Zhao, Yanting;Duan, Cuilan;Zhang, Xu-xiang;Chen, Huangen;Ren, Hongqiang;Yin, Ying;Ye, Lin
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제28권6호
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pp.946-956
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2018
The gut microbiota of aquatic animals plays a crucial role in host health through nutrient acquisition and outcompetition of pathogens. In this study, on the basis of the high-throughput sequencing of 16S rRNA gene amplicons, we examined the bacterial communities in the gut of freshwater shrimp (Macrobrachium nipponense) and in their living environments (sediment and pond water) and analyzed the effects of abiotic and biotic factors on the shrimp gut bacterial communities. High bacterial heterogeneity was observed in the freshwater shrimp gut samples, and the result indicated that both the surrounding bacterial community and water quality factors (particularly dissolved oxygen and temperature) could affect the shrimp gut bacterial community. Despite the observed heterogeneity, 57 genera, constituting 38-99% of the total genera in each of the 40 shrimp gut samples, were identified as the main bacterial population in the gut of M. nipponense. In addition, a high diversity and abundance of lactic acid bacteria (26 genera), which could play significant roles in the digestion process in shrimp, were observed in the shrimp gut samples. Overall, this study provides insights into the gut bacterial communities of freshwater shrimp and basic information for shrimp farming regarding the application of probiotics and disease prevention.
In recent years, environmental pollution by phannaceuticals and personal care products (PPCPs) in the aquatic environment is of great concern worldwide. Recent studies have been reported to occur in a variety of environmental organisms such as surface, drinking and ground water, soils, sediments and hospitals. The purpose of this study was to evaluate the occurrence and environmental behavior of fourteen human PPCPs in surface waters of Mankyung River in South Korea. We were conducted to field survey for water quality and PPCPs analysis at November, 2006. PPCPs were analyzed by liquid chromatograph coupled with a tandem mass spectrometer (HPLC-MS/MS). The concentration of COD was measured to be 2.37$\sim$19.71 mg/L, which was belong to 4$\sim$5 grade in water quality criteria of lake. Station 2 that there is no pollution in upper stream, was appeared to lower concentration. The concentration of TN and TP, that is cause matter of eutrophication, were found to be 7.78$\sim$35.42 mg/L and 0.08$\sim$0.95 mg/L, respectively, which were exceeding 5 grade in Lake water quality criteria. The 11 kind of PPCPs compounds except levofloxacin and triclosan were detected to Mankyung river. PPCPs concentrations of STP(Sewer Treatment Plant) effluents and aquatic environment in Mankyung river have been detected in the range from dozens of ng/L to hundreds of ${\mu}g/L$ that by order of atenolol, carbamazepine, propranolol, Ibuprofen, erythromycin, ifenprodil, clarithromycin, mefenamic acid, fluconazole, indomethacin, disopyramide. PPCPs concentration of Station 1 and 5, which was influenced by Jeonju STP and Wanju STP, was detected high values. Station 2 that there is no pollution, showed lower values. Station 3 which joined Gosan stream and Jeonju stream and station 4 which influenced by stock wastewater was detected to low values.
연안역의 환경을 오염이란 관점에서 가장 객관적이고 효율적인 평가 방법을 선정하기 위하여 인천연안역을 대상으로 저서동물군집을 이용한 환경평가 방법인 종-개체수-생물량곡선 (SAB), 순위-빈도 곡선 (RFD), 개체수-생물량 비교법 (ABC), 대수-정규 분포 곡선 (LND), 내서 동물 식성지수를 응용한 저서 오염 지수 (BPI)에 적용하여 환경평가를 실시하였다. 그래프를 이용한 평가방법은 환경상태를 한 눈에 파악 할 수 있는 장점이 있지만, 충분한 생물자료가 요구되기 때문에 지역적으로 또는 세부적으로 비교${\cdot}$분석될 수 없는 단점이 있었다. 반면 저서오염지수에 의하면 정점간의 비교가 가능하였으며, 집괴분석의 결과에서 얻을 수 없는 출현종의 기능적인 면을 고려하여 오염의 정도나 경로까지 추적할 수 있었다. 여러 환경평가방법을 적용한 결과를 종합해 볼 때, 인천연안역은 외해역 보다는 영종도 북동쪽 해역이 다소 오염의 영향을 받고 있었으며, 특히 인천항이 오염의 영향을 크게 받고 있는 것으로 나타났다.
북서 지중해 Fos 해역에서의 해양 오염이 해양 저서 생들에 미치는 영향을 조사하기 위하여 Fos 지역의 해저에 발달하고 있는 저서생물군집 Coralligenous Community의 공간분포를 군집생태학적 측면에서 분석하였다. Fos 임해공업단지의 영향하에 있는 3개의 정점을 환경구배에 따라 설정하고(Arnette, Laurons, Auguette)마르세이유 동남쪽 Riou섬 서편 Moyade에 한 개의 대조정점을 택하여 분석한 결과 오염이 심한, Fos 해역의 내만으로 들어갈수록 출현종의 수나 개체수가 감소하는 현상을 관찰할 수 있었다. 또한 종의 다양도, numerical abundance, 다양성 지수 등의 생태학적 제 지수도 오염의 진전에 따라 함께 감소하고 있다. 특히 Fos 해역 가장 안 쪽에 위치하고 있는 Auguette 정점은 인근 대단위 Fos 공업단지의 산업폐수는 물론 도시의 생활하수로부터 심각할 정도로 영향을 받고 있음이 밝혀졌다. 이렇게 선업 폐수와 도시 하수가 복합적으로 작용하여 해양 저서생물에 미치는 영향을 Community Composition, Coralligenous Community 특유의 기능적 측면, 생태군별에 의한 분석 등을 통하여 조사하였다. 기타 Fourfold Point Correlation Coefficient와 Jaccard's Community Coefficient를 이용하여 정점간의 종류사도를 비교 검토하였으며 Coralligenous Community의 하부동물상과의 관계도 아울러 고찰하였다.
Analysis of benthic macroinvertebrate community and biological estimation of water quality by the benthic macroinvertebrates were conducted at Olympic Park at its nearby waters in Seoul from December, 2004 to September, 2005. The benthic macrovertebrates were 49 species. Among them, 39 species of aquatic insects were included 11 species in odonata, 9 species in diptera, 7 species in hemiptera, 6 species in coleoptera, 3 species in ephemeroptera, 2 species in trichoptera and 1 species in lepipdoptera, and 10 species of non-insects were 6 species in mollusca, 2 species in hirudinea and 2 species in oligochaeta. Species number of lakes, Seongnae Stream within and outside the Olympic Park was 25 species, 35 species and 33 species, respectively. Individual number of lakes, Seongnae Stream within and outside the Olympic Park was $131\;inds/2.5m^2\;239\;inds/2.5m^2\;556\;inds/2.5m^2$, respectively. Mean dominance indices of lakes, Seongnae Stream within and outside the Olympic Park was 0.74, 0.61 and 0.72, respectively. According to the saprobic system based on the ESB index(Ecological score of benthic macroinvertebrate community), all survey sites are $\beta-mesosaprobic$ waters. To increase of abundance of benthic macroinvertebrates, regular interval monitoring has to be enforced and standard of water quality for the ecological ponds of Olympic Park has to be prepared.
As a part of research to elucidate the pathogenesis of so called Soft Tunic Syndrome(STS), that caused mass mortalities in the cultured sea squirts, Halocynthia roretzi, the epidemiological and pathological analysis were done to both clinically normal and diseased groups of the farms of Tongyoung and Geoje coastal areas in southeast sea from February to July, 2008. In the histological finding of the tunic, most of individuals showed tunic softness syndromes that included the disarrangement and destruction of tunic fiber with the simultaneous presence of flagellates-like cells, recently suspected as main agents of tunic softness syndromes. Simultaneously, the intensive degenerative changes of the skeletal muscle of diseased sea squirts were recognized. The changes were characterized with the hyalinization and condensation of muscle fibril and hemocytic infiltration in the muscle fibers. Those were thought to be a kind of typical Zenker's necrosis as in the skeletal muscle of higher vertebrates. Besides of the diseased sea squirts, Zenker's necrosis of skeletal muscles were seen in the normal ones. Epidemiological inquiry for diseased groups revealed that the higher incidences of tunic softness syndrome were recorded in the fast growing groups and in the sites presuming the organic pollution. And Higher malondialadehyde(MDA) and glutathione peroxidase(GPx) activity were detected in the groups showing STS. Those results suggested that Zenker's necrosis of body muscles was a kind of"nutritional myopathy" by oxidative stress. Conclusively, it was considered that Zenker's necrosis of body muscles gives an important clue for elucidating pathogenesis of STS of cultured squirts. And it seems that the necrosis were caused by the oxidative stress to body muscle during abnormal rapid growth of sea squirts.
Global climate change, followed by an increase in anthropogenic activities in aquatic ecosystems, and species invasions, has resulted in a decline in aquatic organism biodiversity. The Batanghari River, Sumatra's longest river, is polluted by mercury-containing illegal gold mining waste (PETI), industrial pollution, and domestic waste. Several studies have provided evidence suggesting a decline in fish biodiversity within the Batanghari River. However, a comprehensive evaluation of the present status of biodiversity in this river is currently lacking. The species under investigation were identified through various molecular-based identification methods, as well as morphological identification, which involved the use of neighbor-joining (NJ) trees. All collected specimens were initially identified using morphological techniques and subsequently confirmed with molecular barcoding analysis. Morphological and DNA barcoding identification categorized all specimens (1,692) into 36 species, 30 genera and 16 families, representing five orders. A total of 36 DNA barcodes were generated from 30 genera using a 650-bp-long fragment of the mitochondrial cytochrome oxidase subunit I (COI) gene. Based on the Kimura two-parameter model (K2P), The minimum and maximum genetic divergences based on K2P distance were 0.003 and 0.331, respectively, and the average genetic divergence within genera, families, and orders was 0.05, 0.12, 0.16 respectively. In addition, the average interspecific distance was approximately 2.17 times higher than the mean intraspecific distance. Our results showed that the COI barcode enabled accurate fish species identification in the Batanghari River. Furthermore, the present work will establish a comprehensive DNA barcode library for freshwater fishes along Batanghari River and be significantly useful in future efforts to monitor, conserve, and manage fisheries in Indonesia.
Surface sediment samples from 31 stations in Jinhae Bay were analyzed to evaluate the pollution by sewage from the spatial distribution of the fecal sterol, coprostanol. The sums of eight sterols (coprostanol, epicholestanol, epicoprostanol, cholesterol, cholestanol, brassicasterol, stigmasterol and $\beta$-sitosterol) were in the range of $2,703-27,154{\cal}ng/{\cal}g$ dry weight. The concentrations of the coprostanol in the sediments, which is a good tracer of sewage-derived organic contamination, were in the range of $76-3,964{\cal}ng/{\cal}g$ dry weight. The levels of coprostanol were much higher (almost one order of magnitude) at stations close to the big cities such as Masan and Jinhae. However, those levels were comparable to or lower than those previously reported in other foreign locations. Some ratios of coprostanol to other sterols and multivariate analysis could provide us with the information on the origin of the sterols being from sewage, plankton, and/or benthos. Those showed sewage dominance at the stations near the cities Masan and Jinhae, plankton dominance at the center of Jinhae Bay and mainly marine fauna origin at the mouth of Jinhae Bay. These results suggest that the contents of sterols and some ratios of these components are quite powerful tracer for the detection of the origin of the organic contaminants in the coastal environments.
To understand the geochemical characteristics of intertidal sediment in a semi-enclosed bay, we measured various geochemical parameters, including grain size, ignition loss (IL), chemical oxygen demand (COD), acid volatile sulfide (AVS), and trace metals (Al, Fe, Cu, Pb, Zn, Cd, Hg, and As), in intertidal sediment from three bays (Deukryang Bay, Yeoja Bay, and Gamak Bay) in the southern region of Jeollanam Province. The intertidal sediment in Deukryang Bay consisted of various sedimentary types, such as sand, gravelly muddy sand, mud, and silt, whereas the intertidal sediments in Yeoja and Gamak Bays were composed mainly of mud. The concentrations of IL, COD, AVS and trace metals in the intertidal sediments of the three study regions were relatively high near areas affected by input of stream waters and/or shellfish farming waste. The concentrations of organic matter and trace metals in Gamak Bay were much higher than those in Deukryang and Yeoja Bays, which appears to be due to the influence of anthropogenic pollutants, originating from the city and the industrial complex near Gamak Bay. The evaluation results of organic matter and metal pollution using the sediment quality guidelines showed that the intertidal sediments in the three study regions were not polluted in terms of organic matter and trace metals. In future, sustainable management for sources of organic matter and trace metal is necessary to conserve a healthy benthic ecosystem in intertidal sediments.
This study evaluated the effect of the inland pollution sources on the bacteriological water quality in Narodo area after rainfall events. Following 16 mm of rainfall, the water discharged from Dohwa Stream and contaminants from Balpo village had a very limited effect on bacteriological water quality in adjacent area and the affected area did not extend to the designated area. In comparion, after 33 mm of rainfall, the density of fecal coliforms at stations located in the mouth of Dohwa stream and the discharg point of contamination sources located in Balpo village were lower than after 16 mm of rainfall. These results were obtained during an extreme high tide near the coast the contaminants discharged from Dohwa stream and Balpo village. Therefore, it is necessary to conduct a detailed survey to examine the dffects of tides on the diffusion characteristics of the contaminants discharged from Dohwa stream and Balpo village in order to manage of Narodo area efficiently.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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