• Animal Bioscience
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• 제36권3호
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• pp.506-520
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• 2023

Objective: Japanese Brown (JBR) cattle, especially the Kochi (Tosa) pedigree (JBRT), is a local breed of moderately marbled beef. Despite the increasing demand, the interbreed differences in muscle metabolites from the highly marbled Japanese Black (JBL) beef remain poorly understood. We aimed to determine flavor-related metabolites and postmortem metabolisms characteristic to JBRT beef in comparison with JBL beef. Methods: Lean portions of the longissimus thoracis (loin) muscle from four JBRT cattle were collected at 0, 1, and 14 d postmortem. The muscle metabolomic profiles were analyzed using capillary electrophoresis time-of-flight mass spectrometry. The difference in post-mortem metabolisms and aged muscle metabolites were analyzed by statistical and bioinformatic analyses between JBRT (n = 12) and JBL cattle (n = 6). Results: A total of 240 metabolite annotations were obtained from the detected signals of the JBRT muscle samples. Principal component analysis separated the beef samples into three different aging point groups. According to metabolite set enrichment analysis, post-mortem metabolic changes were associated with the metabolism of pyrimidine, nicotinate and nicotinamide, purine, pyruvate, thiamine, amino sugar, and fatty acid; citric acid cycle; and pentose phosphate pathway as well as various amino acids and mitochondrial fatty acid metabolism. The aged JBRT beef showed higher ultimate pH and lower lactate content than aged JBL beef, suggesting the lower glycolytic activity in postmortem JBRT muscle. JBRT beef was distinguished from JBL beef by significantly different compounds, including choline, amino acids, uridine monophosphate, inosine 5'-monophosphate, fructose 1,6-diphosphate, and betaine, suggesting interbreed differences in the accumulation of nucleotide monophosphate, glutathione metabolism, and phospholipid metabolism. Conclusion: Glycolysis, purine metabolism, fatty acid catabolism, and protein degradation were the most common pathways in beef during postmortem aging. The differentially expressed metabolites and the relevant metabolisms in JBRT beef may contribute to the development of a characteristic flavor.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제33권1호
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• pp.61-74
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• 2023

The global increase in multidrug-resistant (MDR) bacteria has inspired researchers to develop new strategies to overcome this problem. In this study, 23 morphologically different, soil-isolated actinomycete cultures were screened for their antibacterial ability against MDR isolates of ESKAPE pathogens. Among them, isolate BOGE18 exhibited a broad antibacterial spectrum, so it was selected and identified based on cultural, morphological, physiological, and biochemical characteristics. Chemotaxonomic analysis was also performed together with nucleotide sequencing of the 16S rRNA gene, which showed this strain to have identity with Streptomyces lienomycini. The ethyl acetate extract of the cell-free filtrate (CFF) of strain BOGE18 was evaluated for its antibacterial spectrum, and the minimum inhibitory concentration (MIC) ranged from 62.5 to 250 ㎍/ml. The recorded results from the in vitro anti-biofilm microtiter assay and confocal laser scanning microscopy (CLSM) of sub-MIC concentrations revealed a significant reduction in biofilm formation in a concentration-dependent manner. The extract also displayed significant scavenging activity, reaching 91.61 ± 4.1% and 85.06 ± 3.14% of 2,2-diphenyl-1-picrylhydrazyl (DPPH) and 2,2'-azinobis(3-ethylbenzothiazoline-6-sulfonic acid) (ABTS), respectively. A promising cytotoxic ability against breast (MCF-7) and hepatocellular (HePG2) cancer cell lines was obtained from the extract with IC₅₀ values of 47.15 ± 13.10 and 122.69 ± 9.12 ㎍/ml, respectively. Moreover, based on gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS) analysis, nine known compounds were detected in the BOGE18 extract, suggesting their contribution to the multitude of biological activities recorded in this study. Overall, Streptomyces lienomycini BOGE18-derived extract is a good candidate for use in a natural combating strategy to prevent bacterial infection, especially by MDR pathogens.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제33권6호
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• pp.753-759
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• 2023

The genus Paenibacillus contains a variety of biologically active compounds that have potential applications in a range of fields, including medicine, agriculture, and livestock, playing an important role in the health and economy of society. Our study focused on the bacterium SS4^T (KCTC 43402^T = GDMCC 1.3498^T), which was characterized using a polyphasic taxonomic approach. This strain was analyzed using antiSMASH, BAGEL4, and PRISM to predict the secondary metabolites. Lassopeptide clusters were found using all three analysis methods, with the possibility of secretion. Additionally, PRISM found three biosynthetic gene clusters (BGC) and predicted the structure of the product. Genome analysis indicated that glucoamylase is present in SS4^T. 16S rRNA sequence analysis showed that strain SS4^T most closely resembled Paenibacillus marchantiophytorum DSM 29850^T (98.22%), Paenibacillus nebraskensis JJ-59^T (98.19%), and Paenibacillus aceris KCTC 13870^T (98.08%). Analysis of the 16S rRNA gene sequences and Type Strain Genome Server (TYGS) analysis revealed that SS4^T belongs to the genus Paenibacillus based on the results of the phylogenetic analysis. As a result of the matrix-assisted laser desorption/ionization-time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF/MS) results, SS4^T was determined to belong to the genus Paenibacillus. Comparing P. marchantiophytorum DSM 29850^T with average nucleotide identity (ANI 78.97%) and digital DNA-DNA hybridization (dDDH 23%) revealed values that were all less than the threshold for bacterial species differentiation. The results of this study suggest that strain SS4^T can be classified as a Paenibacillus andongensis species and is a novel member of the genus Paenibacillus.

• 식물병연구
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• 제30권2호
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• pp.114-123
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• 2024

In July 2022, stem rot symptom was found in a peony plant grown in a pot under a greenhouse at Jinju, Gyeongnam Province, South Korea. Two fungal species were isolated from the infected peony stems and cultured on 1/2-strength potato dextrose agar for identification. The morphological characteristics of the fungal isolates were examined, and nucleotide sequences of the internal transcribed spacer region, β-tubulin and translation elongation factor 1-α were analysed. The pathogenicity of the two isolates was confirmed in detached peony leaves, according to Koch's postulates. To our knowledge, this is the report of Neopestalotiopsis clavispora and Sclerotinia sclerotiorum as the causal agents of peony stem rots. Antifungal activity of chemical fungicide propineb and rhizobacterium Bacillus siamensis H30-3 was shown against the two plant pathogenic fungi N. clavispora and S. sclerotiorum.Unidentified diffusible and volatile compounds from B. siamensis H30-3 could suppress in vitro mycelial growths of N. clavispora JJ 8-2-1 and S. sclerotiorum JJ 8-2-2.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제33권11호
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• pp.1428-1436
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• 2023

The three Gram-negative, catalase- and oxidase-positive bacterial strains RS43^T, HBC28, and HBC61^T, were isolated from fresh water and subjected to a polyphasic study. Comparison of 16S rRNA gene sequence initially indicated that strains RS43^T, HBC28, and HBC61^T were closely related to species of genus Curvibacter and shared the highest sequence similarity of 98.14%, 98.21%, and 98.76%, respectively, with Curvibacter gracilis 7-1^T. Phylogenetic analysis based on genome sequences placed all strains within the genus Curvibacter. The average nucleotide identity (ANI) and digital DNA-DNA hybridization (dDDH) values between the three strains and related type strains supported their recognition as two novel genospecies in the genus Curvibacter. Comparative genomic analysis revealed that the genus possessed an open pangenome. Based on KEGG BlastKOALA analyses, Curvibacter species have the potential to metabolize benzoate, phenylacetate, catechol, and salicylate, indicating their potential use in the elimination of these compounds from the water systems. The results of polyphasic characterization indicated that strain RS43^T and HBC61^T represent two novel species, for which the name Curvibacter microcysteis sp. nov. (type strain RS43^T =KCTC 92793^T=LMG 32714^T) and Curvibacter cyanobacteriorum sp. nov. (type strain HBC61^T =KCTC 92794^T=LMG 32713^T) are proposed.

• 한국식품조리과학회지
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• 제15권5호
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• pp.483-489
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• 1999

향미채소의 첨가가 쇠고기 곰국이나 스프스톡(soup stock)의 맛성분 변화에 미치는 영향을 연구하기 위해 양지머리 고기 국물의 단백질 용출량, 유리 아미노산, 핵산 관련 물질을 측정하고 더불어 색도 측정과 관능 평가를 실시한 결과를 다음과 같이 요약할 수 있다. 1)양지머리 스프스톡의 조단백질, 유리 아미노산, 핵산 관련 물질 용출량은 대체로 가열시간에 따라 증가하였다. 2) 파(Go), 당근(Ca), 그리고 양파+당근+셀러리(A)를 첨가한 스프스톡의 조단백질 용출량은 향미채소를 첨가하지 않은 스프스톡의 용출량보다 많았다. 3) 유리 아미노산 용출량은 파 첨가 스프스톡(Go$_{5}$)에서 가장 많았으며 특히 arginine, alanine, glycine, threonine, glutamic acid가 많았다. 셀러리(C$_{5}$)와 양파 ( $O_{5}$)첨가 스프스톡 중의 유리아미노산은 향미채소 무첨가(B$_{5}$) 스프스톡보다 적었다. 4)파 첨가 5시간 가열 시료의(Go$_{5}$의 5'-IMP, inosine, hypoxanthine 농도는 다른 향미채소 첨가 스프스톡보다 높았으나 셀러리(C$_{5}$)와 양파( $O_{5}$) 첨가 스프스톡의 5'-IMP, inosine, hypoxanthine 농도는 향미채소 무첨가(B$_{5}$) 스프스톡보다 낮았다. 5) Hunter scale로 측정한 색도는 마늘 첨가(G$_{5}$) 스프스톡의 L값이 가장 낮았으며 셀러리(C$_{5}$)와 당근(Ca$_{5}$)첨가 스프스톡의 L값은 B$_{5}$값과 비슷하였다. 6) 관능 검사 결과 스프스톡의 색, 향, 맛과 전반적인 기호도에 있어서 향미채소 첨가구간의 유의적인 차이를 나타내지 않았다.

• 한국양식학회지
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• 제20권1호
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• pp.51-55
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• 2007

이 연구는 실용 배합사료를 자체 제작한 기존의 배합사료, 상품사료 및 습사료를 장기간 걸쳐 사육한 넙치에 대해 육질을 평가하기 위해 수행하였다. 실험어는 13개월간 사육한 넙치 성어기(600 g 전후) 대상으로 수행하였으며, 실험사료는 시험사료(EP1 및 EP2) 2종, 상품사료(CEP) 및 습사료(MP)를 공급하였다. 전어체의 성분분석은 조단백질은 EP2가 EP1 및 CEP 사료구 보다 유의적으로 높게 나타났으며, 조지방은 EP2 및 MP 사료구가 CEP 사료구와 비교하여 유의적으로 높게 나타났다. 근육내 유리아미노산의 성분분석은 EP사료구간에서 MP 사료구보다 proline, glycine, alanine 함량이 높게 나타났으며, taurine에 있어서 EP1 사료구가 다른 사료구와 비교하여 높은 경향을 보였다. 핵산 관련물질 성분분석은 ATP 및 IMP의 양에서 배합사료에서 습사료보다 높은 값을 보였으며, 특히 EP2에서 다른 사료구와 비교하여 높은 값을 보였다. 관능검사는 향, 외관, 맛에 있어서 EP 사료구와 MP 사료구가 유의적인 차이를 보이지 않았다(P>0.05). 전반적인 기호도에 있어 EP2가 다른 사료구들보다 유의적으로 높게 나타났다. 물리적 성질의 경도 측정은 EP2는 EP1 및 CEP 사료구와 비교하여 높게 나타났으며, 탄력성과 응집성은 모든 사료구에서 차이를 보이지 않았다. 상기 결과를 토대로 그동안 배합사료를 넙치에 공급한 연구 결과를 고려하였을 때, 생사료를 공급한 넙치에 비해 품질이 결코 떨어지지 않으며, 오히려 배합사료를 공급한 양식산 넙치가 체계적인 관리 하에 앞으로 품질향상을 더 높일 수 있을 것이다.

• 한국식품저장유통학회지
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• 제18권4호
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• pp.508-516
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• 2011

본 연구에서는 대왕오징어를 가공식품의 소재로 활용하기 위하여 건조 및 자숙공정을 이용하여 쓴맛 및 신맛을 내는 염화암모늄을 효율적으로 제거하고자 하였으며, 무처리 한 대왕오징어(RGS, Raw giant squid)와 건조과정을 거친 대왕오징어(DGS, Dried giant squid) 및 자숙과정을 거친 대왕오징어(BGS, Boiled giant squid)의 이화학적 성분 비교를 통한 맛성분의 기초자료로 활용하고자 하였다. 각 공정별 오징어의 일반성분 분석결과, RGS, DGS 및 BGS의 수분함량은 각각 75.65, 39.75 및 41.12%로 건조과정을 거친 대왕오징어에 비해 자숙공정을 거친 대왕오징어의 수분함량이 다소 높은 결과를 나타내었고, RGS, DGS 및 BGS의 조단백질 함량은 각각 20.10, 56.25 및 49.58%로 자숙공정을 거친 대왕오징어에 비해 건조과정을 거친 대왕오징어에서 더 높은 함량을 나타내었다. RGS, DGS 및 BGS의 조지방 함량은 각각 0.15, 0.57 및 1.35%로 자숙공정을 거친 대왕오징어에서 높은 값을 나타내었고, 조회분 함량 역시 공정에 따라 큰 차이를 나타내어 RGS, DGS, BGS가 각각 1.68, 4.50 6.77%로 자숙처리한 대왕오징어에서 높은 값을 나타내었다. 핵산관련물질의 총 함량은 RGS, DGS, BGS에서 각각 17.62, 45.31, 17.50 mg/100 g로 건조처리한 대왕오징어에서 높게 나타났으며, Hypoxanthine (Hx)함량도 가장 높게 나타났다. 또한 관능평가 결과에서 DGS와 BGS는 RGS보다 쓴맛, 신맛 및 짠맛의 강도평가에서 낮은 점수를 얻는 것으로 볼 때, 건조 및 자숙공정 처리에 의해 쓴맛 및 신맛이 효율적으로 제거됨을 알 수 있었다. 대왕오징어 시료에서 총 17개의 구성아미노산이 분석되었고, 주요 구성 아미노산으로 glutamic acid, aspartic acid, proline 및 arginine 등이 확인되었고, histidine, tyrosine, methionine 등의 함량은 낮았다. 또한, 주요 유리아미노산은 hydroxyproline, alanine, arginine 등으로 확인되었으며, taurine의 함량도 비교적 높게 나타났다.

• 한국토양비료학회지
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• 제39권4호
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• pp.195-203
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• 2006

길항미생물 MP-1은 여러 종의 곰팡이와 효모 및 음식물을 부패시키는 세균 (그람양성 및 음성) 에 대하여 항균활성을 보였다. MP-1의 16S rRNA gene 염기서열은 기존에 밝혀진 Brukholderia sp.의 염기서열과 99-100% 유사하였다. 배양액으로부터의 항균물질은 에틸아세테이트 (EtOAc)를 사용하여 분리하였으며 EtOAc에 용해된 산성 분획은 silica gel, Sephadex LH-20, ODS 컬럼크로마토 그래피 및 HPLC를 사용하여서 정제를 실시 하였다. 최종적으로 Gas chromatographic-mass 스펙트럼을 통한 분석을 통하여 4 종의 항균 활성을 나타내는 물질은 phenylacetic acid, hydrocinnamic acid, 4-hydroxyphenylacetic acid 및 4-hydroxyphenylacetate methyl ester로 확인 되었다. 각각의 항균 활성물질들의 미생물에 대한 최소저해농도(MIC)는 $250{\sim}2500ug\;ml^{-1}$ 인 것으로 나타났다. 또한 6 mm paper disc 에서의 1mg (건물중) 산성 분획의 항균활성은 같은 비율로 혼합한 표준혼합용액 보다 더 효과적인 것으로 나타났다.

• 한국가금학회지
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• 제38권4호
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• pp.285-291
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• 2011

본 연구는 1일령 초생추(Ross)를 이용하여 사육 일령(30, 36, 42일령)에 따른 계육 품질 변화를 조사하고자 수행하였다. 육계의 사육 단계별 닭고기의 육질 변화에서 일반 성분은 사육 일령이 증가할수록 수분은 감소하였으며, 단백질은 사육 일령이 증가할수록 감소하였으나, 상대적으로 지방 함량은 증가하였다. 닭고기의 무기물 중에서 Ca의 함량은 사육 일령에 따라서 일정한 경향을 나타내지 않았으나, P는 사육 일령이 경과함에 따라 감소하는 경향을 나타내었다. 맛과 관련이 있는 핵산 물질의 inosine은 사육 일령이 경과할수록 증가하는 경향을 나타내었으나 유의적인 차이는 없었다(p<0.05). 이러한 경향은 다리살에서도 비슷하게 나타내었다. 닭고기의 명도 값($L^*$)은 사육 일령이 증가할수록 조금씩 어두워져 42일령 대형닭고기에서는 가장 어두운 값을 나타내었다. 그러나 황색도($b^*$)는 사육 일령이 증가할수록 더 진한 황색도를 나타내었다. 닭고기의 물리적 특성에서는 사육 일령이 증가할수록 가열 감량은 감소하였으나 전단력은 사육 일령이 증가할수록 증가하였다.