• 한국동물위생학회지
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• 제32권3호
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• pp.227-239
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• 2009

At the present study, it was aimed to detect virulence genes and antimicrobial resistance genes among 102 strains of 12 Salmonella serotypes isolated from pigs and cattle. In polymerase chain reaction (PCR), invA was detected from all strains of Salmonella spp., spvC was detected from Salmonella enterica serotype Enteritidis (S. Enteritidis) (100%), S. Bradenburg (75%), and S. Typhimurium (20.4%). Drug resistance related genes of 12 types were detected from all strains. TEM ($bla_{TEM}$) gene was detected from 51 (92.7%) of 55 $\beta$-lactams (54 ampicillin or 1 amoxicillin) resistance strains. 55 (100%) of 55 chloramphenicol resistance strains, 3 (100%) of 3 gentamicin resistance strains and 5 (100%) of 5 kanamycin resistance strains did contain cml, aadB, and aphA1-Iab, respectively. strB (89.9%), strA (88.4%), aadA2 (84.1%) and aadA1 (72.5%) were detected from 69 streptomycin resistance strains. sulII and dhfrXII were detected from 49 (100%) of 49 sulfamethoxazole/trimethoprim resistance strains, but sulI was not detected. tetA (97.9%) and tetB (21.6%) were detected from 97 tetracycline resistance strains. int gene was detected from 58 (56.9%) of 102 strains. 54 S. Typhimurium of 102 Salmonella spp. were attempted to detect drug resistance genes. TEM was detected from 44 (95.7%) of 46 $\beta$-lactams (45 ampicillin or 1 amoxicillin) resistance strains. cmlA was detected from 51 (100%) of 51 chloramphenicol resistance strains. aadA2 (100%), strA (100%), strB (100%), and aadA1 (79.6%) were detected from 54 streptomycin resistance strains. sulII (100%) and dhfrXII (100%) were detected from 49 sulfamethoxazole/trimethoprim resistance strains. tetA was detected from 54 (100%) of 54 tetracycline resistance strains. int gene was detected from 54 (100%) of 54 strains. The major drug resistance pattern and resistance gene profile were ampicillin, chloramphenicol, streptomycin, sulfamethoxazole/trimethoprim and tetracycline (ACSSuT) and TEM, cmlA, aadA1, aadA2, strA, strB, sulII, dhfrXII, tetA and int, respectively.

• Journal of Oral Medicine and Pain
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• 제24권2호
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• pp.219-234
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• 1999

치석에는 박리상피세포, 백혈구 등이 포함되어 있어 이들의 핵 내에 있는 DNA의 유전자형을 찾아내 개인식별을 할 수 있을 것으로 추정된다. 본 연구에서는 치석만으로 개인식별이 가능한지를 알아보고자 40명으로부터 채취한 치석을 증류수에 세척한 군과 세척하지 않은 군으로 나누어 DNA를 추출하고 중합효소연쇄반응법을 이용하여 증폭절편다형(AMP-FLPs)을 실시한 후 성별검사를 위한 X-Y homologous amelogenin gene과 유전자지문검사를 위한 STR유전좌위 LPL, F13B, Triplex(F13A01, FESFPS, vWA) 등 6개의 유전자를 검색하여 - X-Y homologous amelogenin gene과 LPL, F13B는 각각 증폭하였으며 F13A01, FESFPS, vWA 세 유전자는 동시에 증폭하였음 - 다음과 같은 결과를 얻었다. 1) X-Y homologous amelogenin gene 검색으로 세척군에서 27개의 검체 중 8개, 비세척군에서 13개 중 11개에서 성별검사가 가능하였다. 2) LPL유전자는 세척군, 비세척군에서 각각 27개 검체중 2개, 13개 검체 중 5개가 검색되었으며 3개의 대립유전자(10, 11, 12)와 4개의 유전자형 (10-10, 10-11, 10-12, 11-12)이 나타났다. 3) F13B유전자는 세척군, 비세척군에서 각각 27개 검체 중 1개, 13개 검체 중 4개가 검색되었으며 2개의 대립유전자(9, 10)와 2개의 유전자형(9-10, 10-10)을 관찰하였다. 4) F13A01유전자는 비세척군에서만 13개 검체 중 3개가 검색되었고 3개의 대립유전자(3.2, 4, 6)와 3개의 유전자형(3.2-3.2, 4-5, 4-6)을 관찰하였고, 세척군에서는 나타나지 않았다. 5) FESFPS유전자는 비세척군에서만 13개 검체 중 1개가 검색되었고 유전자 형은 11-12로 나타났다. 6) vWA유전자는 세척군, 비세척군에서 각각 1개씩 검색되었으며, 3개의 대립유전자형(14, 16, 17)와 2개의 유전자형(14-16, 14-17)을 관찰하였다. 이상의 결과를 종합해 볼 때, 치석은 X-Y homologous amelogenin gene증폭을 통한 성별검사와 단일 STR유전좌위 증폭을 통한 유전자지문형 검사에는 유용하나 복합 STR유전좌위의 검색에는 부적합한 것으로 나타났으며 법의학적시료로 응용이 가능한 것으로 사료된다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제31권9호
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• pp.1305-1310
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• 2021

Shikimate is a key high-demand metabolite for synthesizing valuable antiviral drugs, such as the anti-influenza drug, oseltamivir (Tamiflu). Microbial-based strategies for shikimate production have been developed to overcome the unstable and expensive supply of shikimate derived from traditional plant extraction processes. In this study, a microbial cell factory using Corynebacterium glutamicum was designed to overproduce shikimate in a fed-batch culture system. First, the shikimate kinase gene (aroK) responsible for converting shikimate to the next step was disrupted to facilitate the accumulation of shikimate. Several genes encoding the shikimate bypass route, such as dehydroshikimate dehydratase (QsuB), pyruvate kinase (Pyk1), and quinate/shikimate dehydrogenase (QsuD), were disrupted sequentially. An artificial operon containing several shikimate pathway genes, including aroE, aroB, aroF, and aroG were overexpressed to maximize the glucose uptake and intermediate flux. The rationally designed shikimate-overproducing C. glutamicum strain grown in an optimized medium produced approximately 37.3 g/l of shikimate in 7-L fed-batch fermentation. Overall, rational cell factory design and culture process optimization for the microbial-based production of shikimate will play a key role in complementing traditional plant-derived shikimate production processes.

• The Plant Pathology Journal
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• 제28권2호
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• pp.207-211
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• 2012

It has been known that streptomycin resistance in bacteria can occur as a results of chromosomal mutation or through gene acquisition or both. Chromosomal mutations for resistances are point mutations in the rpsL gene, which alter ribosomal protein S12. Acquired resistance has occurred when an $Sm^R$ plasmid carrying transposon Tn5393 with tandem strA-strB gene is transferred by conjugation. A total of 686 isolates of Xanthomonas smithii subsp. citri causal agent of citrus canker disease were collected from 26 citrus orchards in Jeju Island in 2003 and 2004 seasons. Forty-nine of 111 isolates from streptomycin non-sprayed orchards in 2003 season were resistant to streptomycin. Of 107 isolates from orchards sprayed one time with streptomycin, 58 isolates were resistant, and 166 of 221 isolates from orchards sprayed two times with streptomycin were resistant. In 12 orchards sprayed three or more times with streptomycin, 219 of 247 isolates were resistant to streptomycin. Twenty-five isolates of X. smithii subsp. citri were surveyed to identify the mechanisms of streptomycin resistance in this study. Twenty-one of these 25 isolates were resistant to streptomycin, and it was proven by PCR assay that 18 of the 21 streptomycin resistant isolates have the strB gene. In sixteen of the 21 streptomycin resistant isolates, it was occurred a point mutation altered codon lysine (AAG)-41 of rpsL gene to arginine (AGG). The streptomycin-sensitive isolates easily acquired the resistance by mixed culture with resistant isolates. The strB gene was amplified from the isolates that acquired the resistance by mixed culture, and one isolate of them was also point-mutated in codon 41 of rpsL gene to be resistant. In this study, most of the streptomycin-resistant isolates of X. smithii sub sp. citri in Jeju island expressed the resistance by both chromosomal point mutation and gene acquisition, and the resistance was easily acquired through conjugation by culture mixed with streptomycin resistant and sensitive strains.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제16권2호
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• pp.111-118
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• 1988

유기산 생산균인 L. casei Y, Str. faecium C, Str. faecalis, Cl. butyricum M, B. toyoi를 사료첨가제와 발효유로부터 분리 확인하여 이들 균주가 자돈의 대장균증 설사를 유발시키는 E. coli $A_2$, E. coli G$_7$에 대하여 in vitro에서는 어떤 항균효과를 나타내는지 조사한 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. L. casei Y, Str. faecium C, Str. faecalis, B. toyoi Cl. butyricum M을 각각 배양한 BL broth 3일 배양액은 모두 E. coli $A_2$와 E. coli G$_7$에 대하여 항균효과를 나타내었고, 이들 배양액을 E. coli $A_2$와 E. coli G$_7$에 대한 발육 Disc 확산시험 결과 그 저지환 직경은 각각 15mm와 17mm, 14mm와 15mm, 13mm와 14mm, 11mm와 13 mm, 10mm와 12mm 였다. 2. 유기산 생산 능력이 우수한 균일수록 E. coli $A_2$와 E. coli G$_7$에 대한 항균력이 높게 관찰되었으며, L. casei Y와 Str. faecium C가 이들 두 대장균에 대하여 높은 항균력을 나타내었다. 3. 유기산 생성균과 대장균(E. coli $A_2$, E. coli G$_7$)을 BL broth 에 혼합 배양할 때 E. coli $A_2$와 E. coli G$_7$은 배양액의 pH가 5.0 이하일 때 생육억제 되었고, pH 4.5 이하였을 때 사멸되었다. 4. 생성된 유기산은 배양액의 pH를 저하시킴과 동시에 항균성 물질로 직접 작용하여 E. coli $A_2$와 E. coli G$_7$의 생육저해 또는 사멸을 유도하였다. 5. E. coli $A_2$가 E. coli G$_7$보다 유기산 생산균의 대사산물에 대하여 더 높은 내성을 갖고 있었다.

• 식물병연구
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• 제30권2호
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• pp.199-205
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• 2024

Erwinia amylovora는화상병의원인균으로국내에서는 2015년 이후 사과와 배 나무에 큰 피해를 일으키고 있다. 농가에서는 화상병 예방을 위해 개화기에 항생제를 살포하고 있다. 그러나 항생제의 지속적인 사용은 저항성균의 출현을 유발하고, 이로 인해 방제 효율의 저하를 초래할 수 있다. 따라서, 본 연구에서는 2019–2023년 동안 국내에서 분리한 E. amylovora 361균주를 대상으로 스트렙토마이신에 대한 최소억제농도의 변화 양상을 조사하였다. 국내에서 분리한 연구 대상 균주들에 대한 스트렙토마이신의 최소억제농도는 0.5–4 µg/ml였고 균주에서 스트렙토마이신에 약한 저항성을 유도하는 strA-strB 유전자는 확인되지 않았다. 또한 경기도, 강원도 및 충청북도에서 다른 지역에 비해 스트렙토마이신의 최소억제농도가 높았다. 이러한 연구 결과는 스트렙토마이신의 사용에 대한 주의를 유도하고 방제 대책을 수립하기 위한 기초자료로 활용될 수 있을 것이다.

• 식물병연구
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• 제28권1호
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• pp.26-31
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• 2022

Pseudomonas syringae pv. actinidiae (Psa)는 키위에 세균성 궤양병을 일으키는 병원균이다. Psa 균주는 유전적 및 생화학적 특징에 따라 5개의 biovar로 나누어진다. 그중 biovar 2와 3이 국내에서 발견되어 광범위한 피해를 주고 있다. Psa를 방제하는 효율적인 방법 중 한가지는 streptomycin과 같은 항생제를 사용하는 것이다. 그러나, 이 항생제에 저항성을 갖는 균주가 국내에서 분리되었고, 선행 연구에서 biovar 2 균주의 저항성이 strA-strB 유전자에 의한 것으로 밝혀졌다. 본 연구에서는 Psa biovar 3 균주에서 streptomycin 저항성의 분자적 기작을 밝히고자 하였다. 실험실에서 선발된 streptomycin 저항성 균주의 리보솜 단백질 S12를 암호화하는 유전자인 rpsL의 염기서열을 결정한 결과, 43번째 또는 88번째 코돈에서 자연발생적 점 돌연변이가 일어난 것을 확인하였다. 한편, 두 곳의 키위 과수원에서 분리된 4개의 streptomycin 저항성 biovar 3 균주에서는 민감성 균주에서 AAA인 rpsL의 코돈 43이 AGA로 단일 염기 치환이 일어났고, 이는 아미노산을 lysine에서 arginine으로 변화시키게 된다. 국내에서 발견된 biovar 3 균주 모두의 저항성 기작은 rpsL 유전자의 돌연변이에 기인하였다.

• 천문학회지
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• 제37권5호
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• pp.349-353
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• 2004

Magnetic fields are an important ingredient of galaxy clusters and are indirectly observed on cluster scales as radio haloes and radio relics. One promising method to shed light on the properties of cluster wide magnetic fields is the analysis of Faraday rotation maps of extended extragalactic radio sources. We developed a Fourier analysis for such Faraday rotation maps in order to determine the magnetic power spectra of cluster fields. In an advanced step, here we apply a Bayesian maximum likelihood method to the RM map of the north lobe of Hydra A on the basis of our Fourier analysis and derive the power spectrum of the cluster magnetic field. For Hydra A, we measure a spectral index of -5/3 over at least one order of magnitude implying Kolmogorov type turbulence. We find a dominant scale of about 3 kpc on which the magnetic power is concentrated, since the magnetic autocorrelation length is ${\lambda}_B = 3 {\pm} 0.5\;kpc$. Furthermore, we investigate the influences of the assumption about the sampling volume (described by a window function) on the magnetic power spectrum. The central magnetic field strength was determined to be ${\~}7{\pm}2{\mu}G$ for the most likely geometries.

• 한국식품과학회지
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• 제27권5호
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• pp.646-651
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• 1995

순수 물질 수용액의 표면장력치 측정과 JND를 통한 맛 관능 분석에 의해 쓴 맛 물질의 표면 장력과 쓴 맛 간의 상관성을 연구한 결과, 모든 쓴 맛 물질 수용액은 용액의 농도가 증가함에 따라 표면 장력이 감소되어 Szyszkowski 방정식과 Techplot program으로 표면 장력 감소 곡선을 수학적으로 나타낼 수 있었고 또한 관능 분석에 의한 JND 맛 곡선도 같은 방법으로 묘사하여 상호 비교됨을 알 수 있었다. 또한 측정된 모든 쓴 맛 성분들에 대하여 표면 장력 곡선으로부터 상수 a, b 값을, 맛 곡선으로부터 상수 A, B 값을 계산하여 쓴 맛 인지역치 $log\;C_{1}$과 평형 상수 b 값 간의 음의 상관 관계식을 구하였다. 또한 쓴 맛 인지역치 농도 $log\;C_{1}$과 기계적인 측정치로 산출된 parameter들의 상관성을 PV-wave 프로그램을 이용해서 3차원적으로 비교한 $log\;C_{1}$/a/b와 $log\;C_{1}$/A/B간의 상관관계는 주목할 만하며 이는 용액과 기체간의 계면 system에서의 계면 흡착 모델이 구강 내에서의 조직과 용액 간의 관능적 모델에도 적용됨을 나타내며 나아가 표면장력치의 측정이, 신경자극 전달 측정을 위한 Beidler의 이론과 Szyszkowski 방정식을 이용하여 쓴 맛을 기계적으로 측정하는 독립적인 방법을 개발하는데 응용될 수 있음을 시사해 준다.

• 한국동물위생학회지
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• 제22권2호
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• pp.121-128
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• 1999

The present study was conducted to investigate the incidence of pneumonic lesions with special regard to enzootic pneumonia and the microbiology of pneumoic lungs from 544 slaughter pigs during the period from October 1995 to September 1996. The incidence of enzootic pneumonic lesion was 76.3% (41s/s44) and pleurisy was detected from 7.9% of slaughter pigs. Seasonal prevalence of pneumonic lesions in slaughter pigs were in order of prevalence of 82.9% in spring, 76.8% in winter, 74.8% in autumn and 69.0% in summer, respectively. Pasteurella multocida, Streptococcus sp, Str suis, Corynebacterium sp, Actinobacillus pleuropneumoniae, Hemophilus parasuis, and Klebsiella pneumoniae were detected in order of prevalence from 16.9%, 15.9%, 7.5%, 6.0%, 1.4%, 1.0% and 0.5% of 415 pneumonic lungs, respectively. P multocida were susceptible to oxytetracycline, polymyxin-B, streptomycin, and vancomycin, while the majority of them were resistant to amoxicillin, ampicillin, cephalothin, kanamycin, and penicillin-G. Str suis were susceptible to amoxicillin, ampicillin, cephalothin, penicillin-G, although the majority of them were resistant to erythromycin, oxytetracycline, streptomycin, vancomycin. A pleuropneumoniae were susceptible to ampicillin, and cephalothin, but the majority of them were resistant to oxytetracycline.