• 제목/요약/키워드: mutant p50

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Analysis of Mutant Isocitrate Dehydrogenase 1 Immunoexpression, Ki-67 and Programmed Death Ligand 1 in Diffuse Astrocytic Tumours : Study of Single Center in Bandung, Indonesia

  • Bolly, Hendrikus Masang Ban;Faried, Ahmad;Hermanto, Yulius;Lubis, Billy Parulian;Tjahjono, Firman Priguna;Hernowo, Bethy Suryawathy;Arifin, Muhammad Zafrullah
    • Journal of Korean Neurosurgical Society
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    • 제64권1호
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    • pp.100-109
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    • 2021
  • Objective : Diffuse astrocytic tumour (DAT) is a diffuse infiltrative astrocytoma tumour accompanied by molecular parameters such as the presence or absence of isocitrate dehydrogenase (IDH) gene mutations. Ki-67 is a marker for DAT proliferation, while programmed death ligand 1 (PD-L1) indicates an immune evasion mechanism. This study aimed to analyze the correlation among mutant IDH1 R132H, Ki-67, and PD-L1 immunoexpression in the DAT. Methods : A cross-sectional study was carried out on 30 paraffin blocks of DAT cases. Paraffin block samples consist of grade II (n=14), grade III (n=8), and grade IV (n=8). In this study, the immunohistochemistry-staining of mutant IDH1 R132H, Ki-67, and PD-L1 were carried out to determine the frequency of DAT with IDH1 mutations. Results : Our study shown the frequency of IDH1 mutations in grade II 50.0% (7/14), grade III 37.5% (3/8), and grade IV 12.5% (1/8). Our study also showed a difference in Ki-67 and PD-L1 expression between each the degree of DAT histopathology (p=0.0001 and p=0.002, respectively). There was an association between both mutant IDH1 R132H, and Ki-67 with PD-L1 expression in DAT (p=0.0087 and p=0.0049, respectively). Conclusion : DAT with the mutant IDH1 is frequently observed in grade II and small number of grade III. The expression of wild type IDH1, Ki-67, and PD-L1 were found to be higher in high grade DAT (grade III and grade IV). There is a correlation between each of mutant IDH1 status and Ki-67 with PD-L1 expression in DAT.

中性 Protease 高 生産性 Bacillus sp. KN103N의 分離 및 酵素의 特性 (Isolation of Neutral Protease Hyperproducing Bacillus sp. KN103N and Some Properties of the Enzyme)

  • 김홍립;오평수
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제19권2호
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    • pp.116-121
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    • 1991
  • A bacterial strain KN, which highly produced a protease, was isolated from several soil samples and identified to to belong to the genus Bacillus. We selected mutant strain Bacillus sp. KN103N, which was hyperproducer of protease and was resistant to D-cyclowerine, from the strain KN by several steps of mutagenesis. Neutral protease productivity of mutant strain KN103N was about 55 times as much as that of the original strain KN. The optimum pH and temperature for the enzyme activity were 7.0 and 50$^{\circ}C$, respectively and the enzyme was relatively stable at pH6.0~8.0 and below 40$^{\circ}C$. The enzyme was inactivated by EDTA, but not by DFP. These results indicate that the enzyme from Bacillus sp. KN103N was a neutral (metallo-) protease.

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Two- Dimensional Electrophoresis Analysis of Proteins; Bacillus subtilis LTD and Its Antifungal Activity Deficient Mutant

  • Lee, Young-Keun;Dinh, Le Thi;Jang, Yu-Sin;Chung, Hye-Young;Chang, Hwa-Hyoung
    • 환경생물
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    • 제22권4호
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    • pp.487-493
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    • 2004
  • To investigate the antifungal activity related protein in pesticidal bacteria, a bacterial strain LTD was isolated from soil collected at Gimje in Jeonbuk province, Korea, and identified as Bacillus subtilis LTD based on a API50 CHB kit and 168 rDNA sequencing. It has an antifungal activity against 9 plant pathogenic fungi in a paper disc assay. The antifungal activity- deficient mutant, B. subtilis mLTD was induced at a 5 kGy dose of $^{60}Co$ gamma radiation. Using the two-dimensional electrophoresis and the matrix assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry, the comparison analysis of proteins between the wild and mutant were performed. A major intracellular serine proteinase IspA (MW: 32.5 kDa), a NAD (P) H dehydrogenase (MW: 20.0 kDa), and a stage II sporulation protein AA, SpoIIAA (MW: 14.3kDa) were detected only in the B. subtilis LTD. These results suggested that the functions of these proteins found only in the B. subtilis LTD could. be closely related to the antifungal activity against plant pathogenic fungi.

Role of Val289 Residue in the $\alpha$-Amylase of Bacillus amyloliquefaciens MTCC 610: An Analysis by Site Directed Mutagenesis

  • Priyadharshini, R.;Hemalatha, D.;Gunasekaran, P.
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제20권3호
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    • pp.563-568
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    • 2010
  • The Val289 residue in the $\alpha$-amylase of Bacillus amyloliquefaciens, which is equivalent to the Ala289 and Val286 residues in the $\alpha$-amylases of B. stearothermophilus and B. licheniformis, respectively, was studied by site-directed mutagenesis. This residue was substituted with 10 different amino acids by random substitution of the Val codon. In these mutant $\alpha$-amylases, Val289 was substituted with Ile, Tyr, Phe, Leu, Gly, Pro, Ser, Arg, Glu, and Asp. Compared with the wild-type $\alpha$-amylase, the mutant $\alpha$-amylase Val289Ile showed 20% more hydrolytic activity, whereas Val289Phe and Val289Leu showed 50% lesser activity. On the other hand, the mutant $\alpha$-amylases Val289Gly, Val289Tyr, Val289Ser, and Val289Pro showed less than 15% activity. The substitution of Val289 with Arg, Asp, or Glu resulted in complete loss of the $\alpha$-amylase activity. Interestingly, the mutant $\alpha$-amylase Val289Tyr had acquired a transglycosylation activity, which resulted in the change of product profile of the reaction, giving a longer oligosaccharide.

GAL promoter에 적합한 효모변이주 Y334의 회분식 배양에서의 재조합 단백질 발현특성 (The Study on Recombinant Protein Production using S. cerevisiae Mutant Y334 Suitable for GAL Promoter)

  • 강환구;이문원;전희진
    • KSBB Journal
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    • 제14권4호
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    • pp.476-481
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    • 1999
  • 본 연구에서 갈락토즈를 거의 사용하지 않고 glucose repression 정도가 줄어든 변이주를 이용하여 발현최적화를 수행하였다. 두 균주에서의 GAL promoter에 의한 외래단백질 생산시 glucose repression 정도에 대해 조사하였는데 대조해 Y2805는 glucose가 다 소비된 후 2~3시간 지난 후 발현이 시작되나 변이주 Y334는 약 0.5g/L 글루코즈 농도에서 25%정도의 발현이 이루어짐에 따라 변이주 Y334는 GAL promoter에 미치는 glucose repression정도가 매우 약한 장점을 확인하였다. GAL promoter에 의한 외래 단백질 생산시 발현을 위한 최적 갈락토즈 농도를 조사하였는데, Y3805는 3% 까지의 높은 갈락토즈 농도에서, 변이주 Y334는 1%정도의 낮은 갈락토즈 농도에서 각각 최대 발현량을 보였으며 변이주 Y334는 특히 0.01%정도의 낮은 갈락토즈 농도에서도 최대 발현의 60%량을 발현하였고 오히려 높은 갈락토즈 농도에서는 성장장애 현상을 보였다. 두 균주를 이용하여 배지중 pH가 외래 단백질 생산에 미치는 영향을 조사하였는데 두 균주 모두 pH 5근처에서 최대 발현량을 보임을 알 수 있었다. GAL promoter에 의한 외래 단백질 생산시 글루코즈와 갈락토즈, 에탄올의 소비속도를 조사하였는데, 글루코즈와 에탄올의 소비속도는 거의 비슷하였으나 갈락토즈 소비속도는 Y2805는 0.1232 g/L/hr/O.D.이고, 변이주 Y334는 0.0131g/L/hr/O.D. 이다. 또한 두균주의 분비효율을 조사하였는데 Y2805는 발효후반부에 총 생산 albumin중 약 70%는 분비되었고 30%는 cell 내 위치하는 것을 알 수 있었고 Y334의 경우에는 발효후반부에 총 생산 albumin중 50%가 cell 밖으로 분비되고 50%는 cell 내에 존재하는 것으로 확인되었다. 이는 Y334의 해결해야 할 단점으로 생각 되어지며 이러한 문제의 해결을 위해 albumin 생산성이 2~3배 증가된 초분비 S. cerevisiae 돌연변이주 개발이 현재 진행중이다.

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Quorum sensing 결핍 세균에서 생물막 형성의 시간적 추이 분석 (Time-course Analysis of Biofilm Formation in Quorum Sensing-deficient Bacteria)

  • 김수경;이미난;이준희
    • 미생물학회지
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    • 제50권2호
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    • pp.108-113
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    • 2014
  • 녹농균(Pseudomonas aeruginosa)과 비브리오 불니피쿠스균(Vibrio vulnificus)은 그람 음성의 병원균들로써, quorum sensing(QS) 기전을 통해 병원성을 발현하는 세균들이다. 이들 병원균의 감염은 많은 경우 생물막 형성에 의해 매개된다고 알려져 있는데, 이에 본 연구에서는 P. aeruginosa와 V. vulnificus를 대상으로 QS 기전의 유무에 따른 생물막 형성의 시간적 추이를 분석해 보았다. 그 결과 P. aeruginosa의 경우 QS 기전이 결핍된 균주가 야생형에 비해 초기 부착은 더 잘 하였으나, 이후 생물막 구조의 성숙 능력은 야생형에 비해 현저히 떨어짐을 알 수 있었다. 이러한 특성 때문에 야생형과 QS 결핍 균주의 생물막 형성을 시간의 추이에 따라 정량적으로 비교해 보면 초기 10시간 정도 까지는 QS 결핍 균주가 더 많은 생물막을 형성하다가, 이후 야생형이 더 많이 생물막을 형성하는 역전 현상이 관찰되었다. V. vulnificus는 P. aeruginosa와는 달리 QS 결핍 균주가 야생형보다 더 많은 생물막을 형성한다고 보고된 균주이다. 이 균주에서 같은 방식으로 생물막 형성을 조사해 본 결과, 108시간의 장시간 동안에도 항상 QS 결핍 균주가 야생형 보다 더 많은 생물막을 형성하여, 역전 현상은 관찰되지 않았다. 이 결과는 P. aeruginosa의 경우에는 QS 기전이 초기 부착은 저해하는 방향으로, 성숙과정은 촉진시키는 방향으로 작용하며, V. vulnificus에서는 일관되게 생물막 형성을 저해하는 방향으로 작용함을 보여주는 것이다. 따라서 생물막 제어를 위한 타겟으로 QS기전을 이용할 때에는 제어하고자 하는 생물막 형성 단계와 세균 종을 함께 고려하여야 한다고 제안한다.

원발성 폐암환자의 혈청 및 조직에서의 p53단백 표현 (The Significance of p53 Expression in Serum and Tissue from Patients with Lung Cancer)

  • 장중현;성순희
    • Tuberculosis and Respiratory Diseases
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    • 제45권2호
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    • pp.333-340
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    • 1998
  • 연구배경: 폐암은 전세계적으로 암중에서도 높은 발생빈도를 보이는 질환이며 흡연, 공해와 환경오염 등으로 인해 점차 증가하고 있다. 폐암에서는 다양한 유전학적 변화가 나타나는데 그중에서도 특히 p53의 유전자 변이와 그에 따른 p53 본래의 종양억제력의 상실은 종양발생에 관련되는 것으로 밝혀져 있다. P53 변이의 확인은 면역조직염색, PCR 분석법과 ESISA 분석 등으로 조사할 수 있다. 방 법: P53의 혈청학적 측정은 69명의 폐암환자와 대조군으로 42명 비폐암 호흡기질환자에서 조사되었다. 혈청 p53 변이단백은 ELISA 방법으로 측정하였고 조직 면역화학염색은 p53의 단크론항체를 이용하였다. 결 과: 혈청학적 검사에서 비소세포 폐암의 p53 변이단백은 0.28ng/mL, 소세포폐암은 0.20ng/mL, 그리고 대조군은 0.34ng/mL로서 세군간의 유의한 차이는 관찰되지 않았다. 또한 폐암의 임상병기에 따른 p53의 농도에는 어떤 상관성도 발견할 수 없었다. 폐암조직에 대한 p53 면역화학염색상 50%의 양성율을 보였으나 혈청학적 검사와는 어떤 상관성을 볼 수 없었다. 결 론: 결론적으로 본 연구의 변이 p53단백에 대한 혈청학적 검사는 폐암에 대한 진단적 가치는 없는 것으로 생각된다. 또한 원발성 폐암의 p53 변이를 확인하기 위한 조직면역화학염색은 50%에서 양성을 확인하였다.

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The Physiological Role of CPR1 in Saccharomyces cerevisiae KNU5377 against Menadione Stress by Proteomics

  • Kim, Il-Sup;Yun, Hae-Sun;Kwak, Sun-Hye;Jin, Ing-Nyol
    • Journal of Microbiology
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    • 제45권4호
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    • pp.326-332
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    • 2007
  • In order to understand the functional role of CPRl in Saccharomyces cerevisiae KNU5377 with regard to its multi-tolerance characteristics against high temperatures, inorganic acids, and oxidative stress conditions, whole cellular proteins were analyzed via liquid chromatography electrospray ionization tandem mass spectrometry (LC-ESI-MS/MS). This procedure was followed by two-dimensional (2-D) gel electrophoresis. Under menadione stress conditions, the 23 upregulated proteins were clearly identified only in the wild- type strain of KNU5377. Among the proteins, Sodl1p Tsa1p, Ahp1, Cpr1p, Cpr3, Ssb2p, and Hsp12p were identified as components of antioxidant systems or protein-folding related systems. The CPR1 protein could not be completely detected in the $cpr1{\Delta}$ mutant of KNU5377 and the other upregulated proteins in the wild-type strain evidenced a clear correlation with the results of immunoblot analysis. Moreover, a reduction in growth patterns (about 50%) could be observed in the $cpr1{\Delta}$ mutant, as compared with that of the wild-type strain under mild MD stress conditions. These results indicate that the upregulation of CPR1 may contribute to tolerance against MD as an inducer of oxidative stress.

벼 5-methyltryptophan 저항성 돌연변이체의 특성 (Characteristics of Rice Mutants Resistant to 5- Methyltryptophan)

  • 이효연;강권규;노일섭;이춘환;권혜경;박현숙
    • 한국작물학회지
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    • 제40권5호
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    • pp.637-643
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    • 1995
  • 5-methyltryptophan (5MT) 저항성 벼 (Oryza sativa L. val. Sasanishiki)로 부터 선발된T-RI의 자식후대개체 중에서 저항성이 우성형질로 분리된 TR75주를 이용하여 그 식물체의 여러 특성을 조사하였다. 그 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. TR75는 종자, 근, 약에 있어서는 25 mg/1의 5MT가 포함된 MS배지에서 callus가 형성되었으나, 야생형의 경우에는 어느 기관에서도 Callus 유도는 일어나지 않았다. 2. 각 기관으로 부터 유도된 TR75의 callus는 50mg/1의 5MT배지에서도 저항성을 보여주었지만 야생형의 callus는 25mg/1의 5MT 배지에서 모두 갈변화 하였다. 3. TR75는 3종류의 아미노산 아날로그(L-azetidine-2-carboxylic acid, S-2-aminoethyl-L-cystene, p-fluoro-DL-phenylalanine)에 대해서는 저항성을 갖고 있지 않다. 4. TR75의 유리아미노산 함량은 야생형 종자에 비해 tryptophan, phenylalanine, aspartic acid가 각각 5.0, 5.3, 2.7 배 증가하였으며, 그 외 다른 종류의 아미노산 함량도 1.5∼2.0배 증가하였다. 전 아미노산 함량도 약 1.5배 가량 증가하였다. 그러나 alanine과 leucine은 약간 감소하였다.

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Klebsiella sp. L-10 의 NTG 50 변 이주로부터 생산된 고점성 히알우론산 복합체의 정제 및 특성 (Purification and Characterization of High Viscous Hyaluronic Acid Complex from Klebsiella sp. L-10 NTG 50)

  • 이향숙;김나미
    • 한국식품영양학회지
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    • 제9권3호
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    • pp.242-246
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    • 1996
  • High viscous hyaluronic acid complex from Klebsiella sp. L-10 NTG 50 mutant was purified by two-phase extraction system using PEG-K2HP04 and its physicochemical properties were Investigated. Viscosity of the purified hyaluronic acid complex was decreased as temperature and salts concentration were Increased and also showed low viscosity at below pH 5.0 and above pH 11.0. Hardness, cohesiveness and adhesiveness of the purified hyaluronic acid complex were 1, 20kg, 1.91 and 0.62, respectively. Water holding capacity was 6.9ml per gram of the purified hyaluronic acid complex powder.

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