• 식물병연구
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• 제13권3호
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• pp.145-151
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• 2007

Xanthomonas axonopodis pv. glycines에 의해 발병되는 콩 불마름병은 한국에서 콩에 가장 많이 발생하는 중요한 세균성 병해 중 하나이다. 본 연구에서는 Xanthomonas axonopodis pv. glycines를 종자에서 검출하기 위해 PCR기법을 이용하였으며, 한국의 36개 주요 콩 품종의 종자 오염을 조사하였다. 그리고 병원균 검출과 동정을 위한 PCR assay와 dilution plating assay를 비교하였다. PCR assay를 이용하여 인공접종에 의한 이병종자와 자연감염된 이병종자로부터 병원균 검출을 확인하였다. PCR assay를 통한 이런 결과는 dilution plating assay와 비슷한 결과를 보여 주었으며 종자에서 병원균을 검출하는 다른 전통적인 방법보다 더 효과적인 방법으로 증명되었다. 36개 주요 콩 품종의 X. axonopodis pv. glycines에 의한 종자 전염을 확인한 결과 풍산나물콩, 만리콩, 태광콩, 대망콩, 아주까리콩에서 병원균이 검출되었다. 그러므로 PCR assay는 콩 종자에서 신속하고, 민감하게 X. axonopodis pv. glycines 특이적으로 검출할 수 있는 효과적인 방법으로 활용될 수 있을 것이다.

• The Plant Pathology Journal
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• 제22권4호
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• pp.314-317
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• 2006

A phage technique for detection of Xanthomonas axonopodis pv. citri, a causal bacterium of canker on Sastuma mandarin fruits was developed. Phage and ELISA techniques were compared for their sensitivity for detection of Xanthomonas axonopodis pv. citri on orange fruits. Both of techniques revealed a similar efficiency for the bacterial detection; the pathogenic bacteria were observed in pellet from the fruits with over one canker spot with below 2 mm in diameter. In field assays, the increase of phage population(120%) on surface of the fruits related to the disease development one month later indicated that the bacterial pathogens inhabit on the surface. The procedure will be effectively used for detection of only living bacterial pathogen on fruit surfaces of Satsuma mandarin and for the disease forecasting.

• 식물병연구
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• 제12권2호
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• pp.129-133
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• 2006

2003년 수원의 팥 재배 포장에서 새로운 병해가 발견되었다. 처음에는 잎에서 수침상 점무늬가 형성되고 점점 커져 주위로 노란색의 테두리를 형성하는 진갈색의 반점을 형성한다. 심해지면 잎이 떨어지고 잎자루 및 꼬투리에도 진갈색의 병반이 형성된다. YDC 배지에서 병원세 균을 순수 분리하였을 때 Xanthomonas속 세균의 전형적인 특징인 노란색 색소를 띤 세균이 형성되었다. 분리된 세균을 $10^8 cfu/ml$로 현탁한 후 3 주 동안 자란 팥과 콩에 분무 접종하여 병원성을 확인하였다. 지방산 조성 및 함량과 다양한 탄소원 이용정도를 이용하여 분리세균 SL4311은 X. axonopodis pv. phaseoli로 SL4309와 SL4310 은 X. axonopodis pv. phaseoli var. fuscans로 동정하였으며 이 병을 팥의 세균성잎마름병으로 명명하였다.

• The Plant Pathology Journal
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• 제17권6호
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• pp.336-341
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• 2001

The distribution of citrusphages and phage types of Xanthomonas axonopodis pv. citri was investigated in Korea. Forty-eight strains of the bacterial pathogen and 28 bacteriophage strains were isolated from citrus leaves showing the citrus canker symptom. Only a single bacteriophage group, named CPK, was identified based on their aggressiveness to the bacterial pathogen. The bacterial strains were differentiated into two Iysotypes based on their sensitivity to CPK. Lysotype I, which was sensitive to CPK, was more predominant (96%), while only 4% belonged to Iysotype II, which was resistant to CPK. Among the 13 xanthomonads including Iysotype A and Iysotype B of X axonopodis pv. citri, CPKs were only aggressive to BC 83 (=Xc 62) strain of X. axonopodis pv, citri reported as Iysotype A. Thus, bacterial pathogens and citrusphages related to citrus plants mainly distributed in Korea were presumed as Iysotype A of X. axonopodis pv, citri, and Iysotype A-infecting CP$_1$ respectively.

• 미생물학회지
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• 제46권4호
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• pp.359-365
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• 2010

조릿대 근권토양으로부터 분리한 방선균 50균주를 대상으로 고추 세균성 점무늬병원균(Xanthomonas axonopodis pv. vesicatoria)의 항균활성 12균주를 선발하였다. 이들 항균활성 12균주의 계통학적 위치를 검토한 결과, 모두 Streptomyces 속의 Cluster II에 속하는 특징을 나타내었다. JR-24 균주는 최소저해 농도(MIC) 10 ${\mu}l$/disc를 나타내었으며, 배양액 5 ${\mu}l$/ml를 처리 하여 12시간 배양한 결과 Xanthomonas axonopodis pv. vesicatoria에 강한 생육저해효과를 나타내어 최우수 균주로 선발되었다. 항균활성 균주 JR-24의 16S rRNA 유전자 염기서열을 검토한 결과, Streptomyces galbus $DSM40089^T$ (X79852)와 98.1%, Streptomyces longwoodensis $LMG20096^T$ (AJ781356)와 98% 그리고 Streptomyces capoamus $JCM4734^T$ (AB045877)와 97.8%의 상동성을 나타내었다. API 20NE와 API 50CHE를 이용하여 JR-24 균주의 생리 생화학적 특성을 확인한 결과, L-arabinose, D-fructose, D-glucose, D-galactose을 이용하며 gelatin, protein, starch에 대하여 분해능이 있는 것으로 확인되었다. 주요지방산으로는 iso-$C_{14:0}$ (25.93%), iso-$C_{15:0}$ (10.13%), anteiso-$C_{15:0}$ (19.29%) 그리고 iso-$C_{16:0}$ (20.35%) 등을 함유하였으며, 퀴논종은 MK-9 ($H_4$) 4.37%, MK-9 ($H_6$) 51.22% 그리고 MK-9 ($H_8$) 49.47%로 동정되었다. Streptomyces sp. JR-24 균주의 계통학적 특성을 근연종인 Streptomyces galbus $DSM40089^T$와 비교한 결과, 다수의 표현형적 및 계통학적 차이를 나타내었다. 본 연구에서 분리된 Streptomyces sp. JR-24는 친환경 미생물제제 개발을 위한 유전자원 확보에 있어서 매우 큰의의가 있을 것으로 사료 된다.

• 식물병연구
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• 제18권2호
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• pp.129-132
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• 2012

Citrus bacterial canker is an economically important disease affecting citrus production in many citrusgrowing areas and several pathotypes have been recognized within the Xanthomonas pathogens causing canker. In view of the containment of the disease, accurate identification of the causal bacterium is important. In this study, triplex PCR method was developed by using the previously reported primers. Two groups of primer combination, such as, one group including primers 2/3, J-pth1/J-pth2 and XACF/XACR, and another group 2/3, J-pth1/J-pth2 and Xac01/Xac02, were suitable for the detection and differentiation of X. a. pv. citri $A^w$, X. a. pv. aurantifolii B and C, and X. a. pv. citrumelo E strains. Moreover, the primer combination of Xac01 and J-pth2 promised us to use as a specific primer set to detect X. a. pv. citrumelo E strain. The PCR methods developed in this study could be used for the rapid differentiation of Xanthomonas pathotypes of citrus.

• Journal of Applied Biological Chemistry
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• 제44권4호
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• pp.173-176
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• 2001

This report concerns the role of indole-3-acetic acid (IAA) in bacterial pustule disease of soybean. Pustule production in soybean leaves caused by Xanthomonas axonopodis pv. glycines was accompanied by a drastic increase in IAA content of host tissues. The phytopathogenic bacterium synthesized IAA in a tryptophan concentration-dependent manner when grown in a defined minimal medium. In complex media, however, the pathogen showed no response to tryptophan feeding, implying that the bacterial biosynthetic machinery of IAA is strictly regulated by nutrient availability of its growth environments. The results may suggest that IAA of bacterial origin and tryptophan of plant origin be involved in the process of pustule symptom development in soybean.

• The Plant Pathology Journal
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• 제19권4호
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• pp.205-209
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• 2003

Dispersal of citrus bacterial canker caused by Xanthomonas axonopodis pv. citri on Unshiu orange was investigated in naturally infested nursery plot at Seogwipo in Jeju island, Korea. Based on phage detection, over 2% of the bacterial pathogen over-wintered in canker lesions and started to multiply in late May. However, symptoms were first observed 1 month after the phage detection. The disease dispersed non-directionally to nearby plants possibly because of indirect dissemination of the bacterium by rain splashes. The disease increased from late June to late August and decreased thereafter. Population of phage increased constantly, however, disease occurrence somewhat fluctuated due to environmental factors. Disease incidence and severity were correlated with rainfall with wind that occurred 14-32 days earlier from late May to late August.

• The Plant Pathology Journal
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• 제24권4호
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• pp.423-432
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• 2008

The difference of carbon source utilization and fatty acid composition between the pathotypes of Xanthomonas strains, which causing citrus bacterial canker was compared, and the physiochemical characteristics were used to analyze relationship of the strains for the first time. The pattern of several carbon sources utilization and fatty acids composition reliably discriminated the pathotypes of Xanthomonas strains. The dendrogram which was constructed by 95 carbon source utilization profiles differentiated X. axonopodis pv. citri A, $A^*$ and $A^w$ from the other pathotypes. When the dendrogram was drawn by combined analysis of carbon source utilization pattern and fatty acid composition, X. axonopodis pv. aurantifolii B, C and X. axonopodis pv. citrumelo formed a distinct cluster. The difference of carbon source utilization and fatty acid composition could be used effectively for the identification of pathotypes of citrus bacterial canker. The physiochemical characteristics strongly indicated that the strains isolated in Korea belong to X. axonopodis pv. citri A type. The cluster analysis by the band patterns of ERIC-, BOX- and REP-PCR allowed the discrimination of the pathotypes isolated from Korea. However, the rep-PCRs could not differentiate X. axonopodis pv. citri A types from $A^*$ and $A^w$ types. The overall results of metabolic profiles and rep-PCRs strongly indicated that the Korean isolates are X. axonopodis pv. citri A type.

• 식물병연구
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• 제15권2호
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• pp.83-87
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• 2009

콩 불마름병을 일으키는 Xanthomonas axonopodis pv. glycines를 종자에서 DNA 추출없이 바로 검출하는 방법에 대하여 연구하였다. 콩 종자에서 X. axonopodis pv. glycines를 특이적으로 검출하기 위해 특이적인 유전자로 알려져 있는 glycinecin A로부터 증폭 size가 401 bp인 primer Xag F1 & Xag R1을 고안하였다. Xag Fl과 Xag R1 primer는 콩 종자와 잎에서 분리한 균주와 KACC에서 분양받은 X. axonopoids pv. glycines 균주를 증폭시켰으나 근연종인 X. axonopodis pv. citri, X. axonopodis pv. vesicatoria 등은 증폭되지 않았다. 콩 종자에 존재하는 것으로 알려진 다른 세균들 역시 증폭되지 않았다. 고안된 Xag F1 & Xag R1 primer를 이용한 X. axonopodis pv. glycines의 검출 한계 농도 측정은 genomic DNA와 세포 현탁액을 이용하였다. X. axonopodis pv. glycines의 genomic DNA는 200 fg까지 증폭이 되었으며, 세포현탁액은 $OD_{600nm}$ 0.1로 농도를 조정한 뒤, $10^{-8}$까지 희석하여 측정한 결과 $10^{-6}$인 $1.8{\times}10^3$ cfu/ml까지 증폭이 확인되었다. 자연 감염된 종자에서 병원균을 검출하기 위해 종자를 육안상 건전종자와 불건전한 종자(변색립, 피해립)로 구분하여 direct PCR 방법으로 실험 한 결과 육안상 건전종자에서는 병원균이 검출되지 않았으나 불건전한 종자에서는 병원균의 검출이 확인되었다. 또한 진탕 배양 시간에 따른 병원균의 검출여부를 조사한 결과 진탕 배양 2시간부터 병원균의 검출이 확인되었으며 시간이 지날수록 증폭 밴드가 더욱 선명해 지는 것을 확인할 수 있었다. 그러므로 고안된 Xag Fl & Xag R1 primer를 이용한 direct PCR 방법은 다른 많은 미생물들로 오염되어진 콩종자에 있는 X. axonopodis pv. glycines를 신속하고 민감하게 검정할 수 있는 효과적인 방법으로 활용될 수 있을 것이다.