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낙동강에서 분리된 Aphanizomenon flos-aquae (Cyanophyceae) 균주의 목표 유전자를 이용한 잠재적 독소 생성능 및 계통학적 분석 (Analysis of Potential Toxigenicity and Phylogeny using Target Genes in Aphanizomenon flos-aquae (Cyanophyceae) strains isolated from the Nakdong River)

  • 류희성;안성민;임창건;신라영;박종근;이정호
    • 생태와환경
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    • 제50권1호
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    • pp.137-147
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    • 2017
  • 독소 생성 분류군의 정의는 분리균주에 의해서 동정되고, 단일배양에 의한 독소 생성 여부 및 유전적 검토가 확인된 분류군을 의미한다. 이러한 관점에서 Aphanizomenon flos-aquae의 독소 생성능은 세계적으로 아직 논쟁의 여지가 있다. 본 연구는 낙동강에서 분리한 Aphanizomenon flos-aquae (DGUC001, DGUC003)을 대상으로 16S rRNA 염기서열을 이용하여 계통학적 위치를 확인하고, 남세균독소인 saxitoxin (STX)과 cylindrospermopsin (CYN)의 잠재적 생성능력을 유전자 수준에서 검토하였다. 연구에 사용된 균주는 2016년 8월과 2016년 10월에 낙동강 본류구간의 하천수에서 분리되었다. 계통학적 분석에는 16S rRNA가 사용되었으며, 독소 생성 유전자는 CYN과 STX 생합성에 관여하는 cyrA, cyrJ, sxtA, sxtI 유전자가 선택되었다. 분리된 균주 DGUC001과 DGUC003은 육안으로 관찰 가능한 크기의 다발(fascicles)을 형성하였으며, 세포사(trichome)가 병렬 형태로 나열되고, 세포사의 양쪽 끝에 위치한 말단 세포(terminal cell)가 거의 투명하거나 긴 끈 형태의 세포질을 가지고 있었다. 또한, 두 개의 균주는 98.4%의 유전적 유사도를 나타내어 동일종으로 판단되었고, 유전자 은행에서 선별한 Cluster I의 Aph. flos-aquae strains과도 계통수에서 66~82%의 bootstrap value의 지지도로 단일 cluster에 포함되었다. 확보된 두 개 균주의 유전자 정보는 유전자은행 NCBI에 등록되었으며, KY327795, KY327796의 Accession no.를 부여받았다. 한편, 세포독소 CYN의 생합성에 관여하는 유전자 cyrA와 cyrJ는 두 개 균주 모두에서 확인되지 않았다. STX의 생합성을 담당하는 유전자 중 sxtA 유전자는 두 개의 균주에서 확보되었으며, 독소생합성 과정의 분자생물학적 지표 역할을 하는 sxtI 유전자는 발견되지 않았다. 따라서 낙동강 현장시료에서 분리된 두 개의 균주는 형태학적 및 계통분류학적으로 동일종인 Aphanizomenon flos-aquae Ralfs ex Bornet et Flahault 1888로 동정되었으며, 두 개의 균주는 CYN과 STX의 잠재적인 독소 비생성 균주로 확인되었다. 이 결과를 통하여 Aph. flos-aquae가 독소 생성 분류군으로 분류되는 것에 대한 보다 면밀한 검토가 필요할 것으로 판단되었다.

15 MV를 이용한 전립샘암 세기조절 방사선치료 시 빔의 개수에 따른 부작용 발생률에 관한 연구 (A Study on the Incidence of Side Effects according to the Number of Beams in Intensity-modulated Radiation Therapy for Prostate Cancer using 15 MV)

  • 이주아
    • 한국방사선학회논문지
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    • 제17권3호
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    • pp.481-487
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    • 2023
  • 본 연구에서는 15 MV를 이용한 전립샘암의 세기조절방사선치료 시 빔의 개수에 따른 광중성자선량의 부작용 발생률을 분석하고자 한다. 전립샘암 세기조절방사선치료의 방사선치료계획설계는 1회 처방선량 220 cGy, 전체 치료 횟수는 33회로 총 7260 cGy로 수립하였다. 실험에 사용된 선형가속기는 Varian의 True Beam STx(Varian, USA)이며, 계획용 표적체적(Planning target volume; PTV)에 15 MV로 광중성자 선량이 발생되도록 하였다. 치료계획의 설계는 Eclipse System (Varian Ver 10.0, USA)을 사용하여 세기조절방사선치료 5, 7, 9 portals로 하였다. 광중성자 선량 측정을 위해 광자극발광선량계 (Optically stimulated luminescence albedo neutron dosimeter, Landauer Inc., USA)를 사용하였다. 세기조절방사선치료 5 portals 시 1,000명당 1.7명, 7 portals 시 1,000명당 1.8명, 9 portals 시 1,000명당 2.0명이 광중성자 선량으로 인하여, 갑상샘에 부작용을 나타낼 확률임을 산출하였다. 본 연구는 세기조절방사선치료 시 2차 피폭선량의 위험성을 연구하여, 향후 방사선의 확률적 영향과 관련된 의미 있는 자료로 활용될 수 있기를 기대한다.

광중성자 발생으로 인한 전립샘암 환자의 유전적 위험과 발암의 확률에 관한 연구 (A Study on the Genetic Risk and Carcinogenesis Probability of Prostate Cancer Patients Due to Photoneutron Generation)

  • 이주아
    • 한국방사선학회논문지
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    • 제17권3호
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    • pp.473-479
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    • 2023
  • 본 연구에서는 고 에너지를 이용한 전립샘암의 방사선 치료 시 발생되는 광중성자의 선량을 광자극발광선량계를 사용하여 측정하였다. 이에 따른 복부에 발생되는 유효선량에 의한 유전적 위험확률을 연구하고자 하였다. 15 MV 에너지 발생이 가능한 의료용 선형가속기 True Beam STx(Varian Medical Systems, USA)와 방사선 치료 계획 시스템(Eclipse, Varian Medical System, USA)을 사용하였다. 선형가속기 Couch 위에 인체팬텀을 설치하고, 광중성자 선량의 측정은 Albedo Neutron Optical Stimulation Luminescence Neutron Detector(Landauer Inc., IL, USA)를 사용하였다. VMAT과 3C-CRT 의 복부에서 광중성자 선량값은 VMAT이 3D-CRT에 비하여 2배 이상 높은 52.8 mSv 였다. 전립샘암의 방사선 치료 시, 광중성자 선량으로 인한 복부에 발생되는 유효선량에 의한 유전적 위험확률은 VMAT는 1,000명 당 3.2명, 3D-CRT는 1.4명이 발생률임을 산출하였다. 전립샘암의 방사선 치료 시 발생할 수 있는 큰 부작용이 있는 복부를 연구함으로써 전립샘암 환자들의 삶의 질과 확률적 영향을 연구하는데에 의미 있는 연구로 활용되어지길 기대한다.

관절형 허브 로터를 이용한 전진비행조건에서의 플래핑 운동에 대한 실험적 연구 (An Experimental Study on Flapping Motion of Forward Flight Condition used to Articulated Hub Rotor)

  • 이재하;백동민;이욱;최종수;송근웅
    • 한국항공우주학회지
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    • 제41권4호
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    • pp.261-267
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    • 2013
  • 본 논문에서는 헬리콥터 전진비행 조건에서 플래핑모션에 대하여 축소 로터 실험을 통하여 실험결과와 이론적인 예측결과를 비교하였다. 축소로터 성능 실험은 충남대학교 아음속 풍동에서 수행하였으며 1.8 x 1.8m의 개방형 시험부를 사용하였다. 전진비행조건에서의 실험 결과에 의하면 축소로터의 전진비행조건에서의 추력 결과를 고정한 조건에서 동력계수는 차이가 있는 것을 확인 할 수 있었다. 또한, 공력 성능 측정 결과와 이론적인 예측결과의 비교를 통하여 헬리콥터의 플랩핑 각도의 범위에 대하여 비교하여 보았다. Coning 각도, 횡방향과 종방향에 대한 플래핑 각도에 대해서는 실험결과와 예측결과의 유사함을 확인하였다.

Photometric Monitoring of Globular Clusters with KMTNet pre-science Camera

  • Lee, Dong-Joo;Lee, Chung-Uk;Kim, Dong-Jin;Hong, Kyeongsoo;Koo, Jae-Rim;Lee, Jae Woo;Kim, Seung-Lee;Cha, Sang-Mok;Lee, Yongseok;Lim, Beomdu;Park, Byeong-Gon;Jeon, Young-Beom
    • 천문학회보
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    • 제40권1호
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    • pp.55.3-55.3
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    • 2015
  • 한국천문연구원에서 개발 중인 KMTNet 망원경은 2014년 칠레(5월), 남아공(8월), 호주(11월)에 설치가 완료되었다. 망원경 설치 이후, 연구관측용 광시야 18k CCD 카메라를 설치하기 전까지의 기간 동안 시험관측용 4k CCD 카메라(STX-16803)를 활용하여 관측을 수행하였다. 시험관측 대상으로는 KMTNet의 주 관측 영역인 우리은하 팽대부처럼 별이 밀집된 영역에서 영상차감법(Difference Image Analysis; DIA)을 활용해 변광하는 천체를 찾기 위해 $25^{\prime}{\times}25^{\prime}$의 CCD 관측 영역에 적당한 6개의 남반구 구상성단을 선정하였다. 본 발표에서는 관측된 성단의 측광 결과와 영상차감법을 이용해 찾은 변광성에 대해 논의할 예정이다.

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Virulence genes and antimicrobial resistance of pathogenic Escherichia coli isolated from diarrheic weaned piglets in Korea

  • Do, Kyung-Hyo;Byun, Jae-Won;Lee, Wan-Kyu
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제62권4호
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    • pp.543-552
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    • 2020
  • For efficient prevention and treatment of enteric colibacillosis, understanding about latest virulence factors and antimicrobial resistance of Escherichia coli is essentially needed. The aim of this study was to survey antimicrobial resistance and determine the prevalence of fimbriae and enterotoxin genes among 118 pathogenic E. coli isolates obtained from Korean pigs with diarrhea between 2016 and 2017. The genes for the toxins and adhesins were amplified by polymerase chain reaction (PCR). The susceptibility of the E. coli isolates to antimicrobials were tested using the standard Kirby-Bauer disk diffusion method. The most prevalent fimbrial antigen was F18 (40.7%), followed by F4 (16.9%), and the most prevalent combinations of toxin genes were Stx2e (21.2%), STb:EAST-1 (19.5%), and STa:STb (16.9%), respectively. Among the pathotypes, enterotoxigenic E. coli (ETEC) was the most predominant (67.8%), followed by Shiga-toxin producing E. coli (STEC, 23.7%). We confirmed high resistance rates to chloramphenicol (88.1%), tetracycline (86.4%), streptomycin (86.4%), and ampicillin (86.4%). And the majorities of isolates (90.7%) showed multi-drug resistance which means having resistance to 3 or more subclasses of antimicrobials. Results of this study can be a source of valuable data for investigating the epidemiology of and control measures for enteric colibacillosis in Korean piggeries.

Detection of Escherichia coli O157:H7, Salmonella spp., Staphylococcus aureus and Listeria monocytogenes in Kimchi by Multiplex Polymerase Chain Reaction (mPCR)

  • Park, Yeon-Sun;Lee, Sang-Rok;Kim, Young-Gon
    • Journal of Microbiology
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    • 제44권1호
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    • pp.92-97
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    • 2006
  • We developed an mPCR assay for the simultaneous detection, in one tube, of Escherichia coli O157:H7, Salmonella spp., Staphylococcus aureus and Listeria monocytogenes using species-specific primers. The mPCR employed the E. coli O157:H7 specific primer Stx2A, Salmonella spp. specific primer Its, S. aureus specific primer Cap8A-B and L. monocytogenes specific primer Hly. Amplification with these primers produced products of 553, 312, 405 and 210 bp, respectively. All PCR products were easily detected by agarose gel electrophoresis, and the sequences of the specific amplicons assessed. Potential pathogenic bacteria, in laboratory-prepared and four commercially available kimchi products, were using this mPCR assay, and the amplicons cloned and sequenced. The results correlated exactly with sequences derived for amplicons obtained during preliminry tests with known organisms. The sensitivity of the assay was determined for the purified pathogen DNAs from four strains. The mPCR detected pathogen DNA at concentrations ranging from approximately 0.45 to $0.05\;pM/{\mu}l$. Thus, this mPCR assay may allow for the rapid, reliable and cost-effective identification of four potentially pathogens present in the mixed bacterial communities of commercially available kimchi.

Occurrence of Toxic Alexandrium and Intoxification of Two Mollusk Species by Paralytic Shellfish Poisoning Toxins on the Southeastern Coast of Korea

  • Kim Young-Soo;Lee Jong-Soo;Jang Joon-Ho;Kim Keun-Yong;Kim Chang-Hoon
    • Fisheries and Aquatic Sciences
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    • 제8권2호
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    • pp.76-82
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    • 2005
  • We analyzed the paralytic shellfish poisoning (PSP) toxins of the toxic marine dinoflagellate Alexandrium tamarense collected from Dadaepo and Gaduck-do in Busan and from Sujeong-ri in Jinhae Bay, Korea, in April 2003. We also analyzed the PSP toxin of mussels (Mytilus galloprovincialis) and oysters (Crassostrea gigas) collected around Busan and Jinhae Bay. PSP toxin analyses were conducted by high performance liquid chromatography (HPLC). Fifteen cultured A. tamarense isolates contained 2.78 to 57.47 fmol/cell, with nearly identical toxin profiles: major components C2, GTX4; minor components C1, GTX1, NEO; and trace components GTX2, GTX3, STX. PSP toxin contents were 0 to $492\;\mu{g}$ STXeq/100 g in mussels and 0 to $48\;\mu{g}$ STXeq/100 g in oysters. Mussels at Gijang and Sujeong-ri contained the most PSP toxin contents ($492\;\mu{g}\;STXeq/100\;g\;and\;252\;\mu{g}\;STXeq/100\;g,\;respectively$), exceeding the quarantine level ($80\;\mu{g}$ STXeq/100 g). Their dominant toxin components were C2, C1, GTX2, and GTX3; the minor components GTX1, GTX4, GTX5, and NEO were sporadically detected. Phytoplankton contained 0.774 fmol/L seawater and 1.228 fmol/L seawater at Gijang and Sujeong-ri in April. At that time, Alexandrium cells were present in the water column at Gijang at 2,577 cells/mL and at Sujeong-ri at 6,750 cells/mL. Overall, we found the high and similar PSP toxin contents in AZexandrium isolates and mussels, and a correlation between occurrence of toxic Alexandrium cells in the water column and mussel intoxification. High densities of toxic Alexandrium cells in the water column immediately preceded shellfish intoxification at Gijang and Sujeong-ri in April.

A Comparison Study of Volumetric Modulated Arc Therapy Quality Assurances Using Portal Dosimetry and MapCHECK 2

  • Jin, Hosang;Jesseph, Fredrick B.;Ahmad, Salahuddin
    • 한국의학물리학회지:의학물리
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    • 제25권2호
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    • pp.65-71
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    • 2014
  • A Varian Portal Dosimetry system was compared to an isocentrically mounted MapCHECK 2 diode array for volumetric modulated arc therapy (VMAT) QA. A Varian TrueBeam STx with an aS-1000 digital imaging panel was used to acquire VMAT QA images for 13 plans using four photon energies (6, 8, 10 and 15 MV). The EPID-based QA images were compared to the Portal Dose Image Prediction calculated in the Varian Eclipse treatment planning system (TPS). An isocentrically mounted Sun Nuclear MapCHECK 2 diode array with 5 cm water-equivalent buildup was also used for the VMAT QAs and the measurements were compared to a composite dose plane from the Eclipse TPS. A ${\gamma}$ test was implemented in the Sun Nuclear Patient software with 10% threshold and absolute comparison at 1%/1 mm (dose difference/distance-to-agreement), 2%/2 mm, and 3%/3 mm criteria for both QA methods. The two-tailed paired Student's t-test was employed to analyze the statistical significance at 95% confidence level. The average ${\gamma}$ passing rates were greater than 95% at 3%/3 mm using both methods for all four energies. The differences in the average passing rates between the two methods were within 1.7% and 1.6% of each other when analyzed at 2%/2 mm and 3%/3 mm, respectively. The EPID passing rates were somewhat better than the MapCHECK 2 when analyzed at 1%/1 mm; the difference was lower for 8 MV and 10 MV. However, the differences were not statistically significant for all criteria and energies (p-values >0.05). The EPID-based QA showed large off-axis over-response and dependence of ${\gamma}$ passing rate on energy, while the MapCHECK 2 was susceptible to the MLC tongue-and-groove effect. The two fluence-based QA techniques can be an alternative tool of VMAT QA to each other, if the limitations of each QA method (mechanical sag, detector response, and detector alignment) are carefully considered.

D* 서치와 퍼지 알고리즘을 이용한 모바일 로봇의 충돌회피 주행제어 알고리즘 설계 (Development of a Navigation Control Algorithm for Mobile Robots Using D* Search and Fuzzy Algorithm)

  • 정윤하;박효운;이상진;원문철
    • 대한기계학회논문집A
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    • 제34권8호
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    • pp.971-980
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    • 2010
  • 이 논문은 모바일 로봇이 고정 장애물 또는 움직이는 장애물이 존재하는 환경에서 장애물을 회피하며 운행될 수 있는 제어 알고리즘을 연구하였다. 이 제어 알고리즘은 $D^*$ 알고리즘과, 충돌 위험도 퍼지로직, 이동로봇의 행동결정 퍼지로직을 사용하여 전역경로계획과 지역경로계획을 수행한다. $D^*$ 알고리즘에는 로봇이 이동하는 2 차원 공간을 정방형 격자 분활하여 적용한다. 이 알고리즘은 파이썬 프로그래밍 언어와 이동로봇의 운동방정식을 사용한 시뮬레이션을 통해 검증하였다. 시뮬레이션 결과를 통해 알고리즘을 적용하여 로봇이 이동하는 장애물을 피하거나 모르는 고정 장애물을 피하면서 원하는 위치로 이동하는 것을 볼 수 있다.