Biological sequences such as DNA and amino acid sequences typically contain a large number of items. They have contiguous sequences that ordinarily consist of more than hundreds of frequent items. In biological sequences analysis(BSA), a frequent contiguous sequence search is one of the most important operations. Many studies have been done for mining sequential patterns efficiently. Most of the existing methods for mining sequential patterns are based on the Apriori algorithm. In particular, the prefixSpan algorithm is one of the most efficient sequential pattern mining schemes based on the Apriori algorithm. However, since the algorithm expands the sequential patterns from frequent patterns with length-1, it is not suitable for biological datasets with long frequent contiguous sequences. In recent years, the MacosVSpan algorithm was proposed based on the idea of the prefixSpan algorithm to significantly reduce its recursive process. However, the algorithm is still inefficient for mining frequent contiguous sequences from long biological data sequences. In this paper, we propose an efficient method to mine maximal frequent contiguous sequences in large biological data sequences by constructing the spanning tree with a fixed length. To verify the superiority of the proposed method, we perform experiments in various environments. The experiments show that the proposed method is much more efficient than MacosVSpan in terms of retrieval performance.
Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
/
2006.10b
/
pp.278-283
/
2006
결정 트리는 큰 가설 공간을 가지고 있어 유연하고 강인한 성능을 지닐 수 있다. 하지만 결정트리가 학습 데이터에 지나치게 적응되는 경향이 있다. 학습데이터에 과도하게 적응되는 경향을 없애기 위해 몇몇 가지치기 알고리즘이 개발되었다. 하지만, 데이터가 속성 축에 평행하지 않아서 오는 공간 낭비의 문제는 이러한 방법으로 해결할 수 없다. 따라서 본 논문에서는 다변수 노드를 사용한 선형 분류기를 이용하여 이러한 문제점을 해결하는 방법을 제시하였으며, 결정트리의 성능을 높이고자 지지 벡터 머신을 도입하였다(SVMDT). 본 논문에서 제시한 알고리즘은 세 가지 부분으로 이루어졌다. 첫째로, 각 노드에서 사용할 속성을 선택하는 부분과 둘째로, ID3를 이 목적에 맞게 바꾼 알고리즘과 마지막으로 기본적인 형태의 가지치기 알고리즘을 개발하였다. UCI 데이터 셋을 이용하여 OC1, C4.5, SVM과 비교한 결과, SVMDT는 개선된 결과를 보였다.
Kim, Jin-Ho;Park, In-Sik;Kim, Bong-Ok;Yang, Yoon-Seok;Won, Yong-Gwan;Kim, Jung-Ja
Journal of the Institute of Electronics Engineers of Korea CI
/
v.48
no.2
/
pp.28-37
/
2011
With growing concerns about healthy life recently, although the podiatry which deals with the whole area for diagnosis, treatment of foot and leg, and prevention has been widely interested, research in our country is not active. Also, because most of the previous researches in data analysis performed the quantitative approaches, the reasonable level of reliability for clinical application could not be guaranteed. Clinical data mining utilizes various data mining analysis methods for clinical data, which provides decision support for expert's diagnosis and treatment for the patients. Because the decision tree can provide good explanation and description for the analysis procedure and is easy to interpret the results, it is simple to apply for clinical problems. This study investigate rules of item of diagnosis in disease types for adapting decision tree after collecting diagnosed data patients who are 2620 feet of 1310(males:633, females:677) in shoes clinic (department of rehabilitation medicine, Chungnam National University Hospital). and we classified 15 foot diseases followed factor of 22 foot diseases, which investigated diagnosis of 64 rules. Also, we analyzed and compared correlation relationship of characteristic of disease and factor in types through made decision tree from 5 class types(infants, child, adolescent, adult, total). Investigated results can be used qualitative and useful knowledge for clinical expert`s, also can be used tool for taking effective and accurate diagnosis.
Journal of The Korean Association of Information Education
/
v.17
no.4
/
pp.433-447
/
2013
The purpose of this study is to find out the factors of the students' achievement on the computer training courses which are based on computer practice. In order to improve the academic achievement of the students, it is necessary to analyze the factors affecting academic achievement and apply the results of the analysis to education. In particular, it is necessary to study for finding out factors of the academic achievement in practical computer training courses, because these courses are different from other courses focusing on the theory. In this study, in order to find out the factors, the logistic regression analysis and the decision tree analysis which is the field of data mining were peformed. For the experimental data, the test results of the MOS certification of the S university in seoul were used. Through logistic regression analysis it is found that the factors of the professors, class size, lecture time, group(lecture period) are important in order. Through decision tree analysis of data mining, it is found that there are some additional factors ; entrance year, whether the course is retaken, and the classroom environment. and these various factors effect the academic achievement compositively as identified through the model tree. The tree model was presented as a result of the analysis, and the importance of the factors is expressed numerically from multiple tree models by using the proposed mathematical formula.
Algorithms for mining association rules based on the Apriori algorithm use the hash tree data structure for storing and counting supports of the candidate frequent itemsets and the most part of the execution time is consumed for searching in the hash tree. The DHP(Direct Hashing and Pruning) algorithm makes efforts to reduce the number of the candidate frequent itemsets to save searching time in the hash tree. For this purpose, the DHP algorithm does preparative simple counting supports of the candidate frequent itemsets. At this time, the DHP algorithm uses the direct hash table to reduce the overhead of the preparative counting supports. This paper proposes and evaluates an efficient hashing mechanism for the direct hash table $H_2$ which is for pruning in phase 2 and the hash tree $C_k$, which is for counting supports of the candidate frequent itemsets in all phases. The results showed that the performance improvement due to the proposed hashing mechanism was 82.2% on the maximum and 18.5% on the average compared to the conventional method using a simple mod operation.
Due to the characteristics of a data stream, it is very important to confine the memory usage of a data mining process regardless of the amount of information generated in the data stream. For this purpose, this paper proposes the Prime pattern tree(PPT) for finding frequent itemsets over data streams with using the confined memory space. Unlike a prefix tree, a node of a PPT can maintain the information necessary to estimate the current supports of several itemsets together. The length of items in a prime pattern can be reduced the total number of nodes and controlled by split_delta $S_{\delta}$. The size and the accuracy of the PPT is determined by $S_{\delta}$. The accuracy is better as the value of $S_{\delta}$ is smaller since the value of $S_{\delta}$ is large, many itemsets are estimated their frequencies. So it is important to consider trade-off between the size of a PPT and the accuracy of the mining result. Based on this characteristic, the size and the accuracy of the PPT can be flexibly controlled by merging or splitting nodes in a mining process. For finding all frequent itemsets over the data stream, this paper proposes a PPT to replace the role of a prefix tree in the estDec method which was proposed as a previous work. It is efficient to optimize the memory usage for finding frequent itemsets over a data stream in confined memory space. Finally, the performance of the proposed method is analyzed by a series of experiments to identify its various characteristics.
As the amount of electronic documents increases explosively, automatic text categorization methods are needed to identify those of interest. Most methods use machine learning techniques based on a word set. This paper introduces a new method, called FPTC (FP-Tree based Text Classifier). FP-Tree is a data structure used in data-mining. In this paper, a method of storing text sentence patterns in the FP-Tree structure and classifying text using the patterns is presented. In the experiments conducted, we use our algorithm with a #Mutual Information and Entropy# approach to improve performance. We also present an analysis of the algorithm via an ordinary differential categorization method.
Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
/
2002.04b
/
pp.100-102
/
2002
데이터 마이닝의 대표적인 기법인 연관규칙 마이닝을 위한 다양만 알고리즘들이 제안되었고, 각 알고리즘에 따른 대용량 데이터에 대한 신속한 탐색을 위한 독특한 자료구조가 제안되었다 각 자료구조의 특성에 따른 알고리즘 성능은 데이터의 패턴에 크게 의존한다. 본 논문에서는 Concept을 형성하는 세가지 대표적인 자료구조인 Hash Tree, Lattice. FP-Tree에 대해 비교 분석해보고, 데이터 패턴에 적합한 효율적인 알고리즘의 설계 위한 framework을 제안한다.
Park, No-Suk;Kim, Soonho;Lee, Young Joo;Yoon, Sukmin
Journal of Korean Society of Environmental Engineers
/
v.38
no.2
/
pp.87-95
/
2016
Turbidity is a key indicator to the user that the 'Discolored Water' phenomenon known to be caused by corrosion of the pipeline in the water supply system. 'Discolored Water' is defined as a state with a turbidity of the degree to which the user visually be able to recognize water. Therefore, this study used data mining techniques in order to estimate turbidity changes in water supply system. Decision tree analysis was applied in data mining techniques to develop estimation models for turbidity changes in the water supply system. The pH and residual chlorine dataset was used as variables of the turbidity estimation model. As a result, the case of applying both variables(pH and residual chlorine) were shown more reasonable estimation results than models only using each variable. However, the estimation model developed in this study were shown to have underestimated predictions for the peak observed values. To overcome this disadvantage, a high-pass filter method was introduced as a pretreatment of estimation model. Modified model using high-pass filter method showed more exactly predictions for the peak observed values as well as improved prediction performance than the conventional model.
Objective: With the background of aging population in China and advances in clinical medicine, the amount of operations on old patients increases correspondingly, which imposes increasing challenges to critical care medicine and geriatrics. The study was designed to describe information on the length of ICU stay from a single institution experience of old critically ill gastric cancer patients after surgery and the framework of incorporating data-mining techniques into the prediction. Methods: A retrospective design was adopted to collect the consecutive data about patients aged 60 or over with a gastric cancer diagnosis after surgery in an adult intensive care unit in a medical university hospital in Shenyang, China, from January 2010 to March 2011. Characteristics of patients and the length their ICU stay were gathered for analysis by univariate and multivariate Cox regression to examine the relationship with potential candidate factors. A regression tree was constructed to predict the length of ICU stay and explore the important indicators. Results: Multivariate Cox analysis found that shock and nutrition support need were statistically significant risk factors for prolonged length of ICU stay. Altogether, eight variables entered the regression model, including age, APACHE II score, SOFA score, shock, respiratory system dysfunction, circulation system dysfunction, diabetes and nutrition support need. The regression tree indicated comorbidity of two or more kinds of shock as the most important factor for prolonged length of ICU stay in the studied sample. Conclusions: Comorbidity of two or more kinds of shock is the most important factor of length of ICU stay in the studied sample. Since there are differences of ICU patient characteristics between wards and hospitals, consideration of the data-mining technique should be given by the intensivists as a length of ICU stay prediction tool.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.