Accurate methods for the identification of closely related species or breeds in raw and processed meats must be developed in order to protect both consumers and producers from mislabeling and fraud. This paper describes the development of DNA markers for the discrimination and improvement of Korean native pig (KNP) meat. The KIT gene is related to pig coat color and is often used as a candidate marker. A 538 bp fragment comprising intron 19 of the pig KIT gene was amplified by PCR using specific primers, after which the PCR amplicons of a number of meat samples from KNP and three major improved breeds (Landrace, Duroc and Yorkshire) were sequenced in order to find a nucleotide region suitable for PCR-RFLP analysis. Sequence data showed the presence of two nucleotide substitutions, g.276G>A and g.295A>C, between KNP and the improved pig breeds. Digestion of KIT amplicons with AccII enzyme generated characteristic PCR-RFLP profiles that allowed discrimination between meats from KNP and improved pig. KNP showed three visible DNA bands of 264/249, 199, and 75 bp, whereas DNA bands of 249, 199, and 90 bp were detected in the three improved pig breeds. Therefore, the 75 bp DNA fragment was specific only to KNP, whereas the 90 bp DNA fragment was specific to the improved breeds. The breed-specific DNA markers reported here that target the KIT gene could be useful for the identification of KNP meat from improved pig meats, thus contributing to the prevention of falsified breed labeling.
Identification of animals has been used with an e ar tag with dummy code and blood typing has been used for paternity and individual identification in live animals. Various genetic markers are different for breeds of pig and hence, it is necessary to identity the discrete genetic marker in korean native pig. A total of 240 pigs were used to find korean native pig population specific markers that expressed in population of korean native pigs. To identify the individual traceability, 20 animals were randomly chosen and tested for a whole process from being live to slaughter stages. The candidate genetic marker used in the study were 18 DNA microsatellites which were identified in pig genome. The number of alleles of those DNA microsatellites ranged form a minimum of 3 to maximum of 6. The heterozygote frequency rang6d from 0.44 to 0.69. Effective number of alleles for each DNA microsatellotes were 2 to 4. By choosing 6 candidate genetic markers among all, the traceability of individual identification was estimated as accurate as 99.99%(p>0.0014), nearly.
Pig's original image data was transformed to a binary image, an image excluding head and tail portion from the whole binary image, and a projected image associated with pig's height. Then the length of body, width of shoulder, and area of pig were calculated and the relationships among the above characteristics and pig's weight were analyzed. The results obtained from this study were as follows: 1. Whole binary image data was considered to be improper to determine the pig's weight because the movement of pig's head and tail portion affected the image data. 2. Binary image data excluding head and tail portion from the whole binary image showed a better estimation of the pig's weight than the whole binary image. 3. Pig's should width was analyzed to be improper factor to determine the pig's weight. 4. The projected image associated with pig's height showed the highest correlation between the pig's area of the image and pig's weight(R2=0.9965). From this research the projected image associated with pig's height, which is excluding head and tail portion from the whole body of pig's image, was considered to be the prime factor to measure the pig's weight by the noncontact measurement.
KSII Transactions on Internet and Information Systems (TIIS)
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v.15
no.9
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pp.3186-3203
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2021
In this paper, a multi-scale local difference directional number (MLDDN) pattern is proposed for pig identification. Firstly, the color images of individual pig are converted into grey images by the most significant bits (MSB) quantization, which makes the grey values have better discrimination. Then, Gabor amplitude and phase responses on different scales are obtained by convoluting the grey images with Gabor masks. Next, by calculating the main difference of local edge directions instead of traditionally edge information, the directional numbers of Gabor amplitude and phase responses are encoded. Finally, the block histograms of the encoded images are concatenated on each scale, and the maximum pooling is adopted on different scales to avoid the high feature dimension. Experimental results on two pigsties show that MLDDN impressively outperforms the other widely used local descriptors.
A 7-month-old, female miniature pig was presented with excessive cerumen and pruritus. Greasy brown cerumen in both exteranal ear canal and sporadic head shaking were observed in the physical examination. Numerous budding yeasts in the cerumen were examined on microscopic examination. For species identification, PCR-RFLP using incubated colony on modified Dixon's medium was performed and finally, causative yeast was identified as M. furfur.
Porcine endogenous retroviruses (PERVs) gamma1 in the pig genome have the potential to act as harmful factors in xenotransplantation (pig-to-human). Long terminal repeats (LTRs) are known to be strong promoter elements that could control the transcription activity of PERV elements and the adjacent functional genes. To investigate the transcribed PERV gamma1 LTR elements in pig tissues, bioinformatic and experimental approaches were conducted. Using RT-PCR amplification and sequencing approaches, 69 different transcribed LTR elements were identified. And 69 LTR elements could be divided into six groups (15 subgroups) by internal variation including tandem repeated sequences, insertion and deletion (INDEL). Remarkably, all internal variations were indentified in U3 region of LTR elements. Taken together, the identification and characterization of various PERV LTR transcripts allow us to extend our knowledge of PERV and its transcriptional study.
High performance liquid chromatographic separation is described for the analysis of bile acids after hydrolysis in seven commercial crude bile drugs and ox and pig galls. They are simultaneously separated with HPLC mobile phase of acetonitrile/0.5% ammonium carbonate (pH 6.7) (25.5 : 74.5) at a flow rate $(1.0{\rightarrow}1.5ml/min.)$ and differential refractometer. The linearity of calibration curve and recovery test are good by using the method. The analysis of major bile acids in seven commercial crude bile drugs using the described method is presented. Sample no. 1 of them is similar to separation pattern of ox gall. Sample no. 6 of them is supposed to be genuine bear gall on the basis of identification of ursodeoxycholic acid. Sample $no.\;2{\sim}5$ and 7 of them are supposed to be pig gall on the basis of identification of hyodeoxycholic acid which is a characteristic component of pig gall.
We developed a polymerase chain reaction (PCR)-based molecular method for sexing and identification using sexual dimorphism between the Zinc Finger-X and -Y (ZFX-ZFY) gene and polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) for mitochondrial DNA (mtDNA) cytochrome B (CYTB) gene in meat pieces and commercial sausages from animals of different origins. Sexual dimorphism based on the presence or absence of SINE-like sequence between ZFX and ZFY genes showed distinguishable band patterns between male and female DNA samples and were easily detected by PCR analyses. Male DNA had two PCR products appearing as distinct two bands (ZFX and ZFY), and female DNA had a single band (ZFX). Molecular identification was carried out using PCR-RFLP of CYTB gene, and showed clear species classification results. The results yielded identical information on the sexes and the species of the meat samples collected from providers without any records. The analyses for DNA isolated from commercial sausage showed that pig was the major source but several sausages originated from chicken and Atlantic cod. Applying this PCR-based molecular method was useful and yielded clear sex information and identified the species of various tissue samples originating from livestock.
In the survey on the pig-stomach worms of the abattoir pigs in Gyeongbug province, some unusual nematodes were found by gross and microscopic inspection to the pig-stomach. The results obtained in the survey and identification were summarized as follows. 1. A natural infection of Anisakis type larvae in the pig gastric wall was newly confirmed in korea and in all cases, the larvae were identified as Anisakis type 1 (Berland, 1961). 2. A chronic granulomatous lesion with small lymphocytes, neutrophils and eosinophils was appeared in the gastric wall penetrated by the larvae. 3. Of total 318 pigs, 9 pigs were infected with the larvae and in each stomach, only one or two worms were detected from the abattoir pigs. 4. Ascarops strongylina was found as one percent.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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