• 식물분류학회지
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• 제51권3호
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• pp.326-331
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• 2021

The complete chloroplast genome of Zoysia macrostachya Franch. & Sav. isolated in Korea is 135,902 bp long (GC ratio is 38.4%) and has four subregions; 81,546 bp of large single-copy (36.3%) and 12,586 bp of small single-copy (32.7%) regions are separated by 20,885 bp of inverted repeat (44.1%) regions, including 130 genes (83 protein-coding genes, eight rRNAs, and 39 tRNAs). Thirty-nine single nucleotide polymorphisms and 11 insertions and deletion (INDEL) regions were identified from two Z. macrostachya chloroplast genomes, the smallest among other Zoysia species. Phylogenetic trees show that two Z. macrostachya chloroplast genomes are clustered into a single clade. However, we found some incongruency with regard to the phylogenetic position of the Z. macrostachya clade. Our chloroplast genome provides insights into intraspecific variations and species delimitation issues pertaining to the Zoysia species.

• 식물분류학회지
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• 제52권3호
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• pp.156-172
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• 2022

Campsis grandiflora (Thunb.) K. Schum is an ornamental species with various useful biological effects. The chloroplast genome of C. grandiflora isolated in Korea is 154,293 bp long (GC ratio: 38.1%) and has four subregions: 84,121 bp of large single-copy (36.2%) and 18,521 bp of small single-copy (30.0%) regions are separated by 24,332 bp of inverted repeat (42.9%) regions including 132 genes (87 protein-coding genes, eight rRNAs, and 37 tRNAs). One single-nucleotide polymorphism and five insertion and deletion (INDEL) regions (40-bp in total) were identified, indicating a low level of intraspecific variation in the chloroplast genome. All five INDEL regions were linked to the repetitive sequences. Seventy-two normal simple sequence repeats (SSRs) and 47 extended SSRs were identified to develop molecular markers. The phylogenetic trees of 29 representative Bignoniaceae chloroplast genomes indicate that the tribe-level phylogenic relationship is congruent with the findings of previous studies.

• 한국자원식물학회지
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• 제9권3호
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• pp.305-310
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• 1996

유용 취나물 5종류의 종간 유사도 및 종내 변이를 파악하기 위하여 38개체를 대상으로 PCR 방법을 이용하여 비교분석하였다. 사용된 62가지 primer 중에서 38개체 전체에서 band를 보여준 것은 10가지였고, 이를 통해 얻어진 총 band의 수는 176개로 나타났다. 종내변이는 청옥취가 31.1%에 해당하는 15개의 polymorphic band를 가져 변이가 가장 낮았으며 곰취는 61.1%로 가장 높게 나타났다. 군집분석 결과 조사된 38개체는 유사도 0.93에서 5종의 구분이 가능하였으며 38개체 각각은 유사도 0.62-0.99의 유사성을 갖는 것으로 나타났고 종내변이는 0.93이상으로 높게 나타나 변이가 적은 것으로 나타났다. 이상의 결과에서 PCR방법을 이용한 결과가 취나물 5종류를 구분하는데 유용하게 사용되었으며 군집분석 결과 종내 변이가 매우 낮은 것으로 나타났다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제17권9호
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• pp.1197-1203
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• 2004

This study deals with the characterization of three populations (two hatchery and one natural) of Indian major carps Catla catla and Labeo rohita from different locations in India. The genetics of Indian major carps has been completely obscure and this is the first report on comparative allozyme variations in natural and hatchery population. The total 10 biochemical genetic markers used to measure interspecific and intraspecific level of diversity. The allele frequency data indicate different level of genetic variability in three populations. The hatchery population exhibited least polymorphism, low level of heterozygosity and genetic diversity.

• 한국자원식물학회지
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• 제22권2호
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• pp.152-158
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• 2009

갈대속 식물 두 종 달뿌리풀과 갈대의 종간 유연관계분석 및 수환경변화에 따른 종내 지역별 유연관계를 조사하기위해 RAPD 분석을 수행하였다. 총 9개의 oligoprimer를 이용한 효소중합반응에서 300 bp에서 1,900 bp 사이의 구간에서 142개의 유효한 polymorphic band를 확인하였다. Nei-Li의 genetic distance를 이용한 분석결과에 의하면, 비유사도지수가 달뿌리풀 개체군 종내에서는 0.012에서 0.061, 갈대 개체군 종내에서는 0.033에서 0.095의 낮은 상이성을 나타내어 종내 지역집단간에는 높은 유전적 유연관계를 보였으며, 달뿌리풀 개체군과 갈대 개체군 종간에서는 0.043에서 0.132의 상이성을 나타내어 달뿌리풀과 갈대 사이의 비유사도지수의 큰 차이는 보이지 않았으나 유전적으로 거리가 있는 것으로 나타났다. RAPD 결과 이 두 종 사이에 뚜렷한 차이를 구별할 수 있는 genetic marker를 확인하였고, UPGMA 유집분석에 의하면 두 종은 비슷한 수환경끼리 유연관계가 가까운 것으로 나타났고 다른 수환경끼리는 유연관계가 먼 것으로 나타났다. RAPD 분석법은 갈대속 두 종의 분류학적 혼동 해결과 동시에, 수환경변화에 따른 종내 지역별 유전적 유연관계 확인에 매우 유용한 방법인 것으로 나타났다.