was used, irrespective of the adhesive system. CONCLUSION. Plasma-activation seems to be suitable to improve bond strength between zirconia and self-etch resin materials. However, further research is necessary to identify the influence of varying plasma-parameters.

화상처리 기법과 전기화학적 임피던스 분광법을 이용한 강교 도장용 에폭시 하도 도료의 열화 평가 (Evaluation of Deterioration of Epoxy Primer for Steel Bridge Coating using Image Processing and Electrochemical Impedance Spectroscopy)

  • 이찬영;이상훈;박진환
    • Corrosion Science and Technology
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    • 제8권2호
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    • pp.53-61
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    • 2009
  • 본 연구에서는 강교 도장재료로 사용될 수 있는 에폭시 하도 도료를 도포한 시험편을 촉진시험을 통해 열화시킨 후 도막의 외관 평가 및 EIS에 의한 평가를 실시하고, 그 2가지 방법에 대한 비교 분석을 실시하였다. 화상처리 기법에 의해 구한 총 열화 면적율과 열화도 평점 산정 결과를 상호 비교해 본 결과 녹이 발생한 경우가 그렇지 않은 경우보다 열화도 평점이 높게 나타났다. 이는 강교 도장의 열화도 평가 기준에서 단위 열화 면적율당 부여하는 열화도 평점이 박리의 경우보다 녹의 경우가 더 크기 때문이다. 열화 면적율과 EIS 측정 데이터를 비교해 본 결과 녹의 면적율 약 0.1% 이상, 블리스터링의 면적율 약 3% 이상만 되어도 도막의 임피던스는 약 $10^4{\Omega}{\cdot}cm^2$ 혹은 그 이하로 크게 저하되었다. 2개의 시험편을 제외한 모든 시험편에 대해 전하전달저항(charge transfer resistance, $R_{ct}$)과 이중층 정전용량(double layer capacitance, $C_{dl}$) 값이 나타났으며, 이 결과로부터 이들 시험편들은 도막과 강재 계면에 수분이 축적되어 부식이 진행되고 있음을 알 수 있었다. 열화도 평점과 EIS 측정결과를 상호 비교해 본 결과 저주파수(10 mHz)에서의 임피던스 값이 $10^6{\Omega}{\cdot}cm^2$ 이하로 떨어진 경우는 모두 열화도 평점이 10점 이상으로 나타났으며, NORSOK cyclic test 과정에 의해 열화시킨 경우 열화도 평점이 높지 않음에도 불구하고 임피던스는 가장 낮게 나타났다. 이것은 도장계와 열화조건이 주 시험편과 다르기 때문인 것으로 판단되며, 열화조건이 더 가혹하거나 복합적일 경우 외관 상태에 비해 도막의 저항이 더 크게 저하될 가능성이 있다고 생각된다.