Objective: The aim of this study is to identify single nucleotide polymorphisms (SNPs) and genes related to pig IMF and estimate the heritability of intramuscular fat content (IMF). Methods: Genome-wide association study (GWAS) on 704 inbred Berkshires was performed for IMF. To consider the inbreeding among samples, associations of the SNPs with IMF were tested as random effects in a mixed linear model using the genetic relationship matrix by GEMMA. Significant genes were compared with reported pig IMF quantitative trait loci (QTL) regions and functional classification of the identified genes were also performed. Heritability of IMF was estimated by GCTA tool. Results: Total 365 SNPs were found to be significant from a cutoff of p-value <0.01 and the 365 significant SNPs were annotated across 120 genes. Twenty five genes were on pig IMF QTL regions. Bone morphogenetic protein-binding endothelial cell precursor-derived regulator, forkhead box protein O1, ectodysplasin A receptor, ring finger protein 149, cluster of differentiation, tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, SRY (sex determining region Y)-box 9 (SOX9), MYC proto-oncogene, and macrophage migration inhibitory factor were related to mitogen-activated protein kinase pathway, which regulates the differentiation to adipocytes. These genes and the genes mapped on QTLs could be the candidate genes affecting IMF. Heritability of IMF was estimated as 0.52, which was relatively high, suggesting that a considerable portion of the total variance of IMF is explained by the SNP information. Conclusion: Our results can contribute to breeding pigs with better IMF and therefore, producing pork with better sensory qualities.
Journal of Physiology & Pathology in Korean Medicine
/
v.18
no.6
/
pp.1635-1642
/
2004
The aim of this study was to find out the effectiveness on germinated Rhynchosia Volubilis for Female Bone Morphogenesis. For this purpose, experiments using germinated Rhynchosia Volubilis(GRV) according to germinating days were conducted to measure the polyphosphate contents and to examine the effects of the transcription activity of gene related to bone morphogenesis on the formation of bone in female. The quantitative analysis of the polyphosphate contents showed that 1 day geminated Rhynchosia Volubilis(GRV) group is treble better contents of polyphosphate than non-germinated Rhynchosia Volubilis, 2 day and 3 day GRV groups. The active of the COL1, OTN, MGP, BMP genes was less than the increase of the polyphosphate contents.
Influence of loneliness on human survival has been established epidemiologically, but genomic research remains undeveloped. We identified 34 loneliness-associated genes which were statistically significant for high-lonely and low-lonely individuals. With the univariate Cox proportional hazards regression model, we obtained corresponding regression coefficients for loneliness-associated genes fo individual cancer patients. Furthermore, risk scores could be generated with the combination of gene expression level multiplied by corresponding regression coefficients of loneliness-associated genes. We verified that high-risk score cancer patients had shorter mean survival time than their low-risk score counterparts. Then we validated the loneliness-associated gene signature in three independent brain cancer cohorts with Kaplan-Meier survival curves (n=77, 85 and 191), significantly separable by log-rank test with hazard ratios (HR) >1 and p-values <0.0001 (HR=2.94, 3.82, and 1.78). Moreover, we validated the loneliness-associated gene signature in bone cancer (HR=5.10, p-value=4.69e-3), lung cancer (HR=2.86, p-value=4.71e-5), ovarian cancer (HR=1.97, p-value=3.11e-5), and leukemia (HR=2.06, p-value=1.79e-4) cohorts. The last lymphoma cohort proved to have an HR=3.50, p-value=1.15e-7. Loneliness-associated genes had good survival prediction for cancer patients, especially bone cancer patients. Our study provided the first indication that expression of loneliness-associated genes are related to survival time of cancer patients.
Jae‑Hyun Kim;Minsun Kim;Hyuk‑Sang Jung;Youngjoo Sohn
International Journal of Molecular Medicine
/
v.44
no.3
/
pp.913-926
/
2019
Leonurus sibiricus L. (LS) is a medicinal plant used in East Asia, Europe and the USA. LS is primarily used in the treatment of gynecological diseases, and recent studies have demonstrated that it exerts anti-inflammatory and antioxidant effects. To the best of our knowledge, the present study demonstrated for the first time that LS may promote osteoblast differentiation and suppress osteoclast differentiation in vitro, and that it inhibited lipopolysaccharide (LPS)-induced bone loss in a mouse model. LS was observed to promote the osteoblast differentiation of MC3T3-E1 cells and upregulate the expression of runt-related transcription factor 2 (RUNX2), a key gene involved in osteoblast differentiation. This resulted in the induction of the expression of various osteogenic genes, including alkaline phosphatase (ALP), osteonectin (OSN), osteopontin (OPN), type I collagen (COL1) and bone sialoprotein (BSP). LS was also observed to inhibit osteoclast differentiation and bone resorption. The expression levels of nuclear factor of activated T-cells 1 (NFATc1) and c-Fos were inhibited following LS treatment. NFATc1 and c-Fos are key markers of osteoclast differentiation that inhibit receptor activator of nuclear factor-κB ligand (RANKL)-induced mitogen-activated protein kinase (MAPKs) and nuclear factor (NF)-κB. As a result, LS suppressed the expression of osteoclast-associated genes, such as matrix metallopeptidase-9 (MMP-9), cathepsin K (Ctsk), tartrate-resistant acid phosphatase (TRAP), osteoclast-associated immunoglobulin-like receptor (OSCAR), c-src, c-myc, osteoclast stimulatory transmembrane protein (OC-STAMP) and ATPase H+ transporting V0 subunit d2 (ATP6v0d2). Consistent with the in vitro results, LS inhibited the reduction in bone mineral density and the bone volume/total volume ratio in a mouse model of LPS-induced osteoporosis. These results suggest that LS may be a valuable agent for the treatment of osteoporosis and additional bone metabolic diseases.
Objectives : This study was conducted to evaluate the effect of Kanghwalsokdan-tang Gamibang water extract (KSG) on osteoporosis. Methods : RANKL-stimulated RAW 264.7 was used to evaluate inhibitory effect of KSG osteoclast differentiation and gene expression. We counted TRAP (+) multinucleated cells and measured TRAP activity and mRNA expressions of osteoclastogenesis-related genes (NFATc1, MITF, JNK1, cathepsin K, MMP-9) to figure out the effect of KSG on osteoclast. Osteoblastogenesis was also determined in rat calvarial cell. Alkaline phosphatase (ALP) activity, bone matrix protein and collagen synthesis were measured by using murine calvarial cell. Results : KSG inhibited the differentiation of osteoclast precursor cell and expression of genes related osteoclastogenesis like NAFTc1, MITF, c-fos, JNK1, Cathepsin K, MMP-9 and TRAP. KSG increased cell division and function of osteoblast separated from the skull of a rat and ALP synthesis, biosynthesis of bone matrix protein and collagen. Conclusions : Reviewing these results, KSG has efficacy on osteoclast inhibition and osteoblast activation. After further study, KSG will be able to apply for osteoporosis treatment and prevention.
Purpose: We evaluated whether Spatholobus suberectus extract (SSE) can be used as a means of preventing and treating osteoporosis by measuring its effect on osteoclast differentiation, gene expression, and bone resorption. Methods: SSE was used to examine the effect on RAW 264.7 cells stimulated with RANKL to induce bone resorption. The inhibitory effect of TRAP formation and the expression of the bone resorption factors TRAP, cathepsin K, and MMP-9 during differentiation were measured. The effects on the differentiation-related factors NFATc and TRAIL and on the expression of OC-STAMP, DC-STAMP, ATP6v0d2, MITF, c-Fos, and inflammation-related factors were also evaluated. The effect on bone resorption was evaluated by culturing RANKL-treated osteoclasts on artificial bone fragments and observing the resulting resorption traces. The effect on bone damage in experimental animals was also measured. Results: SSE inhibited the differentiation of RANKL-stimulated osteoclasts into osteoclasts and suppressed the expression of cathepsin K, TRAP, MMP-9, NFATc1, TRAIL, MITF, OC-STAMP, DC-STAMP, ATP6v0d2, and c-Fos genes. Bone pore formation due to osteoclast action was also inhibited, and LPS-induced bone loss was suppressed in animal experiments. Conclusions: SSE could be useful for the prevention or treatment of osteoporosis by inhibiting osteoclast differentiation and bone resorption and suppressing bone loss induced in experimental animals. However, studies of larger populations are required.
Objective : Bone homeostasis is maintained by balance of bone formation and resorption. Therefore, bone related diseases arose by disturbance of this balance between osteoblast and osteoclast activities. To develop a successful screening system the therapeutic components based on oriental medicine is essential to set up systematic approach for that purpose. The purpose of this study is to the know the gene expression using cDNA microarray assay. Methods : Cervi Pantotricuhum Cornu Herbal-acupuncture extract was prepared by boiling. human osteosarcoma cells(HOS) were treated with Cervi Pantotricuhum Cornu Herbal-acupuncture solution. Then mRNA was extracted and cDNA microarray assay was performed. Results : Human osteosarcoma cells(HOS) treated with Cervi Pantotricuhum Cornu Herbal-acupuncture solution($500{\mu}g/m{\ell}$) showed that thioredoxin, TAFII31 and two novel genes were increased. However many genes decreased their expression by Cervi Pantotricuhum Cornu Herbal-acupuncture. Conclusions : This type of approach will give a good chance to explore the favorable effects of Cervi Pantotricuhum Cornu Herbal-acupuncture. Further study is needed for investigating the effect of Cervi Pantotricuhum Cornu Herbal-acupuncture.
Cho Young-Eon;Lomeda Ria-Ann R.;Kim Yang-Ha;Ryu Sang-Hoon;Choi Je-Yong;Kim Hyo-Jin;Beattie John H.;Kwun In-Sook
Nutritional Sciences
/
v.8
no.4
/
pp.242-249
/
2005
It is well established that zinc plays an important role in bone metabolism and mineralization. The role of zinc in bone formation is well documented in animal models, but not much reported in cell models. In the present study, we evaluated zinc deficiency effects on osteoblastic cell proliferation, alkaline phosphatase activity and expression, and extracellular matrix bone nodule formation and bone-related gene expression in osteoblastic MC3T3-E1 cells. To deplete cellular zinc, chelexed-FBS and interpermeable zinc chelator TPEN were used. MC3T3-E1 cells were cultured in zinc concentration-dependent (0-15 ${\mu}M\;ZnCl_2$) and time-dependent (0-20 days) manners. MC3T3-E1 cell proliferation by MTT assay was increased as medium zinc level increased (p<0.05). Cellular Ca level and alkaline phosphatase activity were increased as medium zinc level increased (p<0.05). Alkaline phosphatase expression, a marker of commitment to the osteoblast lineage, measured by alkaline phosphatase staining was increased as medium zinc level increased. Extracellular calcium deposits measured by von Kossa staining for nodule formation also appeared higher in Zn+(15 ${\mu}M\;ZnCl_2$) than in Zn-(0 ${\mu}M\;ZnCl_2$). Bone formation marker genes, alkaline phosphatase and osteocalcin, were also expressed higher in Zn+ than in Zn-. The current work supports the beneficial effect of zinc on bone mineralization and bone-related gene expression. The results also promote further study as to the molecular mechanism of zinc deficiency for bone formation and thus facilitate to design preventive strategies for zinc-deficient bone diseases.
Purpose: Zinc (Zn) is an essential trace element for bone mineralization and osteoblast function. We examined the effects of Zn deficiency on osteoblast differentiation and mineralization in MC3T3-E1 cells. Methods: Osteoblastic MC3T3-E1 cells were cultured at concentration of 1 to $15{\mu}M$$ZnCl_2$ (Zn- or Zn+) for 5, 15 and 25 days up to the calcification period. Extracellular matrix mineralization was detected by staining Ca and P deposits using Alizarin Red and von Kossa stain respectively, and alkaline phosphatase (ALP) activity was detected by ALP staining and colorimetric method. Results: Extracellular matrix mineralization was decreased in Zn deficiency over 5, 15, and 25 days. Similarly, staining of ALP activity as the sign of an osteoblast differentiation, was also decreased by Zn deficiency over the same period. Interestingly, the gene expression of bone-related markers (ALP, PTHR; parathyroid hormone receptor, OPN; osteopontin, OC; osteocalcin and COLI; collagen type I), and bone-specific transcription factor Runx2 were downregulated by Zn deficiency for 5 or 15 days, however, this was restored at 25 days. Conclusion: Our data suggests that Zn deficiency inhibits osteoblast differentiation by retarding bone marker gene expression and also inhibits bone mineralization by decreasing Ca/P deposition as well as ALP activity.
Objectives: This study was conducted to evaluate the effects of Hyeolbuchugeo-tang (HBC) on Osteoporosis. Methods: We induced RAW 264.7 cells to differentiate to Osteoclasts by RANKL and treated RANKL-induced RAW 264.7 cells with HBC (0, 150, 350, $700{\mu}g/ml$). To measure osteoclast differentiation and activation, we counted TRAP (+) MNCs and measured mRNA expressions of its related genes (TRAP, MMP-9, cathepsin K, NFATc1, c-Fos, MITF, iNOS, COX-2, TNF-${\alpha}$) by RT-PCR. To assess bone resorption, the Bone pit formation were examined under a microscope. Results: HBC decreased TRAP (+) MNCs and inhibited mRNA expressions of TRAP, MMP-9, cathepsin K, NFATc1, c-Fos, MITF in osteoclast. And HBC inhibited Bone pit formation. Conclusions: HBC inhibited osteoclast differentiation and activation and bone resorption. Taken together, these results indicate that HBC might have potentials for prevention and treatment of Osteoporosis.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.