• 제목/요약/키워드: taxonomic research

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A Lichen Genus Porpidia (Porpidiaceae) from South Korea

  • Wang, Xin Yu;Joshi, Yogesh;Hur, Jae-Seoun
    • Mycobiology
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    • 제39권1호
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    • pp.61-63
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    • 2011
  • Taxonomic study of the crustose lichen Porpidia was performed in this paper. Three species are described, including two recorded species and one new record: Porpidia macrocarpa (DC.) Hertel & A. J. Schwab. A description of each species is presented along with morphological, anatomic, and chemical characteristics. A key to the identification of species of Porpidia is also presented.

Two newly recorded genera Gongylidioides Oi, 1960 and Mermessus O.P.-Cambridge, 1899 with descriptions of Gongylidioides kaihotsui Saito and Ono, 2001 and Mermessus naniwaensis (Oi, 1960) (Araneae: Linyphiidae) from Korea

  • Kim, Seung Tae;Lee, Sue Yeon;Yoo, Jung-Sun
    • Journal of Species Research
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    • 제5권2호
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    • pp.201-205
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    • 2016
  • Gongylidioides kaihotsui Saito and Ono, 2001 and Mermessus naniwaensis (Oi, 1960) of Linyphiidae are described from Korea with taxonomic illustrations. The genera Gongylidioides Oi, 1960 and Mermessus O.P.-Cambridge, 1899 are newly recorded genera to Korean spider fauna.

Description of Philodromus paiki sp. nov. and Philodromus spinitarsis Simon, 1895(Araneae: Philodromidae) from Korea

  • Chang Moon Jang;Sue Yeon Lee;Jung Sun Yoo;Seung Tae Kim
    • 환경생물
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    • 제41권4호
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    • pp.497-504
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    • 2023
  • The present study describes Philodromus paiki sp. nov., which was previously misidentified as P. fuscomarginatus (De Geer, 1778), P. poecilus (Thorell, 1872), and P. spinitarsis Simon, 1895 in Korea, as a new species with diagnosis, detailed descriptions, and taxonomic photographs. Additionally, P. spinitarsis is also described to correct previous misidentifications of Korean records of the species.

Molecular identification of the algal pathogen Pythium chondricola (Oomycetes) from Pyropia yezoensis (Rhodophyta) using ITS and cox1 markers

  • Lee, Soon Jeong;Hwang, Mi Sook;Park, Myoung Ae;Baek, Jae Min;Ha, Dong-Soo;Lee, Jee Eun;Lee, Sang-Rae
    • ALGAE
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    • 제30권3호
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    • pp.217-222
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    • 2015
  • Pythium species (Pythiales, Oomycetes) are well known as the algal pathogen that causes red rot disease in Pyropia / Porphyra species (Bangiales, Rhodophyta). Accurate species identification of the pathogen is important to finding a scientific solution for the disease and to clarify the host-parasite relationship. In Korea, only Pythium porphyrae has been reported from Pyropia species, with identifications based on culture and genetic analysis of the nuclear internal transcribed spacer (ITS) region. Recent fungal DNA barcoding studies have shown the low taxonomic resolution of the ITS region and suggested the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1 (cox1) gene as an alternative molecular marker to identify Pythium species. In this study, we applied an analysis of both the ITS and cox1 regions to clarify the taxonomic relationships of Korean Pythium species. From the results, the two closely related Pythium species (P. chondricola and P. porphyrae) showed the same ITS sequence, while the cox1 marker successfully discriminated P. chondricola from P. porphyrae. This is the first report of the presence of P. chondricola from the infected blade of Pyropia yezoensis in Asia. This finding of the algal pathogen provides important information for identifying and determining the distribution of Pythium species. Further studies are also needed to confirm whether P. chondricola and P. porphyrae are coexisting as algal pathogens of Pyropia species in Korea.

범용성 DNA 바코드 분석 기반 한국산 천남성속(Arisaema) 식물의 분자계통학적 연구 (Study on Molecular Phylogenetics of Korean Arisaema Species Based on Universal DNA Barcodes)

  • 노푸름;한경숙;김욱진;양선규;최고야;고성철;문병철
    • 한국자원식물학회지
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    • 제31권1호
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    • pp.37-51
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    • 2018
  • 국내에 분포하는 천남성속의 계통학적 유연관계와 한약재 천남성(Arisaematis Rhizoma)으로 사용되는 천남성 3종(둥근잎천남성, 두루미천남성, 일파산남성)에 대한 분류학적 특징을 분석하기 위하여 천남성속 식물에 대한 분자계통학적 연구를 수행하였다. 3개의 범용성 DNA 바코드(ITS, matK, rbcL) 염기서열을 이용하여 국내 분포 천남성속 8분류군과 중국에 분포하는 약전수재 종 1분류군을 포함하는 9종 50개 시료와 같은 과의 Dracunculus vulgaris를 군외군으로 하여 유연관계를 분석하였다. 3개의 개별 DNA 바코드 염기서열과 이들을 유합한 염기서열로 계통학적 유연관계를 분석한 결과, 천남성속의 9 분류군은 6개의 독립적인 분계조를 형성하며 구별되었으며(Clade I, 둥근잎천남성 및 천남성; Clade II, 점박이천남성 및 섬남성; Clade III, 큰천남성; Clade IV, 일파산남성; Clade V, 두루미천남성; Clade VI, 무늬천남성 및 거문천남성), 이들 6개의 분계조는 각각 Pedatisecta절, Sinarisaema절, 및 Tortuosa절로 분류되었다. 또한 이들 DNA 바코드 구간의 비교 결과는 천남성속 식물의 종 및 종 이하 분류 단위의 분류학적 재검토의 필요성에 대한 중요한 정보를 제공하였다. 하지만 대한민국약전에 수재되어 한약재로 사용가능한 3종의 천남성 기원종의 종내 분류학적 연관성이나 분자계통학적 특징은 확인되지 않았다.

16S 앰플리콘 시퀀싱 기반 한라마 출생시와 이유기의 분변 미생물 비교 분석 (Comparison of Fecal Microbiota between Birth and Weaning of Halla Horses Using 16S rRNA Gene Amplicon Sequencing)

  • 이종안;강용준;최재영;신상민;신문철
    • 생명과학회지
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    • 제32권12호
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    • pp.1005-1012
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    • 2022
  • 본 연구는 한라마 출생시와 이유기의 분변 미생물 조성과 다양성 차이에 대해 16S 앰플리콘시퀀싱 데이터 분석을 통해 수행하였다. 출생시에 Proteobacteria (35.7%)가, 이유기에는 Firmicutes (45.6%)가 문 수준에서 가장 우점하는 미생물로 확인되었다. 속 수준에서는 출생시에 Escherichia (19.7%), Clostridium (14.0%)가 우점종으로 관측되었으며, 이유기에는 Fibrobacter (6.6%)가 가장 높게 분포하고 있었다. 다양성(α-diversity) 분석 결과 이유기에 풍부도와 균등도 지표들이 통계적으로 유의한 수준에서 높게 나타났다. PCoA 분석을 수행한 결과 출생시와 이유기 미생물 군집 특성(β-diversity)은 속 수준과 종 수준에서 두개의 그룹으로 명확히 구분되었다. 미생물 분포에 대한 통계적 유의성 검증을 위해 세 가지 Jensen-Shannon, Bray-Curtis, Unifrac의 distance metric를 이용해 PERMANOVA 분석을 수행한 결과 통계적 유의성(q<0.001)을 보이며 조성 차이가 있었다. 출생시와 이유기 특성을 대표하는 미생물 마커 선발을 위해 LEfSe 분석을 수행하였다. 속 수준에서 출생시에 장내 질환을 유발할 가능성이 있는 Escherichia, Bacteroides, Clostridium, Methylobacterium 등이 우점하였으며, 이유기에는 섬유소 분해에 관여하는 Fibrobacter가 상대적으로 많이 분포하였다. 본 연구를 통해 승용마로 가치가 높은 한라마의 출생시와 이유기의 미생물 조성 및 다양성 차이에 대한 결과를 제시하였으며 성장단계별 질병예방 및 영양소 흡수에 관여하는 미생물 구명을 위한 기초자료로 활용될 수 있을 것으로 기대한다.