As the large amount of data can be efficiently stored, the methods extracting meaningful features from big data has become important. Especially, the techniques of converting high- to low-dimensional data are crucial for the 'Data visualization'. In this study, principal component analysis (PCA; linear dimensionality reduction technique) and Isomap (non-linear dimensionality reduction technique) are introduced and applied to neural big data obtained by the functional magnetic resonance imaging (fMRI). First, we investigate how much the physical properties of stimuli are maintained after the dimensionality reduction processes. We moreover compared the amount of residual variance to quantitatively compare the amount of information that was not explained. As result, the dimensionality reduction using Isomap contains more information than the principal component analysis. Our results demonstrate that it is necessary to consider not only linear but also nonlinear characteristics in the big data analysis.
International Journal of Computer Science & Network Security
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제22권6호
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pp.230-240
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2022
Sharing of online videos via internet is an emerging and important concept in different types of applications like surveillance and video mobile search in different web related applications. So there is need to manage personalized web video retrieval system necessary to explore relevant videos and it helps to peoples who are searching for efficient video relates to specific big data content. To evaluate this process, attributes/features with reduction of dimensionality are computed from videos to explore discriminative aspects of scene in video based on shape, histogram, and texture, annotation of object, co-ordination, color and contour data. Dimensionality reduction is mainly depends on extraction of feature and selection of feature in multi labeled data retrieval from multimedia related data. Many of the researchers are implemented different techniques/approaches to reduce dimensionality based on visual features of video data. But all the techniques have disadvantages and advantages in reduction of dimensionality with advanced features in video retrieval. In this research, we present a Novel Intent based Dimension Reduction Semi-Supervised Learning Approach (NIDRSLA) that examine the reduction of dimensionality with explore exact and fast video retrieval based on different visual features. For dimensionality reduction, NIDRSLA learns the matrix of projection by increasing the dependence between enlarged data and projected space features. Proposed approach also addressed the aforementioned issue (i.e. Segmentation of video with frame selection using low level features and high level features) with efficient object annotation for video representation. Experiments performed on synthetic data set, it demonstrate the efficiency of proposed approach with traditional state-of-the-art video retrieval methodologies.
For pattern recognition on high-dimensional data, such as images, the dimensionality reduction as a preprocessing is effective. By dimensionality reduction, we can (1) reduce storage capacity or amount of calculation, and (2) avoid "the curse of dimensionality" and improve classification performance. Popular tools for dimensionality reduction are Principal Component Analysis (PCA), Linear Discriminant Analysis (LDA), and Independent Component Analysis (ICA) recently. Among them, only LDA takes the class labels into consideration. Nevertheless, it, has been reported that, the classification performance with ICA is better than that with LDA because LDA has restriction on the number of dimensions after reduction. To overcome this dilemma, we propose a new dimensionality reduction technique based on an information theoretic measure for difference of distribution. It takes the class labels into consideration and still it does not, have restriction on number of dimensions after reduction. Improvement of classification performance has been confirmed experimentally.
International Journal of Computer Science & Network Security
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제21권3호
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pp.31-36
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2021
RNA sequencing (RNA-Seq) is a technology that facilitates transcriptome analysis using next-generation sequencing (NSG) tools. Information on the quantity and sequences of RNA is vital to relate our genomes to functional protein expression. RNA-Seq data are characterized as being high-dimensional in that the number of variables (i.e., transcripts) far exceeds the number of observations (e.g., experiments). Given the wide range of dimensionality reduction techniques, it is not clear which is best for RNA-Seq data analysis. In this paper, we study the effect of three dimensionality reduction techniques to improve the classification of the RNA-Seq dataset. In particular, we use PCA, SVD, and SOM to obtain a reduced feature space. We built nine classification models for a cancer dataset and compared their performance. Our experimental results indicate that better classification performance is obtained with PCA and SOM. Overall, the combinations PCA+KNN, SOM+RF, and SOM+KNN produce preferred results.
Journal of Advanced Marine Engineering and Technology
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제40권8호
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pp.726-732
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2016
Clustering analysis is widely used in data mining to classify data into categories on the basis of their similarity. Through the decades, many clustering techniques have been developed, including hierarchical and non-hierarchical algorithms. In gene profiling problems, because of the large number of genes and the complexity of biological networks, dimensionality reduction techniques are critical exploratory tools for clustering analysis of gene expression data. Recently, clustering analysis of applying dimensionality reduction techniques was also proposed. PCA (principal component analysis) is a popular methd of dimensionality reduction techniques for clustering problems. However, previous studies analyzed the performance of PCA for only full data sets. In this paper, to specifically and robustly evaluate the performance of PCA for clustering analysis, we exploit an improved FCBF (fast correlation-based filter) of feature selection methods for supervised clustering data sets, and employ two well-known clustering algorithms: k-means and k-medoids. Computational results from supervised data sets show that the performance of PCA is very poor for large-scale features.
International Journal of Fuzzy Logic and Intelligent Systems
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제12권1호
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pp.1-5
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2012
Data reduction has been used widely in data mining for convenient analysis. Principal component analysis (PCA) and factor analysis (FA) methods are popular techniques. The PCA and FA reduce the number of variables to avoid the curse of dimensionality. The curse of dimensionality is to increase the computing time exponentially in proportion to the number of variables. So, many methods have been published for dimension reduction. Also, data augmentation is another approach to analyze data efficiently. Support vector machine (SVM) algorithm is a representative technique for dimension augmentation. The SVM maps original data to a feature space with high dimension to get the optimal decision plane. Both data reduction and augmentation have been used to solve diverse problems in data analysis. In this paper, we compare the strengths and weaknesses of dimension reduction and augmentation for classification and propose a classification method using data reduction for classification. We will carry out experiments for comparative studies to verify the performance of this research.
A classification task requires an exponentially growing amount of computation time and number of observations as the variable dimensionality increases. Thus, reducing the dimensionality of the data is essential when the number of observations is limited. Often, dimensionality reduction or feature selection leads to better classification performance than using the whole number of features. In this paper, we study the possibility of utilizing the Markov blanket discovery algorithm as a new feature selection method. The Markov blanket of a target variable is the minimal variable set for explaining the target variable on the basis of conditional independence of all the variables to be connected in a Bayesian network. We apply several Markov blanket discovery algorithms to some high-dimensional categorical and continuous data sets, and compare their classification performance with other feature selection methods using well-known classifiers.
Journal of the Korean Data and Information Science Society
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제22권6호
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pp.1257-1264
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2011
Delirium is a neuropsychiatric disorder accompanying symptoms of hallucination, drowsiness, and tremors. It has high occurrence rates among elders, heart disease patients, and burn patients. It is a medical emergency associated with increased morbidity and mortality rates. That s why early detection and prevention of delirium ar significantly important. And This mental illness like delirium occurred by complex interaction between risk factors. In this paper, we identify risk factors and interactions between these factors for delirium using multi-factor dimensionality reduction (MDR) method.
멀티미디어 정보 검색에서 멀티미디어 데이터는 고차원 공간상의 벡터로 표현된다. 이러한 특정 벡터를 효율적으로 검색하기 위하여 다양한 색인 기법이 제안되어 왔다. 그러나 특정 벡터의 차원이 증가하면서 색인 기법의 효율성이 급격히 떨어지는 차원의 저주 문제가 발생한다. 차원의 저주 문제를 해결하기 위하여 색인하기 이전에 원 특정 벡터를 저차원 공간상의 벡터로 사상하는 차원 축소 기법이 제안된 바 있다. 본 연구에서는 벡터의 놈과 각도 성분을 이용하여 유클리드 거리를 근사하는 함수를 기반으로 하는 새로운 차원 축소 기법을 제안한다. 먼저, 유클리드 거리 근사를 위하여 추정된 각도의 오차의 발생 원인을 분석하고 이 오차를 줄이기 위한 기본 방향을 제시한다. 또한, 고차원 특정 벡터를 다수의 특징 서브 벡터들의 집합으로 분리하고 각 특징 서브 벡터로부터 놈과 각도 성분을 근사하여 차원을 축소하는 새로운 기법을 제안한다. 각도 성분을 정확하게 근사하기 위해서는 올바른 기준 벡터의 설정이 필수적이다. 본 연구에서는 최적 기준 벡터의 조건을 제시하고, Levenberg-Marquardt 알고리즘을 이용하여 기준 벡터를 선정하는 방법을 제안한다. 또한, 축소된 저차원 공간상의 벡터틀을 위한 새로운 거리 함수를 정의하고, 이 거리 함수가 유클리드 거리 함수의 하한 함수가 됨을 이론적으로 증명한다. 이는 제안된 기법이 착오 기각의 발생을 허용하지 않으면서 효과적으로 차원을 줄일 수 있음을 의미하는 것이다. 끝으로, 다양한 실험에 의한 성능 평가를 통하여 제안하는 방법의 우수성을 규명한다.
본 연구는 노이즈 필터링과 차원축소 등의 방법을 이용하여 텍스트 지표의 정상화에 대해 검토하고 실증 분석을 통해 동 지표의 활용가능성을 제고할 수 있는 후처리 과정을 탐색하고자 하였다. 실증분석에 대한 예측 목표 변수로 월별 선행지수 순환 변동치, BSI 전산업 매출실적, BSI 전산업 매출전망 그리고 분기별 실질 GDP SA전기비와 실질 GDP 원계열 전년동기비를 상정하고 계량경제학에서 널리 활용되는 Hodrick and Prescott 필터와 비모수 차원축소 방법론인 충분차원축소를 비정형 텍스트 데이터와 결합하여 분석하였다. 분석 결과 월별과 분기별 변수 모두에서 자료의 수가 많은 경우 텍스트 지표의 노이즈 필터링이 예측 정확도를 높이고, 차원 축소를 적용함에 따라 보다 높은 예측력을 확보할 수 있음을 확인하였다. 분석 결과가 시사하는 바는 텍스트 지표의 활용도 제고를 위해서는 노이즈 필터링과 차원 축소 등의 후처리 과정이 중요하며 이를 통해 경기 예측의 정도를 높일 수 있다는 것이다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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