• 제목/요약/키워드: specific labeling

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Fabrication of a Partial Genome Microarray of the Methylotrophic Yeast Hansenula polymorpha: Optimization and Evaluation of Transcript Profiling

  • OH , KWAN-SEOK;KWON, OH-SUK;OH, YUN-WI;SOHN, MIN-JEONG;JUNG, SOON-GEE;KIM, YONG-KYUNG;KIM, MIN-GON;RHEE, SANG-KI;GERD GELLISSEN,;KANG, HYUN-AH
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제14권6호
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    • pp.1239-1248
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    • 2004
  • The methylotrophic yeast Hansenula polymorpha has been extensively studied as a model organism for methanol metabolism and peroxisome biogenesis. Recently, this yeast has also attracted attention as a promising host organism for recombinant protein production. Here, we describe the fabrication and evaluation of a DNA chip spotted with 382 open reading frames (ORFs) of H. polymorpha. Each ORF was PCR-amplified using gene-specific primer sets, of which the forward primers had 5'-aminolink. The PCR products were printed in duplicate onto the aldehyde-coated slide glasses to link only the coding strands to the surface of the slide via covalent coupling between amine and aldehyde groups. With the partial genome DNA chip, we compared efficiency of direct and indirect cDNA target labeling methods, and found that the indirect method, using fluorescent-labeled dendrimers, generated a higher hybridization signal-to-noise ratio than the direct method, using cDNA targets labeled by incorporation of fluorescence-labeled nucIeotides during reverse transcription. In addition, to assess the quality of this DNA chip, we analyzed the expression profiles of H. polymorpha cells grown on different carbon sources, such as glucose and methanol, and also those of cells treated with the superoxide­generating drug, menadione. The profiles obtained showed a high-level induction of a set of ORFs involved in methanol metabolism and oxidative stress response in the presence of methanol and menadione, respectively. The results demonstrate the sensitivity and reliability of our arrays to analyze global gene expression changes of H. polymorpha under defined environmental conditions.

생쥐 난소 과립세포의 체외배양중 세라마이드에 의한 자연세포사의 측정 (Determination of Ceramide-Induced Apoptotic Cell Death in Mouse Granulosa Cell Cultured In Vitro)

  • 김종훈;김경미;윤용달
    • 한국발생생물학회지:발생과생식
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    • 제2권1호
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    • pp.1-8
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    • 1998
  • 본 연구에서는 자연세포사 (apoptosis)를 유발시키는 것으로 알려진 ceramide를 배양중인 생쥐 과립세포에 처리한 뒤 형광염색, in-situ 3'-end labeling(ISEL), 그리고 flow cytometry 기법을 이용하여, 자연세포사 및 세포주기에 미치는 ceramide의 영향을 조사하였다. Ceramide를 처리하지 않은 대조군에 비하여, ceramide를 처리한 실험군에서 세로의 생존율은 농도에 비레하여 유의하게 감소하였다. 또한 acridine orange에 의한 형광염색 결과, 자연세포사의 양상을 보이는 핵을 갖는 세포의 수가 ceramide의 농도가 증가함에 따라 현저하게 증가되었다. 또한 ISEL을 실시해 본 결과, 자연세포사가 ceramide의 처리농도가 증가됨에 따라 점차적으로 증가되었다. 한편, ceramide를 처리한 과립세포의 세포주기 분석을 위한 flow cytometry 결과도 자연세포사가 일어난 $A_{0}$기에 있는 세포들의 비율이 대조군에 비하여 농도 의존적으로 증가하였으며, $G_{0}$/$G_{1}$ 기에 있는 세포들이 비율은 현저하게 감소됨을 관찰할 수 있었다. 위의 결과로 보아 ceramide는 생쥐 과립세포의 $G_{0}$/$G_{1}$ 기에 특이저긍로 자\ulcorner하여 자연세포사를 유발하며, 난포의 폐쇄시 과립세포의 자연세포사를 유발할 것으로 사료된다.

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Dosimetric Analysis of a Phase I Study of PSMA-Targeting Radiopharmaceutical Therapy With [177Lu]Ludotadipep in Patients With Metastatic Castration-Resistant Prostate Cancer

  • Seunggyun Ha;Joo Hyun O;Chansoo Park;Sun Ha Boo;Ie Ryung Yoo;Hyong Woo Moon;Dae Yoon Chi;Ji Youl Lee
    • Korean Journal of Radiology
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    • 제25권2호
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    • pp.179-188
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    • 2024
  • Objective: 177Lutetium [Lu] Ludotadipep is a novel prostate-specific membrane antigen targeting therapeutic agent with an albumin motif added to increase uptake in the tumors. We assessed the biodistribution and dosimetry of [177Lu]Ludotadipep in patients with metastatic castration-resistant prostate cancer (mCRPC). Materials and Methods: Data from 25 patients (median age, 73 years; range, 60-90) with mCRPC from a phase I study with activity escalation design of single administration of [177Lu]Ludotadipep (1.85, 2.78, 3.70, 4.63, and 5.55 GBq) were assessed. Activity in the salivary glands, lungs, liver, kidneys, and spleen was estimated from whole-body scan and abdominal SPECT/CT images acquired at 2, 24, 48, 72, and 168 h after administration of [177Lu]Ludotadipep. Red marrow activity was calculated from blood samples obtained at 3, 10, 30, 60, and 180 min, and at 24, 48, and 72 h after administration. Organand tumor-based absorbed dose calculations were performed using IDAC-Dose 2.1. Results: Absorbed dose coefficient (mean ± standard deviation) of normal organs was 1.17 ± 0.81 Gy/GBq for salivary glands, 0.05 ± 0.02 Gy/GBq for lungs, 0.14 ± 0.06 Gy/GBq for liver, 0.77 ± 0.28 Gy/GBq for kidneys, 0.12 ± 0.06 Gy/GBq for spleen, and 0.07 ± 0.02 Gy/GBq for red marrow. The absorbed dose coefficient of the tumors was 10.43 ± 7.77 Gy/GBq. Conclusion: [177Lu]Ludotadipep is expected to be safe at the dose of 3.7 GBq times 6 cycles planned for a phase II clinical trial with kidneys and bone marrow being the critical organs, and shows a high tumor absorbed dose.

용인지역 고등학생의 가공식품 구매행동 분석 (Analysis of Purchasing Behaviors of Processed Foods in High School Students in Yongin Region)

  • 구희진;김성영
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제43권12호
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    • pp.1929-1936
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    • 2014
  • 용인시에 위치한 고등학교에 재학 중인 남녀 고등학생 179명을 대상으로 가공식품의 구매행동 특성에 대한 결과를 분석한 후 요약하면 다음과 같다. 고등학생들의 가공식품 섭취 횟수는 남학생 70.3%, 여학생 68.2%가 1~2회를 섭취하였다. 자주 섭취하는 가공식품의 종류로는 과자류가 31.3%로 가장 많았으며 그 다음으로는 음료수(17.3%)> 빵류(12.3%)> 라면류(11.7%)와 우유 및 유제품류(11.7%)> 빙과류(10.6%) 순의 결과를 보였다. 구매장소는 마트, 학교매점 및 편의점을 선호하였으며 가장 큰 구매이유는 '맛이 있어서'라는 응답이 43.6%로 '배가 고파서' 35.2%보다 높은 결과를 보였다. 구매 시 고려이유 역시 '맛'이 70.9%로 가장 중요한 것으로 보였으며 그 다음으로는 '가격' 16.2%, '양' 5.6%, '영양' 4.5%로 '영양'보다는 '맛' 위주로 가공식품을 선택하는 것으로 판단되었다. 식품표시 항목 중 '유통기한(67.0%)'을 가장 중요한 항목으로 인식하고 있었으며 영양표시 항목 중에서는 '열량(57.5%)'이 가장 중요하고 그 다음으로는 '총 지방함량(10.1%)'> '트랜스지방(9.5%)'> '콜레스테롤(7.3%)' 순의 결과를 보였다. 식품표시 및 영양표시에 대한 확인 정도의 결과는 '항상 확인함'이라고 응답한 학생은 12.3%에 불과했으며 '가끔 확인함'이 59.2%로 가장 많았다. '확인하지 않음'의 비율이 28.5%나 되어 건강한 식품의 선택을 위한 식품 및 영양표시정보에 대한 고등학생들의 관심도는 매우 낮은 수준임을 알 수 있었다. 확인하지 않는 이유에 대한 결과에서도 '관심이 없어서'가 27.9%의 높은 결과를 보였다. 이 외에 표시항목들이 '너무 작거나 조잡해서'라는 응답도 28.5%로 높은 결과를 보였다. '이해가 어려워서' 16.2%, '습관적인 구매 때문에'는 15.1%의 결과를 보였다. 따라서 고등학생들의 건전한 가공식품 구매활동을 유도하기 위해서는 정확하고 정돈된 식품 및 영양성분표시의 정보제공이 우선시 되어야 할 뿐만 아니라 건강한 식습관 형성 및 식품표시정보에 대한 학생들의 관심도를 향상시킬 수 있는 보다 적극적이고 구체적인 영양교육 프로그램의 운영이 요구된다.

요오드 131$^{131}I$의 beta-emission을 이용한 면역방사성표지법에 의한 feline leukemia virus의 유전자 발현에 관한 연구 (Gene expression of feline leukemia virus(FeLV) in cat kidney cells with radioimmunoassay using beta-emission of $^{131}I$)

  • 박만훈;노현모
    • 미생물학회지
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    • 제21권2호
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    • pp.61-70
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    • 1983
  • Synchronized cat kidney cells chronically infected with feline leukemia virus (FeLV) were used to study virus production, the synthesis of group specific antigen (gag) and envelope (env) proteins, the expression of env protein on the cell surface during the cell cycle, and the stability of viral RNA. As detecting method, we developed the radioimmunoassay (RIA) system using beta-emission of $^{131}I$ and demonstrated the validity of this system by comparison with routine RIA system using gamma-emission of $^{125}I$. The produced virus was analysed by developed RIA interval was determined by measuring reverse transcriptase activity. The results show that infected cells produce the complete virus particle containing products of gag, env and pol genes of FeLV, and maximum virus production occurs during mitosis of synchronized cells. Labeling of the cell surface of synchronized cells with $^{131}I$ shows that the amount of $gp70^{env}$ on the cell surface parallels cellular gorwth. Therefore, the cell cycle-dependent release of virus is not petition RIA of synchronized cells with $^{131}I$ labeled viral proteins synthesis during the cell cycle. The rate of synthesis of gag protein shows three peaks, corresponding to the $G_1,\;late\;S\;and\;late\;G_2$ phases of cell cycle. But the rate of synthesis of env protein dose not change, suggesting that in these cells the synthesis of these two gene products in controlled seperately. In Actionomycin D treated cells, the synthesis of viral proteins decreased sharply from 8 hours after treatment, and the late S and $G_2$ peaks of gag protein synthesis were disappeared. This shows the stability of viral RNA for about 6 hours in the absence of continuing viral RNA synthesis.

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Study on the Improvement of Laws Related to the Electromagnetic Wave of Mobile Phones

  • Park, Jong-Ryeol;Noe, Sang-Ouk
    • 한국컴퓨터정보학회논문지
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    • 제25권10호
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    • pp.231-240
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    • 2020
  • 이미 세계 여러나라는 핸드폰 전자파의 위험성을 경고하며 조치를 실시하여왔다. 반면 우리나라는 휴대폰 사용으로 인한 문제보다 학생들조차 핸드폰을 사용하지 못하게 하면 인권침해라고 항의하는 분위기이다. 인간의 뇌세포도 핸드폰 전자파에 더 많이 노출되고 있어 인체의 유해가능성에 대해 세계 여러나라에서 연구하고 있으며 최근의 연구한 발표결과들은 강력히 경고하고 있다. 현재 국내의 전자파 등급표시로는 국민에게 경각심을 불러일으키기에는 너무나 부족하다. IT 강국이라는 명성에 발맞추어 국립 전자파연구센터를 조직·운영하고 일반대중에게 핸드폰 전자파의 유해성을 경고하고 업계에 직접적인 의무를 부과할 수 있는 전파법제의 개정이 필요하다고 생각된다.

조건부 랜덤 필드와 컨볼루션 신경망을 이용한 의미론적인 객체 분할 방법 (Semantic Segmentation using Convolutional Neural Network with Conditional Random Field)

  • 임수창;김도연
    • 한국전자통신학회논문지
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    • 제12권3호
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    • pp.451-456
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    • 2017
  • 컴퓨터비전에서 가장 기본적이고, 복잡한 문제를 수반하는 의미론적 분할(Semantic segmentation)은 이미지의 각 픽셀을 특정 객체로 분류하며, 레이블(label)을 지정하는 작업을 수행한다. 기존에 연구되어온 확률적 그래프 모델인 MRF와 CRF는 픽셀 수준의 라벨링 작업의 정확도를 높이는 효과적인 방법으로 연구되어왔다. 본 논문에서는 최근 각광받고 있는 딥러닝의 한 부류인 CNN과 확률 모델인 CRF를 결합한 형태의 의미론적 분할 방법을 제안하였다. 학습과 성능 검증을 위하여 Pascal VOC 2012 이미지 데이터베이스를 사용하였고, 학습에 사용되지 않은 임의의 이미지를 이용하여 테스트를 진행 하였다. 연구의 결과로서 기존 의미론적 분할 알고리즘보다 더욱 뛰어난 분할 성능을 보여주었다.

화주기업 특성에 따른 해외물류센터 서비스 품질 인식차이에 관한 연구 (A Study on Perception Difference for Service Quality of Abroad Logistics Center by the Characteristics of Shippers)

  • 노윤진;박종석
    • 한국항만경제학회지
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    • 제31권4호
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    • pp.151-168
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    • 2015
  • 수출기업의 경우 최종 바이어에게 물품을 인도할 때까지 다양한 불확실성을 회피하고 안정적인 물품인도를 위한 수단으로 해외 물류센터를 이용하고 있으며, 물류센터에서 제공되는 품질 수준에 따라 바이어와의 지속적인 거래관계 구축을 도모할 수 있다. 이에 본 연구에서는 수출화주 기업을 중심으로 이들 기업이 갖고 있는 기업특성에 따라 해외물류센터를 활용하는 동기와 현지에서 이용하는 물류센터의 서비스 품질 지각에 차이가 존재하는지 분석하고자 했다. 분석결과, 해외물류센터의 활용 동기에 있어서는 기업의 규모와 제품특성에 따라서는 물류센터를 활용하는 동기에 인식차이가 존재하지 않았으며, 다수의 응답기업에서 국내외 경쟁사에 대한 대응, 바이어의 요구를 충족하기 위해 해외 물류센터를 활용하는 것으로 나타났으며, 해외물류센터 활용 시 지각하는 서비스 품질에 있어서는 물류센터 내 포장 및 라벨링 작업에서 지각하는 품질 수준이 낮은 것으로 나타났다. 또한 주로 문제발생 대응, 정시배송, 주문진행 정보 서비스 등의 변수에서 물류서비스 품질을 높게 지각하고 있는 것으로 분석되어졌다. 특히 취급제품의 특성에 따른 품질 지각 수준이 다른 것으로 분석되어 향후 바이어가 수입하는 제품의 특성에 따라 적절하게 물류센터의 서비스를 활용해야 할 필요가 있는 것으로 분석되었다.

돼지 생식기 및 호흡기 증후군 진단을 위한 in situ hybridization 기법의 응용 (Application of in situ hybridization for diagnosis of porcine reproductive and respiratory syndrome)

  • 김승재;박남용
    • 대한수의학회지
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    • 제37권4호
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    • pp.793-807
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    • 1997
  • We tried to develop detection system of porcine reproductive and respiratory syndrome virus(PRRSV) by in situ hybridization(ISH) in the piglets experimentally infected with KPRRS-2, the Korean isolate(12 piglets) or Mn-1b, the American isolate(4 piglets), and in the natural infection suspected 6 piglets. Twelve 30-days-old piglets(two pigs per each inoculated group) were inoculated by nasal instillation of KPRRS-2 virus(total dose $10^{4.5}TCID_{50}$), Six piglets(one pig per each group) were induced contact infection with inoculated piglets, during the experiment, and two piglets were used as control. Inoculated or contacted piglets were euthanized at 1, 3, 5, 7, 14 and 21 days postinoculation(DPI). The respiratory signs such as coughing and nasal discharge were observed on day 3 DPI, and ear cyanosis were on day 5 DPI, including contacted piglets. Through the necropsy, purple discolorization of dorsal part of lung, and hypertrophy of local lymph nodes were observed. The histopathological lesions of lung were interstitial pneumonia characterized by type 2 pneumocyte hyperplasia. We prepared the probe for ISH by RNA isolation from KPRRS-2, RT-PCR, and biotin labeling. We performed the ISH within only 1~2 hours using $Microprobe^{TM}$ capillary action system. As the results, the strong red specific positive signals, means PRRSV distribution, was mainly observed in the cytoplasm of alveolar macrophages. And also signals were detected in some type 2 pneumocytes and bronchiolar epithelium of lung, myocardium, liver, kidney, tonsil, spleen, gastrointestinal mucosa, testis and lymph nodes.

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RAPID PREDICTION OF ENERGY CONTENT IN CEREAL FOOD PRODUCTS WITH NIRS.

  • Kays, Sandra E.;Barton, Franklin E.
    • 한국근적외분광분석학회:학술대회논문집
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    • 한국근적외분광분석학회 2001년도 NIR-2001
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    • pp.1511-1511
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    • 2001
  • Energy content, expressed as calories per gram, is an important part of the evaluation and marketing of foods in developed countries. Currently accepted methods of measurement of energy by U.S. food labeling legislation include measurement of gross calories by bomb calorimetry with an adjustment for undigested protein and by calculation using specific factors for the energy values of protein, carbohydrate less the amount of insoluble dietary fiber, and total fat. The ability of NIRS to predict the energy value of diverse, processed and unprocessed cereal food products was investigated. NIR spectra of cereal products were obtained with an NIR Systems monochromator and the wavelength range used for analysis was 1104-2494 nm. Gross energy of the foods was measured by oxygen bomb calorimetry (Parr Manual No. 120) and expressed as calories per gram (CPGI, range 4.05-5.49 cal/g). Energy value was adjusted for undigested protein (CPG2, range 3.99-5.38 cal/g) and undigested protein and insoluble dietary fiber (CPG3, range 2.42-5.35 cal/g). Using a multivariate analysis software package (ISI International, Inc.) partial least squares models were developed for the prediction of energy content. The standard error of cross validation and multiple coefficient of determination for CPGI using modified partial least squares regression (n=127) was 0.060 cal/g and 0.95, respectively, and the standard error of performance, coefficient of determination, bias and slope using an independent validation set (n=59) were 0.057 cal/g, 0.98, -0.027 cal/g and 1.05 respectively. The PLS loading for factor 1 (Pearson correlation coefficient 0.92) had significant absorption peaks correlated to C-H stretch groups in lipid at 1722/1764 nm and 2304/2346 nm and O-H groups in carbohydrate at 1434 and 2076 nm. Thus the model appeared to be predominantly influenced by lipid and carbohydrate. Models for CPG2 and CPG3 showed similar trends with standard errors of performance, using the independent validation set, of 0.058 and 0.088 cal/g, respectively, and coefficients of determination of 0.96. Thus NIRS provides a rapid and efficient method of predicting energy content of diverse cereal foods.

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