Transferrin ($T_{f}$) has been used as a targeting ligand for delivering liposome/interleukin-12 (IL-12) pDNA complexes to cancer cells mostly due to the greater number of transferrin receptors ($T_{f}R$) found on tumor cells than on normal cells. $T_{f}$ was conjugated to liposomes via the reaction of MPB-PE with thiol groups of $T_{f}$ introduced by a heterobifunctional cross-linking agent, N-succinimidyl-3-(2-pyridyldithio)propionate (SPDP). Four days after C26 inoculation when the tumor volume reached ${\sim}100mm^{3}$, tumor-bearing Balb/c mice were injected intravenously with $T_{f}-liposome/IL-12 pDNA$complexes twice a week for 3 weeks. Significant suppression of tumor growth was achieved in the group treated with the $T_{f}-liposome/IL-12 pDNA$ complexes, with a dose of $10{\mu}g$ of IL-12 pDNA showing the highest suppression effect among the tested doses. Similar results were obtained when the therapy was initiated one day after tumor inoculation, although in this case $30{\mu}g$ IL-12 pDNA/$T_{f}-liposome$ complexes showed a significant suppression of tumor growth between 19 and 23 days after tumor inoculation. This result indicates that the transferrin receptor-targeted liposomal system is an efficient delivery agent of therapeutic genes, such as IL-12, in mice and that its potential clinical use warrants further research investigation.
본 연구는 2006년 8월부터 2007년 9월까지 여수, 남해, 진도, 무안, 거문도, 서산 및 중국의 산동에서 포획한 낙지 유전자 집단을 분석하기 위하여 미토콘드리아 16S rRNA 염기서열로 조사했다. 유전자 분석은 총 28 개체로부터 11개의 haplotype이 발견되었다. 유전자 분화율은 0.2-1.2% 범위로 나타났다. Haplotype에 대한 PHYLIP 및 network 조사에 따르면 낙지는 두개의 clade (clade AIclade B)로 나뉘어지며, clade 사이의 분화율은 0.4%로 나타났다. 지역적 거리에 따라 haplotype이 다음과 같이 분화되었다. 하나는 여수, 남해, 무안, 진도 haplotype과 다른 하나는 서산, 거문도, 산동 haplotype으로 나뉘어졌다. 계충구조 분석에서도 한국 낙지집단 및 중국과의 유전적 차이를 볼 수 있으나, 현저한 지역적 차이는 나타나지 않았다. 따라서 한국연안에 서식하고 있는 일부 낙지집단은 gene flow에 의해서 유전적 동질성을 나타낼 수 있지만, 한국집단 간 뿐만 아니라 중국집단과의 유전적 분화는 지역적 거리 및 장벽으로 인하여 제한적인 gene flow로 설명될 수 있다.
This paper presents a signal processing IC for digital HDTV, which is designed to operate in bunt-in HDW or in HD-set-top Box. The chip supports de-multiplexing an ISO/IEC 13818-1 MPEG-2 TS stream. It decodes MPEG-2 MP@HL video bitstream, and provides high-quality scaled video for display on HDTV monitor. The chip consists of ARM7TDMI for TS-Demux, PCI interface, Audio interface, MPEG2 MP@HL video decoder Display processor, Graphic processor, Memory controller, Audio int3face, Smart Card interface and UART. It is fabricated using Sam sung's 0.18-um and the package of 492-pin BGA is used.
Evaporation heat transfer characteristics by pulsating flow in a plate heat exchanger have been investigated experimentally in this study. R-l34a is evaporated by receiving heat from the hot water in the plate heat exchanger. The pulsating frequency in refrigerant side of the plate heat exchanger is varied in the range of 5-25 Hz. The operating pressure of R-l34a and mass flux of hot water are also varied 0.6-0.9 MPa and $45-105 kg/m^2s$, respectively. The experimental results indicate that evaporation heat transfer coefficient of pulsating flow is improved up to 6.3% compared with that of the steady flow at 10 Hz and $G_w=45 kg/m^2s$. It is also found that the evaporation heat transfer enhancement ratio is decreased with an increase in mass flux of hot water, and the evaporation heat transfer enhancement is little influenced by operating pressure of R-l34a.
GFAAS(graphite furnace atomic absorption spectrophotometer)를 이용하여 혈액 중 납을 분석할 때, 납은 비교적 휘발성 원소인 관계로 바탕선이 높아지므로 희화 온도를 일정 온도 이상으로 높일 수 없었다. 그래서 종래에는 매트릭스 변형제를 사용하여 희화 온도를 $700^{\circ}C$까지 올려서 희화시켜야 바탕선이 안정되었다. 본 연구에서는 광온도 및 전류 제어 장치가 부착된 기기(Shimadzu, AA-6501S)를 사용하여 온도조절을 단시간에 정확히 함으로써 매트릭스 변형제를 사용하지 않고 Triton X-100으로만 희석하여 분석해도 희화 온도 $550^{\circ}C$ 부근에서 바탕선이 안정됨을 알았다. 또한 자동 바탕 보정 장치인 $D_2$ arc형과 SR(self reversal)법을 비교해 본 결과, 같은 농도에서의 흡광도는 $D_2$ arc형이 높았으나 BGC(background correction)값은 SR법이 높음을 알았다.
Objectives: It is well known that genetic factors and environmental factors play major role in aging skin. In general, son and daughter take after their parents in appearance. But comparability of skin properties in Korean family has not been well estimated. So we evaluated the correlation of skin properties in Korean mother-daughter pairs. Methods: 10 couples of mother and daughter pair(n=20) participate in this study. Mothers and daughters were aged $50.6{\pm}2.459$ and $23.8{\pm}2.15$ years, respectively. Skin moisture, sebum, skin color and elasticity is measured using non-invasive method : Corneometer CM825, Sebumeter(MPA580), Mexameter MX18, Cutometer MPA580. Statistical analysis program we used is Minitab 14 Korea. Results: The Skin moisture of mother group was significantly higher than daughter group. And skin elasticity(R2) of the daughter group was significantly higher than mother group. In the results of correlation analysis between mother and daughter pairs, skin elasticity(R2) had high positive correlation(r=0.729, p=0.026). But skin moisture, sebum, melanin index, erythema index and skin elasticity(R5) did not be confirmed a significant correlation. Conclusions: Skin elasticity(R2) is the only factor that showed high positive correlation significantly in mother and daughter pairs. Mother and daughter share the genetic factors and environmental factors that influence skin aging. So, mother's aging pattern will be a good guide for anti-aging of daughters.
Let $X_k(x)=({\int}^T_o{\alpha}_1(s)dx(s),...,{\int}^T_o{\alpha}_k(s)dx(s))\;and\;X_{\tau}(x)=(x(t_1),...,x(t_k))$ on the classical Wiener space, where ${{\alpha}_1,...,{\alpha}_k}$ is an orthonormal subset of $L_2$ [0, T] and ${\tau}:0 is a partition of [0, T]. In this paper, we establish a change of scale formula for conditional Wiener integrals $E[G_{\gamma}|X_k]$ of functions on classical Wiener space having the form $$G_{\gamma}(x)=F(x){\Psi}({\int}^T_ov_1(s)dx(s),...,{\int}^T_o\;v_{\gamma}(s)dx(s))$$, for $F{\in}S\;and\;{\Psi}={\psi}+{\phi}({\psi}{\in}L_p(\mathbb{R}^{\gamma}),\;{\phi}{\in}\hat{M}(\mathbb{R}^{\gamma}))$, which need not be bounded or continuous. Here S is a Banach algebra on classical Wiener space and $\hat{M}(\mathbb{R}^{\gamma})$ is the space of Fourier transforms of measures of bounded variation over $\mathbb{R}^{\gamma}$. As results of the formula, we derive a change of scale formula for the conditional Wiener integrals $E[G_{\gamma}|X_{\tau}]\;and\;E[F|X_{\tau}]$. Finally, we show that the analytic Feynman integral of F can be expressed as a limit of a change of scale transformation of the conditional Wiener integral of F using an inversion formula which changes the conditional Wiener integral of F to an ordinary Wiener integral of F, and then we obtain another type of change of scale formula for Wiener integrals of F.
연구배경 : 저자들은 최근 결핵균의 자극에 의해 peripheral blood monocytes (PBM)에서 IL-$1{\beta}$와 $TNF{\alpha}$가 생성되고, 기도상피세포에서는 IL-8과 RANTES와 같은 chemokine이 생성된다는 사실을 밝힌 바 있다. 이와같은 사실은 기도상피세포가 IL-8과 RANTES와 같은 chemokine을 분비함으로써 결핵의 병인에 능동적으로 참여함을 시사한다고 하겠다. 기도상피세포에서 발현하는 chemokine들이 결핵의 병태생리에 관여한다면, 폐결핵을 일으키는 가진 균주인 H37Rv와 폐결핵을 일으키지 않는 균주인 H37Ra로 자극하였을때 기도상피세포에서 분비되는 chemokine의 성상이 다를 것이라는 가정이 가능하다. 실제로 독성을 가지고 있는 Erdman 균주와 독성을 가지고 있지 않는 H37Ra의 lipoarabinomannan(LAM) 의 구조가 다르고, 이 LAM으로 대식세포를 자극하였을때 H37Ra LAM은 대식세포에서 $TNF{\alpha}$를 생성시키지만 H37Rv LAM은 $TNF{\alpha}$를 생성시키지 못하고 이와같은 차이가 결핵균에 대한 생체의 방어기전을 설명한다는 보고가 있다. 본 연구는 폐결핵의 병태생리에서 기도상피세포의 역할을 규명하고자, 독성이 있는 균주인 H37Rv와 독성이 없는 균주인 H37Ra를 사용하여 결핵균의 독성여부에 따른 기도상피세포에서 분비되는 chemokine의 차이를 연구하고자 하였다. 방 법 : 정상인에서 채취한 말초혈액에서 말초혈액 단핵세포(PBM)를 분리하여, sonicated H37Rv, H37Ra($5{\times}10^5$ bacilli, A TCC) 또는 LPS($10{\mu}l/ml$)로 자극하면서 24시간 동안 배양하였다. 또한 PBM에 대한 interferon gamma($IFN{\gamma}$)의 영향을 평가하고자 PBM를 결핵균으로 자극하기 한 시간전에 $IFN{\gamma}$(10ng/ml, R & D) 로 전처치한 군과 $IFN{\gamma}$ 전처치 없이 자극한 군을 두었다. 24시간후 상층액을 채취하여 상층액의 일부는 $-70^{\circ}C$에서 보관하였고 이후 ELISA kit(R & D)를 이용하여 $TNF{\alpha}$와 $IL-1{\beta}$의 농도를 측정하였다. 배양된 PBM의 상충액(1 : 2 희석액 )으로 배양된 A549 세포를 다시 자극하면서 24시간 동안 배양하였다. 24시간 배양후, 상층액은 IL-8, RANTES의 측정을 위하여 $-70^{\circ}C$에서 보관하고, 남아있는 A549 세포에서 tRNA를 추출하였다. 배양 상층액에서는 ELISA kit(R & D)를 이용하여 IL-8, RANTES의 농도를 측정하였고, 추출한 tRNA는 Northern blot analysis를 이용하여 IL-8, RANTES의 mRNA의 양을 측정 정량하였다. 결 과 : 말초혈액 단핵세포를 LPS, H37Rv, 또는 H37Ra로 자극하였을 때 대조군에 바하여 $TNF{\alpha}$와 IL-$1{\beta}$의 생성이 읖미 있게 증가하였다. 독성이 없는 H37Ra로 자극하였을 때가 독성이 있는 H37Rv로 자극하였을 때보다 $TNF{\alpha}$와 IL-$1{\beta}$의 생성이 많았으나 통계적인 유의성은 없었다. $IFN{\gamma}$로 전처치하였을 때 $TNF{\alpha}$와 IL-$1{\beta}$의 생성이 전처치하지 않은 군에 비해 증가하였으나 H37Rv군과 H37Ra군 사이에 통계적으로 유의한 차이는 없었다. A549 세포를 결핵균이나 LPS로 자극한 말초혈액 단핵세포 배양액으로 자극하였을 때, RANTES와 IL-8 의 유전자 발현이 대조군에 비하여 의미있게 증가하였다(p<0.001). 또한 H37Ra 배양액으로 자극한 군에서 H37Rv 배양액으로 자극한 군에 비하여 RANTES와 IL-8의 유전자 발현이 의미있게 증가하였다 (p<0.05). A549 세포를 결핵균이나 LPS로 자극한 말초혈액 단핵세포 배양액으로 자극하였을 때 RANTES와 IL-8의 생성이 대조군에 비하여 의미있게 증가하였다. 그러나 유전자 발현과는 달리, H37Ra 배양액으로 자극한 군에서 H37Rv 배양액으로 자극한 군에 비하여 RANTES와 IL-8의 생성이 증가하였지만 통계적인 유의성은 없었다. 결 론 : 기도상피세포는 폐결핵에서 RANTES와 IL-8과 같은 강력한 chemokine을 분비하여 염증반응을 증폭시킴으로써 폐결핵의 병인에 능동적으로 참여함을 추정할 수 있었다. 그러나 말초혈액 단핵세포에서의 $TNF{\alpha}$와 IL-$1{\beta}$의 생성은 결핵균주의 독성여부에 따라 차이가 없었고, A549 세포에서도 RANTES와 IL-8의 유전자 발현은 H37Ra 에서 유의하게 증가하였으나 RANTES와 IL-8의 생성은 유의한 차이가 없어 결핵균의 독성 여부가 균주에 따른 생체의 면역반응즉 chemokine 생성의 차이 때문이라는 본 연구의 가설을 증명할 수는 없었다.
Hyeonwoo Kim;Jiwon Kim;Ji Won Cho;Kwang-Sung Ahn;Dong-Il Park;Sangsoo Kim
Genomics & Informatics
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제21권3호
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pp.40.1-40.11
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2023
Microbial community profiling using 16S rRNA amplicon sequencing allows for taxonomic characterization of diverse microorganisms. While amplicon sequence variant (ASV) methods are increasingly favored for their fine-grained resolution of sequence variants, they often discard substantial portions of sequencing reads during quality control, particularly in datasets with large number samples. We present a streamlined pipeline that integrates FastP for read trimming, HmmUFOtu for operational taxonomic units (OTU) clustering, Vsearch for chimera checking, and Kraken2 for taxonomic assignment. To assess the pipeline's performance, we reprocessed two published stool datasets of normal Korean populations: one with 890 and the other with 1,462 independent samples. In the first dataset, HmmUFOtu retained 93.2% of over 104 million read pairs after quality trimming, discarding chimeric or unclassifiable reads, while DADA2, a commonly used ASV method, retained only 44.6% of the reads. Nonetheless, both methods yielded qualitatively similar β-diversity plots. For the second dataset, HmmUFOtu retained 89.2% of read pairs, while DADA2 retained a mere 18.4% of the reads. HmmUFOtu, being a closed-reference clustering method, facilitates merging separately processed datasets, with shared OTUs between the two datasets exhibiting a correlation coefficient of 0.92 in total abundance (log scale). While the first two dimensions of the β-diversity plot exhibited a cohesive mixture of the two datasets, the third dimension revealed the presence of a batch effect. Our comparative evaluation of ASV and OTU methods within this streamlined pipeline provides valuable insights into their performance when processing large-scale microbial 16S rRNA amplicon sequencing data. The strengths of HmmUFOtu and its potential for dataset merging are highlighted.
We present a new proof of the characterization theorem for Minkowski Pythagorean-hodograph curves in the Minkowski spaces $\mathbf{R}^{n+1,m}$. For an polynomial curves $\mathbf{s}(t)=(x_1(t),...,\;x_{n+m}(t))$, we also find Minkowski Pythagorean-hodograph curves $\mathbf{r}(t)=(x_0(t),\;x_1(t),...,\;x_{n+m}(t))$. In case m=0, Minkowski Pythagorean-hodograph curves become Pythagorean-hodograph curves in the Euclidean spaces $\mathbf{R}^{n+1}$ and Theorems in this paper hold for these Pythagorean-hodograph curves.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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