• 제목/요약/키워드: graph $(k_0,\

검색결과 291건 처리시간 0.026초

유전체 수준 대사 경로 그래프 레이아웃을 위한 슈퍼노드화 방안에 관한 연구 (Graph abstraction for Genome scale graph layout of metabolic pathways)

  • 송은하;김민경;이상호
    • 한국정보과학회:학술대회논문집
    • /
    • 한국정보과학회 2006년도 한국컴퓨터종합학술대회 논문집 Vol.33 No.1 (A)
    • /
    • pp.58-60
    • /
    • 2006
  • 대사 경로를 자동으로 레이아웃 해주는 시스템에 있어 노드 수가 일정수 이상으로 증가할수록 에지 크로싱이 기하급수적으로 증가하는 문제가 있다. 따라서 유전체 수준에서 대사 경로간의 관계(Cross-talk) 등을 살펴보기 위해서는 레이아웃 상에 나타나는 에지 크로싱을 줄이고 이를 압축하여 표시할 필요가 있다. 이는 개개의 대사경로에 대한 레이아웃 분만 아니라 대사 경로간의 관계 등 다양한 단계와 방식의 레이아웃이 가능한 시스템이 필요하기 때문이다. 본 논문에서는 레이아웃 상에 나타나는 에지 크로싱에 의한 가독성 저해를 피하기 위하여 대상 경로 상에 존재하는 연결성 높은 부그래프를 찾는 모듈을 개발하였다. 또한 각각의 부그래프를 슈퍼노드로 치환하는 방식을 적용함으로써 대사 경로를 이해하기 쉽도록 하였다. 또한 이러한 과정은 반복적, 혹은 역방향으로 실행할 수 있도록 하였다. 실험결과, 대사 경로 상에 존재하는 연결성 높은 부그래프들은 그래프밀도값 Q가 0.8로 나타나, 단백질 상호작용 네트워크에 비하여 희소한(sparse) 네트워크 구조를 보임을 알 수 있었다.

  • PDF

THE ZEROTH-ORDER GENERAL RANDIĆ INDEX OF GRAPHS WITH A GIVEN CLIQUE NUMBER

  • Du, Jianwei;Shao, Yanling;Sun, Xiaoling
    • Korean Journal of Mathematics
    • /
    • 제28권3호
    • /
    • pp.405-419
    • /
    • 2020
  • The zeroth-order general Randić index 0Rα(G) of the graph G is defined as ∑u∈V(G)d(u)α, where d(u) is the degree of vertex u and α is an arbitrary real number. In this paper, the maximum value of zeroth-order general Randić index on the graphs of order n with a given clique number is presented for any α ≠ 0, 1 and α ∉ (2, 2n-1], where n = |V (G)|. The minimum value of zeroth-order general Randić index on the graphs with a given clique number is also obtained for any α ≠ 0, 1. Furthermore, the corresponding extremal graphs are characterized.

네모파 전압전류법 측정을 위한 블루투스 기반 휴대형 포텐쇼스탯 (A Portable Potentiostat with Bluetooth Communication for Square wave Voltammetry Measurement)

  • 심원식;한지훈;김수윤;권현정;박정호
    • 전기학회논문지
    • /
    • 제65권4호
    • /
    • pp.622-627
    • /
    • 2016
  • This paper describes the development of a portable potentiostat which can perform square wave voltammetry on electrochemical sensors and wireless transmission of the measured data to a smartphone using Bluetooth. The potentiostat consists of a square wave potential pulse generation circuit for applying the potential pulse to the electrochemical sensor, a reduction/oxidation (or redox) current measurement circuit, and Bluetooth for wireless data transmission to an Android-based smartphone. The measured data are then processed to show the output graph on the smart phone screen in real time. This data transformation into a graph is carried out by developing and installing a simple transformation application software in the Android-based smartphone. This application software also enables the user to set and change the measurement parameters such as the applied voltage range and measured current range at user's convenience. The square voltammetry output data measured with the developed portable potentiostat were almost same as the data of the commercial potentiostat. The measured oxidation peak current with the commercial potentiostat was $11.35{\mu}A$ at 0.26 V and the measured oxidation peak current with the developed system was $12.38{\mu}A$ at 0.25 V. This proves that performance of the developed portable measurement system is comparable to the commercial one.

K-평균 클러스터링과 그래프 탐색을 통한 심장 자기공명영상의 좌심실 자동분할 알고리즘 (Automatic Left Ventricle Segmentation Algorithm using K-mean Clustering and Graph Searching on Cardiac MRI)

  • 조현우;이해연
    • 정보처리학회논문지B
    • /
    • 제18B권2호
    • /
    • pp.57-66
    • /
    • 2011
  • 심장 질환을 예방하기 위해서는 정기적인 검진을 통해 심장 기능을 분석하고 관찰하는 것이 중요하다. 정기적인 검진에서 심장 기능은 심장을 촬영한 후에 관측자가 이를 수작업을 통하여 처리하여 혈류량과 심박구출률 등을 분석함으로서 이루어지나, 시간도 오래 걸리며 관측자에 따른 변이성이 문제가 된다. 본 논문에서는 심장 단축 자기공명영상에서 좌심실 영역을 분할하는 자동화된 알고리즘을 제안한다. 코일 위치에 따른 왜곡을 보정하고, K-평균 클러스터링 기법을 이용하여 좌심실 내부를 분할한다. 영상의 왜곡 및 잡음에 의하여 발생하는 분할 오류는 그래프 탐색 기법을 적용하여 수정하였다. 제안하는 알고리즘의 성능을 평가하기 위하여 38명의 지원자 그룹에 대하여 혈류량과 심박구출률을 계산하였고, 전문가에 의한 수동윤곽검출 결과와 GE MASS 소프트웨어와 비교하였다. 결과에 따르면 제안한 알고리즘의 수동윤곽검출과 혈류량의 차이는 평균적으로 이완기에 6.2mL${\pm}$5.6 및 수축기에 2.9mL${\pm}$3.0, 심박구출률의 차이는 2.1%${\pm}$1.5로 높은 정확성을 보였다. 특히 제안한 알고리즘은 기존 알고리즘에서 발생하던 사용자 간섭률을 최소화하여 자동화 성능을 향상하였다.

이항트리에서 S-에지번호 매김 (The S-Edge Numbering on Binomial trees)

  • 김용석
    • 대한전자공학회:학술대회논문집
    • /
    • 대한전자공학회 2004년도 하계종합학술대회 논문집(1)
    • /
    • pp.167-170
    • /
    • 2004
  • We present a novel graph labeling problem called S-edge labeling. The constraint in this labeling is placed on the allowable edge label which is the difference between the labels of endvertices of an edge. Each edge label should be ${ a_n / a_n = 4 a_{n-l}+l,\;a_{n-1}=0}$. We show that every binomial tree is possible S-edge labeling by giving labeling schems to them. The labelings on the binomial trees are applied to their embedings into interconnection networks.

  • PDF

고무차륜 AGT 경량전철 차량의 고장시 안전시험 (Safety test of rubber-tired AGT light rail vehicle)

  • 김연수;임태건;이정선
    • 한국정밀공학회:학술대회논문집
    • /
    • 한국정밀공학회 2005년도 춘계학술대회 논문집
    • /
    • pp.2024-2027
    • /
    • 2005
  • This study was aimed to prove the safety of rubber-tired AGT light rail vehicle, which was designed to have the redundant equipment for safety, so the experiment of this paper was operated in condition of malfunction which we made such as bake sequence test and momentary interruption test. The result can bes handled by Labview 7.0 and showed as the graph.

  • PDF

Strong Roman Domination in Grid Graphs

  • Chen, Xue-Gang;Sohn, Moo Young
    • Kyungpook Mathematical Journal
    • /
    • 제59권3호
    • /
    • pp.515-523
    • /
    • 2019
  • Consider a graph G of order n and maximum degree ${\Delta}$. Let $f:V(G){\rightarrow}\{0,1,{\cdots},{\lceil}{\frac{{\Delta}}{2}}{\rceil}+1\}$ be a function that labels the vertices of G. Let $B_0=\{v{\in}V(G):f(v)=0\}$. The function f is a strong Roman dominating function for G if every $v{\in}B_0$ has a neighbor w such that $f(w){\geq}1+{\lceil}{\frac{1}{2}}{\mid}N(w){\cap}B_0{\mid}{\rceil}$. In this paper, we study the bounds on strong Roman domination numbers of the Cartesian product $P_m{\square}P_k$ of paths $P_m$ and paths $P_k$. We compute the exact values for the strong Roman domination number of the Cartesian product $P_2{\square}P_k$ and $P_3{\square}P_k$. We also show that the strong Roman domination number of the Cartesian product $P_4{\square}P_k$ is between ${\lceil}{\frac{1}{3}}(8k-{\lfloor}{\frac{k}{8}}{\rfloor}+1){\rceil}$ and ${\lceil}{\frac{8k}{3}}{\rceil}$ for $k{\geq}8$, and that both bounds are sharp bounds.

RGG/WSN을 위한 분산 저장 부호의 성능 분석 (A Performance Analysis of Distributed Storage Codes for RGG/WSN)

  • 정호영
    • 한국정보전자통신기술학회논문지
    • /
    • 제10권5호
    • /
    • pp.462-468
    • /
    • 2017
  • 본 논문에서는 IoT/WSN을 랜덤 기하 그래프를 이용하여 모델링하고 WSN에서 발생되는 데이터를 효율적으로 저장하기 위해 사용되는 지역 부호의 성능을 고찰하였다.. 노드 수가 n=100, 200인 무선 센서 네트워크를 랜덤 기하 그래프로 모델링하여 분산화된 저장 코드의 복호 성능을 시뮬레이션을 통해 분석하였다. 네트워크의 총 노드 수가 n=100일 때와 200일 때 복호율 ${\eta}$에 따른 복호 성공률은 노드 수 n보다는 소스 노드 수 k값에 따라 좌우됨을 알 수 있었다. 특히 n 값에 관계없이 $${\eta}{\leq_-}2.0$$일 때 복호 성공 확률은 70%를 상회함을 알 수 있었다. 복호 율 ${\eta}$에 따른 복호 연산 량을 살펴본 바, BP 복호 방식의 복호 연산 량은 소스 노드 수 k 값이 증가함에 따라 기하급수적으로 증가함을 알 수 있었다. 이는 소스 노드의 수가 증가할수록 LT 부호의 길이가 길어지고 이에 따라 복호 연산량이 크게 증가하는데 원인이 있는 것으로 생각된다.

대용량 그래프 압축과 마이닝을 위한 그래프 정점 재배치 분산 알고리즘 (A Distributed Vertex Rearrangement Algorithm for Compressing and Mining Big Graphs)

  • 박남용;박치완;강유
    • 정보과학회 논문지
    • /
    • 제43권10호
    • /
    • pp.1131-1143
    • /
    • 2016
  • 수십억 개 간선들로 구성된 대용량 그래프를 어떻게 효과적으로 압축할 수 있을까? 정점 재배치를 통해 인접 행렬의 0이 아닌 값들을 집중시키면 그래프를 효율적으로 압축할 수 있을 뿐 아니라 페이지랭크 등 여러 그래프 마이닝 알고리즘의 수행 속도를 개선할 수 있다. 최신 정점 재배치 기법인 SlashBurn은 실세계 네트워크의 멱법칙 특성을 활용하는 실세계 그래프에 효과적인 방법이다. 하지만 단일 머신 기반으로 설계되어 대용량 그래프에 대해 처리 속도가 현저히 느려지거나 적용이 불가능한 한계가 있다. 본 논문에서는 이러한 한계를 극복하기 위한 분산 SlashBurn을 제안한다. 분산 SlashBurn은 대규모의 정점 재배치 프로세스를 분산 처리하여 대용량 그래프를 기존 방법보다 훨씬 빠르고 확장성 있게 처리한다. 대용량 실세계 그래프들에 대한 실험 결과, 분산 SlashBurn은 단일 머신 SlashBurn보다 45배 이상 빠르게 동작하였고, 16배 이상 큰 그래프를 처리할 수 있었다.