• 제목/요약/키워드: T$_2$ map

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Linkage Disequilibrium and Effective Population Size in Hanwoo Korean Cattle

  • Lee, S.H.;Cho, Y.M.;Lim, D.;Kim, H.C.;Choi, B.H.;Park, H.S.;Kim, O.H.;Kim, S.;Kim, T.H.;Yoon, D.;Hong, S.K.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제24권12호
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    • pp.1660-1665
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    • 2011
  • This study presents a linkage disequilibrium (LD) analysis and effective population size ($N_e$) for the entire Hanwoo Korean cattle genome, which is the first LD map and effective population size estimate ever calculated for this breed. A panel of 4,525 markers was used in the final LD analysis. The pairwise $r^2$ statistic of SNPs up to 50 Mb apart across the genome was estimated. A mean value of $r^2$ = 0.23 was observed in pairwise distances of <25 kb and dropped to 0.1 at 40 to 60 kb, which is similar to the average intermarker distance used in this study. The proportion of SNPs in useful LD ($r^2{\geq}0.25$) was 20% for the distance of 10 and 20 kb between SNPs. Analyses of past effective population size estimates based on direct estimates of recombination rates from SNP data demonstrated that a decline in effective population size to $N_e$ = 98.1 occurred up to three generations ago.

난지도 매립지 일대의 지하수위 분포 추정을 위한 복합 크리깅의 응용 (Application of Cokriging for the Estimation of Groundwater Level Distribution at the Nanjido Waste Landfill Area)

  • 정상용;이강근
    • 대한지하수환경학회지
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    • 제2권2호
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    • pp.58-63
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    • 1995
  • 난지도 매립장의 기저침출수위 분포와 그 주변지역의 지하수위 분포를 추정하기 위해 복합크리깅을 이용하였다. 지하수위 분포는 지형의 변화와 밀접한 관련을 갖고 있어서 지형의 변화가 큰 지역에서 지하수위 분포를 추정할 때에는 지형의 표고 자료도 함께 사용하는 것이 더 좋은 결과를 만들어 낸다. 본 연구에서는 87개의 지하수위 자료와 144개의 표고자료에 대한 반베리오그램을 구하고, 그것의 적합한 모델을 교차타당성 조사에 의해 선정한 후 복합크리깅과 정규크리깅을 이용하여 지하수위 분포도 만들었다. 2개의 지하수위 등고선도를 비교해보면 지하수위 자료가 많이 확보된 매립장내에서는 큰 차이가 없으나, 지하수위 표본자료가 부족하고 지형의 변화가 큰 지역(등고선도의 좌상단 구역)과 지하수위 표본자료가 부족한 한강 인접지역에서 끈 차이를 보인다. 이 구역들에서 지형의 표고를 고려해볼 때,복합크리깅에 의한 지하수위 등고선도가 정규크리깅에 의한 지하수위 등고선보다 더 실제에 가까운 것으로 사료된다.

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Tree Height Estimation of Pinus densiflora and Pinus koraiensis in Korea with the Use of UAV-Acquired Imagery

  • Talkasen, Lynn J.;Kim, Myeong Jun;Kim, Dong Hyeon;Kim, Dong Geun;Lee, Kawn Hee
    • Journal of Forest and Environmental Science
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    • 제33권3호
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    • pp.187-196
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    • 2017
  • The use of unmanned aerial vehicles (UAV) for the estimation of tree height is gaining recognition. This study aims to assess the effectiveness of tree height estimation of Pinus densiflora Sieb. et Zucc. and Pinus koraiensis Sieb. et Zucc. using digital surface model (DSM) generated from UAV-acquired imageries. Images were taken with the $Trimble^{(R)}$ UX5 equipped with Sony ${\alpha}5100$. The generated DSM, together with the digital elevation model (DEM) generated from a digital map of the study areas, were used in the estimation of tree height. Field measurements were conducted in order to generate a regression model and carry out accuracy assessment. The obtained coefficients of determination (R2) and root mean square error (RMSE) for P. densiflora (R2=0.71; RMSE=1.00 m) and P. koraiensis (R2=0.64; RMSE=0.85 m) are comparable to the results of similar studies. The results of the paired two-tailed t-test show that the two tree height estimation methods are not significantly different (p-value=0.04 and 0.10, alpha level=0.01), which means that tree height estimation using UAV imagery could be used as an alternative to field measurement.

수열합성 공정을 이용한 금속 다공체의 나노 산화물 형성 (Formation of Nano-oxides on Porous Metallic Glass Compacts using Hydrothermal Synthesis)

  • 박혜진;김영석;홍성환;김정태;조재영;이원희;김기범
    • 한국분말재료학회지
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    • 제22권4호
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    • pp.229-233
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    • 2015
  • Porous metallic glass compact (PMGC) are developed by electro-discharge sintering (EDS) process of gas atomized $Zr_{41.2}Ti_{13.8}Cu_{12.5}Ni_{10}Be_{22.5}$ metallic glass powder under of 0.2 kJ generated by a $450{\mu}F$ capacitor being charged to 0.94 kV. Functional iron-oxides are formed and growth on the surface of PMGCs via hydrothermal synthesis. It is carried out at $150^{\circ}C$ for 48hr with distilled water of 100 mL containing Fe ions of 0.18 g/L. Consequently, two types of iron oxides with different morphology which are disc-shaped $Fe_2O_3$ and needle-shaped $Fe_3O_4$ are successfully formed on the surface of the PMGCs. This finding suggests that PMGC witih hydrothermal technique can be attractive for the practical technology as a new area of structural and functional materials. And they provide a promising road map for using the metallic glasses as a potential functional application.

레이다 간섭기법(SAR Interferometry)을 이용한 지형도 제작 (Topographic Mapping using SAR Interferometry Method)

  • 정도찬;김병국
    • 한국공간정보시스템학회:학술대회논문집
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    • 한국공간정보시스템학회 2000년도 학술회의 논문집 3권2호
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    • pp.67-76
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    • 2000
  • 위성영상을 이용하여 지형도를 제작하는 새로운 방법으로 레이다 간섭기법이 활발히 연구되고 있다. 레이다 간섭기법은 같은 지역에 대한 두 장의 SAR 영상을 이용하여 고도값을 추출하는 방법으로, 기존의 SPOT과 같은 광학영상에 비하여 날씨나 시간의 제약을 받지 않고 지형정보를 얻을 수 있다는 장점을 가지고 있다. 그러나 레이다 간섭기법을 이용하여 고도값을 추출하는 방법은 처리과정이 복잡하고 기복이 심한 지역에서의 수직위치 정확도가 떨어진다는 단점을 가지고 있다. 본 연구에서 ERS-1과 ERS-2의 tandem 모드 SAR 영상을 사용하여 수치표고모형을 작성한 후 14개의 지상기준점에 대한 수직위치 정확도를 분석한 결과 14.06m의 오차를 보였다. 그러나 항공탑재레이다 시스템의 영상을 사용하여 수치표고 모형을 제작하면 $2{\sim}5m$의 수직위치 정확도를 얻을 수 있으므로 1/10,000이나 1/25,000 축척 지형도의 수정, 갱신에 활용할 수 있으리라 기대된다.

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The proper concentrations of dextrose and lidocaine in regenerative injection therapy: in vitro study

  • Woo, Min Seok;Park, Jiyoung;Ok, Seong-Ho;Park, Miyeong;Sohn, Ju-Tae;Cho, Man Seok;Shin, Il-Woo;Kim, Yeon A
    • The Korean Journal of Pain
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    • 제34권1호
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    • pp.19-26
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    • 2021
  • Background: Prolotherapy is a proliferation therapy as an alternative medicine. A combination of dextrose solution and lidocaine is usually used in prolotherapy. The concentrations of dextrose and lidocaine used in the clinical field are very high (dextrose 10%-25%, lidocaine 0.075%-1%). Several studies show about 1% dextrose and more than 0.2% lidocaine induced cell death in various cell types. We investigated the effects of low concentrations of dextrose and lidocaine in fibroblasts and suggest the optimal range of concentrations of dextrose and lidocaine in prolotherapy. Methods: Various concentrations of dextrose and lidocaine were treated in NIH-3T3. Viability was examined with trypan blue exclusion assay and 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromide assay. Migration assay was performed for measuring the motile activity. Extracellular signal-regulated kinase (Erk) activation and protein expression of collagen I and α-smooth muscle actin (α-SMA) were determined with western blot analysis. Results: The cell viability was decreased in concentrations of more than 5% dextrose and 0.1% lidocaine. However, in the concentrations 1% dextrose (D1) and 0.01% lidocaine (L0.01), fibroblasts proliferated mildly. The ability of migration in fibroblast was increased in the D1, L0.01, and D1 + L0.01 groups sequentially. D1 and L0.01 increased Erk activation and the expression of collagen I and α-SMA and D1 + L0.01 further increased. The inhibition of Erk activation suppressed fibroblast proliferation and the synthesis of collagen I. Conclusions: D1, L0.01, and the combination of D1 and L0.01 induced fibroblast proliferation and increased collagen I synthesis via Erk activation.

중력, 자력 및 위성영상 자료를 이용한 의성소분지의 지질 및 지구조 연구 (Subsurface Geology and Geologic Structure of the Euiseong Basin using Gravity, Magnetic, and Satellite Image Data)

  • 유상훈;황종선;민경덕;우익
    • 자원환경지질
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    • 제38권2호
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    • pp.143-153
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    • 2005
  • 경상분지에 속하는 의성소분지는 백악기말 활발했던 화산활동의 결과로 형성되었으며, 밀양소분지와는 팔공산단층을 경계로, 영양소분지와는 안동단층을 경계로 구획된다. 본 연구에서는 화산암체와 심성암체의 복합체로 이루어진 의성지역에서 지구물리학적 연구를 수행하여 지표 및 지하 지질구조를 규명, 해석하고자 한다. 지표지질 양상을 파악하기 위하여 수행된 IRS 위성영상과 수치고도자료를 이용한 선구조와 선밀도 분석 결과, 선구조의 방향은 $N55^{\circ}\~65^{\circ}W$가 현저하게 우세하며, 연장성은 $N55^{\circ}\~65^{\circ}W$ 방향과 N-S 방향이 우세하게 나타났다. 지하 밀도 불연속면의 평균심도를 구하기 위하여 중력자료의 파워스펙트럼분석(Power spectrum analysis)을 시행한 결과, $4\~5{\cal}km$의 분지기반암의 심도와 $0.5\~0.6{\cal}km$의 천부지층경계면의 심도가 규명되었다. 파워스펙트럼 결과를 참고로 측선 A-A'와 B-B‘에서 2.5차원 모델링을 실시한 결과, 측선 A와 B에서 나타나는 특징적인 저이상은 지하지질구조 특성에 기인한 것으로 판단된다. 자력기반암의 경계를 파악하기 위한 자력자료의 Analytic signal 분석은 $0.001\~130nT/m$의 범위를 가지며, 높은 에너지를 보이는 부분은 팔공산 화강암체의 경계와 분지내의 칼데라 분포지역과 잘 일치한다.

동해의 Topex/Poseidon 고도계로부터 추정된 해면고도이상치의 수평구조와 변동성 (Variability and Horizontal Structure of Sea Surface Height Anomaly Estimated from Topex/poseidon Altimeter in the East (Japan) Sea)

  • 김응;노영재;김창식
    • 한국해양학회지:바다
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    • 제8권2호
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    • pp.94-110
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    • 2003
  • 본 연구는 Topex/Poseidon 고도계 자료(1992∼2000년, 286 cycles)를 사용하여 동해의 해면고도의 시공간적 변동 특성과 구조를 규명하였다. 분석을 위하여 객관적 적합보간법을 이용하여 격자구조의 해면이상치(SSHA)자료를 생성하였으며, 스펙트럼 분석과 경험직교함수 분석을 하였다. SSHA분포는 동해 극전선 해역을 중심으로 남쪽해역과 북쪽해역으로 구분이 되며, 남쪽해역은 쓰시마난류의 영향을 받아 SSHA의 변동폭이 크고, 북쪽해역은 상대적으로 작다. 동해에서의 시공간적 변동 특성은 5개의 경험직교함수로서 특징 지워지며 총분산의 85% 이상을 설명할 수 있었다 제 1모드는 동해의 전역의 SSHA의 계절 및 년간 변동을 지배하며 총분산의 72.3%로 우세하다. 제 2-5 모드들은 상대적으로 적은 분산을 설명하고 있으며(약 14%), 주로 쓰시마난류, 동한난류와 관련된 해류의 영향에 의한 연안해역의 변동과 극전선역의 사행과 관련된 변동 및 중규모 소용돌이와 관련된 변동으로 파악되었다. 유의한 스펙트럼을 보이는 주기는 0.5년 1년, 2.5년, 3.3년 등이었다.

경기도(京畿道) 광릉(光陵)의 활엽수림(闊葉樹林)과 침엽수림(針葉樹林) 유역(流域)의 유출량(流出量) 산정(算定)을 위한 준분포형(準分布型) 수문모형(水文模型)(TOPMODEL)의 적용(適用) (Application of The Semi-Distributed Hydrological Model(TOPMODEL) for Prediction of Discharge at the Deciduous and Coniferous Forest Catchments in Gwangneung, Gyeonggi-do, Republic of Korea)

  • 김경하;정용호;박재현
    • 한국산림과학회지
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    • 제90권2호
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    • pp.197-209
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    • 2001
  • 준분포형 수문모형인 TOPMODEL은 산림유역의 유출량, 주 유출경로 및 수질을 공간적으로 예측하는데 많이 적용된다. TOPMODEL은 물리모형이 아니라 일종의 개념모형이며 주요 구성요소는 지형지수와 토양의 수평전달계수로 각각 지표면과 지표하 유출의 기여면적을 계산하는데 이용된다. 본 연구는 우리나라의 소규모 산림유역에서 TOPMODEL의 적용성을 검증하기 위하여 수행되었다. 시험지는 1979년부터 임업연구원에서 운용하고 있으며 서울 근교 경기도 광릉시험림에 위치해 있다. 활엽수림 유역은 임령이 약 80년, 유역면적이 22.0ha이고, 침엽수림 유역은 임령이 약 22년, 유역면적이 13.6ha이다. 관측자료는 활엽수 유역의 경우 1995년 7월과 2000년 6월에 발생한 2개 강우-유출사상이고 침엽수 유역의 경우 1995년과 1999년 7월 그리고 2000년 8월의 3개 강우-유출사상을 이용하였다. 지형지수는 $10m{\times}10m$의 수치지형도를 만들어 계산하였다. 지형지수 분포는 활엽수림 유역의 경우 2.6에서 11.1, 침엽수림 유역은 2.7에서 16.0으로 나타났다. 모형의 예측 효율성을 목적함수로 최적화한 결과 모형매개변수(m)와 유역의 평균 포화수평전달계수($lnT_0$)가 높은 민감도를 나타내었다. 매개변수의 최적값은 활엽수림 유역의 경우 m값은 0.034와 0.038 그리고 $lnT_0$값은 8.672와 9.475였으며, 침엽수 유역의 경우 m값은 0.031, 0.032, 0.033 그리고 $lnT_0$값은 5.969, 7.129, 7.575였다 이들 값을 이용하여 모의한 결과 모형의 예측 효율성은 활엽수림 0.958과 0.909 그리고 침엽수림 0.825, 0.922와 0.961로서 비교적 높게 나타났다. 강우-유출량 관측치와 모의치를 이용하여 강우-수문곡선을 작성한 결과 두 유역 모두 유출지연시간은 잘 일치하였다. 일부 강우-유출사상의 경우 총유출량과 첨두유량의 관측치와 모의치 간에 다소 차이를 보였지만 TOPMODEL은 전반적으로 10% 이하의 오차범위에서 총유출량과 첨두유량을 예측할 수 있었다. 결론적으로 TOPMODEL은 우리나라의 미계측 산림유역에서 유출량을 산정하는데 유용한 수문모형이다.

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Detection of Mendelian and Parent-of-origin Quantitative Trait Loci for Meat Quality in a Cross between Korean Native Pig and Landrace

  • Choi, B.H.;Lee, Y.M.;Alam, M.;Lee, J.H.;Kim, T.H.;Kim, K.S.;Kim, J.J.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제24권12호
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    • pp.1644-1650
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    • 2011
  • This study was conducted to detect quantitative trait loci (QTL) affecting meat quality in an $F_2$ reference population of Korean native pig and Landrace crossbreds. The three-generation mapping population was generated with 411 progeny from 38 $F_2$ full-sib families, and 133 genetic markers were used to produce a sex-average map of the 17 autosomes. The data set was analyzed using least squares Mendelian and parent-of-origin interval-mapping models. Lack-of-fit tests between models were used to characterize the QTL for mode of gene expressions. A total of 10 (32) QTL were detected at the 5% genome (chromosome)-wise level for the analyzed traits. Of the 42 QTL detected, 13 QTL were classified as Mendelian, 10 as paternal, 14 as maternal, and 5 as partial expressed QTL, respectively. Among the QTL detected at 5% genome-wise level, four QTL had Mendelian mode of inheritance on SSCs 5, 10, 12, and 13 for cooking loss, drip loss, crude lipid and crude protein, respectively; two QTL maternal inheritance for pH at 24-h and shear force on SSC11; three QTL paternal inheritance for CIE b and Hunter b on SSC9 and for cooking loss on SSC15; and one QTL partial expression for crude ash on SSC13, respectively. Most of the Mendelian QTL (9 of 13) had a dominant mode of gene action, suggesting potential utilization of heterosis for genetic improvement of meat quality within the cross population via marker-assisted selection.