Lee Seong-Hun;Kang Sang-Ho;Park Yong-Hwan;Min Dong-Myung;Kim Young-Mi
Journal of Microbiology and Biotechnology
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v.16
no.2
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pp.205-211
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2006
A quantitative analytical method to detect new lines of genetically modified (GM) maize, NK603 and TC1507, has been developed by using a real-time polymerase chain reaction (PCR). To detect these GM lines, two specific primer pairs and probes were designed. A plasmid as a reference molecule was constructed from an endogenous DNA sequence of maize, a universal sequence of a cauliflower mosaic virus (CaMV) 35S promoter used in most GMOs, and each DNA sequence specific to the NK603 and TC1507 lines. For the validation of this method, the test samples of 0, 0.1, 0.5, 1.0, 3.0, 5.0, and 10.0% each of the NK603 and TC1507 GM maize were quantitated. At the 3.0% level, the biases (mean vs. true value) for the NK603 and TC1507 lines were 3.3% and 15.7%, respectively, and their relative standard deviations were 7.2% and 5.5%, respectively. These results indicate that the PCR method developed in this study can be used to quantitatively detect the NK603 and TC1507 lines of GM maize.
This study was performed to evaluate the prevalence rate of Toxoplasma gondii on 217 stray cats in Daejeon. The positive infection rate of T. gondii was 15.7% in enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), 12.4% in latex agglutination test (LAT), 14.7% in indirect immunofluorescent antibody test (IFA) and 0.5% in polymerase chain reaction (PCR) respectively. In districts, Yuseong-gu was shown the highest seropositive rate of T. gondii as 31.8% in ELISA, 22.7% in LAT and 31.8% in IFA. In gender, the seropositive rate of female cats was slightly higher than that of male cats as 17.2% in ELISA, 15.2% in LAT, 15.2% in IFA and 1.0% in PCR. Cats captured in National science museum, detached house and apartment was shown relatively high prevalence rate of T. gondii.
Influeza type A virus have been worldwide problematic in animals as well as in humans. In this study, the use of reverse-transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) was described for detecting influenza virus type A. The primer of RT-PCR was designed from an nonstructural (NS) gene of Influenza A virus. By RT-PCR, a product with the size of 189 bp was detected only when influenza virus type A was used as template. No products could be detected with Influenza virus type B as well as other respiratory pathogens. The detection limit of the RT-PCR was up to $10^{0.3}TCID_{50}$ which is comparable to the sensitivity of cell culture method. The RT-PCR could detect the influenza A virus from nasal turbinates of the ferrets infected with influenza virus type A not type B.
There are several immunosuppressive viral diseases in chickens such as avian adenovirus (AAV), chicken anemia virus (CAV), infectious bursal disease (IBD) and Marek's disease (MD). In this study, we have investigated two broiler chicken farms suffered from high mortality in Jeonbuk in July to August 2009. Clinically high fever and growth retardation were observed in the diseased chicken. In necropsy, the hemorrhages in thigh leg and thymus, hemorrhages and enlargement of liver, kidney and proventriculus, and yellowish fluid in heart were seen. Histologically, necrotic foci and basophilic intranuclear inclusion bodies of hepatocytes, hemorrhages and infiltrated lymphocytes in kidney and proventriculus were observed. By using polymerase chain reaction (PCR), the genes of avian adenovirus, CAV and ND virus were detected in specimens. We suggested that these coinfection cases with high mortality were due to primarily infection of immunosuppressive diseases such as avian adenovirus, CAV, followed by secondary infection of Newcastle disease (ND) virus.
A captive mute swan (Cygnus olor) in the brooding period was found dead without any specific signs. On necropsy, the entire digestive tract was severely necrotized with loosely adherent pseudomembranes, and Clostridium perfringens (CP) colonies isolated from the intestinal contents were identified as CP type A by polymerase chain reaction. Microscopically, the intestine and the liver were necrotized and intralesional bacterial clusters were observed. In this case, there were no other mortalities, so the condition of a single bird, in particular, stress from incubation effort, could act as the predisposing factor for necrotic enteritis. In this study, we report a unique case of necrotic enteritis associated with incubation in a captive mute swan.
According to the Korean government policy of expanding HACCP system application to food chain from farm to meat market, the importance of HACCP assessment to keep balance among the certified HACCP plants is urged. The objective of this study is to recommend more effective HACCP assessment methods. We reviewed major foreign countries HACCP implementation policy focused on the audit system, and compared with the Korean HACCP assessment system. We found that the checklist guidelines of prerequisite program were not enough for precise evaluation and many of the items were not directly related to the risk occurrences. And current rating grade for each items and judgments were inadequate to induce non-compliances and corrections for better HACCP implementation. We suggest revision points as follows; (1) checklists should be revised and reorganized according to the possibility of risk occurrences, (2) all the items should be supported by detailed guidelines for more objective inspection, (3) non-compliances identified must be reconfirmed after correction, (4) the items for HACCP plan should be divided into an accreditation inspection and a regular inspection, (5) rating grade 'high', 'medium', 'low', 'failure' was better for indicating non-compliances.
Blood samples were collected from 672 goats in 60 farms from five provinces of Korea between November 2009 and August 2011. The prevalence of antibodies to pestiviruses was investigated. The examination for antibodies was performed using an enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) detecting antibodies to the bovine viral diarrhea virus (BVDV) and border disease virus (BDV). All blood samples were screened using reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) with primer pairs specific to common pestivirus genome regions. The observed individual seroprevalence was 1.49% and herd seroprevalence was 11.67%. Also, the specific genomes to pestiviruses were detected in 3 out of the 915 clinical samples (0.45%). Based on the nucleotide sequence data, detected pestiviruses were belonged to two BVDV type-1 and one BVDV type-2. The pestivirus infection has been occurred among Korean black goats. However, our results indicate that the prevalence of pestiviruses in black goats was not significantly higher on farms with cattle.
The economic impact of swine mycoplasma infection is high. An accurate diagnosis is often difficult and time consuming. We report the development and validation of an effective multiplex polymerase chain reaction (PCR) assay that detects Mycoplasma (M.) hyopneumoniae and M. hyorhinis. The multi detection of M. hyopneumoniae and M. hyorhinis primer set were employed to detect mycoplasma species and typing of the species was performed on the basis of sequence analysis of the PCR product. The target nucleic acid fragments were specifically amplified by M. hyopneumoniae and M. hyorhinis PCR with 16S ribosomal DNA primers. Single and mixed Mycoplasma species DNA templates were used to evaluate the specificity of the multiplex assay. The corresponding specific DNA products were amplified for each pathogen. The multiplex PCR assay provides a novel tool for simultaneous detection and differentiation of M. hyopneumoniae and M. hyorhinis.
Ehrlichia chaffeensis infects human and animals, and causes human monocytotropic ehrlichiosis (HME). It is emerging as a tick-borne zoonosis of concern. Although deer are important natural reservoir hosts of E chaffeensis, few surveys of deer in Korea for E chaffeensis have been conducted. Therefore, we conducted this study to confirm the occurrence of E chaffeensis in deer. To accomplish this study, we collected blood from total 27 deer and then polymerase chain reaction (PCR) and 16S rRNA sequence analyse to evaluate the samples for the presence of E chaffeensis. The results of this study indicated that 9 (33%) of the deer were infected with E chaffeensis. This is the first study to demonstrate that deer in Korea are infected with E chaffeensis, which indicates that they can act as a natural reservoir host for E chaffeensis.
Checko, Aleksandra;Avramova, Andrijana P.;Berger, Michael S.;Christiansen, Henrik L.
Journal of Communications and Networks
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v.18
no.2
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pp.162-172
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2016
The placement of the complete baseband processing in a centralized pool results in high data rate requirement and inflexibility of the fronthaul network, which challenges the energy and cost effectiveness of the cloud radio access network (C-RAN). Recently, redesign of the C-RAN through functional split in the baseband processing chain has been proposed to overcome these challenges. This paper evaluates, by mathematical and simulation methods, different splits with respect to network level energy and cost efficiency having in the mind the expected quality of service. The proposed mathematical model quantifies the multiplexing gains and the trade-offs between centralization and decentralization concerning the cost of the pool, fronthaul network capacity and resource utilization. The event-based simulation captures the influence of the traffic load dynamics and traffic type variation on designing an efficient fronthaul network. Based on the obtained results, we derive a principle for fronthaul dimensioning based on the traffic profile. This principle allows for efficient radio access network with respect to multiplexing gains while achieving the expected users' quality of service.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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