• Title/Summary/Keyword: Ribonuclease

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Saccharomyces uvarum의 Catabolic Repression 시기에 유도되는 Ribosomal Ribonuclease에 대한 연구 (Induction of Ribosomal Ribonuclease during Catabolic Repression in Saccharomyces uvarum)

  • 윤성녀;이기성;최영길
    • 한국균학회지
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    • 제14권3호
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    • pp.201-207
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    • 1986
  • 효모 세포(S. uvarum)를 재료로 하여 배양 시기 및 sugar starvation시기에 특이하게 출현 또는 유도되는 RNase의 localization과 특성을 조사하고자 하였다. 정상 배양 시기 및 sugar starvation시킨 효모 세포를 세포 분획구에 따라 RNase 활성도를 측정하는 한편 ribosome 양의 변화를 조사하였다. 특히 ribosomal 분획구에서 추출한 RNase들을 poly(C)와 반응시킨 후 생성물을 TLC에 적응하여 효소의 특성 및 유도 여부를 조사하였다. 그 결과를 요약하면 다음과 같다. 세포 분획구 중 $45,000{\times}g$ pellet 분획구 및 Postribomosal 분획구에서는 배양 시기나 sugar starvation에 관계없이 RNase의 활성도는 유의하게 증감하지 않았으나, ribosomal 분회구에서는 정체기와 sugar starvation시 활성도가 각각 2배, 10배 이상 급격히 증가하였다. ribosome의 양적 동태를 살펴보면 early log phase의 세포에 비하여, 정체기 세포와 sugar starvation시킨 세포에서는 $1/3{\sim}1/6$까지 급격히 감소하였다. TLC의 결과 rRNase의 종류는 early log phase에서는 oligonuclease와 3'-ribonuclease, 5'-ribonuclease,stationarf phase에서는 oligonuclease, 3'-ribonuclease, sugar starvation 시켰을 때는 3'-ribonuclease, 5'-ribonuclease의 활성이 나타났다. 그리고 완전 배지를 사용한 효모 세포에서는 공통적으로 oligonuclease의 활성이 나타난 반면, sugar starvation시킨 효모 세포에서는 oligonuclease의 활성은 나타나지 않았다.

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Improved Fluorometric Assay Method for Ribonuclease Activity

  • Lee, Jong-Soo;Choi, Jong-Soo
    • BMB Reports
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    • 제30권4호
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    • pp.258-261
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    • 1997
  • A simple quantitative assay method for ribonuclease activity has been developed. This method is based on the decrease of fluorescence intensity emitted by the ethidium bromide bound to RNA due to the degradation of RNA by ribonuclease. The substrate RNA was reacted with ribonuclease A and the fluorescence intensity was measured after the addition of ethidium bromide. The intensity difference was calculated using a blank reaction mixture containing no RNase. Whole cellular RNA substrate produced a significant error and was not suitable for this assay method possibly because of local microheterogeniety caused by high molecular weight rRNA. but satisfying results were obtained with tRNA substrate. The intensity difference increased linearly by raising enzyme concentration up to $2{\times}10^{-4}$ Kunitz Units of ribonuclease A. More refined and reliable results were obtained by use of initial reaction velocities which were calculated from the plots of intensity difference vs time. A linear relationship between initial velocities and enzyme concentrations was observed up to 0.01 Kunitz Units of enzyme.

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Bacillus subtilis ATP 조해(阻害) Ribonuclease에 관한 연구 (ATP-Inhibited Ribonuclease of Bacillus subtilis)

  • 이택수
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제18권3호
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    • pp.167-176
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    • 1975
  • ATP-저해 ribonuclease는 Bacillus subtilis와 같은 Bacillus속에서만 발견 되는 것으로서 이들 효소의 생리적 역활을 규명할 목적으로 Bacillus subtilis 균주를 사용하여 ATP저해성 negative ribonuclease변이주의 취득을 시도하고 선정된 균주가 생산하는 ribonuclease의 정제 및 몇 가지 성질에 대하여 실험한 결과는 아래와 같다. 1. Bacillus subtilis로 부터 ATP-저해 ribonuclease negative mutant의 취득을 시도한 결과 시험된 1817주의 균중에서 101균주가 변이주주로 선정 되었다. 2. 수개의 개별적인 column chromatography에 의하여 당균주가 생산하는 ATP-저해성 ribonuclease의 정제를 시도한 결과 DEAE-Sephadex A-50 column chromatography을 이용한 경우는 30배의 정제 효과와 99%의 회수율을 나타냈고 Sephadex G-75 column의 경우는 20배의 정제 효과와 98%의 회수율을 각각 나타냈다. 3. pH 5침전, 유안염석, Sephadex G-75 및 CM Sephadex를 연속적으로 통과시켜 당효소에 대한대량정제 시험을 시도한 결과 최초의 step(crude extract) 과정에 비하여 60배의 정제효과를 나타냈다. 4. 본정제 효소액에 대하여 전기영동을 실시한 결과 비정제 효소액에 비하여 매우 감소된 수의 담백 pattern을 나타냈다. 5. 당균주가 생산하는 ATP저헤 ribonuclease는 single stranded RNA를 분해하여 2',3'-cyclic AMP, 2',3'-cyclic CMP, 2',3'-cyclic GMP, 2',3'-cyclic UMP와 몇종의 미지물을 생성하였고 또한 본효소는 double stranded RNA를 분해하지 않었다.

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An Antiproliferative Ribonuclease from Fruiting Bodies of the Wild Mushroom Russula delica

  • Zhao, Shuang;Zhao, Yong Chang;Li, Shu Hong;Zhang, Guo Qing;Wang, He Xiang;Ng, Tzi Bun
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제20권4호
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    • pp.693-699
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    • 2010
  • An antiproliferative ribonuclease with a new N-terminal sequence was purified from fruiting bodies of the edible wild mushroom Russula delica in this study. This novel ribonuclease was unadsorbed on DEAE-cellulose, but absorbed on SP-Sepharose and Q-Sepharose. It had a molecular mass of 14 kDa, as judged by fast protein liquid chromatography on Superdex 75 and SDS-polyacrylamide gel electrophoresis. Its optimal pH and optimal temperature were pH 5 and $60^{\circ}C$, respectively. The ranking of its activity toward various polyhomoribonucleotides was poly C> poly G>poly A>poly U. It could inhibit proliferation of HepG2 and MCF-7 cancer cells with an $IC_50$ value of $8.6\;{\mu}M$ and $7.2\;{\mu}M$, respectively. It was devoid of antifungal and HIV-1 reverse transcriptase inhibitory activity.

RNase A에 對한 RNA의 加水分解反應性에 미치는 Spermine의 抑制效果 (Inhibitory Effect of Spermine of the Susceptibility of RNA for RNase A)

  • 이찬용;김흥균;고동성
    • 대한화학회지
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    • 제29권6호
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    • pp.646-650
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    • 1985
  • RNase A에 對한 RNA의 加水分解反應性은 spermine에 의하여 抑制되었다. Spermine의 濃度가 增加함에 따라 RNase의 活性度는 점점 減少하다가 plateau에 到達되었다. 同一한 條件에서 spermine의 濃度가 增加함에 따라 RNA의 粘性度는 점점 增加되어 RNase의 活性度에서의 spermine의 依存性과 같이 plateau에 이르게 되었다. RNase A에 對한 RNA의 加水分解反應性에 미치는 spermine의 抑制效果는 denatured(變性) DNA에 의하여 救濟되나 native(本性) DNA에 의하여서는 無關하였다. 이들 實驗結果는 spermine에 의하여 RNA의 分子間 aggregation이 일어나며 그로 因하여 RNA의 RNase A에 對한 加水分解反應性이 抑制될 수 있음을 보여준다.

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A Phosphate Starvation-Inducible Ribonuclease of Bacillus licheniformis

  • Nguyen, Thanh Trung;Nguyen, Minh Hung;Nguyen, Huy Thuan;Nguyen, Hoang Anh;Le, Thi Hoi;Schweder, Thomas;Jurgen, Britta
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제26권8호
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    • pp.1464-1472
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    • 2016
  • The BLi03719 protein of Bacillus licheniformis DSM13 belongs to the most abundant extracellular proteins under phosphate starvation conditions. In this study, the function of this phosphate starvation inducible protein was determined. An amino-acid sequence analysis of the BLi03719-encoding gene showed a high similarity with genes encoding the barnase of Bacillus amyloliquefaciens FZB42 and binase-like RNase of Bacillus pumilus SARF-032. The comparison of the control strain and a BLi03719-deficient strain revealed a strongly reduced extracellular ribonuclease activity of the mutant. Furthermore, this knockout mutant exhibited delayed growth with yeast RNA as an alternative phosphate and carbon source. These results suggest that BLi03719 is an extracellular ribonuclease expressed in B. licheniformis under phosphate starvation conditions. Finally, a BLi03719 mutant showed an advantageous effect on the overexpression of the heterologous amyE gene under phosphate-limited growth conditions.

법랑질과 상아질의 타액단백 흡착에 관한 연구 (Interaction of Salivary Proteins with Human Enamel and Dentin Powder)

  • 김동순
    • 대한치과의사협회지
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    • 제11권3호
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    • pp.205-209
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    • 1973
  • 법랑질과 상아질의 타액단백의 흡착관계를 구명키 위하여 타액을 법랑질과 상아질 분말의 column에 흡착시킨후 증류수, 3M Nacl, 0.1M phosphate buffer, pH 7.1, 0.2M EDTA 함유한 phosphate buffer와 증류수를 차례로 용출시켜 용출액의 amylase, ribonuclease 및 단백양을 관찰한 결과는 다음과 같다. 1. 타액 amylase와 ribonuclease는 법랑질과 상아질 분말에 모두 흡착하였다. 2. 0.2M EDTA가 함유한 buffer에서는 단백양을 법랑질과 상아질분말에서 모두 33.5%정도 용출되었으나 효소활성은 없었다.

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CTAB/Hexanol/Isooctane 역미셀계를 이용한 단백질 분리 (Protein Separation with CTAB/Hexanol/Isooctane Reverse Micellar System)

  • 김영숙;신해헌;권윤중;변유량;홍석인
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제18권5호
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    • pp.517-524
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    • 1990
  • CTAB/hexanol/isooctane 역미셀을 이용하여 단백질을 선택적으로 분리할 수 있는 분리조건을 밝히기 위해서 먼저 분자량과 등전점이 다른 여러 단백질의 용해와 회수에 미치는 pH, 이온의 종류 및 이온 강도, 계면활성제의 종류 등 system parameters에 대해 연구 검토하였다. pH에 따른 단백질의 용해는 등전점이 낮은 pepsin이 pH5-7 이상, 등전점이 높은 lisozyme이나 ribonuclease-a는 pH11-12 이상으로 단백질이 계면활성제의 (+)전하와 반대전하인 (-)를 띠는 등전점 이상의 pH역역에서 용해가 가능하였다.

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Functional Implications of the Conserved Action of Regulators of Ribonuclease Activity

  • Yeom, Ji-Hyun;Shin, Eun-Kyoung;Go, Ha-Young;Sim, Se-Hoon;Seong, Maeng-Je;Lee, Kang-Seok
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제18권8호
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    • pp.1353-1356
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    • 2008
  • RNase E (Rne) plays a major role in the decay and processing of numerous RNAs in E. coli, and protein inhibitors of RNase E, RraA and RraB, have recently been discovered. Here, we report that coexpression of RraA or RraB reduces the ribonucleolytic activity in rne-deleted E. coli cells overproducing RNase ES, a Streptomyces coelicolor functional ortholog of RNase E, and consequently rescues these cells from growth arrest. These findings suggest that the regulators of ribonuclease activity have a conserved intrinsic property that effectively acts on an RNase E-like enzyme found in a distantly related bacterial species.

Cloning and Sequencing of the rph Gene Encoding RNase PH from Legionella pneumophila

  • Kim, Se-Jin;Lim, Jong-Seok;Cianciotto, Nicholas P.;Choe, Yong-Kyung
    • Journal of Microbiology
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    • 제37권4호
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    • pp.218-223
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    • 1999
  • Legionella pneumophila, the cause of Legionnaires disease, is able to survive intracellularly in eukaryotic cells such as monocytes, macrophages, and protozoan organisms. During protein biosynthesis, the rph gene encodes ribonuclease (RNase) PH which functions as a phosphorolytic nuclease that removes nucleotides following the CCA terminus of tRNA and as a nucleotidyl-transferase which adds nucleotides to the ends of RNA molecules by usingnucelside diohosphates as substrates. In this sutdy, the rph gene was screened in pUC19 library employing a DNA probe which was constructed from PCR based on a consensus pattern of multiple alignment of RNas PH. The encoded protein consists of 235 amino acid residues with a calculated molecular weight of 26,112 Daltons. The RNase PH signature domains are completely conserved.

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