The purpose of this study was to determine if contrast media would enhance visualization of the endocardium for assessment of left ventricle (LV) function. In addition, differences between pre- and post-contrast evaluation for the cardiac output measurements including the modified Simpson's method and automated contour tracking (ACT) method were examined. Ten clinically healthy adult beagle dogs (three males and seven females) between 2~3 years old and weighing 6.6~10.8 kg were used. Echocardiographic examinations were performed to compare pre- and post-contrast LV endocardium visualization using a segmental scoring method. Two different methods for measuring cardiac output were also compared. LV visualization was significantly enhanced in post-contrast echocardiography (p < 0.01). Significant differences between pre- and post-contrast measurements for the modified Simpson's method (p < 0.05) were also observed. No significant difference was found for the ACT method. Contrast echocardiography provides better LV chamber opacification and significantly improves wall segment visualization. Furthermore, contrast echocardiography for measuring cardiac output is helpful for the modified Simpson's method.
Some computational approaches are needed for clarifying RNAi sequences, because it takes much time and endeavor that almost of RNAi sequences are verified by experimental data. Incorrectness of RNAi mechanism and other unaware factors in organism system are frequently faced with questions regarding potential use of RNAi as therapeutic applications. Our massive parallelized pair alignment scoring between dsRNA in Genebank and expressed sequence tags (ESTs) in Caenorhabditis elegans Genome Sequencing Projects revealed that this provides a useful tool for the prediction of RNAi induced cosuppression details for practical use. This pair alignment scoring method using high performance computing exhibited some possibility that numerous unwanted gene silencing and cosuppression exist even at high matching scores each other. The classifying the relative higher matching score of them based on GO (Gene Ontology) system could present mapping dsRNA of C. elegans and functional roles in an applied system. Our prediction also exhibited that more than 78% of the predicted co-suppressible genes are located in the ribosomal spot of C. elegans.
Purpose: To evaluate the safety and prognostic factors of intramedullary nailing of distal tibia fractures in terms of function and symptoms of the ankle joint. Materials and Methods: We retrospectively analyzed 22 distal tibial fractures with intramedullary nailing. The mean duration of follow-up was 43 months. We reviewed medical records to describe each case. We measured radiographic parameters such as fracture configuration, arthritic change of the ankle joint and status of reduction. We also assessed clinical results by AOFAS ankle hind foot scoring system, degree of pain by VAS and range of motion to find out prognostic factors for functional result of the ankle joint. Results: Bone healing was obtained in all cases without any wound complications. Mean AOFAS ankle score was 94. There were 4 cases with mild (VAS<3/10) ankle pain and 2 cases with mild limitation of ankle motion. The comminution of fracture had a significant relationship with delayed angular deformity of ankle joint (p=0.032). There was no other significant parameter affecting ankle joint function except the location of nail-end. Conclusion: Intramedullary nailing in distal tibia fracture is a safe and effective procedure. But further study may need to evaluate the relationship between the position of nail-end and the function of ankle joint.
Proceedings of the Korean Society for Bioinformatics Conference
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2005.09a
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pp.294-299
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2005
We have studied unbound docking for 12 protein-protein complexes using conformational space annealing (CSA) combined along with statistical pair potentials. The CSA, a powerful global optimization tool, is used to search the conformational space represented by a translational vector and three Euler amgles between two proteins. The energy function consists of three statistical pair-wise energy terms; one from the distance-scaled finite ideal-gas reference state (DFIRE) approach by Zhou and the other two derived from residue-residue contacts. The residue-residue contact terms describe both attractive and repulsive interactions between two residues in contact. The performance of the CSA docking is compared with that of ZDOCK, a well-established protein-protein docking method. The results show that the application of CSA to the protein-protein docking is quite successful, indicating that the CSA combined with a good scoring function is a promising method for the study of protein-protein interaction.
Reject inference in credit scoring is a statistical approach to adjust for nonrandom sample bias due to rejected applicants. Function estimation approaches are based on the assumption that rejected applicants are not necessary to be included in the estimation, when the missing data mechanism is missing at random. On the other hand, the density estimation approach by using mixture models indicates that reject inference should include rejected applicants in the model. When mixture models are chosen for reject inference, it is often assumed that data follow a normal distribution. If data include missing values, an application of the normal mixture model to fully observed cases may cause another sample bias due to missing values. We extend reject inference by a multivariate normal mixture model to handle incomplete characteristic variables. A simulation study shows that inclusion of incomplete characteristic variables outperforms the function estimation approaches.
We develop a stochastic model to predict the score of a soccer match. We describe the scoring process of the soccer match as a markovian arrival process (MAP). To do this, we define a two-state underlying Markov chain, in which the two states represent the offense and defense states of the two teams to play. Then, we derive the probability vector generating function of the final scores. Numerically inverting this generating function, we obtain the desired probability distribution of the scores. Sample numerical examples are given at the end to demonstrate how to utilize this result to predict the final score of the match.
This paper approaches the issue of seismic vulnerability assessment strategies for facade walls of traditional masonry buildings through the development of a methodology and its subsequent application to over 600 building facades from the old building stock of the historic city centre of Coimbra. Using the post-earthquake damage assessment of masonry buildings in L'Aquila, Italy, an analytical function was developed and calibrated to estimate the mean damage grade for masonry facade walls. Having defined the vulnerability function for facade walls, damage scenarios were calculated and subsequently used in the development of an emergency planning tool and in the elaboration of an access route proposal for the case study of the historic city centre of Coimbra. Finally, the methodology was pre-validated through the comparison of a set of results obtained from its application and also resourcing to a widely accepted mechanical method on the description of the out-of-plane behaviour of facade walls.
Purpose: This study presents clinical results of anterior cruciate ligament(ACL) augmentation using autogenous two-strand semitendinosus tendon in the treatment of partial ACL tears with preservation of residual portion. Materials and Methods: From January 2004 to June 2006, twenty two patients who had an ACL injury underwent ACL augmentation using autogenous two-strand semitendinosus tendon were enrolled in this study. We evaluated the clinical results with regard to clinical findings(range of motion, Lachman test, pivot shift test), standard knee scales(Lysholm, Modified Feagin Scoring System), and KT-1000 arthrometer testing. Results: At minimum one year postoperatively, there was no limitation of range of motion. Lachman and pivot shift tests were negative in all knees. On instrumented anterior laxity test by KT-1000 arthrometer, mean side to side difference was improved from 4.6mm preoperatively to 1.7mm postoperatively. Average Lysholm score was improved from 70 to 92. Ninety one percent of cases were rated as good or excellent in Modified Feagin Scoring System. Conclusion: Augmentation using autogenous two-strand semitendinosus tendon with preservation of residual portion of the ACL seems to be an acceptable method for restoring knee stability and proprioceptive function.
This study was conducted to examine and compare the characteristics in the cognitive functions of peritoneal dialysis, hemodialysis and normal kidney function groups as basic data for effectively educating dialysis patients. The data were collected from May 10 to October 30. 2000, collected from each of 20 patients with peritoneal dialysis, hemodialysis and normal Kidney function and who registered for the dialysis room at a general hospital affiliated to a university in Seoul and sampled by age and educational level through personal interviews with the researchers of this study. As a measuring tool, MMSE developed by Folstein et al.(1975) to measure cognitive function disorder was used, slightly revised for hemodialysis patients. Collected data were processed into frequency, percentage, mean, and standard deviation by the use of SAS. The results of this study are as follows : 1. With a maximum of 30 points for cognitive function, the mean of the peritoneal dialysis patients was $27.06{\pm}2.06$, while that of the hemodialysis patients was $27.25{\pm}2.76$; that of the normal Kidney function patients was $27.85{\pm}2.00$, indicating no significant difference among those three groups. 2. As for the subjects who scored 23 points, the turning point of confirming the cognitive disorder, the percentage was 5% in the case of the peritoneal dialysis, 10% in the case of the hemodialysis and 5% in the case of the normal Kidney function group. 3. Differences between the peritoneal dialysis and hemodialysis patients by gender, occupation, spouse, diabetes, hypertension, the period of dialysis, number of hospitalizations, and the use of erythropoietin were not significant in the scoring of cognitive function. 4. There was no significant correlation between the level of Hb, Hct, albumin, aluminium, PTH, BUN, Cr, dialysis adequacy and the cognitive function. Considering such results, it is clear that there is no significant difference in the cognitive functions of the sampled subjects. Therefore, the nurse in the dialysis room should continually carry out assessment and intervention against elements degrading the effect of patients' education to improve self- care.
Purpose: Isolated acetabular fractures can occur as a result of a high energy impact on the hip joint. Surgery is required for most patients with an isolated acetabular fracture in order to alleviate pain, restore joint stability, and regain hip function. This study was conducted in order to examine the course of hip function in patients after surgical treatment of an isolated traumatic acetabular fracture. Materials and Methods: This prospective series of consecutive cases included patients who underwent surgery for treatment of an isolated acetabular fracture in a European level one trauma center between 2016 and 2020. Patients with relevant concomitant injuries were excluded. Scoring of hip function was performed by a trauma surgeon using the Modified Merle d'Aubigné and Postel score at six-week, 12-week, six-month, and one-year follow-up. Scores between 3-11 indicate poor, 12-14 fair, 15-17 good, and 18 excellent hip function. Results: Data on 46 patients were included. The mean score for hip function was 10 (95% confidence interval [CI] 7.09-12.91) at six-week follow-up (23 patients), 13.75 (95% CI 10.74-16.76) at 12-week follow-up (28 patients), 16 (95% CI 13.40-18.60) at six-month follow-up (25 patients), and 15.50 (95% CI 10.55-20.45) at one-year follow-up (17 patients). After one-year follow-up, the scores reflected an excellent outcome in 11 patients, good in five patients, and poor in one patient. Conclusion: This study reports on the course of hip function in patients who have undergone surgical treatment for isolated acetabular fractures. Restoration of excellent hip function takes six months.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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