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CpG Islands Detector: a Window-based CpG Island Search Tool

  • Kim, Ki-Bong
    • Genomics & Informatics
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    • 제8권1호
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    • pp.58-61
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    • 2010
  • CpG is the pair of nucleotides C and G, appearing successively, in this order, along one DNA strand. It is known that due to biochemical considerations CpG is relatively rare in most DNA sequences. However, in particular subsequences, which are a few hundred to a few thousand nucleotides long, the couple CpG is more frequent. These subsequences, called CpG islands, are known to appear in biologically more significant parts of the genome. The ability to identify CpG islands along a chromosome will therefore help us spot its more significant regions of interest, such as the promoters or 'start' regions of many genes. In this respect, I developed the CpG islands search tool, CpG Islands Detector, which was implemented in JAVA to be run on any platform. The window-based graphical user interface of CpG Islands Detector may facilitate the end user to employ this tool to pinpoint CpG islands in a genomic DNA sequence. In addition, this tool can be used to highlight potential genes in genomic sequences since CpG islands are very often found in the 5' regions of vertebrate genes.

CD-ROM 제품(製品) 선정을 위한 평가기준(評價基準) (A Study on the Evaluation Criteria for the Selection of Academic CD-ROM Products)

  • 최상기
    • 정보관리연구
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    • 제25권4호
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    • pp.36-55
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    • 1994
  • 본 연구는 도서관과 정보(情報)센터에서 CD-ROM 제품을 수집하는 데 필요한 평가기준을 종합적으로 고찰한 것이다. 번 연구에서는 지금까지 많은 연구에서 논의된 CD-ROM 제품 평가 기준을 관리적인 면과 기술적인 면으로 구분하였고, 기술적인 면에서는 탐색(探索) 소프트웨어와 이용자 인터페이스 범주로 세분하여 각각의 기준들을 살펴보았다. 부록(附錄)으로 CD-ROM 제품 평가에 필요한 기본적인 체크리스트를 제시하였다.

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Web을 이용한 회전기계 진동진단 사례베이스의 개발 (Development of Vibration Diagnostic Case Based System for Rotating Machinery Using Web)

  • 양보석;이창묵;길병래;길병래
    • 한국소음진동공학회:학술대회논문집
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    • 한국소음진동공학회 1997년도 추계학술대회논문집; 한국과학기술회관; 6 Nov. 1997
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    • pp.314-318
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    • 1997
  • The paper is an outline of development of vibration troubleshooting database on Web Browser which has been able to connect with the Internet. When the vibration trouble have occurred in industrial field, most important matter is that how to solve it. We expect it effective to solve the matter to develop a case base system. The System is expected that the access speed will be fast to connect with the Internet and the user will be free from to learn search queries to use graphical user interface(WWW) as a search interface.

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웹 이용자의 검색엔진 활용 및 탐색 행위와 성향 분석 (Analysis of Search Engine Use, Search Behaviors and Aptitude by Web Users)

  • 이해영
    • 한국문헌정보학회지
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    • 제36권3호
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    • pp.69-91
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    • 2002
  • 본 연구는 웹 이용자들이 검색엔진을 어떻게 선택하여. 어떠한 기능들을 활용하며, 검색결과는 어떻게 평가하는지 그리고 어떤 어려움을 겪고 있는지를 밝혀 보고자 하였다. 28명의 대학의 교수와 대학원생으로 구성된 이용자들을 대상으로 한 인터뷰결과를 분석한다. 연구 결과에 따르면, 본 연구의 참가자들은 검색결과에 대한 평가보다는 특정한 기능이나 익숙함에 근거하여 엔진을 선택하였다. 이들은 통합검색에 대해서는 의견이 양분되어 있었으며, 연산자의 사용이 결과에 미치는 영향이 거의 없다고 보고 있었다. 검색엔진에 대한 평가를 내릴 때에도 검색결과의 정확성외에 결과를 보여주는 인터페이스 디자인에도 상당한 관심을 가지고 있는 것으로 나타났다.

대학도서관 이용자의 메타서치시스템 이용행태 연구 (A Study on User Information Seeking Behavior of Metasearch System in the Academic Library)

  • 남영준;양지안
    • 정보관리학회지
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    • 제27권3호
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    • pp.307-323
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    • 2010
  • 정보환경의 변화에 따라 도서관과 웹 검색엔진의 차별성이 있음에도 불구하고 이용자들은 인터넷의 자원과 학술데이터베이스의 자원을 혼동하고 있다. 특히 구글스칼라와 같은 상업용 검색엔진의 검색속도 와 조작 편의성이라는 상대적 장점 때문에 학술데이터베이스가 갖고 있는 학술적 가치와 신뢰성에도 불구하고 이용자는 구글스칼라를 선호하고 있는 실정이다. 이 연구에서는 구글스칼라가 갖는 장점을 반영한 메타서치시스템의 특성과 가치를 인터페이스 측면과 전자정보원 측면에서 분석하였다. 또한 이러한 새로운 검색채널로서 메타서치시스템과 이와 연계된 링크리졸버를 이용하는 대학도서관의 이용통계를 분석하였다. 이를 바탕으로 구글스칼라와 차별화될 수 있는 도서관만의 특징인 이용자 이용행태 패턴과 주제별 전자정보 이용행태를 도출하여 전자정보 서비스의 방안으로 활용할 수 있음을 조사하였다.

대학 웹진의 사용자 인터페이스 디자인 조사 (A Survey on User Interface Design of University Webzines)

  • 이주희
    • 한국인터넷방송통신학회논문지
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    • 제14권6호
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    • pp.303-308
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    • 2014
  • 이 논문은 대학 웹진 현황을 토대로 웹진의 목적과 어떤 기능을 담당하는지 사용자 인터페이스 디자인 측면에서 다루고자 한다. 이를 위해 웹진의 내용적 측면과 사용자 중심의 콘텐츠 구성과 컬러 및 내비게이션 디자인 측면에서 조사해 보았다. 조사를 통해, 향후 효과적인 대학 웹진 제작을 위해 사용자와 제작자가 어떤 점에 유의하고 참고하여 디자인해야하는지 알아보고자 하였다. 웹진 제작자와 사용자의 상호 적극적인 커뮤니케이션을 활성화하고 공감하기 위해 웹진이 주요한 기능을 하고 있는지 조사를 통해 알 수 있었으며, 웹진의 이런 특성을 살려 제작한 대학들은 사용자 인터페이스 디자인 측면에서도 우수함을 알 수 있었다.

위성 영상 검색시스템의 GUI 개발을 위한 XML 적용 (Application of XML to Develop GUI within Satellite Imageries Search System)

  • 부기동;이영주
    • 한국지리정보학회지
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    • 제5권4호
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    • pp.65-74
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    • 2002
  • 본 연구의 목적은 XML 데이터 형식으로 변환되어 데이터베이스 서버에 저장된 위성영상의 정보를 웹 상에서 검색하고, 데이터의 갱신 및 재사용이 가능한 XML 기반의 GUI를 개발하는데 있다. 이러한 기능을 효율적으로 구현하기 위해서 문서 내용에 대해 구조적인 접근이 가능한 XML의 DOM 인터페이스를 이용하였으며, HTML과 JAVA 스크립트 프로그래밍을 병행하였다. 개발한 시스템은 게이오 대학 SFC 연구소의 위성 영상 관리 시스템에 적용하고 있으며, 그 결과 기술적인 효용성을 확인할 수 있었다.

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인터넷 검색엔진에서 사례기반 추론을 이용한 인터페이스 에이전트 설계 (Design of User Interface Agent user Case-Based Reasoning on Internet Search Engine)

  • 권승학;이명호
    • 한국컴퓨터정보학회논문지
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    • 제5권2호
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    • pp.50-59
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    • 2000
  • 본 연구에서는 인터넷 검색엔진에서 사용자의 관심도를 알아내고 이를 작업 수행에 적용할 수 있는 사용자 인터페이스 에이전트 시스템 구조의 설계를 제안하며, 인공지능 기법을 이용하여 에이전트 시스템을 구축하고자 할 때 인터페이스 에이전트 시스템의 문제 해결 방법으로 널리 사용되고 있는 규칙 기반 추론 시스템을 고려할 수 있다. 그러나 규칙 기반 추론 시스템은 모듈성, 균일성, 자연성 등의 장점으로 인해 비교적 많은 성공을 거두고 있으나 지식획득의 병목현상, 메모리 부재, 제한된 적용성과 같은 문제점을 가지고 있어 이러한 문제점을 해결하기 위해 본 연구에서 사례를 기반으로 한 추론 과정을 제안한다.

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클러스터 환경에서의 MPI 기반 병렬 서열 유사성 검색에 관한 연구 (Study on MPI-based parallel sequence similarity search in the LINUX cluster)

  • 홍창범;차정호;이성훈;신승우;박근준;박근용
    • 한국컴퓨터정보학회논문지
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    • 제11권6호
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    • pp.69-78
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    • 2006
  • 생물정보학 연구 있어서 아미노산이나 염기서열에 대한 유사성이나 상동성을 찾아내는 작업은 유전자의 기능에 대한 예측이나 단백질 구조를 예측하는 연구의 기반이 된다. 이러한 서열 데이터는 컴퓨터의 도입으로 매우 빠르게 증가하고 있다. 이러한 시점에서 서열에 대한 검색 속도는 매우 중요한 요소이기 때문에 대량의 서열정보를 다루기 위해서는 SMP(Sysmmetric Multi-Processors) 컴퓨터나 클러스터를 이용하고 있다. 본 논문에서는 서열 검색에 사용되는 BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)의 속도향상을 위한 방법으로 클러스터 환경에서 병렬화 하는 nBLAST 알고리즘의 병렬화에 대해 제안한다. nBLAST는 기존의 BLAST 소스코드에 대한 수정 없이 병렬라이브러리인 MPI(Message Passing Interface)를 이용하여 질의를 분할하여 병렬화 하기 때문에 환경설정 등의 복잡한 과정을 거치지 않고 손쉽게 BLAST에 알고리즘에 대한 병렬화를 할 수 있다. 또한, 실험을 통하여 28대의 리눅스 클러스터에서 nBLAST를 수행하여 노드 수의 증가에 따른 성능 향상을 확인하였다.

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인터페이스 디자인을 위한 그래픽 화면 구성요소 (A Study on Screen Layout Visual Elements of Interface Design)

  • 이화종
    • 디자인학연구
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    • 제11권2호
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    • pp.265-272
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    • 1998
  • 인터페이스 디자인(Interface Design)을 제작하는 디자이너는 그 정보를 사용자 입장에서 쉽고 빠르게 얻을 수 있게하는 기능성과 심미성을 적절히 조합하여 기능성이 강조된 진보적인 인포메이션 디자인(Inforrnation Design)을 하는 것이다. 그러므로 인터페이스 디자인 작업은 디자이너의 입장이 아닌 사용자 입장이어야 하며, 사용자의 'NEED'를 반영하고 충족시키는 정보전달을 최우선 하는 디자인이 되어야 할 것이다. 본 논문은 지금까지 정립되어있지 않은 인터페이스 디자인의 시각적인 화면(Screen Layout) 구성요소 중 필자가 선정한 10가지의 소재(Visual Elements)를, 디자이너의 입장에서 심미성을 치우쳐 시각적인 아름다움을 강조하여 자칫 인터페이스 디자인의 기본되는 기능성을 배제하는 오류를 범하는 상황을 조금이나마 축소할 수 있는 기능성을 찾아보려 한다.

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