• 제목/요약/키워드: spectral sequence

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Cloning and Characterization of Monofunctional Catalase from Photosynthetic Bacterium Rhodospirillum rubrum S1

  • Lee, Dong-Heon;Oh, Duck-Chul;Oh, You-Sung;Malinverni, Juliana C.;Kukor, Jerome J.;Kahng, Hyung-Yeel
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제17권9호
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    • pp.1460-1468
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    • 2007
  • In this study, an approx. 2.5-kb gene fragment including the catalase gene from Rhodospirillum rubrum S1 was cloned and characterized. The determination of the complete nucleotide sequence revealed that the cloned DNA fragment was organized into three open reading frames, designated as ORF1, catalase, and ORF3 in that order. The catalase gene consisted of 1,455 nucleotides and 484 amino acids, including the initiation and stop codons, and was located 326 bp upstream in the opposite direction of ORF1. The catalase was overproduced in Escherichia coli UM255, a catalase-deficient mutant, and then purified for the biochemical characterization of the enzyme. The purified catalase had an estimated molecular mass of 189 kDa, consisting of four identical subunits of 61 kDa. The enzyme exhibited activity over a broad pH range from pH 5.0 to pH 11.0 and temperature range from $20^{\circ}C$ to $60^{\circ}C$C. The catalase activity was inhibited by 3-amino-1,2,4-triazole, cyanide, azide, and hydroxylamine. The enzyme's $K_m$ value and $V_{max}$ of the catalase for $H_2O_2$ were 21.8 mM and 39,960 U/mg, respectively. Spectrophotometric analysis revealed that the ratio of $A_{406}$ to $A_{280}$ for the catalase was 0.97, indicating the presence of a ferric component. The absorption spectrum of catalase-4 exhibited a Soret band at 406 nm, which is typical of a heme-containing catalase. Treatment of the enzyme with dithionite did not alter the spectral shape and revealed no peroxidase activity. The combined results of the gene sequence and biochemical characterization proved that the catalase cloned from strain S1 in this study was a typical monofunctional catalase, which differed from the other types of catalases found in strain S1.

선편광된 10 GHz 선폭의 1 kW급 20/400-㎛ 이터븀 첨가 광섬유 레이저 (Linearly Polarized 1-kW 20/400-㎛ Yb-doped Fiber Laser with 10-GHz Linewidth)

  • 정예지;정민완;이강인;김태우;김재인;이용수;조준용
    • 한국광학회지
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    • 제32권3호
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    • pp.120-125
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    • 2021
  • 본 연구에서는 다파장 빔결합을 위한 master oscillator power amplifier (MOPA) 구조의 선편광 고출력 이터븀 첨가 광섬유 레이저를 개발하였다. 유도 브릴루앙 산란(stimulated Brillouin scattering, SBS)을 억제하기 위하여 pseudo-random binary sequence (PRBS) 신호로 위상 변조 및 비트길이를 최적화한 선폭 약 10 GHz의 시드 레이저를 구현하였으며, 이를 이용하여 3단 증폭을 하였다. 주 증폭단에서는 모드 불안정성 현상(mode instability, MI)의 문턱값을 높이기 위하여 코어 및 클래딩의 직경이 각각 20 ㎛, 40 ㎛인 편광유지(polarization maintaining, PM) 이터븀 첨가 광섬유를 이용하고 지름이 약 9-12 cm인 나선형 홈에 적용하였다. 그 결과, 입사된 여기광 대비 기울기 효율이 83.7%인 1.004 kW의 레이저 출력을 얻었다. 또한, 빔품질(M2)과 편광소광율(polarization extinction ratio, PER)은 각각 1.12와 21.5 dB로 측정되었다. 더욱이, 역방향 스펙트럼의 레일리 신호와 SBS 신호의 첨두 세기 비율은 2.36 dB로 관측되어, SBS가 완화된 레이저 구현을 확인하였다. 또한 증폭 출력에 따라 기울기 효율 및 빔품질의 저하가 없어 모드불안정이 발생하지 않음을 확인하였다.

NEAR-IR PHOTOMETRIC STUDY OF THE FU ORIONIS OBJECT HBC 722

  • Sung, Hyun-Il;Park, Won-Kee;Yang, Yuna;Lee, Sang-Gak;Yoon, Tae Seog;Lee, Jeong-Eun;Kang, Wonseok;Park, Keun-Hong;Cho, Dong-Hwan;Park, Sunkyung
    • 천문학회지
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    • 제46권6호
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    • pp.253-259
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    • 2013
  • We present near-infrared light curves of HBC 722 after its the September 2010 outburst. We have been monitoring its near-infrared light curves since November 2010 with Korean Astronomy and Space Science Institute Infrared Camera System (KASINICS). HBC 722 exhibits large changes in optical and near-infrared brightness since its outburst. The J, H, and $K_s$ light curves over about 2.5 years show that in all observed bands HBC 722 progressively became fainter until around April 2011, down to J ~10.7, H ~9.9, $K_s$ ~9.3, but it is getting brighter again. Large scatter in the obtained light curve prevents us from finding whether there is any short timescale variation as reported in other optical observations. The near-infrared color of HBC 722 is becoming bluer since its outburst. The pre-outburst Spectral Energy Distribution (SED) of HBC 722 is consistent with that of a slightly reddened Class II YSO with the exception of the extraordinary IR-excess in the far-infrared region.

A fluorogenic method for measuring enteropeptidase activity: spectral shift in the emission of GD4K-conjugated 7-amino-4-methylcoumarin

  • Choi, Mal-Gi;Lee, Eung-Yeong;Chung, Hye-Shin;Jang, Sei-Heon;Lee, Chang-Woo
    • BMB Reports
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    • 제44권7호
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    • pp.458-461
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    • 2011
  • Enteropeptidase is a serine protease secreted by the pancreas and converts inactive trypsinogen to active trypsin. Enteropeptidase cleaves the C-terminal end of the substrate recognition sequence Asp-Asp-Asp-Asp-Lys ($D_4K$). The assay for enteropeptidase has utilized $GD_4K$-conjugated 2-naphthylamine ($GD_4K$-NA) as a fluorogenic probe over the last 30 years. However, no other $D_4K$-conjugated fluorogenic substrates of enteropeptidase have been reported. Furthermore, naphthalene is known as carcinogenic to humans. In this study, we used shift in the emission spectrum of $GD_4K$-conjugated 7-amino-4-methylcoumarin ($GD_4K$-AMC) as a fluorogenic method to measure enteropeptidase activity. The kinetic analysis revealed that enteropeptidase has a $K_M$ of 0.025 mM and a $k_{cat}$ of 65 $sec^{-1}$ for $GD_4K$-AMC, whereas it has a $K_M$ of 0.5 to 0.6 mM and a $k_{cat}$ of 25 $sec^{-1}$ for $GD_4K$-NA. The optimum pH of $GD_4K$-AMC hydrolysis was pH 8.0. Our data indicate that $GD_4K$-AMC is more suitable as a substrate for enteropeptidase than $GD_4K$-NA.

대두, 메주 및 된장의 항산화 효과와 아질산염 소거 효과 (Antioxidant and Nitrite Scavenging Effect of Soybean, Meju and Doenjang)

  • 최계선;임선영;최재수
    • 생명과학회지
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    • 제8권5호
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    • pp.473-478
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    • 1998
  • 본 연구에서는 된장의 기능성 중에서 대두, 메주, 된장의 발효과정을 거치는 동안 항산화 효과와 아질산염 소거 효과의 변화 추이를 고찰하기 위해 DPPH radical 소거능과 아질산염 소거능을 통한 된장의 활성을 시험하였다. 대두, 메주 및 된장은 methanol extract를 계통 추출법에 의거하여 여러 가지 용매를 사용하여 분획하였으며, 각 분획에 대한 활성실험을 행하였다. MeOH ext.로 본 항산화 효과는 된장〉메주〉대두의 순으로 나타났고, 메주와 대두 간의 효과의 차는 거의 없었다. 아질산염 소거효과는 된장〉대두〉메주의 순을 보였고, 래디칼 소거능보다 아질산염 소거능이 더 효과적으로 나타났다. Ethyl acetate 분획에 있어 항산화 효과가 켰으며, 특히 아질산염의 소거 효과는 L-ascorbic acid의 효과를 상회하였다.이에 된장의 ethyl acetate 분획을 반복 정제하여 genis-tin, daidzein, genistein을 분리하였으며, 이는 된장의 항산화 및 아질산염 소거 효과를 나타내는 활성 물질들은 대두중의 페놀성물질에서 크게 벗어나지 않음을 알 수 있었다.

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Griseofulvin from Xylaria sp. Strain F0010, an Endophytic Fungus of Abies holophylla and its Antifungal Activity Against Plant Pathogenic Fungi

  • PARK, JOONG-HYEOP;CHOI, GYUNG-JA;LEE, SEON-WOO;LEE, HYANG-BURM;KIM, KYOUNG-MO;JUNG, HACK-SUNG;JANG, KYOUNG-SOO;CHO, KWANG-YUN;KIM, JIN-CHEOL
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제15권1호
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    • pp.112-117
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    • 2005
  • Abstract Griseofulvin has been used as an antifungal antibiotic for the treatment of mycotic diseases of humans and veterinary animals. The purpose of this work was to identify a griseofulvin-producing endophytic fungus from Abies holophylla and evaluate its in vivo antifungal activity against plant pathogenic fungi. Based on nuclear ribosomal ITS1-5.8SITS2 sequence analysis, the fungus was identified and labeled as Xylaria sp. F0010. Two antifungal substances were purified from liquid cultures of Xylaria sp. F0010, and their chemical identities were determined to be griseofulvin and dechlorogriseofulvin through mass and NMR spectral analyses. Compared to dechlorogriseofulvin, griseofulvin showed high in vivo and in vitro antifungal activity, and effectively controlled the development of rice blast (Magnaporthe grisea), rice sheath blight (Corticium sasaki), wheat leaf rust (Puccinia recondita), and barley powdery mildew (Blumeria graminis f. sp. hordei), at doses of 50 to 150 ${\mu}$g/ml, depending on the disease. This is the first report on the production of griseofulvin and dechlorogriseofulvin by Xylaria species.

VHF 대역 해상 디지털 통신용 π/4-DQPSK 모뎀 구현 (Implementation of π/4-DQPSK Modem for Maritime Digital Communication in VHF Band)

  • 곽재민
    • 한국항행학회논문지
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    • 제18권6호
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    • pp.541-545
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    • 2014
  • ITU-R M.1842-1은 해상 이동 서비스를 위한 RR Appendix18 채널에서 VHF 대역의 디지털 통신의 가이드라인을 제공하는 국제 권고안이다. 본 논문에서는 ITU-R M.1842-1 Annex1에서 제시하는 28.8 kbps 급 ${\pi}$/4-DQPSK 디지털 기저대역 모뎀을 시뮬레이션하고, FPGA로 설계 및 구현한다. 권고안에 패킷구조가 아직 정의되지 않은 상태이므로 패킷검출 및 동기화를 위해 Cazac 시퀀스를 프리앰블로 사용한다. 기저대역 변복조 모뎀은 VHDL로 설계되어 자이링스사의 Atrix7 FPGA 칩이 장착된 NEXYS4 개발 플랫폼에 구현된다. 무선 통신 테스트를 수행하기 위해 ADC/DAC 보드를 제작하고, RF 모듈로서 EV9730을 장착하여 통합 프로토타입을 구현하고 실험한다. 권고안에 정의된 바와 같이 송수신신호는 25 kHz 대역폭을 유지하고, 송수신 플랫폼간 통신이 정상적으로 이루어짐을 실험을 통해 확인한다.

이동통신 Nakagami 페이딩 채널에서 채널코딩과 최대비합성 다이버시티 기법에 의한 Hybrid DS / SFH-CDMA 비동기 MFSK 신호의 성능평가 (Performance Evaluation of Hybrid DS/SFH-CDMA Noncoherent MFSK Signal with Channel Coding and MRC Diversity Techniques in Mobile Communication Nakagami Fading Channels)

  • 강희조
    • 한국전자파학회논문지
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    • 제8권4호
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    • pp.342-353
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    • 1997
  • 본 논문에서는 Nakagami 페이딩 채널환경에서 하이브리드 DS /SFH-CDMA 비동기 M-ary FSK 시스템의 성능을 분석하여 평가하였다. 다중경로 간섭과 다중접속 간섭을 고려하였고, 스펙트럼 효율은 부호화 하였을 때의 시스템과 부호화 하지 않았을 때의 시스템을 계산하였다. 검파 전 MRC 다이버시티 기법과 인터리브 채널코 딩기법(해밍(7,4), BCH(15, 7), RS(7, 4), (15,9))을 함께 적용하여 비트에러율의 성능을 개선시켰다. 비동기 하이브리드 시스템의 비트오율은 가우시안 간섭의 근사값을 사용하여 얻었다. 결과들로부터, 페이딩의 영향이 크면 클수록 시스템의 성능이 열화되며, 직접확산 부분의 변조는 다중경로 간섭에, 주파수 호핑 부분의 변조는 다중접속간섭의 영향에 민감함을 알 수 있었다. 이것들의 결과로부터 채널코딩기법과 검파 전 다이버시티 기법을 함께 사용하므로써 만족할만한 성능을 얻을 수 있었다.

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MBOK 확산 스펙트럼 기반의 지상파 DMB 워터마킹 성능 향상 기법 연구 (A Study on the Performance Improvement Technique for Terrestrial DMB Watermarking based on MBOK Spread Spectrum)

  • 차재상;이민호;이경근;김종태;김건;박소라;이용태;배정남
    • 한국ITS학회 논문지
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    • 제9권1호
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    • pp.42-48
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    • 2010
  • 본 논문에서는 MBOK 확산 스펙트럼 기반의 지상파 DMB 워터마킹 성능 향상 알고리즘에 대해 알아보았다. 제안된 기법을 지상파 DMB 시스템에 적용함으로써 워터마킹 확산코드를 통한 부가 정보 전송이 가능하고 주파수 효율도 개선되었다. MBOK 확산 스펙트럼 방식을 사용할 경우 기존의 직접 확산 방식에 비해 속도가 2m배 향상되지만, m값이 커질수록 하드웨어의 복잡도가 증가하기 때문에 최적 상황에 맞게 검토하여 사용해야한다. 모의실험을 통하여 MBOK 확산 스펙트럼 기법 및 데이터를 반복하여 전송하는 에버리징을 적용한 성능을 분석하였고, 유용성을 확인하였다. 모의실험 을 통하여 MBOK 확산 스펙트럼 기법의 DER 성능 및 에버리징의 수가 증가할수록 성능이 향상되는 것을 확인하였다. 본 논문에서 제안한 기술은 전송 방식으로 OFDM을 사용하는 통신 시스템에서 워터마킹을 이용한 부가 정보 전송 기술 연구를 위한 유용한 자료로 활용할 수 있다.

PTS 방식에서 기준 심볼을 이용한 부가정보 전송 (Side Information Transmission using Reference Symbol in PTS Scheme)

  • 유흥균;박종현;박진수
    • 한국전자파학회논문지
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    • 제15권4호
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    • pp.414-420
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    • 2004
  • Orthogonal frequency-division multiplexing(OFDM)은 무선 환경에서 고속 데이터 전송에 적합한 방식이다. 그러나 높은 peak-to-average power ratio(PAPR)로 인하여 비선형 왜곡의 문제점이 있다. 여러 PAPR 저감 방법 중에서 partial transmit sequences(PTS)는 매우 유연하고 스펙트럼 왜곡이 발생하지 않는 좋은 방법으로 평가된다. 이 방법의 문제점은 최적화된 rotation factor에 대한 부가 정보를 수신기에 전송해야만 데이터를 정확히 복원할 수 있다는 점이다. 본 논문에서는 기존 PTS 방식에서 기준 심볼을 이용하여 부가 정보를 전송하는 기법을 새롭게 제안한다. 이 기법은 rotation factors의 정보를 기준 심볼의 위상으로 표현하는 방법이다. 시뮬레이션 결과를 통해 제안 방식이 종전의 PTS와 동일한 PAPR 저감 성능을 가지면서 정확하게 데이터를 복원하여 요구 BER이 만족됨을 확인하였다. 또한, 제안 방식은 변조 방식에 무관하며, 간단하게 시스템을 구현할 수 있다.