Understanding complex relationships among heterogeneous biological data is one of the fundamental goals in biology. In most cases, diverse biological data are stored in relational databases, such as MySQL and Oracle, which store data in multiple tables and then infer relationships by multiple-join statements. Recently, a new type of database, called the graph-based database, was developed to natively represent various kinds of complex relationships, and it is widely used among computer science communities and IT industries. Here, we demonstrate the feasibility of using a graph-based database for complex biological relationships by comparing the performance between MySQL and Neo4j, one of the most widely used graph databases. We collected various biological data (protein-protein interaction, drug-target, gene-disease, etc.) from several existing sources, removed duplicate and redundant data, and finally constructed a graph database containing 114,550 nodes and 82,674,321 relationships. When we tested the query execution performance of MySQL versus Neo4j, we found that Neo4j outperformed MySQL in all cases. While Neo4j exhibited a very fast response for various queries, MySQL exhibited latent or unfinished responses for complex queries with multiple-join statements. These results show that using graph-based databases, such as Neo4j, is an efficient way to store complex biological relationships. Moreover, querying a graph database in diverse ways has the potential to reveal novel relationships among heterogeneous biological data.
This research focused on the major determinants for the strategic utilization of technology tree as a strategic technology information repository after the adoption of the technology tree in the R&D intensive organization. The study was performed based on both theoretical study and qualitative case study approaches. The result is as follows; for the strategic utilization of the technology tree for the information repository, it should be the market base and be closely related with the technology roadmap. In terms of the needs of times, this study regarding the strategic utilization of technology tree as a strategic technology information repository and as a s strategic supplement for technology roadmap is anticipated to be a good reference for the R&D-oriented organizations and technology-related studies in coming years.
Journal of the Korean association of regional geographers
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v.8
no.4
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pp.529-541
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2002
This paper aims to provide a context-specific interpretation on the shifting process of in-house R&D spaces in a large Korean firm in the context of rapidly changing markets and technology. Drawing on the case study of LG Electronics Company, one of the Korea's flagship companies, I examine the causes and mechanisms leading to a shift in domestic R&D spaces and the nature of learning processes between R&D teams and between R&D and other organizational units, particularly manufacturing. It appears that the current reshaping processes of domestic R&D spaces in LGE focus more on the clustering of core R&D laboratories than the geographical integration of conception and execution. However, it should not simply be viewed that such a move would be reduced to the linear model of innovation and organizational learning. Instead, it involves the firm-specific mode of regulating organizational competences. As contextual variables to induce such a firm-specific mode of organizational change, I consider the spatial form of organization, the spatial sources of knowledge and learning, and the powers of relational learning that can be made between distanciated actors and teams.
Journal of the Korean Association of Geographic Information Studies
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v.10
no.4
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pp.35-45
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2007
Currently, the necessity of inter-system integration and sharing system increases to additionally construct and efficiently utilize the geographical information data in accordance with the increase in demand for geographical information. The provision of the data within the domestic sharing system is led by the tasks within national geographical information distribution network or intra-local governmental combined system. However, any voluntary geographical information sharing cooperation body is increasingly required with the increase in necessity of administrative cooperation among neighboring metropolitan areas, including space planning and development. Accordingly, this study is aimed at looking into the constitutions and roles of cooperation bodies within metropolitan areas by the composition, distribution, update and management of data with special regard to overseas advanced cases whose sharing systems and their effects are highly evaluated, and at presenting any model of the domestic future voluntary sharing cooperation organization within metropolitan area.
Proceedings of the Korean Radioactive Waste Society Conference
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2003.11a
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pp.141-148
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2003
A data collection of a liquid radioactive waste treatment process of a research organization became necessary while developing the RAWMIS(Radioactive Waste Management Integration System) which it can generate personal history management for efficient management of a waste, documents, all kinds of statistics. This paper introduces an input and output application program design to do to database with data in the results and a stream process of a treatment that analyzed the waste occurrence present situation and data by treatment process. Data on the actual treatment process that is not limited experiment improve by a document, human traces, saving of material resources and improve with efficiency of tracking about a radioactive waste and a process and give help to radioactive waste material valance and inventory study.
A systems biology approach for the identification of perturbed molecular functions is required to understand the complex progressive disease such as breast cancer. In this study, we analyze the microarray data with Gene Ontology terms of molecular functions to select perturbed molecular functional modules in breast cancer tissues based on the definition of Gene ontology Functional Code. The Gene Ontology is three structured vocabularies describing genes and its products in terms of their associated biological processes, cellular components and molecular functions. The Gene Ontology is hierarchically classified as a directed acyclic graph. However, it is difficult to visualize Gene Ontology as a directed tree since a Gene Ontology term may have more than one parent by providing multiple paths from the root. Therefore, we applied the definition of Gene Ontology codes by defining one or more GO code(s) to each GO term to visualize the hierarchical classification of GO terms as a network. The selected molecular functions could be considered as perturbed molecular functional modules that putatively contributes to the progression of disease. We evaluated the method by analyzing microarray dataset of breast cancer tissues; i.e., normal and invasive breast cancer tissues. Based on the integration approach, we selected several interesting perturbed molecular functions that are implicated in the progression of breast cancers. Moreover, these selected molecular functions include several known breast cancer-related genes. It is concluded from this study that the present strategy is capable of selecting perturbed molecular functions that putatively play roles in the progression of diseases and provides an improved interpretability of GO terms based on the definition of Gene Ontology codes.
Awodele, Olufunsho;Popoola, Temidayo D.;Ogbudu, Bawo S.;Akinyede, Akin;Coker, Herbert A.B.;Akintonwa, Alade
Safety and Health at Work
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v.5
no.2
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pp.106-111
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2014
Background: The manufacture of paint involves a variety of processes that present with medical hazards. Safety initiatives are hence introduced to limit hazard exposures and promote workplace safety. This aim of this study is to assess the use of available control measures/initiatives in selected paint factories in Lagos West Senatorial District, Nigeria. Methods: A total of 400 randomly selected paint factory workers were involved in the study. A well-structured World Health Organization standard questionnaire was designed and distributed to the workers to elicit information on awareness to occupational hazards, use of personal protective devices, and commonly experienced adverse symptoms. Urine samples were obtained from 50 workers randomly selected from these 400 participants, and the concentrations of the heavy metals (lead, cadmium, arsenic, and chromium) were determined using atomic absorption spectroscopy. Results: The results show that 72.5% of the respondents are aware of the hazards associated with their jobs; 30% have had formal training on hazards and safety measures; 40% do not use personal protective devices, and 90% of the respondents reported symptoms relating to hazard exposure. There was a statistically significant (p < 0.05) increase in the mean heavy metal concentrations in the urine samples obtained from paint factory workers as compared with nonfactory workers. Conclusion: The need to develop effective frameworks that will initiate the integration and ensure implementation of safety regulations in paint factories is evident. Where these exist, there is a need to promote adherence to these practice guidelines.
During the past decade after entering the World Trade Organization (WTO), China has quickened its integration into the global economy while its foreign trade has been further invigorated. On the 10th anniversary of China's accession to the WTO, the Chinese government issues White Paper to give a comprehensive introduction to China's foreign trade development. Through this paper, the Chinese government introduces I. Historic Progress in China's Foreign Trade II. Reform of and Improvements to China's Foreign Trade System III. The Development of China's Foreign Trade Contributes to the World Economy IV. Promoting Basically Balanced Growth of Foreign Trade V. Constructing All-round Economic and Trade Partnerships with Mutually Beneficial Cooperation VI. Realizing Sustainable Development of Foreign Trade. At present, the underlying impact of the international financial crisis, the protracted, arduous and complicated nature of the world economic recovery is manifesting itself, and the global economic structure and trade layout face in-depth readjustment. China will make new adjustments to its foreign trade, in an effort to turn foreign trade from scale expansion to quality and profit improvement, and from mainly relying on its low-cost advantage to enhancing its comprehensive competitive edge, thereby turning China from a big trading country to a strong trading power. China's foreign trade is still hampered by many uncertainties and is bound to meet new difficulties and challenges. During the 12th Five-year Plan period China will open itself wider to the outside world as a driver for further reform, development and innovation, make full use of its advantages, strengthen international cooperation in all respects. And at the same time China integrate itself into the world economy on a wider scale and at a higher level. China is willing to work with its trading partners to cope with the various challenges facing the world economy and trade, and promote its foreign trade to realize a more balanced, coordinated and sustainable development, and share prosperity and mutually beneficial results with its trading partners.
Journal of the Korean Society for information Management
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v.32
no.4
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pp.167-203
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2015
This study tends to apprehend how much public library contributes to a role of upbuilder of digital integrated local society through a survey. For this, I performed the survey on 935 organization of public library in the whole country registered in national library statistical system. As a result, firstly, it's apprehended that equipment infra, Internet infra, etc like computer, laptop, scanner, tablet PC, etc are in relatively high level. Secondly, service or resource like electronic book, digital and virtual reference service, library service mobile App, etc that users can use are in relatively high level but software supporting cooperation and group task, fusibility of participating space, etc are shown very low level. Thirdly, the rate of literacy training relating to technology were only 22.4%, education subject focused on resource searching subject and somewhat future-oriented technical education like directions of video conference technique, cloud computing application education, etc wasn't conducted. Finally, we should consider expansion of providing technology and equipment and provision of future-oriented service and education according to a flow of the time that needs to seek change in various roles of library as enjoying culture space or creative space.
Purpose: The purpose of this study is to investigate systematic and comprehensive explanation about safety behavior by applying integrated model of Theory of Planned Behavior (TPB) and Social Cognitive Theory (SCT). By showing the interrelationship of effects of factors affecting safety behavior in a single model, comprehensive understanding regarding safety behavior will be possible. Research design, data, and methodology: This study try to integrate the two theory, TPB and SCT, to introduce background factors, such as safety culture, affecting cognitive factors of subjective norm, safety attitude, perceived behavioral control, safety consciousness, which are again affecting behavior intention of the TPB. We composed 73 questionnaire to analyse the relationship among factors affecting safety behavior. The questionnaire were distributed to stewards and stewardesses of KAL, ASIANA, and LCCs. 422 were collected and used for analysis. Factor analysis, regression analysis, and control effect analysis were conducted using SPSS windows version 2.0. Results: The safety culture, safety atmosphere, and safety education/training were turned out to affect subjective norm, safety attitude, perceived behavioral control, safety consciousness. And the cognitive factors also showed to affect safety intention significantly. The results that safety intention affects safety behavior was found. Also there are control effect of cost consciousness and punishment while safety intention affects safety behavior. Conclusions: Safety is the virtue that should be given first priority to in our daily life. To secure safety, everyone in an organization should have high level of safety intention and conduct safety behavior. The study results provide systematic and comprehensive understandings on the relationship among factors affecting cabin crews' safety behavior. The results will help design safety related regulations, education/training, and support employees to engage in safety behavior related activities.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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