• 제목/요약/키워드: plasmid pC7

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Saccharomyces cerevisiae와 Pichia pastoris에서 Bovine Pancreatic Deoxyribonuclease I의 과발현과 특성 (Overexpression and Characterization of Bovine Pancreatic Deoxyribonuclease I in Saccharomyces cerevisiae and Pichia pastoris)

  • 조은수;김정환;윤기홍;김연희;남수완
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제40권4호
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    • pp.348-355
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    • 2012
  • 본 연구에서는 S. cerevisiae와 P. pastoris에서 bovine pancreatic (bp-) DNase I의 과발현과 재조합 DNase I의 특성을 조사하였다. bp-DNase I 유전자는 GAL10 promoter, $MF{\alpha}$, GAL7 terminator 사이에 삽입하여 재조합 plasmid인 pGAL-$MF{\alpha}$-DNaseI (6.4 kb)를 구축하였다. 그리고 bp-DNase I 유전자를 AOX1 promoter, $MF{\alpha}$, AOX1 terminator 에 삽입하여 재조합 plasmid인 pPEXI (8.8 kb)를 구축하였다. 재조합 plasmid인 pGAL-$MF{\alpha}$-DNaseI과 pPEXI를 각각 S. cerevisiae와 P. pastoris 숙주세포에 형질전환시켰다. 형질전환된 효모세포들을 galactose와 methanol 배지에서 $30^{\circ}C$, 48시간 배양하면 bp-DNase I은 대부분이 배양 상등액으로 과발현되었다. P. pastoris 형질전환체는 배양 상등액에서 45.5 unit/mL의 DNase I 활성을 보였으며, 반면에 S. cerevisiae 형질전환체는 37.7 unit/mL의 DNase I 활성을 보였다. 또한 DNA 분해 특성을 조사한 결과, P. pastoris 재조합 DNase I으로 기질 DNA(calf thymus)를 처리하였을 때 1분 이내 DNA가 분해되는 것을 확인할 수 있었으며 이는 상업용 bp-DNase I과 S. cerevisiae 재조합 DNase I으로 처리했을 때보다 빠른 분해 패턴을 보였다.

재조합 균주 Escherichia coli가 생산하는 Bacillus stearothermophilus Acetyl Xylan Esterase II의 정제 및 특성 (Purification and Characterization of Acetyl Xylan Esterase II from Escherichia coli Cells Harboring Recombinant Plasmid pKMG7)

  • 김희선;서정한;최용진
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제23권4호
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    • pp.454-460
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    • 1995
  • Acetylxylan esterase II was produced by Escherichia coli HB101 harboring the recombinant plasmid pKMG7 which contained the estII gene of Bacillus stearothermophilus. Optimal medium for the production of the acetylxylan esterase by E. coli HB101/pKMG7 was determined to contain 0.5% galactose, 1% yeast extract and 1% NaCl. The enzyme produced was purified to homogeneity using a combination of 20-50% ammonium sulfate precipitation, DEAE-Sepharose CL-6B chromatography and Sephacryl S-200 gel filtration. The temperature and pH optimum of the esterase were 45$\circ$C and pH 6, respectively. The essential amino acids for the esterase activity were found to be methionine, serine, and cysteine. Molecular weight of the esterase was determined to be 28 kDa by SDS-polyacrylamide gel electrophoresis, and 120 kDa by gel filtration. This suggests that the functional enzyme is a homomeric tetramer. The esterase had an isoelectric point of pH 3.4. The N-terminal amino acid sequence of the enzyme was Ala-Leu-Phe-Glu-Ser-Arg-Phe-Phe-Ser-Glu-Val-Leu-Gly-Leu.

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알카리내성 세균의 생리적 특성 및 형질전환 (Physiological properties and transformation of alkaline-tolerant bacteria)

  • 유주현;정용준;정건섭;오두환
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제14권3호
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    • pp.239-244
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    • 1986
  • 새로운 알카리내성 숙주균주를 개발하기 위하여 토양으로부터 알카리조건하에서 생육하는 미생물을 분리하고 이들 중에서 amylase활성과 Protease활성 및 항균력을 동시에 가지며 plasmid pUB 110이 형질전환 되어 이 plasmid가 안정하게 유지되는 균주를 선정하여 알카리내성 Bacillus sp. YA-14로 동정하였다. 분리균주의 amylase와 protease는 각각 pH 8.0과 pH 7.5에서 가장 활성이 높았으며 피검균으로 사용한 B. subtilis와 Sarcina lutea에 항균력을 나타내었다. 분리균주의 형질전환에는 0.4% MgSO$_4$ 가 함유된 modified SPI배지 (MSPI, pH8.0)를 사용하였으며 말기대수증식기의 균체가 적당하였다. Transformant는 20세대 계대배양 후에도 pUB,110plasmid가 안정하게 유지되어 형질발현되었다. 이 결과로부터 분리균주는 Bacillus속의 host-vector계에서 새로운 알카리내성 숙주균주로서 이용할 수 있는 가능성을 보여주었다.

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젖산균의 Plasmid DNA 분리방법 및 Electroporation에 의한 젖산균의 형질전환에 관한 연구

  • 김선기
    • 한국유가공학회:학술대회논문집
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    • 한국유가공기술과학회 1997년도 춘계 제44회 유가공 심포지움
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    • pp.41-61
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    • 1997
  • 젖산균의 유전자 연구를 촉진하기 위해 간단하고 신속한 plasmid DNA의 분리방법과 electro-poration을 이용하여 vector plasmid의 간단하고 신속한 전이방법을 얻기 위해 젖산균의 형질전환에 영향하는 요인에 대하여 연구하였으며 연구결과는 다음과 같다. 1. O'Sullivan과 Klaenhammer의 방법을 개선하여 젖산균 plasmid DNA의 분리에 좋은 결과를 얻을 수 있는 신속하고 쉬운 방법을 고안하였으며, genomic DNA 분리에 이용되는 guanidium thio-cyanate 처리방법을 plasmid의 분리에 적용할 수 있었다. 2. L. casei, L. acidophilus. L. delbruekii var. bulgaricus. L. brevis와 L. plantarum 균주에서 plasmid를 확인하였으며, 돼지 분에서 분리된 L. lactis ssp. lactis. L. fermentum과 L. plantarum에서도 plasmid를 분리 확인하였다. 3. Lactococci의 plasmid분리는 lactobacilli와는 달리 mutanolysin의 처리없이도 잘 되었으며, L. lactis ssp. lactis와 Ent. faecalis에서 plasmid를 확인하였다. 4. E. coli plasimd 분리에 이용되는 MPS membrane filter 방법으로 젖산균 plasmid pLZ12의 분리가 가능하였으나, 세포파편이 filter를 막아 사용에 어려움이 있는 것으로 확인되었다. 5. Plasmid 분리없이 electroporation을 이용한 세포 대 세포 전이법으로 간편하고 빠르게 E. coli DH5${\alpha}$에 E. coli Jm109의 plasmid pBX19, pBR322를 전이시켰다. 6. L. lactis ssp. lactis 균주에 lysozyme 처리시 30${\sim}$80%의 생존율을 보였으며, 대부분의 L. acidophilus 균주의 경우 약 70%의 생존율을 보였다. L. casei 102S의 경우는 45분간 처리 시에도 100%의 생존율을 보였다. 8. L. lactis ssp. lactis 균주에 pLZ12를 6.0kV에서 전이시킨 결과 12.5kV에서보다 형질전환 효율이 훨씬 높았으며 lysozyme 처리에 의해 형질전환 효율이 증가되었다. 9. L. acidophilus 균주에 pLZ12를 전이시 6.0kV에서는 전이가 모두 이루어졌으나, 12.5kV에서는 L. acidophilus WIESBY와 NCFM에서 전이가 이루어지지 않았으며, lysozyme 처리 후 pLZ12를 전이시켰을 때 12kV보다 6.0kV에서 형질전환 효율이 증가되었다. 10. Gene Pulser와 Progenitor II를 사용하여 pLZ12를 L. lactis ssp. lactis 균주에 전이하였을 때 Gene Pulser에 비해 Progenitor II의 형질전환 효율이 현저히 떨어졌다. L. acidophilus HY7008과 HY7001은 두 기기 모두 형질전환이 이루어졌으나, L. acidophilus WEISBY와 NCFM은 Progeni-tor II에서 전이가 일어나지 않았으며, Gene Pulser에서 전이균주를 얻어 두 electroporator간에 형질전환 효율의 차이를 보였다. 11. L. casei 102S에 pLZ12를 electroporation시 낮은 전압에서 형질전환 효율이 비교적 좋았으며, 배양 시기를 달리하여 전이시켰을 때 대수생장 말기의 세포가 형질전환 효율이 좋았다. 12. L. casei 102S세포를 각각 10% glycerol, EB, 2차 증류수 등에 녹여 electroporation을 실시하였을 때 각각 $3.8{\times}10^3$, $5.0{\times}10^2$,1.5${\times}10^2$cfu의 형질전환 효율을 보였으며, 1.0mM HEPES, TE buffer를 사용하였을 때에는 전이가 이루어지지 않았다. 13. Plasmid pLZ12의 농도를 달리하여 electroporation을 하였을 때 형질전환 효율이 농도에 비례하여 증가하였다. 14. L. casei 102S에 대수생장 말기의 세포를 채취하여 10% glycerol, 200 Ohms, 25 ${\mu}$FD, 10kV/cm로 plasmid pLZ12를 electroporation할 때 최대 형질전환 효율인 3.8${\times}$10$^{3}$cfu를 얻었으며, lysozyme 처리가 다른 젖산균과는 달리 형질전환 효율을 증가시키지 못하였다. 15. L. casei 102S 세포를 10% glycerol과 EB에 녹여 -20$^{\circ}C$에서 냉동시킨 다음 1일과 7일 후의 세포를 electroporation한 결과 냉동시 세포에 손상을 주는 것으로 인식되었다.

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Characterization of the Plasmid-Encoded Arsenic Salts Resistance Determinant from Klebsiella oxytoca D12

  • Rhie, Ho-Gun;Lee, Sung-Jae;Lee, Ho-Sa
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제14권3호
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    • pp.593-598
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    • 2004
  • The arsenical resistance (ars) operon was cloned from a 67-kilobase pair (kb) plasmid, which was previously shown to be responsible for arsenic salts resistance in K. oxytoca D12. When plasmid pAE48, carrying the ars operon, was transformed into E. coli, transformed cells displayed enhanced survival in the presence of 4 mM arsenite, 50 mM arsenate, or 0.4 mM antimonite. The nucleotide sequence of the 5.6-kb fragment encoding arsenical resistance revealed five open reading frames (ORFs), which were predicted to encode polypeptides of 12.8 (arsR), 13.4 (arsD), 62.6 (arsA), 45 (arsB), and 16.7 (arse) kilodaltons (kDa). Each ORF was preceded by a ribosome binding site. A putative promoter-like sequence was identified upstream of arsR, and a possible termination site was found downstream of arsC. When the deduced amino acid sequences of the K. oxytoca Dl2 Ars proteins were compared with the amino acid sequences of the E. coli R773 Ars proteins, a significant amino acid similarity was observed (87.9% for ArsR, 89.2% for ArsD, 83.2% for ArsA, 92.6% for ArsB, and 91.3% for ArsC), suggesting an evolutionary relationship of the ars genes of E. coli plasmid R773 and K. oxytoca Dl2.

Cephalosporin C의 생변환을 위한 Trigonopsis variabilis의 D-amino Acid Oxidase 유전자의 클로닝 및 발현 (Cloning and Expression of D-amino Acid Oxidise from Trigonopsis variabilis for Cephalosporin C Biotransformation)

  • 이진형;정태완
    • KSBB Journal
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    • 제10권3호
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    • pp.264-270
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    • 1995
  • Trigonopsis variabilis는 버l타락탐 항생제인 cephalosporin C (ceph C)를 ${\alpha}$-keto-adipyl-7 a aminocephalosporanic acid(AKA-7 ACA)로 생변 환하는 강력한 D-amino acid oxidase 효소를 갖고 있다. 본 연구는 이 D-AAO 효소의 유전자를 추출하기 위하여 polymerase chain reaction (PCR)을 사용하였다. PCR 단편을 콜로닝하기 위하여 Taq D DNA polymerase, Klenow, T4 DNA polymerase I, Alkaline phosphatase Calf Intestinal와 T4 kinase 의 효소반응을 이용하여 4가지의 방법을 샤용한 결 과, blunt - end 의 PCR fragment 를 phosphory­l lation하고 blunt -end의 pUC18 plasmid를 dephos phorylation 한 후 ligation 한 것 이 가장 좋은 클로 닝 효율을 보였다. Ceph C에 대한 D-AAO 효소의 활성은 재조합 E. coli의 세포추출액과 permea bilized cells에서 모두 확인할 수 있었다.

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항생제 다제내성균 Staphylococcus aureus SA2로부터 분리한 테트라사이클린 내성 플라스미드 pKH6의 염기서열

  • 이대운;윤성준;김우구;신철교;임성환;이백락;문경호
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제24권4호
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    • pp.423-426
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    • 1996
  • The complete nucleotide sequence of pKH6, a tetracycline-resistance (Tc$^{r}$) plasmid isolated from multi-drug resistant Staphylococcus aureus SA2, has been determined and compared with that of the staphylococcal Tc$^{r}$ plasmid pTl8l. The nucleotide sequences of the two plasmids are in agreement except for 7 nucleotides. All differences are caused by base pair substitutions. Among 6 substitutions, 3 occurred in coding regions. However, only two base substitutions in coding regions resulted in changes of amino acid sequences in two different ORFs of repC and Pre proteins.

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Saccharomyces cerevisiae에서 Bacillus CGTase의 표층발현 (Surface Display of Bacillus CGTase on the Cell of Saccharomyces cerevisiae)

  • 김현철;임채권;김병우;전숭종;남수완
    • 생명과학회지
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    • 제15권1호
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    • pp.118-123
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    • 2005
  • B. stearothermophilus 유래의 CGTase 유전자(cgtS)를 보유하고 있는 재조합 plasmid pCGTS (4.8 kb)을 효모 표면 발현용 vector인 pYDl (GAL1 promoter)에 subcloning 하였다. 구축된 재조합 plasmid, pYDCGT (7.2 kb)는 S. cerevisiae EBY100에 형질전환하였고, tryptophan이 결여된 SD 배지에서 1차 선별된 형질전환체들을 YPGS배지에서 배양 후 활성 염색을 통하여 CD가 생 성 됨을 확인하였다. 배양시간과 효소반응시간에 따른 반응 산물을 TLC로 분석 한 결과, 배양 12시간째부터 효소활성이 나타났고, 반응 10분 이후부터 CD가 생성되어 시간이 지남에 따라 CD 생성양이 증가하는 것을 확인하였다. 회분 배양한 결과 $25^{\circ}C$$30^{\circ}C$에서 CGTase의 최대 활성이 각각 21.3 unit/1 와 16.5 unit/1로 나타났고, plasmid 안정성은 각각 $86\%$$82\%$로 나타나 배양온도에 상관없이 plasmid는 비교적 안정하게 유지되었다.

Microbial Transformation of Aniline to Acetaminophen

  • Lee, Sang-Sup;Jin, Hyung-Jong;Son, Mi-Won
    • Archives of Pharmacal Research
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    • 제15권1호
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    • pp.30-34
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    • 1992
  • In order to obtain acetaminophen, a popular analgesic-antipyretic, through microbial p-hydroxylation and N-acetylation of aniline, various fungi and bacteria were secreened. Among them, Streptomyces species were chosen for strain improvement by the use of interspecific protoplast fusion technique. Two interspecific fused strains were developed between S. rimosus (N-cetylation function) and S. aureofaciens (p-hydroxylation function) and also between S. lividans and S. globisporus. For efficient protoplast fusion and cell wall regeneration, various conditions were examined. In a typical experiment of mixed S rimosus ($pro^- \;his^-$) and S. aureofaciens ($ilv^-$) protoplasts with 40% (w/v) polythylene glycol 3350 (PEG) for 3 min gave $8.3\times10^{-7}$ of fusion frequency. Treatment of mixed S. lividans (pant-) and S. globisporus (leu-) protoplasts with 50% (w/v) PEG for 3 min at $30^\circ{C}$ gave $1.2\times10^{-6}$ of frequency. Among the fused strains, up to 40-50% increase in p-hydroxylation power was observed. To investigate the possibility of plasmid involvement in p-hydroxylation power was observed. To investigate the possibility of plasmid involvement in p-hydroxylation of acetanilide, plasmid curing was attempted. We found that cells treated with acriflavine (at the frequency of 100%) and cells regenerated from protoplsts of S. auroefaciens (2% frequency) lost their p-hydroxylation function.

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Plasmid-associated Bacteriocin Production by Leuconostoc sp. LAB145-3A Isolated from Kimchi

  • Choi, Yeon-Ok;Ahn, Cheol
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제7권6호
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    • pp.409-416
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    • 1997
  • Leuconostoc sp. LAB145-3A isolated from kimchi produced a bacteriocin which was active against food pathogens, such as Listeria monocytogenes, Enterococcus faecalis, and E. faecium. Bacteriocin production occurred during the early exponential phase of growth and was stable upto the late stationary phase of growth. Optimum conditions for bacteriocin production were $37^{\circ}C$ with an initial pH of 7.0. The bacteriocin of LAB145-3A was sensitive to proteases, but stable for solvents, pH change and heat treatment. It was stable even at autoclaving temperature for 15 min. The bacteriocin exhibited a bactericidal mode of action against Lactobacillus curvatus LAB170-12. The bacteriocin produced by Leuconostoc sp. LAB145-3A was purified by CM-cellulose cation exchange column chromatography and Sephadex G-50 gel filtration. The purification resulted in an approximate 10,000-fold increase in the specific activity. Approximately 4% of the initial activity was recovered. Purified bacteriocin exhibited a single band on the SDS-PAGE with an apparent molecular weight of 4,400 daltons. This bacteriocin was named leucocin K. Leuconostoc sp. LAB145-3A had two residential plasmids with molecular sizes of 23 kb and 48 kb. A comparison of plasmid profiles between LAB145-3A and its mutants revealed that the 23 kb plasmid (pCA23) was responsible for bacteriocin production and immunity to the bacteriocin in Leuconostoc sp. LAB145-3A.

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