Golshan, Farzad;Abrishamifar, Adib;Arasteh, Mohammad
Journal of Power Electronics
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v.17
no.4
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pp.914-922
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2017
Multilevel converters have attracted a lot of attention in recent years. The efficiency parameters of a multilevel converter such as the switching losses and total harmonic distortion (THD) mainly depend on the modulation strategy used to control the converter. Among all of the modulation techniques, the selective harmonic elimination (SHE) method is particularly suitable for high-power applications due to its low switching frequency and high quality output voltage. This paper proposes a new expression for the SHE problem in five-level converters. Based on this new expression, a simple analytical method is introduced to determine the feasible modulation index intervals and to calculate the exact value of the switching angles. For each selected harmonic, this method presents three-level or five-level waveforms according to the value of the modulation index. Furthermore, a flowchart is proposed for the real-time implementation of this analytical method, which can be performed by a simple processor and without the need of any lookup table. The performance of the proposed algorithm is evaluated with several simulation and experimental results for a single phase five-level diode-clamped inverter.
Ko, Hae Li;Park, Hyo-Jung;Kim, Jihye;Kim, Ha;Youn, Hyewon;Nam, Jae-Hwan
Journal of Microbiology and Biotechnology
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v.29
no.1
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pp.127-140
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2019
Since 1990, many nucleic acid expression platforms consisting of DNA or RNA have been developed. However, although RNA expression platforms have been relatively neglected, several such platforms capped at the 5' end of RNA by an anti-reverse cap analog have now been developed. At the same time, the capping reaction is a bottleneck in the production of such platforms, with high cost and low efficiency. Here, we investigated several viral and eukaryotic internal ribosome entry sites (IRESs) to develop an optimal RNA expression platform, because IRES-dependent translation does not require a capping step. RNA expression platforms constructed with IRESs from the 5' untranslated regions of the encephalomyocarditis virus (EMCV) and the intergenic region of the cricket paralysis virus (CrPV) showed sufficient expression efficiency compared with cap-dependent RNA expression platforms. However, eukaryotic IRESs exhibited a lower viral IRES expression efficiency. Interestingly, the addition of a poly(A) sequence to the 5' end of the coxsackievirus B3 (CVB3) IRES (pMA-CVB3) increased the expression level compared with the CVB3 IRES without poly(A) (pCVB3). Therefore, we developed two multiexpression platforms (termed pMA-CVB3-EMCV and pCrPV-EMCV) by combining the IRESs of CVB3, CrPV, and EMCV in a single-RNA backbone. The pMA-CVB3-EMCV-derived RNA platform showed the highest expression level. Moreover, it clearly exhibited expression in mouse muscles in vivo. These RNA expression platforms prepared using viral IRESs will be useful in developing potential RNA-based prophylactic or therapeutic vaccines, because they have better expression efficiency and do not need a capping step.
Prohibitin (PHB), an evolutionarily-conserved protein, has been found to be over-expressed in gastric cancer and be closely related with tumor malignancy. In this study, to investigate the relationship between PHB expression and cell apoptosis in the BGC823 gastric cancer cell line, low and high expression PHB in BGC823 cells was accomplished using RNA interference technology and gene transfer techniques. Cell proliferation, cell cycling, apoptosis, Bax, Bcl-2 and Cyt.c protein expression and the activation of Caspase-3,9 were assessed after 48h. Over-expression of PHB gene in BGC823 cells resulted in slow cell growth, cell arrest in G2 phase, and an increased apoptosis ratio while the opposite was found for PHB under-expressing cells. In PHB over-expressing cells, the expression of Bax gene was increased, the expression of Bcl-2 was decreased, the activation level of Caspase-3, 9 was increased, but the activation level of Caspase-8 demonstrated no change. These results indicate that PHB induced apoptosis through the mitochondrial pathway.
Sujin Lee;Jeong In Yang;Joo Hee Lee;Hyun Woo Lee;Tae Jin Kim
IMMUNE NETWORK
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v.22
no.6
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pp.50.1-50.19
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2022
Autoreactive B cells are not entirely deleted, but some remain as immunocompetent or anergic B cells. Although the persistence of autoreactive B cells as anergic cells has been shown in transgenic mouse models with the expression of B cell receptor (BCR) reactive to engineered self-antigen, the characterization of naturally occurring anergic B cells is important to identify them and understand their contribution to immune regulation or autoimmune diseases. We report here that a low-level expression of CD138 in the splenic B cells marks naturally arising anergic B cells, not plasma cells. The CD138int B cells consisted of IgMlowIgDhigh follicular (FO) B cells and transitional 3 B cells in homeostatic conditions. The CD138int FO B cells showed an anergic gene expression profile shared with that of monoclonal anergic B cells expressing engineered BCRs and the gene expression profile was different from those of plasma cells, age-associated B cells, or germinal center B cells. The anergic state of the CD138int FO B cells was confirmed by attenuated Ca2+ response and failure to upregulate CD69 upon BCR engagement with anti-IgM, anti-IgD, anti-Igκ, or anti-IgG. The BCR repertoire of the CD138int FO B cells was distinct from that of the CD138- FO B cells and included some class-switched B cells with low-level somatic mutations. These findings demonstrate the presence of polyclonal anergic B cells in the normal mice that are characterized by low-level expression of CD138, IgM downregulation, reduced Ca2+ and CD69 responses upon BCR engagement, and distinct BCR repertoire.
Background: Breast cancer is among the five most common cancers and ranks first among cancers diagnosed in Iranian women. Screening and treatment of this disease with molecular methods, especially regarding high incidences at early age and advanced stage, is essential. Several genes with altered expression have been identified by cDNA microarray studies in breast cancer, with the Bcl-2 gene indicated as a likely candidate. In this study, we studied Bcl-2 gene expression levels in parallel tumor and non-tumor breast tissues. Materials and Methods: Forty samples including 21 tumor, 16 non tumor (marginal) and 3 benign breast tissues which were all pathologically diagnosed, were subjected to RNA extraction and polyA RT-PCR with the expression level of Bcl-2 quantified using real-time PCR. Results: There is higher expression levels of the Bcl-2 gene in tumor samples compared with marginal samples, but not attaining significance(p>0.05). Bcl-2 expression in 14 (66.7%) of the cases of tumor samples and 9 (56.3%) cases of the marginal samples were positive. Comparison of the expression of the Bcl-2 gene in histological grade showed that a high expression of Bcl-2 was associated with a high histological grade (p<0.41). Conclusions: Our data suggests that dysregulated Bcl-2 gene expression is potentially involved in the pathogenesis of breast cancer. Using gene expression analysis may significantly improve our ability for screening cancer patients and will prove a powerful tool in the diagnosis and prognostic evaluation of the disease whilst aiding the cooperative group trials in the Bcl-2 based therapy project.
A gene, ClCDA, encoding chitin deacetylase from Colletotrichum lindemuthianum, was optimized according to the codon usage bias of Pichia pastoris and synthesized in vitro by overlap extension PCR. It was secretorily expressed in P. pastoris GS115 using the constitutive expression vector pHMB905A. The expression level reached the highest with 110 mg/l culture supernatant after 72 h of methanol induction, which comprised 77.27 U/mg chitin deacetylase activity. SDS-PAGE, mass spectrometry, and deglycosylation assays demonstrated that partial recombinant protein was glycosylated with an apparent molecular mass of 33 kDa. The amino acid sequences of recombinant proteins were confirmed by mass spectrometry.
Toll-like receptors (TLRs) are a major pattern recognition receptor that recognize the structure of invading pathogen and play key roles by triggering immune response. In this study, we identified a sequence of TLR homolog and characterized at molecular level from the abalone (Haliotis discus hannai). Multiple alignments and phylogenetic analysis of abalone TLR protein belongs to the TLR 2/6. Expression level of abalone TLR 2/6 in the tissue was comparatively high in the mantle, gill, digestive duct, and hemocytes, but lowest in the muscle. Expression level of abalone TLR 2/6 mRNA in the mantle, gill, digestive duct, and hemocytes was 20-fold, 60-fold, 115-fold, 112-fold higher than in the muscle, respectively. Expression level of abalone TLR 2/6 mRNA in the mantle was steadily increased until 12 h and decreased post-infection with Vibrio parahemolyticus. While the expression level of abalone TLR 2/6 mRNA in the gill and hemocytes was drastically increased at 6 and 9 h post-infection with Vibrio parahemolyticus, respectively. These results suggest that abalone TLR 2/6 is conserved through evolution and may play roles similar to its mammalian counterparts.
Plant-derived triterpenoids commonly possesses biological properties such as anti-inflammatory, antimicrobial, anti-viral and anti-cancer. Luvunga scandens is one of the plant that produced triterpenoids. The aims of the study was to analyze cell cycle profile and to determine the expression of p53 unregulated modulator of apoptosis (PUMA), caspase-8 and caspase-9 genes at mRNA level in MCF-7 cell line treated with two triterpenoids, flindissol (1) and 3-oxotirucalla-7,24-dien-21-oic-acid (2) isolated from L. scandens. The compounds were tested for cell cycle analysis using flow cytometer and mRNA expression level using quantitative RT-PCR. The number of MCF-7 cells population which distributed in Sub G1 phase after treated with compound 1 and 2 were 7.7 and 9.3% respectively. The evaluation of the expression of genes showed that both compounds exhibited high level of expression of PUMA, caspase-8 and caspase-9 as normalized to ${\beta}-actin$ via activation of those genes. In summary, the isolated compounds of L. scandens plant showed promising anticancer properties in MCF-7 cell lines.
Endoglucanase gene of Pseudomonas sp. LBC505 was previously cloned in pUC19 to yield plasmid pLCl. The Pseudomonas sp. LBC505 endoglucanase gene was subcloned in a temperature-regulated Es-cherichia coli expression vector, pAS1, containing the leftward promoter $P_L$ of bacteriophage lambda. The level of gene expression was controlled by the thermal inactivation of the heat-sensitive lambda cI857 repressor. Best yield of endoglucanase was obtained by lowering the incubation temperature to $37^{\circ}C$ after induction at $42^{\circ}C$ for 1h. Under these conditions enzyme production continued for about 5h at a gradually decreasing rate. Ecoli harboring recombinant plasmid pASC10 expressed 4.3 times as much CMCase activity as E.coli containing pLCl. To enhance the expression level of endogl, ucanase gene, we have also changed the presumptive Shine-Dalgamo sequence (AGAGGT) of the gene to consensus sequence (AGGAGGT) by site-directed mutagenesis. The genes mutated were subcloned in pASl resulting in the formation of recombinant plasmid pASS50. E.coli harboring the plasmid pASS50 expressed 6.2-fold higher levels of CMCase activity than that of E.coli harboring pLC1.
Objective: To investigate whether the expression of serum soluble neural cell adhesion molecule (sNCAM) is associated with hepatic encephalopathy (HE) in hepatocelular carcinoma (HCC) patients. Materials and Methods: The Oncomine Cancer Microarray database was used to determine the clinical relevance of NCAM expression in different kinds of human cancers. Sera from 75 HCC cases enrolled in this study were assessed for expression of sNCAM by enzyme linked immunosorbent assay (ELISA). Results: Dependent on the Oncomine Cancer Microarray database analysis, NCAM was down regulated in 10 different kinds of cancer, like bladder cancer, brain and central nervous system cancer, while up-regulated in lung cancer, uterine corpus leiomyoma and sarcoma, compared to normal groups. Puzzlingly, NCAM expression demonstrated no significant difference between normal and HCC groups. However, we found by quantitative ELISA that the level of sNCAM in sera from HCC patients with HE ($347.4{\pm}151.9ng/ml$) was significantly more up-regulated than that in HCC patients without HE ($260.3{\pm}104.2ng/ml$), the p-value being 0.008. sNCAM may be an important risk factor of HE in HCC patients, the correlation coefficients was 0.278 (P<0.05) on rank correlation analysis. Conclusions: This study highlights that up-regulated level of serum sNCAM is associated with HE in HCC patients and suggests that the high expression can be used as an indicator.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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