• 제목/요약/키워드: Search Speed

검색결과 793건 처리시간 0.027초

그리드 컴퓨팅을 이용한 BLAST 성능개선 및 유전체 서열분석 시스템 구현 (Performance Improvement of BLAST using Grid Computing and Implementation of Genome Sequence Analysis System)

  • 김동욱;최한석
    • 한국콘텐츠학회논문지
    • /
    • 제10권7호
    • /
    • pp.81-87
    • /
    • 2010
  • 본 논문에서는 현재 생물정보학 연구에서 가장 많이 사용하고 있는 BLAST의 문제점을 분석하고 이에 따른 해결책을 제시하기 위하여 그리드 컴퓨팅을 이용한 G-BLAST(Grid Computing을 이용한 Basic Local Alignment Search Tool)를 제안한다. 본 연구에서 제안하고 있는 G-BLAST을 이용한 시스템은 이기종 분산 환경에서 수행이 가능한 서열분석 통합 소프트웨어 패키지이며 기존 서열분석 서비스의 취약점인 검색 성능을 개선하여 BLAST 검색 기능을 강화 하였다. 또한, BLAST 결과를 사용자가 관리 및 분석이 용이하도록 데이터베이스 및 유전체 서열분석 서비스 시스템을 구현하였다. 본 논문에서는 G-BLAST시스템의 성능확인을 위하여 병렬컴퓨팅 성능테스트 기법을 도입하여 구현된 시스템을 기존 BLAST와 속도 및 효율부분에서 비교하여 성능개선을 확인하였으며 서열결과 분석에 필요한 자료를 사용자관점에서 제공해주고 있다.

Design of a Fast Multi-Reference Frame Integer Motion Estimator for H.264/AVC

  • Byun, Juwon;Kim, Jaeseok
    • JSTS:Journal of Semiconductor Technology and Science
    • /
    • 제13권5호
    • /
    • pp.430-442
    • /
    • 2013
  • This paper presents a fast multi-reference frame integer motion estimator for H.264/AVC. The proposed system uses the previously proposed fast multi-reference frame algorithm. The previously proposed algorithm executes a full search area motion estimation in reference frames 0 and 1. After that, the search areas of motion estimation in reference frames 2, 3 and 4 are minimized by a linear relationship between the motion vector and the distances from the current frame to the reference frames. For hardware implementation, the modified algorithm optimizes the search area, reduces the overlapping search area and modifies a division equation. Because the search area is reduced, the amount of computation is reduced by 58.7%. In experimental results, the modified algorithm shows an increase of bit-rate in 0.36% when compared with the five reference frame standard. The pipeline structure and the memory controller are also adopted for real-time video encoding. The proposed system is implemented using 0.13 um CMOS technology, and the gate count is 1089K with 6.50 KB of internal SRAM. It can encode a Full HD video ($1920{\times}1080P@30Hz$) in real-time at a 135 MHz clock speed with 5 reference frames.

Improved Hybrid Symbiotic Organism Search Task-Scheduling Algorithm for Cloud Computing

  • Choe, SongIl;Li, Bo;Ri, IlNam;Paek, ChangSu;Rim, JuSong;Yun, SuBom
    • KSII Transactions on Internet and Information Systems (TIIS)
    • /
    • 제12권8호
    • /
    • pp.3516-3541
    • /
    • 2018
  • Task scheduling is one of the most challenging aspects of cloud computing nowadays, and it plays an important role in improving overall performance in, and services from, the cloud, such as response time, cost, makespan, and throughput. A recent cloud task-scheduling algorithm based on the symbiotic organisms search (SOS) algorithm not only has fewer specific parameters, but also incurs time complexity. SOS is a newly developed metaheuristic optimization technique for solving numerical optimization problems. In this paper, the basic SOS algorithm is reduced, and chaotic local search (CLS) is integrated into the reduced SOS to improve the convergence rate. Simulated annealing (SA) is also added to help the SOS algorithm avoid being trapped in a local minimum. The performance of the proposed SA-CLS-SOS algorithm is evaluated by extensive simulation using the Matlab framework, and is compared with SOS, SA-SOS, and CLS-SOS algorithms. Simulation results show that the improved hybrid SOS performs better than SOS, SA-SOS, and CLS-SOS in terms of convergence speed and makespan.

Training-Free Hardware-Aware Neural Architecture Search with Reinforcement Learning

  • Tran, Linh Tam;Bae, Sung-Ho
    • 방송공학회논문지
    • /
    • 제26권7호
    • /
    • pp.855-861
    • /
    • 2021
  • Neural Architecture Search (NAS) is cutting-edge technology in the machine learning community. NAS Without Training (NASWOT) recently has been proposed to tackle the high demand of computational resources in NAS by leveraging some indicators to predict the performance of architectures before training. The advantage of these indicators is that they do not require any training. Thus, NASWOT reduces the searching time and computational cost significantly. However, NASWOT only considers high-performing networks which does not guarantee a fast inference speed on hardware devices. In this paper, we propose a multi objectives reward function, which considers the network's latency and the predicted performance, and incorporate it into the Reinforcement Learning approach to search for the best networks with low latency. Unlike other methods, which use FLOPs to measure the latency that does not reflect the actual latency, we obtain the network's latency from the hardware NAS bench. We conduct extensive experiments on NAS-Bench-201 using CIFAR-10, CIFAR-100, and ImageNet-16-120 datasets, and show that the proposed method is capable of generating the best network under latency constrained without training subnetworks.

PSO의 다양한 영역 탐색과 지역적 미니멈 인식을 위한 전략 (The Strategies for Exploring Various Regions and Recognizing Local Minimum of Particle Swarm Optimization)

  • 이영아;김택헌;양성봉
    • 정보처리학회논문지B
    • /
    • 제16B권4호
    • /
    • pp.319-326
    • /
    • 2009
  • PSO(Particle Swarm Optimization)는 군집(swarm)을 구성하는 단순한 개체들인 입자(particle)들이 각자의 경험을 공유하여 문제의 해답을 찾는 최적화 알고리즘으로 다양한 분야에서 응용되고 있다. PSO에 대한 연구는 최적화를 위해 군집이 적합한 영역으로 빠르게 수렴하도록 하는 파라미터 값의 선정, 토폴로지, 입자의 이동에서 주로 이루어지고 있다. 표준 PSO 알고리즘은 입자 자신과 최고의 이웃이 제공하는 정보만을 이용해서 이동하므로 다양한 영역을 탐색하지 못하고 지역적 최적점에 조기 수렴하는 경향이 있다. 본 논문에서는 군집이 다양한 영역을 탐색하기 위해, 각 입자는 더 나은 경험을 가진 이웃입자들의 정보를 상대적인 중요도에 따라서 참조하여 이동하도록 하였다. 다양한 영역의 탐색은 표준 PSO 알고리즘보다 지역적 최적화의 확률을 줄이고 탐색 속도를 가속화하며 탐색의 성공률을 높일 수 있다. 또한 군집이 지역적 미니멈으로부터 벗어나기 위한 검사 전략을 제안하여 탐색의 성공률을 높였다. 제안한 PSO 알고리즘을 평가하기 위하여, 벤치마크 함수들에 적용한 결과 최적화의 진행 속도 개선과 탐색 성공률의 향상이 있었다.

시간-디지털 변환기를 이용한 ADPLL의 잡음 개선에 대한 연구 (A Study on the Noise Improvement of All Digital Phase-Locked Loop Using Time-to-Digital Converter)

  • 안태원;이종석;이원석;문용
    • 전자공학회논문지
    • /
    • 제52권2호
    • /
    • pp.195-200
    • /
    • 2015
  • 본 논문에서는 ADPLL의 잡음 개선을 위해 8비트 SVBS-TDC (Semi-Vernier Binary-Search Time-to-Digital Converter)를 제안했다. TDC의 동작 속도를 높이기 위해 인코더 등 디지털 블록을 사용하지 않는 BS-TDC (Binary-Search TDC) 구조를 사용했으며, 버니어 구조를 적용하여 기존의 BS-TDC에 비해 해상도를 10배 이상 증가시켰다. TDC의 단점인 좁은 입력범위를 개선하기 위해 버니어 구조를 절반만 적용하여 510ps의 넓은 입력 범위를 확보했다. 제안하는 SVBS-TDC는 65nm CMOS 공정으로 설계하였고, 모의실험 결과 1.2V 전원 전압에서 동작 속도는 200MHz이고 해상도는 4ps로서 ADPLL의 잡음 특성을 효과적으로 개선함을 확인하였다.

분할된 압축 인덱스를 이용한 컬럼-지향 플래시 스토리지의 검색 성능 개선 (Search Performance Improvement of Column-oriented Flash Storages using Segmented Compression Index)

  • 변시우
    • 한국산학기술학회논문지
    • /
    • 제14권1호
    • /
    • pp.393-401
    • /
    • 2013
  • 대부분의 기존 데이터베이스들은 빠른 저장 성능을 얻기 위하여 한 레코드의 속성들을 하드 디스크에 연속적으로 배치하는 레코드-지향 저장 모델을 사용하였다. 하지만 검색이 대부분인 데이터웨어하우스 시스템에는 월등한 읽기 성능 때문에 컬럼-지향 저장 방식이 적합한 모델이 되고 있다. 또한, 현재 플래시 메모리가 고속 데이터베이스 시스템을 위한 선호 저장 매체로 인정되고 있다. 본 논문에서는 고속 컬럼-지향 데이터베이스 모델을 도입하고, 고속 컬럼-지향 데이터웨어하우스 시스템을 위한 컬럼-인지 인덱스 관리 기법을 제안한다. 본 인덱스 관리 기법은 개선된 B트리에 기반하며, 중간 노드와 리프노드에서 내장 플래시 인덱스와 빈공간 압축을 통하여 높은 검색 성능을 얻는다. 성능 평가 결과를 기반으로 본 인덱스 관리 기법이 기존 기법보다 검색 처리 및 응답 시간 측면에서 더 우수함을 확인하였다.

동적 확률지도를 이용한 지상 이동표적 탐색 (Search for Ground Moving Targets Using Dynamic Probability Maps)

  • 김은규;최봉완;임동순
    • 산업경영시스템학회지
    • /
    • 제38권4호
    • /
    • pp.11-21
    • /
    • 2015
  • In order to achieve success in ground operations, searching for moving targets is one of critical factors. Usually, the system of searching for adversary ground moving targets has complex properties which includes target's moving characteristics, camouflage level, terrain, weather, available search time window, distance between target and searcher, moving speed, target's tactics, etc. The purpose of this paper is to present a practical quantitative method for effectively searching for infiltrated moving targets considering aforementioned complex properties. Based upon search theories, this paper consists of two parts. One is infiltration route analysis, through terrain and mobility analysis. The other is building dynamic probability maps through Monte Carlo simulation to determine the prioritized searching area for moving targets. This study primarily considers ground moving targets' moving pattern. These move by foot and because terrain has a great effect on the target's movement, they generally travel along a constrained path. With the ideas based on the terrain's effect, this study deliberately performed terrain and mobility analysis and built a constrained path. In addition, dynamic probability maps taking terrain condition and a target's moving speed into consideration is proposed. This analysis is considerably distinct from other existing studies using supposed transition probability for searching moving targets. A case study is performed to validate the effectiveness and usefulness of our methodology. Also, this study suggests that the proposed approach can be used for searching for infiltrated ground moving target within critical time window. The proposed method could be used not only to assist a searcher's mission planning, but also to support the tactical commander's timely decision making ability and ensure the operations' success.

차량의 이동속도와 이동방향을 고려한 SARPE 시스템 설계 (A Design of an SARPE System considering the moving speed and direction of a vehicle)

  • 이병관;정은희;정이나
    • 한국산업정보학회논문지
    • /
    • 제18권6호
    • /
    • pp.61-70
    • /
    • 2013
  • 본 논문에서는 ITS(Intelligent Transport System)인 VANET 환경에서 사고발생 시에 차량 속도와 방위각을 이용하여 경로 단절을 최소화시키면서 응급메시지를 신속하고 정확하게 전송할 수 있는 SARPE(Speed and Azimuth based Routing Protocol for Emergency) 시스템을 제안한다. SARPE 시스템은 다중 경로 탐색 및 경로 선정 작업 시에 불필요한 메시지 및 작업량을 최소화하기 위하여 방위각을 기반으로 경로 탐색을 수행하고, 근원지와 목적지 차량의 평균 속도와 탐색한 경로 내 차량 속도(최대속도, 최소속도)의 차를 이용하여 경로 단절 발생 확률이 적은 경로를 선택한다. 그 결과, 경로 단절로 인해 생기는 경로 재탐색 작업을 최소화하며, 응급메시지를 신속하고 정확하게 전송할 수 있다.

디지털 비디오 부호화에서의 고속 움직임 추정을 위한 저복잡도 알고리즘 (An Algorithm with Low Complexity for Fast Motion Estimation in Digital Video Coding)

  • 이승철;김민기;정제창
    • 한국통신학회논문지
    • /
    • 제31권12C호
    • /
    • pp.1232-1239
    • /
    • 2006
  • MPEG-1/2/4, H.264/AVC와 같은 영상압축표준에서 사용되는 부호화 기술 중 움직임 추정 및 보상은 부호기의 복잡도에 가장 큰 영향을 끼친다. 영상 코덱에서 일반적으로 사용되는 전역탐색(Full Search) 방식은 최적의 정합블록을 찾기 위해 탐색 영역내의 모든 위치에서 SAD값을 비교하기 때문에 부호화 시간을 다량으로 소비하게 된다. 이런 문제를 개선하기 위해 초기에는 TSS, NTSS, DS, HEXBS 등 다양한 형태의 탐색 패턴을 활용한 고속 움직임 탐색 기법들이 개발되었고, 이후에는 움직임 벡터의 시 공간적 상관도를 이용한 DS기반의 MVFAST, PMVFAST, MAS, FAME 등이 개발되었다. 하지만 부정확한 움직임 벡터 탐색으로 인해 화질이 열화되는 문제와 알고리즘의 복잡도가 높아지는 문제는 여전히 해결해야 할 과제로 남아있다. 본 논문에서는 움직임 벡터 탐색시작점을 보다 정확히 결정하고, 각 프레임들의 움직임 특성을 고려한 단순화된 일차원 탐색 패턴들을 사용하여 탐색속도를 극대화하고 화질열화를 최소화시키는 알고리즘을 제안한다.