• 한국식물병리학회지
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• 제14권6호
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• pp.583-588
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• 1998

This study was conducted to investigate the potential of nitrate-nonutilizing mutants (nit mutants) in ecological studies of Fusarium disease of strawberry. Nit mutants of Fusarium oxysporum from strawberry were easily formed on chlorate-containing media. Nit mutants were assigned to three phenotypic classes, nit1, nit3, and NitM, on the basis of their growth on media containing one of the following five different nitrogen sources ; nitrate, nitrite, hypoxanthine, ammonium and uric acid. Frequency of nit mutation and proportion of three phenotypes of nit mutants depended on the isolate. Mutation rate was 45.6% and ranged from 15.0% to 95.0%. The frequency of nit1 mutants was higher than that of nit3 or NitM. The complementary reaction between nit1 and NitM was higher than that of other combination. There has been no complementary response observed between nit3 and nit3. The nit mutants showed similar growth pattern as the that of wild type isolate on potato sucrose agar and potato sucrose liquid media. Most of the mutants retained pathogenicity, and maintained their phenotypes even after two year preservation through subculture on slanted PSA at room temperature. Nit mutants were selctively isolated from infested soil and infected plants on the selective medium (MMCPA) containing potassium chlorate with their original phenotypes, while naturally occurring isolates of Fusarium oxysporum were not grow on the medium. On the contrary, nit mutants showed very slight growth on the medium (MMPA) containing nitrate as a sole nitrogen source, and therefore could be distinguished from wild type isolate.

• 아시안잔디학회지
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• 제25권2호
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• pp.171-176
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• 2011

동전마름병을 일으키는 Sclerotinia homoeocarpa는 한국에서 가장 일반적인 한지형 잔디 병원균이다. 경기도, 충청남도, 전라북도, 경상북도 등 다양한 지역에서 분리한 13개 균주로부터 유도된 nit 변이균주를 이용하여 의한 체세포화합성군(vegetative compatibility group, VCG) 평가가 이루어졌다. 돌연변이주는 질소동화작용에 근거하여 nit1, nit2, nit3, NitM 등 4가지 유형으로 분류되었다. 균주간에 돌연변이주 발생정도는 크게 차이가 있었으며 최대 15개의 변이주를 생산한 균주가 있는 반면에 전혀 형성하지 못한 균주도 존재하였다. 선택배지에서 4가지 돌연변이주 유형 중에 nit1과 NitM의 발생빈도(80%)가 높았으며, nit2와 nit3은 발생빈도가 매우 낮았다. 한 개의 큰 체세포화합성군 그룹과 4개의 작은 그룹이 18개 돌연변이주로부터 결정되었다. Nit 변이균주를 이용하여 의한 VCG 평가는 매우 효율적이었으며, 향후 한국의 Sclerotinia homoeocarpa균의 효율적 관리를 위한 생태학적 역학적인 면을 연구하기 위해서는 보다 많은 지역으로부터 분리된 균주의 평가가 필요하다.

• The Plant Pathology Journal
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• 제15권1호
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• pp.53-56
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• 1999

Fifty-three isolates of Fusarium graminearum were obtained from corn and barley samples in several provinces of Korea. Gas chromatography-mass spectrometric analysis of trichothecenes produced by these isolates revealed that 37 and 16 isolates were nivalenol (NIV)- and deoxynivalenol (DON)-chemotypes, respectively. Two hundred and seventy-five nitrate-nonutilizing (nit) mutants were obtained from the isolates. Of these mutants, 187 were identified as nit1, nit3, or NitM, but 88 could not be identified as one of these classes. The highest frequency of nit mutant was nit1 (65%), followed by nit3 (20%) and NitM (15%). Higher frequency of NitM was observed in DON-chemotypes than in NIV-chemotypes. The mutants were used for vegetative compatibility group (VCG) analysis by examining heterokaryosis using complementary mutant pairs. No heterokaryon formation was observed among all 1,248 pairwise combinations, suggesting that all isolates tested belong to different VCGs. Higher frequency of self-incompatibility was observed in NIV-chemotypes than in DON-chemotypes. These results suggest that the like-lihood of asexual genetic recombination may be very low I F. graminearum under the field condition.

• 한국식물병리학회지
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• 제12권4호
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• pp.395-401
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• 1996

국내의 고추, 사과, 포도, 스타티스(statice)에서 분리한 Glomerella cingulata 균주들의 병원성과 체세포화 합성군(vegetative compatibility group : VCG)과의 관계를 조사하였다. 사과, 포도, 스타티스에서 분리된 균주들은 전기주에 모드 병원성을 나타내었으나 고추에는 병원성이 없었다. 한편, 고추에서 분리된 균주들은 무상처접종시 병원성을 나타내지 못하였다. Nitrate nonutilizing(nit) mutant는 1.5%의 KClO\ulcorner을 첨가한 최소배지에서 선발하였다. nit mutnat들은 nit1, nit2, nit3, nitM의 4가지 표현형 중 하나에 속하였다. VCG는 표현형이 다른 nit mutan간의 대치배양을 통해 결정하였는데 사과, 포도, 스타티스에서 분리한 균주들간에는 같은 VCG를 나타낸 반면 고추에서 분리된 균주들은 다른 VCG로 나타났다. 따라서 G. cingulata 균주들의 체세포화합성은 병원성과 밀접하게 관련되어 있음을 알수 있었다. 또한 동일한 VCG에 속하며 기주가 다른 균주들의 대치배양시 heterokaryon을 형성했으나 자낭을 형성하지는 않았다.

• 대한정형외과스포츠의학회:학술대회논문집
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• 대한정형외과스포츠의학회 2004년도 The 7th korea-japan joint meeting of orthopaedic sports medicine
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• pp.54-54
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• 2004

• The Plant Pathology Journal
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• 제16권5호
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• pp.247-251
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• 2000

Latent infections of healthy-appearing oaks of Hypoxylon atropunctatum complicates field studies by interfering with inoculation experiments to follow pathogenesis, fungal development and reproduction of this canker rot fungus. Mutants with unique and easily scorable phenotypes would be useful for inoculation studies. There is a broad range in the capacity of wild-type isolates to utilize nitrate as a sole nitrogen sources. Several types of nitrate-nonutilization mutants (nit1, Nit3, NitM) were selected from nitrate-utilizing wild-type isolates. Also, a few mutants of Hypoxylon atropunctatum were selected that could only grow poorly on basal medium supplemented with various nitrogen sources and even on yeast extract agar. These unknown mutants need to be characterized further. Nit mutants of Hypoxylon atropunctatum were readily selected, grew well and were recovered after inoculation into oak stems. These results suggest that nit mutants could be useful for inoculation studies in trees that contain latent infections.

• Journal of Plant Biotechnology
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• 제40권4호
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• pp.198-202
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• 2013

환경스트레스 저항성 오이 형질전환체 생산을 위해서 오이 "Eunsung" 품종의 자엽절 절편을 Nit유전자를 포함하는 pPZP211와 pCAMBIA2300 발현벡터로 각각 형질전환된 Agrobacterium과 공동 배양하였다. 공동배양 후 형질전환체 선발, 형질전환체 유도, 신장, 유식물체 생산 등은 자엽절 절편을 이용하는 CTM방법(Jang et al. 2011)에 따라 수행하였다. 발현벡터에 따라 선발배지에 100 mg/L paromomycin을 첨가하여 선발과정을 거쳤으며, 선발배지에서 3 cm크기의 shoot를 유도한 후 PCR, Southern, RT-PCR 및 Northern분석을 통해 형질전환 여부를 확인하였다. 공동배양 한 2,547개의 자엽절 절편으로부터 105개체(4.12%)가 선발배지로부터 얻어졌으며, 그들 중 45개체(1.77%)만이 Nit유전자의 PCR product를 얻을 수 있었다. 오이 genome에 Nit유전자의 도입여부를 확인하기 위하여 45개체에 대한 Southern분석을 수행한 결과 각각 39개체(1.53%)서 확인할 수 있었으며, 이중 오직 6개체(0.24%)에서만 Nit유전자가 안정적으로 발현되고 있음을 RT-PCR과 Northern분석을 통해 확인하였다. 이러한 결과는 Nit유전자가 오이 genome에 안정적으로 도입 및 발현되고 있음을 보여 주고 있음을 알 수 있었다.

• The Plant Pathology Journal
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• 제30권4호
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• pp.384-396
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• 2014

Vegetative compatibility groups (VCGs) are determined for many fungi to test for the ability of fungal isolates to undergo heterokaryon formation. In several fungal plant pathogens, isolates belonging to a VCG have been shown to share significantly higher genetic similarity than those of different VCGs. In this study we sought to examine the relationship between VCG and genetic similarity of an important cool season turfgrass pathogen, Sclerotinia homoeocarpa. Twenty-two S. homoeocarpa isolates from the Midwest and Eastern US, which were previously characterized in several studies, were all evaluated for VCG using an improved nit mutant assay. These isolates were also genotyped using 19 microsatellites developed from partial genome sequence of S. homoeocarpa. Additionally, partial sequences of mitochondrial genes cytochrome oxidase II and mitochondrial small subunit (mtSSU) rRNA, and the atp6-rns intergenic spacer, were generated for isolates from each nit mutant VCG to determine if mitochondrial haplotypes differed among VCGs. Of the 22 isolates screened, 15 were amenable to the nit mutant VCG assay and were grouped into six VCGs. The 19 microsatellites gave 57 alleles for this set. Unweighted pair group methods with arithmetic mean (UPGMA) tree of binary microsatellite data were used to produce a dendrogram of the isolate genotypes based on microsatellite alleles, which showed high genetic similarity of nit mutant VCGs. Analysis of molecular variance of microsatellite data demonstrates that the current nit mutant VCGs explain the microsatellite genotypic variation among isolates better than the previous nit mutant VCGs or the conventionally determined VCGs. Mitochondrial sequences were identical among all isolates, suggesting that this marker type may not be informative for US populations of S. homoeocarpa.

• 한국지반공학회:학술대회논문집
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• 한국지반공학회 1993년도 지하공간 건설기술에 관한 서울 심포지움 논문집
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• pp.223-234
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• 1993

• 해양환경안전학회지
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• 제18권5호
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• pp.388-397
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• 2012

본 연구에서는 3차원수치파동수조에 규칙파뿐만 아니라 안정적인 불규칙파가 조파될 수 있는 새로운 조파시스템 3D-NIT(3-Dimensional Numerical Irregular wave Tank)모델을 제안한다. 그의 타당성을 검증하기 위하여 1) 조파지점에서 계산파형과 목표파형을 비교 검토하고, 2) 경사수심역에 설치된 호안구조물을 대상으로 산정된 기존 월파량에 대한 실험치와 비교 검토하며, 3) 연직원주 구조물에 작용하는 파력 및 구조물에 의한 파랑변형의 해석에 적용하여 기존의 수치 및 수리실험결과와 비교한다. 이상의 결과를 기초로 3D-NIT모델을 경사수심역에 설치된 원주구조물에 작용하는 쇄파력의 해석에 적용하여 입사파고, 구조물의 이격거리 등에 따른 작용쇄파력의 특성을 규명하고, 더불어 국내현장의 특수방파제에 적용하여 반사율, 월파량 등을 검토하였다. 그 결과 본 연구에서 제안하는 3D-NIT모델을 이용한 수치실험결과는 기존의 수리모형실험을 잘 재현하고 있음을 확인하였고 복잡한 형상을 갖는 해안구조물의 해석에 적용할 수 있음이 확인되었다.