• KSBB Journal
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• 제14권6호
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• pp.702-706
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• 1999

대표적인 양식 해조류인 방사무늬 김 엽체를 대상으로 하여 산 처리에 의한 유전형질의 표현 변화를 differential display기법으로 비교하여 보았다. 방사무늬 김 엽체를 0.05% HCl을 첨가한 해수(pH 3.0)에서 5분간 처리한 후 각각 10분, 30분, 60분 그리고 4시간동안 멸균 해수에서 정치 배양시키면서, RNA를 추출하여 cDNA합성, PCR 증폭, agarose gel 전기영동 및 DNA 염기배열을 조사하였다. 그 결과 arbitrary primer OPA 1(CAGGCCCTTC)을 사용하여 differential display한 경우, 산 처리 후 30분간 멸균 해수에서 정치 배양한 엽체에서 특이적으로 RNA 합성이 일어나지 않은 유전자를 분리할 수 있었으며, 그 염기서열을 비교한바 이 유전자 fragment(605 bp)는 dethiobiotin synthetase 유전자와 93%의 높은 상동성을 가진 것으로 나타났다.

• Molecules and Cells
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• 제42권11호
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• pp.783-793
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• 2019

When endoplasmic reticulum (ER) functions are perturbed, the ER induces several signaling pathways called unfolded protein response to reestablish ER homeostasis through three ER transmembrane proteins: inositol-requiring enzyme 1 (IRE1), PKR-like ER kinase (PERK), and activating transcription factor 6 (ATF6). Although it is important to measure the activity of ATF6 that can indicate the status of the ER, no specific cell-based reporter assay is currently available. Here, we report a new cell-based method for monitoring ER stress based on the cleavage of $ATF6{\alpha}$ by sequential actions of proteases at the Golgi apparatus during ER stress. A new expressing vector was constructed by using fusion gene of GAL4 DNA binding domain (GAL4DBD) and activation domain derived from herpes simplex virus VP16 protein (VP16AD) followed by a human $ATF6{\alpha}$ N-terminal deletion variant. During ER stress, the GAL4DBD-VP16AD(GV)-$hATF6{\alpha}$ deletion variant was cleaved to liberate active transcription activator encompassing GV-$hATF6{\alpha}$ fragment which could translocate into the nucleus. The translocated GV-$hATF6{\alpha}$ fragment strongly induced the expression of firefly luciferase in HeLa Luciferase Reporter cell line containing a stably integrated 5X GAL4 site-luciferase gene. The established double stable reporter cell line HLR-GV-$hATF6{\alpha}$(333) represents an innovative tool to investigate regulated intramembrane proteolysis of $ATF6{\alpha}$. It can substitute active pATF6(N) binding motif-based reporter cell lines.

• Restorative Dentistry and Endodontics
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• 제46권4호
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• pp.49.1-49.8
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• 2021

Objectives: To evaluate the fracture incidence of Reciproc R25 instruments (VDW) used during non-surgical root canal retreatments performed by students in a postgraduate endodontic program. Materials and Methods: From the analysis of clinical record cards and periapical radiographs of root canal retreatments performed by postgraduate students using the Reciproc R25, a total of 1,016 teeth (2,544 root canals) were selected. The instruments were discarded after a single use. The general incidence of instrument fractures and its frequency was analyzed considering the group of teeth and the root thirds where the fractures occurred. Statistical analysis was performed using the χ² test (p < 0.01). Results: Seven instruments were separated during the procedures. The percentage of fracture in relation to the number of instrumented canals was 0.27% and 0.68% in relation to the number of instrumented teeth. Four fractures occurred in maxillary molars, 1 in a mandibular molar, 1 in a mandibular premolar and 1 in a maxillary incisor. A greater number of fractures was observed in molars when compared with the number of fractures observed in the other dental groups (p < 0.01). Considering all of the instrument fractures, 71.43% were located in the apical third and 28.57% in the middle third (p < 0.01). One instrument fragment was removed, one bypassed, while in 5 cases, the instrument fragment remained inside the root canal. Conclusions: The use of Reciproc R25 instruments in root canal retreatments carried out by postgraduate students was associated with a low incidence of fractures.

• Animal Bioscience
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• 제36권9호
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• pp.1357-1366
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• 2023

Objective: This study aimed to identify the single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in the dual-specificity phosphatase 8 (DUSP8) and insulin-like growth factor 2 (IGF2) genes and to explore their effects on inosine-5'-monophosphate (IMP), inosine, and hypoxanthine contents in Korean native chicken -red-brown line (KNC-R Line). Methods: A total sample of 284 (males, n = 127; females n = 157) and 230 (males, n = 106; females, n = 124) aged of 10 weeks old KNC-R line was used for genotyping of DUSP8 and IGF2 genes, respectively. One SNP (rs313443014 C>T) in DUSP8 gene and two SNPs (rs315806609A/G and rs313810945T/C) in IGF2 gene were used for genotyping by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) and KASP methods, respectively. The Two-way analysis of variance of the R program was used to associate DUSP8 and IGF2 genotypes with nucleotide contents in KNC-R chickens. Results: The DUSP8 (rs313443014 C>T) was polymorphic in KNC-R line and showed three genotypes: CC, CT, and TT. The IGF2 gene (rs315806609A/G and rs313810945T/C) was also polymorphic and had three genotypes per SNP, including GG, AG, and AA for the SNP rs315806609A/G and genotypes: CC, CT, and TT for the SNP rs313810945T/C. Association resulted into a strong significant association (p<0.01) with IMP, inosine, and hypoxanthine. Moreover, the significant effect of sex (p<0.05) on nucleotide content was also observed. Conclusion: The SNPs in the DUSP8 and IGF2 genes might be used as genetic markers in the selection and production of chickens with highly flavored meat.

• 한국정보통신학회논문지
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• 제10권8호
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• pp.1414-1421
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• 2006

본 논문에서는 VOD에서 스트리밍 데이터를 효율적으로 서비스할 수 있는 Consistency 알고리즘을 제시한다. 미디어 데이터 서비스를 위해 우선 하나의 미디어 데이터를 라운드 로빈 방식으로 스트라이핑하여 각 호스트의 저장 노드에 저장한다. 본 논문에서는 일반적인 계산 용도로 사용되는 barrier 메커니즘을 미디어 플레이 최소 단위인 (SH, GOP) 미디어 데이터에 서비스할 수 있도록 제시하였다. 데이타 처리 방식은 하나의 호스트에 한 프래그먼트 크기의 공유메모리를 할당한다. 이 공유메모리 는 barrier 메커니즘을 통하여 RTP패킷 전송 단위로 결정될 프래그먼트 데이터의 조합을 형성한다. 본 논문에서 제시한 알고리즘에 대해서 실험을 수행하기 위해서 VOD 시스템에서 프로그램을 작성하였다.

• 한국HCI학회:학술대회논문집
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• 한국HCI학회 2007년도 학술대회 1부
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• pp.1025-1030
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• 2007

여러 학계와 산업계로부터 인체영상과 같은 정적인 볼륨 데이터뿐만 아니라, 유체 흐름과 같은 동적으로 움직이는 Time-Variant 볼륨 데이터에 대한 실시간 렌더링의 요구가 계속되고 있다. 일반적으로 Time-Variant 데이터는 그 크기가 정적 볼륨 데이터의 수배에서 수백 배에 이르러, 이를 실시간으로 가시화하는 데에 많은 어려움이 있어왔다. 한편, PC 그래픽스 하드웨어의 급격한 발전에 따라 슈퍼컴퓨터나 다수의 컴퓨터들을 이용한 병렬/분산 렌더링으로나 가능했던 Time-Variant 볼륨 데이터의 실시간 볼륨 렌더링을 한대의 일반 PC에서 수행하려는 시도가 계속되고 있다. GPU의 꼭지점 및 프래그먼트 쉐이더(vertex & fragment shader)는 수치 계산에 최적화된 벡터 연산과 사용자 프로그래밍 기능으로 빠른 볼륨 렌더링을 일반 PC에서도 가능하게 했다. 본 논문에서는 GPU를 이용해서 Time-Variant 볼륨 데이터를 빠르게 가시화하고, 이렇게 개발한 GPU 볼륨 렌더링 프로그램을 사용자가 사용하기 편리하도록 사용자 친화적인 유저 인터페이스를 설계하고 구현하였다. 특히, 시간에 따라 동적으로 변화해야 하는 전이함수를 최대한 편리하게 생성할 수 있도록 전이함수 에디터에 중점을 두었다.

• 천문학회지
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• 제37권4호
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• pp.243-248
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• 2004

Disk galaxies abound with intermediate-scale structures such as OB star complexes, giant clouds, and dust spurs in a close geometrical association with spiral arms. Various mechanisms have been proposed as candidates for their origin, but a comprehensive theory should encompass fundamental physical agents such as self-gravity, magnetic fields, galactic differential rotation, and spiral arms, all of which are known to exist in disk galaxies. Recent numerical simulations incorporating all these physical processes show that magneto-Jeans instability (MJI), in which magnetic tension resists the stabilizing Coriolis force of galaxy rotation, is much more powerful than swing-amplification or the Parker instability in forming self-gravitating intermediate-scale structures. The MJI occurring in shearing and expanding flows off spiral arms rapidly forms structures elongated along the direction perpendicular to the arms, remarkably similar to dust spurs seen in HST images of spiral galaxies. In highly nonlinear stages, these spurs fragment to form bound clumps, possibly evolving into bright arm and interarm H II regions, suggesting that all these intermediate-scale structures in spiral galaxies probably share a common dynamical origin.

• KSBB Journal
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• 제22권4호
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• pp.234-238
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• 2007

본 연구에서는 전극분무 이온화-이온 포획 질량 분석기를 이용하여 인체 IgG의 N-연결 글라이칸 중 이중촉각 구조를 가지면서 비환원 말단의 갈락토오즈 개수가 0, 1, 2 개인 서로 다른 세 가지 글라이칸의 단일 쪼개짐 (MS/MS) 및 다중 쪼개짐 현상을 관찰하고 이를 구조 분석에 이용하였다. MS/MS 분석에서는 퓨코오즈가 결합된 환원 말단의 N-아세틸 글루코사민의 0,2-고리 쪼개짐으로 파생되는 조각 피크가 가장 높은 세기로 나타나는 것을 관찰할 수 있었고, 전구체 피크와 별개로 연속적인 당 단위체의 쪼개짐이 일어나는 것을 알 수 있었다. 또한 G1 글라이칸의 경우에서만 비환원 말단의 갈락토오즈와 N-아세틸글루코사민이 결합된 채 쪼개지는 현상이 일어나는 것을 관찰할 수 있었다. 다중 쪼개짐 질량 분석 기법을 이용하여 MS/MS 스펙트럼에서 나타나는 조각 피크들의 구조를 재확인할 수 있었고, 이를 트리 구조로 정리할 수 있었다. 또한 추가적인 2,4-고리 쪼개짐 현상이 환원 말단 하나 바깥쪽의 N-아세틸 글루코사민에서 공통적으로 일어나는 것을 관찰할 수 있었다. 이와 같은 다중 쪼개짐 질량 분석기법을 이용하여 보다 복잡한 구조의 글라이칸 구조 분석에 이용될 수 있을 것으로 기대된다.

• 정보처리학회논문지D
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• 제16D권1호
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• pp.83-92
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• 2009

현실 세계의 복잡한 비즈니스 로직들이 프로그램 내부에 투영되면서 시스템의 복잡도는 갈수록 높아지고 있다. 이러한 높은 복잡도를 가지는 프로그램도 그 생명주기 동안 재공학을 거쳐야 하는 것은 필연적일 것이다. 다양한 목적으로 가해지는 재공학 작업에서 그 작업의 대상이 되는 핫 스팟 예측은 매우 중요하다. 일반적으로 레거시 시스템의 재공학 작업은 UML과 코드 분석을 기반으로 예측한다. 또한 그 예측 단위는 클래스 혹은 유닛(함수) 단위가 된다. 그러나 함수 내부의 코드의 량이 갈수록 커져가고 있고 더 미세한 핫 스팟을 찾기 위하여 클래스 단위의 탐색보다 더 미세한 부분의 탐색이 필요하다. 본 논문에서는 AOP를 이용한 문장 단위의 핫 스팟 검출 기법을 제안한다. 기존의 기법에서 요구하던 핫 스팟 검출을 위한 UML과 코드 분석, 또한 이 둘 사이의 일치성과 관계없이 동적으로 AOP를 이용하여 레거시 시스템의 실행 정보를 기록하는 동적 이벤트 로그 데이터를 생성한다. 이를 바탕으로 핫 스팟을 예측하고 슬라이싱하는 방법을 제안하였다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제20권1호
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• pp.187-192
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• 2010

In order to monitor the possibility of horizontal gene transfer between transgenic rice and microorganisms in a paddy rice field, the gene flow from a bifunctional fusion (TPSP) rice containing trehalose-6-phosphate synthase and phosphatase to microorganisms in soils was investigated. The soil samples collected from the paddy rice field during June 2004 to March 2006 were investigated by multiplex PCR, Southern hybridization, and amplified fragment length polymorphism (AFLP). The TPSP gene from soil genomic DNAs was not detected by PCR. Soil genomic DNAs did not show homologies on the Southern blotting data, indicating that gene transfer did not occur during the last two years in the paddy rice field. In addition, the AFLP band patterns produced by soil genomic DNAs from both transgenic and non-transgenic rice fields appeared similar to each other when analyzed by the NTSYSpc program. Thus, these data suggest that transgenic rice does not give a significant impact on the communities of soil microorganisms, although long-term observation may be needed.