Irreversible photobleaching of bacteriorhodopsin (bR), namely denaturation induced by illumination of visible light, was investigated by absorption kinetic measurements. The denaturation kinetics revealed that light illumination significantly enhanced the structural decay of bR. The kinetic analyses showed that the molecular structure of bR denatures according to a single-exponential decay, whereas irreversible photobleaching has two decay components. The decay constant of the slow component of photobleaching is almost same as that in the dark. An Arrhenius plot of the denaturation kinetic constants for the fast and slow components showed similar activation energies of approximately 19 kcal/mol.
Kim, Jin-Baek;Ganesan, Ramakrishnan;Kim, Kyoung-Seon;Choi, Jae-Hak
Proceedings of the Polymer Society of Korea Conference
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2006.10a
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pp.176-176
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2006
We designed and synthesized new type of nonchemically amplified polymeric and molecular resists and studied their lithographic performance. The polymeric resists [poly(DOBEMA-co-GBLMA)] show very high degree of photobleaching at 248 nm and moderate to good degree of photobleaching at 193 nm. The molecular resist (CDEOPE-POSS) shows high degree of photobleaching at 248 nm and modetate degree of photobleaching at 193 nm. CDEOPE-POSS possesses very high oxygen reactive ion etching resistance, which makes it suitable to be used as a bilayer resist. The lithographic studies of these resist materials suggest the feasibility of these materials to be used as single and bilayer resists.
Two-photon fluorescence microscopy was performed on the enamel-dentin junction area of a human tooth using a femtosecond pulsed laser. We obtained a clear image contrast between the bright dentin and dark tubules with the autofluorescence generated from the endogenous fluorophores in dentin. The autofluorescence shows a broad spectrum due to complex cross links between dentinal collagens, which extend from blue to orange wavelengths (470-590 nm), but a gradual autofluorescence loss in photobleaching was observed for a long-term exposure under strong excitation. For increasing excitation power, we found that two-step decay becomes significant in the spectrally integrated autofluorescence.
Fluorescence recovery after photobleaching (FRAP) has been widely used for the measurement of molecular diffusion in living cells and tissues. We developed an image-based FRAP (iFRAP) technique using a modified real-time microscope and a 488 nm Ar-ion laser. A fractional intensity curve was obtained from the time-lapse images of fluorescence recovery in the bleached spot to determine the diffusion coefficient of fluorescently labeled macromolecules in porous medium. We validated iFRAP through experiments with agar gels (0.5% and 1.5% w/v) containing FITC-Dextrans (10, 70 and 500 kDa MW). Further validation was performed by a Monte Carlo approach, where we simulated the three-dimensional random walk of macromolecules in agar gel model. Diffusion coefficients were deduced from the mean square displacement curves and showed good agreements with those measured by iFRAP.
The refractive index of thin copolymer film was controlled by photo-degradation of chromophores in the copolymer. FTIR and UV/Vis spectroscopy were employed to elucidate the effect of chemical structure on refractive index changes after photobleaching. The decrease of refractive index of the film by photobleaching can be ascribed to the decrease of polarizability of polymer molecules through breakage of C =C bond in the chromophore. Due to the selective photoreaction of the chromophores which align along the film plane, refractive index of the copolymer film measured in TE mode decreases faster than that in TM mode. Polarized ATR-FTIR spectroscopy was used to verify such a difference in refractive index of the film.
This experiment was designed to determine the effect of light quality on the appearance of photobleaching leaves during the cure of Burley Tobacco. The harvested and browned tobacco leaves were exposed to sunlight in pipe houses covered with 8 kinds of color vinyls (white, red, black, yellow, purple, orange, blue, green), and exposed to ultraviolet rays(20W x 3) and infrared rays (150W x 2) in curing chamber (1.2 x 1.2 x 1.2m). Photobleaching occured more at lower position leaf and after the leaves being browned when the curing was done in sunlight under a transparent vinyl. But photobleaching leaves were 5-6% of total cured leaves in sunlight under all kinds of color vinyl houses. It seems that photobleaching mainly induced by ultrabiolet rays of sunlight, and humidity too influenced. Yellow, orange and purple vinyl were durable and effective as shading material of color vinyls. since white and red vinyl tore easily in two monthes in strong sunlight and under black and blue vinyl houses curing period was longer than others.
Recent denaturation experiments of bacteriorhodopsin (bR) in the dark and under illumination at high temperatures revealed that irreversible thermal bleaching occurs above ~ 70°C and the preceding reversible structural changes in the dark above 60°C are closely related to irreversible photobleaching observed in the same temperature range (Yokoyama et al. (2002). J Biochem. 131,785). In this study, structural properties of bacteriorhodopsin (bR) at high temperatures were extensively probed by hydroxylamine reactivity with the Schiff base in the dark and hydrogen-deuterium (H-D) exchange in the peptide groups. In the Arrhenius plot from kinetics measurements of the hydroxylamine reaction, a good linear relationship between the reaction time constant and the inverse of the absolute temperature was observed below 60°C, while significant increase started above 60°C, suggesting that remarkable increase in water accessibility of the Schiff base in the temperature region. FT-IR spectroscopic studies on the H-D exchange suggested increase in the deuterium exchanges rate of the peptide hydrogen in the same temperature region.
Ultrastructural and anatomical features of the leaf were studied in Panax ginseng C.A. Meyer(ginseng). The ginseng leaf poorly developed palisade tissue and the size of mesophyll cell was larger and the chloroplast density was lower than that of Glycine max (soyben). Ginseng chloroplast was filled with highly stacked grana and condensely-arrayed thylakoid, so the stroma space was hardly absorbed. However, ginseng mesophyll tissue and chloroplast array did not reduce light energy entering the mesophyll chloroplast, and the high LHCP/CP ratio of ginseng thylakoid resulted in the absorption of excess photon. It is reasonable to assume that 1O1-photogenearation by excess light energy partially resulted from the anatomical and ultrastructural characteristics of the ginseng leaf.
This study investigated the relations between the photosynthetic rate and the activities of antioxidatile enzymes, glutathione reductase, ascorbate free radical reductase, ascorbate peroxidase, glutathione peroxidase, and ascorbate oxidase, in the leaves of Panax ginseng. Under the normal cultivation condition, Panax in showed lower g1utathione reductase and ascorbate free radical reductase activities the Glycine max. But P ginseng showed higher 91utathione Peroxidase, ascorbate Peroxidase, and ascorbate oxidase activities than C. Panax. Therefore, P. ginseng showed weak activities of reductases for the reduction of the oxidized antioxidants. Under the light intensity of 25 KLux, the reductases showed a decrease of over 75% after 24 hours. But the peroyoxidases decreased about 40%. These results showed that the decrease of reductases acitivities was consistent with the decrease of photosynthetic rate. Therefore, we consider that the regulation of antioxidative enzymes or the application of exogenous antioxidants will be effective means for the protection of photodamage in p. ginseng.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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