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Pharmacophore Modeling, Virtual Screening and Molecular Docking Studies for Identification of New Inverse Agonists of Human Histamine H1 Receptor

  • Thangapandian, Sundarapandian;Krishnamoorthy, Navaneethakrishnan;John, Shalini;Sakkiah, Sugunadevi;Lazar, Prettina;Lee, Yu-No;Lee, Keun-Woo
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제31권1호
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    • pp.52-58
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    • 2010
  • Human histamine H1 receptor (HHR1) is a G protein-coupled receptor and a primary target for antiallergic therapy. Here, the ligand-based three-dimensional pharmacophore models were built from a set of known HHR1 inverse agonists using HypoGen module of CATALYST software. All ten generated pharmacophore models consist of five essential features: hydrogen bond acceptor, ring aromatic, positive ionizable and two hydrophobic functions. Best model had a correlation coefficient of 0.854 for training set compounds and it was validated with an external test set with a high correlation value of 0.925. Using this model Maybridge database containing 60,000 compounds was screened for potential leads. A rigorous screening for drug-like compounds unveiled RH01692 and SPB00834, two novel molecules for HHR1 with good CATALYST fit and estimated activity values. The new lead molecules were docked into the active site of constructed HHR1 homology model based on recently crystallized squid rhodopsin as template. Both the hit compounds were found to have critical interactions with Glu177, Phe432 and other important amino acids. The interpretations of this study may effectively be deployed in designing of novel HHR1 inverse agonists.

산화분해촉매를 함유한 rPP/ZnO 나노컴포지트 유연식품포장필름 제조 및 물성 특성 연구 (Designed of rPP/d2w®/ZnO Nanocomposite Flexible Film for Food Packaging and Characterization on Mechanical and Antimicrobial Properties)

  • 이진경;길보민;이동진;이익모
    • 한국포장학회지
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    • 제24권1호
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    • pp.1-11
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    • 2018
  • 본 연구에서는 수출 가능한 식품포장재로 pro-oxidant($d2w^{(R)}$)함유 rPP/ZnO 나노컴포지트 유연필름을 제조하였고, 이 산화분해 필름의 기계적 특성과 항균기능을 조사하였다. 산화분해필름은 일정조건의 열과 자외선 처리를 거친 후 특성분석으로 FT_IR, SEM, UTM, GPC를 측정하여 물성변화를 관찰하였다. 카보닐지수와 하이드록실지수에서 열과 자외선에 노출율이 많아질수록 수치는 상승하였다. 표면분석에서는 rPP/$d2w^{(R)}$/ZnO나노컴포지트 필름의 경우 표면이미지가 매끈하여 ZnO의 첨가가 고분자의 상용성을 향상시켰고, 열과 자외선차단효과로 분해를 감소시키는 효과로 작용하였다. 항균력시험에서는 그람음성균은 대장균으로 그람양성균은 황색포도상구균으로 항균력을 측정하였다. 결과로는, ZnO는 시험에 사용한 농도에서 3로그 이상의 미생물 감소율을 나타내었다. 그러나 유연 필름용으로는 ZnO의 농도가 높아질수록 투명도가 떨어지므로 사용에 제한이 있었다. rPP/$d2w^{(R)}$/ZnO가 함유한 시편에서 인장강도는 40% 상승하였고, 신율은 30% 감소되었다. ZnO를 첨가한 경우 기계적 물성상승과 열 안전성과 자외선차단성을 나타내었다. 산화분해능은 열 노출 $70^{\circ}C$ 온도에서 480시간 경과한 후, 자외선 조사로 72시간 노출 이후 시점의 분자량은 수평균분자량이 1,294 g/mol, 무게평균분자량이 5,920 g/mol로 분해되는 결과를 얻었다. 이것으로 UAE 5009:2009, ASTM 6954의 기준에 준한 필름을 제조할 수 있었다. 비교시편과 본 연구에서 제조한 산화분해필름의 분자량이 80.7%와 75.6% 감소한 결과를 얻음으로서, 자연 산화분해됨을 확인하였다. 식품포장재로서 안전성분석에서는 국내법 중 식품접촉플라스틱 폴리프로필렌의 기준에 적합하였다.

전기자극이 흰쥐 창상 표피세포의 핵소체형성부위에 미치는 영향 (Effects of Electrical Stimulation on the Nucleolar Organizer Region in Keratinocyte of Wounded Skin in Rat)

  • 이재형;제강승주;박승택
    • The Journal of Korean Physical Therapy
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    • 제12권1호
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    • pp.1-7
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    • 2000
  • 전기자극이 흰쥐 창상 표피세포의 핵소체형성부위에 미치는 영향을 규명할 목적으로 Sprague-Dawley계 수컷 흰쥐 24마리의 등애 15mm의 절개창을 만들고 봉합한 후 각각 4일 7일 대조군 및 전기자극에 각각 6마리씩 무작위로 배치하고 전기자극군 흰쥐의 에 전극을 부착한 후 맥동빈도 0.5pps, 전류량 $500{\mu}A$로 60분간 전기자극하였으며 대조군은 전극만 부착하고 전류를 통전시키지 않았다. 전자자극 후 등의 피부를 적출하여 포르말린에 고정한 후 파라핀 포매 절편을 제작하여 silver colliod염색을 하였다. 이 표본을 400배율 현미경하에서 관찰하여 핵당 AgNOR으 수를 계측한 후 핵당 AgNOR의 분포와 핵당 평균 AgNOR수를 산출하여 통계분석한 결과 창상유발 4일과 7일째의 전기자극군의 평균 AgNOR수가 대조군보다 통계학적으로 유의하게 높게 나타났다. 이러한 결과는 전기자극이 흰쥐 피부 창상연 표피세포에서 AgNOR 발현을 증가시켰음을 확인할 수 있었으며 이는 미세맥동전류자극이 창상연의 표피세포를 증식시키고 있음을 시사하고 있다.

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Anti-inflammatory and antifatigue effect of Korean Red Ginseng in patients with nonalcoholic fatty liver disease

  • Hong, Meegun;Lee, Yoon Hyeong;Kim, Seungwoo;Suk, Ki Tae;Bang, Chang Seok;Yoon, Jai Hoon;Baik, Gwang Ho;Kim, Dong Joon;Kim, Myong Jo
    • Journal of Ginseng Research
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    • 제40권3호
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    • pp.203-210
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    • 2016
  • Background: Korean Red Ginseng (KRG) is a well-known natural product with anticarcinogenic and antioxidant effects. We evaluated the antifatigue effect of KRG in patients with nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD). Methods: Eighty patients with NAFLD were prospectively randomized to receive 3 wk of KRG or placebo in addition to counseling on healthy eating and regular exercise. Liver function test, proinflammatory cytokines, adiponectin, antioxidant activity, and fatigue score were measured and compared according to the body mass index between the KRG and placebo groups. Results: The liver function tests were significantly improved after 3 wk of treatment in both groups. The mean levels (at baseline and after treatment) of tumor necrosis factor-${\alpha}$ were $108.0pg/mL{\pm}54.8pg/mL$ and $92.7pg/mL{\pm}39.0pg/mL$ (p = 0.018) in the KRG group and $123.1pg/mL{\pm}42.1pg/mL$ and $127.5pg/mL{\pm}62.2pg/mL$ (p = 0.694) in the placebo group, respectively. There was a significant difference in change of adiponectin levels between the KRG ($7,751.2pg/mL{\pm}3,108.1pg/mL$ and $8,197.3pg/mL{\pm}2,714.5pg/mL$) and placebo groups ($7,711.6pg/mL{\pm}3,041.3pg/mL$ and $7,286.1pg/mL{\pm}5,188.7pg/mL$, p = 0.027). In patients with overweight, the fatigue score was significantly decreased in the KRG group ($35.0{\pm}13.2$ and $24.5{\pm}8.9$, p = 0.019). Conclusion: Our results show that KRG might be effective in reducing proinflammatory cytokine and fatigue in overweight patients with NAFLD, in addition to improvements in adiponectin levels.

종양이식 모델 쥐에서 동결건조 시판 막걸리가 종양성장에 미치는 영향 (Effect of commercial Makgeolli on tumor growth in tumor xenograft mice)

  • 신은주;김재호;성기승;염성관;황진택
    • 한국식품저장유통학회지
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    • 제23권1호
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    • pp.104-109
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    • 2016
  • 본 연구는 시중에서 판매되고 있는 막걸리를 알콜과 수분을 제거한 막걸리 동결건조물로 만들어 AGS위암세포주가 이식된 종양이식 마우스 모델을 가지고 종양성장에 미치는 영향을 관찰하였다. 면역세포가 결핍된 C57/BL/6누드마우스를 이용하여 AGS위암 세포 이식 군(Induction), AGS위암 세포 이식+시판막걸리 동결건조물 $100mg/kg{\cdot}day$군(ML), AGS위암 세포 이식+시판막걸리 동결건조물 $500mg/kg{\cdot}day$군(MH), AGS위암 세포 이식+5-FU $18mg/kg{\cdot}day$군으로 나누어 비교한 결과, 시판막걸리 동결건조물에서 종양의 성장을 유의하게 감소시키는 것을 관찰하였다. 이와 더불어 각 군 간에 체중변화는 유의한 차이가 없어 막걸리의 투여에 의한 체중감소 등의 특이한 부작용이 없는 것으로 판단하였다.

길항미생물 Bacillus subtilis GG95를 이용한 상추 균핵병의 생물학적 방제 (Biological Control of Lettuce Sclerotinia Rot by Bacillus subtilis GG95)

  • 이현주;김진영;이진구;홍순성
    • 한국균학회지
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    • 제42권3호
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    • pp.225-230
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    • 2014
  • 상추재배시 문제가 되고 있는 균핵병과 시들음병에 대한 미생물 방제제 개발을 위하여 병해가 발생된 상추 포장에서 미생물을 분리하고, 길항미생물을 선발하여 균의 특성을 조사하고 균핵병에 대한 예방효과를 검정한 결과는 다음과 같다. 경기도 주요 상추 재배지에서 균핵병은 10월부터 발생하여 다음해 5월까지 발생하였으며, 12월에는 최대 40%까지 발생하여 피해를 주고 있었다. 균핵병과 시들음병에 모두 억제효과가 있는 균주를 대치배양을 통해 선발하였다. 선발됨 균주는 Vitek 2의 BCL카드를 이용한 생화학적반응과 형태적 확인, 16s rRNA 분석을 통해 동정한 결과 Bacillus subtilis로 동정되었고 B. subtilis GG95로 명명하였다. B. subtilis GG95의 배양특성을 조사한 결과 온도 $25{\sim}30^{\circ}C$, 산도 7의 배양조건에서 배양이 잘 되었으며, 배양에 적정한 영양원은 탄소원 전분, 질소원 tryptone과 yeast extract를 무기염류 $MgCl_2$를 사용하였을 때 가장 잘 되었다. 영양원에 따라 균핵병과 시들음병에 대한 길항효과가 좋은 탄소원은 fructose, maltose였고 질소원은 peptone였으며, 무기염류는 균핵병은 $CaCl_2$, $K_2HPO_4$, 시들음병은 $MgSO_47H_2O$로 병원균에 대한 길항효과가 차이가 있었다. 상추 균핵병에 대한 B. subtilis GG95의 포장검정 결과 $1{\times}10^8cfu/mL$ 농도의 길항미생물 배양액을 포기당 10 mL씩 3회 관주하고 균핵병원균을 접종한 후 균핵병의 발병정도를 조사한 결과 88% 방제효과가 나타났다.

막과산화를 신속히 유발하는 제초제의 고효율 대량스크리닝을 위한 형광검정법 (Fluorescence Assay for High Efficient Mass Screening of the Herbicides Inducing Rapid Membrane Peroxidation)

  • 김진석;권옥경
    • Weed & Turfgrass Science
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    • 제4권4호
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    • pp.308-314
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    • 2015
  • 본 연구는 식물세포막을 파괴시켜 제초활성을 나타내게 하는 화합물(막과산화형 제초제)을 미지의 많은 화합물로부터 신속하게 탐색하기 위한 새로운 검정법을 확립하기 위하여 실시되었으며, 확립한 전체적인 검정과정은 다음과 같다. 96-well microplate에 시험용액 $200{\mu}L$ 넣고 여기에 오이자엽으로부터 적출한 직경 4 mm의 절편 1개씩을 띄운다. 항온실의 광조건 하에서 회전진탕기로 조금씩 흔들어주면서 8시간 배양한 후 절편을 제거한 다음, 배양액에 HVA와 HRP를 첨가하여 반응시킨 후 마이크로평판용 형광검출기를 이용하여 형광도(Ex 320 nm, Em 425 nm)를 측정한다. 형광변화량이 높을수록 제초활성이 높은 것으로 판단한다. 본 방법은 96-well microplate에서 작업을 수행할 수 있고 형광검출 기술을 이용함으로써 검정과정과 작업을 간편하게 하여 검정효율을 기존보다 현저히 높인 것이 특징이다. 아울러 활성검정을 추출된 효소가 아닌 잎 절편수준에서 수행하기 때문에 보다 실용화에 근접한 정량적 데이터를 얻을 수 있는 장점을 가진다.

개에서 진드기 살충제 amitraz의 단회피하투여 독성시험 (A Single Subcutaneous Dose Toxicity Study of The Acaricide Amitraz in Beagle Dogs.)

  • 허정두;김영길;이현숙;김충용;박승춘;신진영;김성호;신동호;김종춘
    • 생명과학회지
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    • 제14권4호
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    • pp.547-552
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    • 2004
  • 본 연구는 살충제 amitraz의 피하투여 급성독성을 평가하기 위해 0, 2, 10 및 50 mg/kg용량으로 1회 피하투여한 후, 사망률과 일반증상, 체중, 혈액 및 혈청생화학 및 부검소견에 미치는 영향을 평가하였다. 시험결과, 비글 개에 있어서 amitraz의 단회 피하투여는 식욕부진과 침울, 구토, 유루, 운동성감소, 보행실조, 투여부위의 부종, 종괴 및 농양형성, 사지의 부전마비, 횡와위, 빈사, 사망, 체중감소, 투여부위의 근육출혈과 염증, 그리고 간과 신장의 충혈을 유발하는 것으로 나타났다. 반면, 투여 후 14일째에 생존동물의 혈액 및 혈청생화학치에서는 시험물질의 투여와 관련된 어떠한 변화도 인정되지 않았다. 결론적으로 본 시험조건하에서 비글 개에 대한 amitraz의 반수치사량은 22.3 mg/kg (95% 신뢰 한계: 산출되지 않음)이고, 무해용량(no-observed-adverse-effect level)은 2 mg/kg 이하로 사료된다.

Bacillus amyloliquefaciens IUB158-03이 생산하는 항진균물질의 생화학적 특성 및 독성 (Toxicity and Characteristics of Antifungal Substances Produced by Bacillus amyloliquefaciens IUB158-03)

  • 김혜영;이태수
    • 생명과학회지
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    • 제19권11호
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    • pp.1672-1678
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    • 2009
  • B. amyloliquefaciens IUB158-03균주에서 정제된 항진균물질은 극성인 용매에 잘 용해되고, pH 6.0~10.0와 $-70{\sim}121^{\circ}C$에서와 같이 넓은 범위의 온도 및 pH에서 안정성을 보였다. 항진균물질의 FAB-MS, UV 흡수 스펙트럼, 아미노산 조성 등을 분석한 결과 분자량은 1,042 이었고, TLC를 이용하여 분석한 결과 ninhydrin solution에서 보라색으로 발색되었다. UV 스펙트럼은 220 nm, 277 nm에서 ${\lambda}max$를 보였으며, $Asn_3$, $Gln_2$, $Ser_1$ $Gly_1$, $Tyr_1$의 아미노산 조성을 갖는 것으로 나타났다. 그리고 $^1H$-NMR spectrum, $^1H$-COSY, HMQC 을 분석한 결과 iturin A계에 속하는 물질로 확인되었다. NIH3T3 섬유아세포에 대해 항진균물질이 세포독성을 나타내지 않는 것은 물론 마우스에 항진균물질을 경구투여하여 장기 내의 변화와 백혈구 수, 생체내의 생리적인 기능면에서 정상 마우스와 차이를 보이지 않았으므로 생체독성이 없는 것으로 나타났다. 따라서 본 연구를 통하여 B. amyloliquefaciens IUB158-03에서 분리된 항진균물질이 앞으로 고추탄저병의 생물적 방제제로 이용될 수 있는 잠재성을 갖고 있는 것으로 사료된다.

Thermitomyces albuminosus powder의 랫드를 이용한 90일 경구투여독성시험 (Repeated Dose 90-Day Oral Toxicity Study of Dried Thermitomyces albuminosus Powder in Rats)

  • 안민지;허혜선;이지선;손혜영;임해옥;박강백;이준헌;지재규;박영철
    • 생명과학회지
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    • 제26권10호
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    • pp.1153-1162
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    • 2016
  • 계종버섯(Thermitomyces albuminosus)의 안정성을 입증하기 위하여 사료에 계종버섯의 분말을 5%, 2.5%, 1.25%, 0%를 혼합하여 90일 동안 랫드에 자유 급이 시켜 실험동물의 일반증상, 체중변화, 혈액학적 검사, 부검소견, 임상병리, 조직병리학적 검사의 결과를 토대로 독성을 평가하였다. 독성판정기준은 독성의 정도와 양상에 따라 weight-based classification (독성 강도에 따른 분류)로 분류 하였는데 비시험물질-유래 변화인 NOEL, 시험물질-유래 경미한 변화는 NOAEL, 시험물질-유래 중요한 변화는 LOAEL을 기준으로 나누었다. 시험결과, 수컷 좌, 우측 신장 중량이 용량의존적으로 증가하여 고용량군에서는 12%, 8% 증가 하였다. 하지만 임상, 조직병리학적 결과 독성으로 판단되는 소견이 관찰되지 않아 시험물질-유래 경미한 변화로 판단으로 분류하였다. 따라서 판정기준에 따라 수컷은 NOAEL 암컷은 NOEL이 식이함량 5%로 추정되지만 식약처고시에 따라 암수 모두 NOAEL이 식이함량의 5%로 추정할 수 있다. 따라서 계종버섯은 식품 또는 기능성식품으로의 개발에 문제가 없을 것으로 사료된다.