Abstract Salmonella pathogenicity island 1 (SPI1) gene expression is regulated by many environmental signals such as oxygen, osmolarity, and pH. Here, we examined changes in the expression level of various regulatory proteins encoded within SPI1 in response to three different concentrations of NaCl, using primer extension analysis. Transcription of all the regulatory genes tested was activated most when Salmonella were grown in Luria Broth (LB) containing 0.17 M NaCl. The expression of hilA, invF, and hilD was decreased in the presence of 0.47 M NaCl or in the absence of NaCl, while hilC expression was almost constant regardless of the NaCl concentration when Salmonella were grown to exponential phase under low-oxygen condition. The reduced expression of hilA, invF, and hilD resulted in lower invasion of hilC mutant to the cultured animal cells when the mutant was grown in the presence of 0.47 M NaCl or in the absence of NaCl prior to infection. Among the proteins secreted via the SPI1-type III secretion system (TTSS), the level of sopE2 expression was not influenced by medium osmolarity. Various effects of osmolarity on virulence gene regulation observed in this study is one example of multiple regulatory pathways used by Salmonella to cause infection.
본 논문에서는 AES(Advanced Encryption Standard)로 채택된 Rijndael 알고리즘을 구현한 암호 프로세서를 설계하였다. 암호화와 복호화를 모두 수행할 수 있으며, 128비트의 블록과 128비트의 키 길이를 지원한다. 성능과 면적 측면을 모두 고려하여 가장 효율적인 구조로 한 라운드를 구현한 후, 라운드 수만큼 반복하여 암복호화를 수행하도록 하였다. 대부분의 다른 블록 암호 알고리즘과 달리 암복호화 시 구조가 다른 Rijndael의 특성으로 인한 면적의 증가를 최소화하기 위해 ByteSub와 InvByteSub은 알고리즘을 기반으로 구현함으로써 메모리로만 구현하는 방법에 비해 비슷한 성능을 가지면서 필요한 메모리 양은 1/2로 줄였다. 이와 같이 구현한 결과, 본 논문의 Rijndael 암호 프로세서는 0.5um CMOS 공정에서 약 15,000개의 게이트, 32K-bit ROM과 1408-bit RAM으로 구성된다. 그리고 한 라운드를 한 클럭에 수행하여 암복호화 하는데 블럭 당 총 11클럭이 걸리고, 110MHz의 동작 주파수에서 1.28Gbps의 성능을 가진다. 이는 현재 발표된 논문들과 비슷한 성능을 가지면서 면적의 가장 큰 비중을 차지하는 메모리 양은 절반 이상 감소하여 지금까지 발표된 논문 중 가장 우수한 면적 대 성능 비를 가지는 것으로 판단된다.
이중차분간섭기법(Double-Differential Interferometric SAR; DDInSAR)을 이용하여 빙하의 조위반응을 정확히 해석하기 위해서는 극지 해양에 대한 조위모델의 정밀도 평가가 수행되어야 한다. 이 연구에서는 동남극 테라노바 만에서 TPXO7.1, FES2004, CATS2008a, Ross_Inv 조위모델의 정밀도를 평가하기 위해 2년 동안 획득된 16쌍의 one-day tandem COSMO-SkyMed SAR 간섭영상으로부터 생성한 120개의 DDInSAR 영상과 수압식 파고계로 11일 동안 실측한 조위를 이용하였다. 먼저, DDInSAR 영상과 조위모델로 추출된 조위의 이중차분값(${\Delta}\dot{T}$)을 비교하였으며, 실측조위와 조위모델의 조위(T), 그리고 실측조위와 조위모델 조위의 24시간 차분값($\dot{T}$)을 비교하였다. ${\Delta}\dot{T}$와 T, $\dot{T}$의 평균제곱근오차(root mean square error; RMSE)는 조위모델의 역기압 효과(inverse barometer effect; IBE) 보정 후에 감소하였고, 이로부터 조위모델의 IBE는 필수적으로 보정되어야 함이 확인되었다. $\dot{T}$와 ${\Delta}\dot{T}$는 T보다 작은 RMSE를 보였다. 이는 SAR 간섭쌍의 시간차(24시간) 동안의 차분값인 에 조위모델과 실측조위의 평균해수면 오차와 조위모델이 사용하는 조화상수 중 $S_2$, $K_2$, $K_1$, $P_1$의 오차가 상쇄되기 때문이다. 따라서 IBE가 보정된 조위모델의 $\dot{T}$와 ${\Delta}\dot{T}$가 DDInSAR 기법에 사용될 수 있음을 확인하였다. 단기간 실측된 조위로는 최적의 조위모델 선정에 어려움이 있었으나, DDInSAR를 이용한 정밀도 평가에 의하면 Ross_Inv가 4.1 cm의 RMSE를 보여 테라노바 만의 DDInSAR에 가장 적합한 조위모델로 확인되었다.
모멘트 텐서 역산의 응용 목적은 지진 메커니즘, 지진 모멘트, 한반도에서 국지적으로 발생하는 규모 5.5 이하의 소규모 지진의 진원깊이 등의 진원인자를 결정하는 것이다. 이와 같이 광범위한 지형에서 발생하는 지진들은 어느 지역에서의 활동적인 지체구조를 밝혀내는 실마리를 제공해 준다. 더욱이 소규모 지진의 지진 메커니즘 연구를 위해서는 반드시 필요하다. 본 논문에서는 한반도에서 최근에 발생한 규모 3.3 - 4.8의 14개 지진을 모멘트 역산방법 (TDMT_INV)을 이용하여 지진 메커니즘 분석 결과를 소개하고 있다. 단층들의 주향은 북동-남서, 북서-남동 방향으로 주향이동 또는 소규모 역단층의 주향이동 단층을 보이고 있다. 응력장의 압축방향은 몇몇 단층을 제외하고는 동-서 또는 동북동-서남서 방향이 우세한 것으로 나타났다. 그리고 영남 육괴와 원산 지역에 분포하는 지진들은 남-북 또는 북북서-남남동 방향이 우세한 것으로 나타났다.
터널링 전계효과 트랜지스터(tunneling field-effect transistor; TFET)로 적층된 3차원 적층형 집적회로(monolithic 3D integrated-circuit; M3DIC)에 대한 연구 결과를 소개한다. TFET는 MOSFET(metal-oxide-semiconductor field-effect transistor)와 달리 소스와 드레인이 비대칭 구조이므로 대칭구조인 MOSFET의 레이아웃과 다르게 설계된다. 비대칭 구조로 인해서 다양한 인버터 구조 및 레이아웃이 가능하고, 그 중에서 최소 금속선 레이어를 가지는 단순한 인버터 구조를 제안한다. 비대칭 구조의 TFET를 순차적으로 적층한 논리 게이트인 NAND 게이트, NOR 게이트 등의 M3DIC의 구조와 레이아웃을 제안된 인버터 구조를 바탕으로 제안한다. 소자와 회로 시뮬레이터를 이용해서 제안된 M3D 논리게이트의 전압전달특성 결과를 조사하고 각 논리 게이트의 동작을 검증한다. M3D 논리 게이트 별 셀 면적은 2차원 평면의 논리게이트에 비해서 약 50% 감소된다.
An element in a ring R with identity is called invo-clean if it is the sum of an idempotent and an involution and R is called invoclean if every element of R is invo-clean. Let C(R) be the center of a ring R and g(x) be a fixed polynomial in C(R)[x]. We introduce the new notion of g(x)-invo clean. R is called g(x)-invo if every element in R is a sum of an involution and a root of g(x). In this paper, we investigate many properties and examples of g(x)-invo clean rings. Moreover, we characterize invo-clean as g(x)-invo clean rings where g(x) = (x-a)(x-b), a, b ∈ C(R) and b - a ∈ Inv(R). Finally, some classes of g(x)-invo clean rings are discussed.
An early step in the pathogenesis of non-typhoidal Salmonella species is the ability to penetrate the intestinal epithelial monolayer. This process of cell invasion requires the production and transport of secreted effector proteins by a type III secretion apparatus encoded in Salmonella pathogenicity island I (SPI-1). The control of invasion involves a number of genetic regulators and environmental stimuli in complex relationships. SPI-1 itself encodes several transcriptional regulators (HilA, HilD, HilC, and InvF) with overlapping sets of target genes. These regulators are, in turn, controlled by both positive and regulators outside SPI-1, including the two-component regulators BarA/SirA and PhoP/Q, and the csr post-transcriptional control system. Additionally, several environmental conditions are known to regulate invasion, including pH, osmolarity, oxygen tension, bile, $Mg^{2+}$ concentration, and short chain fatty acids. This review will discuss the current understanding of invasion control, with emphasis on the interaction of environmental factors with genetic regulators that leads to productive infection.
Huynh Van Chuong;Nguyen Minh Tuan;Nguyen Thi Nhu Anh;Le Thi Lan Phuong;Nguyen Xuan Hoa
대한수의학회지
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제63권2호
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pp.16.1-16.6
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2023
Salmonella spp. are pathogens involved in most salmonellosis in rabbits. This study examined Salmonella disease in rabbits raised in Thua Thien Hue, Vietnam. Two hundred and 56 rectal swabs of rabbits were taken, and a carrier rate of 33.98% was found. In addition, all the isolated Salmonella spp. strains were 100% motile; positive for H2S, catalase, Voges Proskauer, coagulase, citrate, maltose, and dextrose; and negative for indole, methyl red, urease, oxidase, sucrose, and lactose. The Kirby-Bauer method showed that these Salmonella strains were susceptible to doxycycline (93.2%), tetracycline (84.1%), and levofloxacin (65.9%). On the other hand, they were highly resistant to streptomycin (95.5%), ampicillin (93.2%), colistin (40.9%), and gentamicin (34.1%). Furthermore, polymerase chain reaction used to screen for virulence and specific genes of Salmonella strains showed that all Salmonella strains isolated carried InvA, fimA, and Stn.
Salmonella typhi is frequent causes of foodborne illness and its detection is important for monitoring disease progression. In this study, by using general PCR and novel LAMP (Loop Mediated Isothermal Amplification) assay, we evaluated the usefulness of LAMP assay for detection of Salmonella typhi. In this LAMP assay, forward inner primer (FIP) and back inner primer (BIP) was specially designed for recognizing target invA gene. Target DNA was amplified and visualized as ladder-like pattern of bands on agarose gel within 60 min under isothermal conditions at $65^{\circ}C$. When the sensitivity and reproducibility of LAMP were compared to general PCR, there was no difference of reproducibility but sensitivity of LAMP assay was more efficient than PCR (the detection limit of LAMP assay was 30 fg, while the PCR assay was 3 pg). These results indicate that the LAMP assay is a potential and valuable means for detection of Salmonella typhi, especially for its rapidity, simplicity and low cost.
임신이나 배란진단과 같이 가정에서 직접 사용할 수 있는 형태의 membrane strip 크로마토그래피 방법을 이용하여 식중독 균 DNA 분석시스템을 개발하였다. 분석물질로서는 빈번하게 발생하고 있는 식중독 미생물 중에서 S. typhimurium을 선택하였으며, Salmonella 종에 특이한 유전자 부위인 invA 유전자 분석을 목표로 하였다. 우선 이 유전자는 본 실험실 내에서 설계한 primer 쌍을 사용한 PCR 공정을 통하여 증폭되었다. 이렇게 증폭한 산물을 본 연구자들이 설계한 DNA probe와의 hybridization을 통하여 분석함으로써 전통적으로 사용하고 있는 전기영동 분석법의 단순히 분자크기에 의한 분리법과 비교하여 특이한 분석을 할 수 있었다. 이때 PCR 후 과량으로 잔존하는 primer를 별도로 제거하지 않고 hybridization을 수행할 수 있도록 특별하게 DNA probe를 설계하였다. 또한, probe가 증폭된 DNA와 hybridization 하였을 때 고체표면에 의한 간섭효과가 최소화되도록 설계 시 반영되었고 더욱이 streptavidin-비오틴의 결합을 이용하여 probe를 고정함으로써 고상에서의 상호작용이 더욱 용이하도록 배려하였다. 이러한 분석방법을 이용하여 분석한 결과 시료첨가 후 20-40분 정도에 최소 $10^3$cfu/mL (10 cells/system) 농도의 박테리아를 분석할 수 있었다. 이러한 결과는 일반적으로 사용하는 전기영동법보다 약 10배정도 더 민감한 결과일 뿐만 아니라 실험실 기기를 사용하지 않고 분석을 수행함으로써 분석시료가 제공되는 현장에서도 식중독 균의 탐지가 가능하게 되었다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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