For the isolation of a plant growth-promoting rhizobacteria, strain YK-5 was selected from approximately 400 thermostable strains isolated from special soil samples. Strain YK-5 produced an antifungal compound, and optimum carbon and nitrogen sources for the production of the antifungal compound were investigated against Aspergillus flavus as a test strain. Modified LB medium containing 1% peptone, 1% yeast extract and 5% black sugar was determined to be the optimal medium for growth and antifungal compound production. Culture broth of strain YK-5 potently inhibited growth of the phytopathogenic fungus Fusarium oxysporum KACC 40052 for 7 days. The plant growth-promotion function of strain YK-5 was tested against radish and rice in pot trials. Leaf number, plant height and root length in YK-5-treated radish markedly exceeded (> 60%) those of untreated radish. Leaf length and white rootlet development were markedly more prominent than in commercially-treated rice plants. Strain YK-5 was determined to be Bacillus subtilis YK-5 by physiological, chemotaxonomical, and phylogenetical analyses.
A phosphate-solubilizing bacterial strain isolated from Hippophae rhamnoides rhizosphere was identified as Rahnella sp. based on its phenotypic features and 16S rRNA gene sequence. The bacterial strain showed the growth characteristics of a cold-adapted psychrotroph, with the multiple plant growth-promoting traits of inorganic and organic phosphate solubilization, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate-deaminase activity, ammonia generation, and siderophore production. The strain also produced indole-3-acetic acid, indole-3-acetaldehyde, indole-3-acetamide, indole-3-acetonitrile, indole-3-lactic acid, and indole-3-pyruvic acid in tryptophan-supplemented nutrient broth. Gluconic, citric and isocitric acids were the major organic acids detected during tricalcium phosphate solubilization. A rifampicin-resistant mutant of the strain exhibited high rhizosphere competence without disturbance to the resident microbial populations in pea rhizosphere. Seed bacterization with a charcoal-based inoculum significantly increased growth in barley, chickpea, pea, and maize under the controlled environment. Microplot testing of the inoculum at two different locations in pea also showed significant increase in growth and yield. The attributes of cold-tolerance, high rhizosphere competence, and broad-spectrum plant growth-promoting activity exhibited the potential of Rahnella sp. BIHB 783 for increasing agriculture productivity.
Lee, Shin Ae;Kim, Sang Yoon;Sang, Mee Kyung;Song, Jaekyeong;Weon, Hang-Yeon
Korean Journal of Microbiology
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v.53
no.4
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pp.342-343
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2017
Bacillus velezensis T20E-257 was isolated from the root tissue of a tomato plant and exhibited plant growth-promoting activity. Here we present the complete genome of strain T20E-257. The genome contains 3,900,066 base pairs with a G + C content of 46.7% in 2 contigs. The genome includes 3,708 coding sequences, 27 rRNAs, and 86 tRNAs. We found gene clusters encoding secondary metabolites with an antimicrobial activity and genes related to the production of indole-3-acetic acid and 2,3-butanediol, which play a role in plant growth and health.
Hong, Eun Hye;Lee, Sun Hee;Vendan, Regupathy Thamizh;Rhee, Young Ha
Korean Journal of Microbiology
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v.48
no.4
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pp.246-253
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2012
The purpose of this study was to investigate the molecular diversity of rhizobacteria associated with ginseng of varying age levels and their plant benefiting attributes. A total of 143 different isolates belonging to 15 different bacterial genera were recovered. Although variation was found in the rhizobacterial community due to age of the plant, majority of bacteria belong to Firmicutes (58%). In which, Bacillus was found to be the predominant genus irrespective of age of the ginseng. To assess the plant benefiting attributes, 30 representative isolates were selected. The results indicated that some of the isolates could exhibit multiple plant growth promoting traits like secretion of cell wall degrading enzymes, production of indole-3-acetic acid, synthesis of siderophores, solubilization of phosphates and soil pathogens inhibition. It can be suggested that strains of B. subtilis, B. amyloliquefaciens, B. velezensis, and B. licheniformis were positive for all the above traits, which have potential to be used as plant growth promoting inoculants to improve ginseng crop in the future.
Microorganisms present in the rhizosphere soil plays a vital role in improving the plant growth and soil fertility. Many kinds of fertilizers including chemical and organic has been approached to improve the productivity. Though some of them showed significant improvement in yield, they failed to maintain the soil properties. Rather they negatively affected soil eventually, the land became unsuitable for agricultural. To overcome these problems, microorganisms have been used as effective alternative. For past few decades, plant growth promoting rhizobacteria (PGPR) and arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) have been used as effective inoculants to enhance the plant growth and productivity. PGPR improves the plant growth and helps the plant to withstand biotic and abiotic stresses. AM fungi are known to colonize roots of plants and they increase the plant nutrient uptake. Spore associated bacteria (SAB) are attached to spore wall or hyphae and known to increase the AMF germination and root colonization but their mechanism of interaction is poorly known. Better understanding the interactions among AMF, SAB and PGPR are necessary to enhance the quality of inoculants as a biofertilizers. In this paper, current knowledge about the interactions between fungi and bacteria are reviewed and discussed about AMF spore associated bacteria.
Kim, Tae-Sung;Choi, Sang-Il;Yang, Jae-Kyu;Lee, In-Sook;Bae, Bum-Han
Journal of Soil and Groundwater Environment
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v.15
no.3
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pp.15-26
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2010
The contaminated soils near abandoned mine area can threaten human's health and natural ecosystems through multiple pathways. Remediation of contaminated soil using physicochemical technologies are expensive and destructive of soil environments. On the other hand, environmentally friendly approach that maximize biological remediation, that is, phytoremediation, attracts attention as a low carbon green growth technology. This research is a field demonstration study, focused on the enhanced phytoremediation by bioaugmenting PGPR(Plant Growth Promoting Rhizobacteria)that is helpful on the growth of and heavy metal removal by Echinochloa frumentacea, at a Zn contaminated paddy soil near SamBo mine at Hwasung, Kyunggi. The results showed that the zinc removal by the plant with PSM(Phosphate Solubilizing Bacteria), a kind of PGPR, was three times higher than that by the control. The results are valuable as it is a result from the field-scale technology demonstration. The results also implies that application of PGPR can enhance heavy metal removal from contaminated soil in full scale phytoremediation using Echinochloa frumentacea.
BACKGROUND: Salinity is one of the major limiting factors in agriculture that affect the growth and productivity of crops. It is economically difficult to artificially purify the soil affected by salt. Therefore, the use of plant growth-promoting bacteria (PGPB) in an effort to reduce stress caused by salt is emerging as a cost-effective and environment-friendly method. In this study, the purpose was to isolate the salt-tolerant bacteria from the rhizosphere soil and identify their ability to promote plant growth under salt stress condition. METHODS AND RESULTS: The isolates KST-1, KST-2, AST-3, and AST-4 that showed plant growth-promoting activity for barley in salt conditions were close to Bacillus cereus (KST-1, KST-2, and AST-4) and Bacillus thuringiensis (AST-3) and showed high salt tolerance up to 7% of additional NaCl to the media. When inoculated to barley, the strains had only minor effect on the length of the barley. However, the concentrations of chlorophyll in the barley leaves were found to be higher from the bacteria-inoculated pots than those from the uninoculated control. In particular, the chlorophyll concentration in Bacillus cereus AST-4 experiment was 5.45 times higher than that of the uninoculated control under the same experimental condition. CONCLUSION(S): The isolated salt-tolerant bacteria were found to influence on chlorophyll concentration of the barley. As represented by the strain AST-4, microbes may suggest a cost-effective and environmentally benign method to alleviate salt stress of crops cultivated in salt-accumulated soils such as reclaimed lands.
This study is an evaluation of growth-promoting effects of methyl and ethyl alcohol on Korean radish and cabbage in the soil. In an experiment as College of Education, Seoul National University, Silt loams, which are treated seven times with methyl and ethyl alcohol at rates from 0.5cc. to 2.5cc. per pot, definitely increase growth rate of radish and cabbage seedlings originating from sterilized seeds. A strong, stimulating effect on the growth of radish and cabbage seedlings is produced when a rate of 0.5cc. per pot of alcohol is applied to pot soils. The effect of methyl alcohol is stronger in fresh weight, dry weight, and average height of radish and cabbage than that of ethyl alcohol.
Pyo, Jae Sung;Shrestha, Sarmila Amatya;Park, Song Hee;Kang, Jae Seon
Journal of Life Science
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v.24
no.12
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pp.1308-1315
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2014
Biological control using the plant growth-promoting Rhizobacterium (PGPR) has received significant attention in recent years. PGPR has been linked with promoting growth in economically important crops, such as potatoes, tomatoes, and rice. Bacillus mojavensis KJS-3 (Moja-3), isolated from food waste, possesses antifungal properties against Aspergillus terreus, A. fumagatus, A. flavus, and Fusarium redolense, and it may have potential in the development of products for industrial applications. The main purpose of this study was to determine the effects of spraying the PGPR Bacillus mojavensis KJS-3 on the growth of altari radish (leaf number, leaf length, leaf weight, root length, and rhizome length, adjacent portion diameter, and weight) and lettuce (leaf number, length, width, and weight). Three different concentrations of the foliar spray treatment of B. mojavensis KJS-3 were applied to the altari radish and lettuce: the recommended standard concentration of $1{\times}10^9cfu/g$, half the standard concentration of $0.5{\times}10^9cfu/g$, and double the standard concentration of $2{\times}10^9cfu/g$). The B. mojavensis strain foliar spray treatment increased the growth of the leaves and roots of the altari radish and increased the growth of the lettuce leaves. For both plants, the recommended concentration of B. mojavensis KJS-3 produced better growth than half the standard concentration, and the growth was similar with the double dose. This study demonstrates positive effects of Moja-3, suggesting it may be a potential new bio-fertilizer for improving the growth of altari radish and lettuce.
In search of an effective biological control agent against the tomato pathogen Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici, rhizospheric soil samples were collected from eight agro-ecological zones of Bangladesh. Among the bacteria isolated from soil, 24 isolates were randomly selected and evaluated for their antagonistic activity against F. oxysporum f. sp. lycopersici. The two promising antagonistic isolates were identified as Brevundimonas olei and Bacillus methylotrophicus based on morphological, biochemical and molecular characteristics. These two isolates were evaluated for their biocontrol activity and growth promotion of two tomato cultivars (cv. Pusa Rubi and Ratan) for two consecutive years. Treatment of Pusa Rubi and Ratan seeds with B. olei prior to inoculation of pathogen caused 44.99% and 41.91% disease inhibition respectively compared to the untreated but pathogen-inoculated control plants. However, treatment of Pusa Rubi and Ratan seeds with B. methylotrophicus caused 24.99% and 39.20% disease inhibition respectively. Furthermore, both the isolates enhanced the growth of tomato plants. The study revealed that these indigenous bacterial isolates can be used as an effective biocontrol agent against Fusarium wilt of tomato.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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