Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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2004.11a
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pp.319-322
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2004
소프트웨어 기술은 웹과 인터넷의 대중화로 소프트웨어의 품질 개선과 다양한 요구 변화에 효율적으로 대응하기 위해 급격히 발전하고 있는 추세이다. 완성된 시스템이 다양한 스테이크 홀더들의 품질에 대한 요구를 만족시키는 시스템인지의 여부를 결정하는 소프트웨어 아키텍처의 평가는 매우 중요한 부분이다. 소프트웨어 아키텍처는 프로젝트 초기의 설계 결정사항에 대한 산출물로써 시스템과 프로젝트에 많은 영향을 미치며 특정 시스템의 품질 속성은 주로 소프트웨어 아키텍처에 의해 결정된다. 본 논문에서는 품질 속성을 기반으로 체계적으로 아키텍처를 평가할 수 있는 프로세스를 제시하고 이 프로세스를 NextGen POS 시스템에 적용시켜 보았다.
Journal of the Korean Society for information Management
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v.28
no.3
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pp.13-30
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2011
Faceted navigation has brought a lot of changes to traditional library catalog and is one of the resource discovery interfaces in next-gen library catalog. Faceted navigation usually divides too much retrieved results into some relevant facets for user's convenient navigation. The faceted navigation of 9 libraries adopting resource discovery interfaces was analyzed in this article. The terms are much broader or different from the users' terms so that the users can't properly use the facets. It is essential to maintain consistency with using the terms to provide users with faceted navigation service and this study has found how exactly authority work was done in analysis of the author facets. Also, public libraries introducing faceted navigation need to consider including some facets for various users and university libraries need to consider detailed division of resource types.
Park, Chang-Hyun;Ahn, Hee-Jae;Choi, Dong-Hoon;Jung, Cheul-Kyu
Journal of the Computational Structural Engineering Institute of Korea
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v.23
no.5
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pp.501-507
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2010
Structural optimization is performed to minimize the weight of a RC building structure, which has eight floors above ground and three underground, under gravity, wind, and seismic loads. Design optimization problem is formulated to find the values of the design variables that minimize the volume while satisfying various design and side constraints. To solved the optimization problem posed, several design techniques equipped in PIAnO, a commercial PIDO tool, are used. DOE is used to generate training points and structural analysis is performed using MIADS Gen, a general-purpose structural analysis CAE tool. Then, meta-models are generated from structural analysis results and accuracies of meta-models are evaluated. Next, design optimization is performed by using the verified meta-models and optimization technique equipped in PIAnO. Finally, we obtained optimal results, which could demonstrate the effectiveness of our design method.
Kang, Se Won;Park, So Young;Patnaik, Bharat Bhusan;Hwang, Hee Ju;Kim, Changmu;Kim, Soonok;Lee, Jun Sang;Han, Yeon Soo;Lee, Yong Seok
The Korean Journal of Malacology
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v.31
no.3
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pp.243-247
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2015
A stand-alone BLAST server is available that provides a convenient and amenable platform for the analysis of molluscan sequence information especially the EST sequences generated by traditional sequencing methods. However, it is found that the server has limitations in the annotation of molluscan sequences generated using next-generation sequencing (NGS) platforms due to inconsistencies in molluscan sequence available at NCBI. We constructed a web-based interface for a new stand-alone BLAST, called PANM-DB (Protostome DB) for the analysis of molluscan NGS data. The PANM-DB includes the amino acid sequences from the protostome groups-Arthropoda, Nematoda, and Mollusca downloaded from GenBank with the NCBI taxonomy Browser. The sequences were translated into multi-FASTA format and stored in the database by using the formatdb program at NCBI. PANM-DB contains 6% of NCBInr database sequences (as of 24-06-2015), and for an input of 10,000 RNA-seq sequences the processing speed was 15 times faster by using PANM-DB when compared with NCBInr DB. It was also noted that PANM-DB show two times more significant hits with diverse annotation profiles as compared with Mollusks DB. Hence, the construction of PANM-DB is a significant step in the annotation of molluscan sequence information obtained from NGS platforms. The PANM-DB is freely downloadable from the web-based interface (Malacological Society of Korea, http://malacol.or/kr/blast) as compressed file system and can run on any compatible operating system.
International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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v.1
no.2
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pp.165-169
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2000
We have constructed cDNA library from the larvae whole body of the firefly, Pyrocoelia rufa. Single direct partial sequencing of anonymous cDNA clones was performed to obtain genetic information on the firefly, P. rufa, of which genetic information is currently not available. This expressed sequence tags (EST) analysis of the 54 clones (54%) showed significant homology to the known genes registered in GenBank. Of these clones, twenty-four were related to the known insect genes, but these clones were not matched to previously identified firefly genes. Putative functional categories of these clones showed that the next abundant genes were associated with energy metabolism.
In this paper, we propose the acceleration method of the DDR-SSD RAID level 5. The DDR-SSD is the storage device of the Next Generation Storage(NGS) system. The DDR-SSD has different characteristics with HDD and Flash SSD. That's why the DDR-SSD RAID level 5 does not provide the best performance when the normal acceleration method is used. In this paper, to accelerate the DDR-SSD RAID level 5 operation, we propose the parity cache and the architecture of the parity cell. The parity cache stores only parity blocks. This acceleration method proposed in this paper reduce the number of the disk access and the overhead of parity operations.
Iqbal Muhammad;Laksmono Agus Mahardika Ari;Derry Pratama;Howon kim
Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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2024.05a
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pp.235-238
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2024
This paper investigates the integration of ARIA cryptography within hardware secure modules to bolster IoT security. We present a comparative analysis of two prominent IoT communication protocols, MQTT and LwM2M, augmented with ARIA cryptography. The study evaluates their performance, security, and scalability in practical IoT applications. Our experimental setup comprises FPGA-enabled hardware secure modules interfaced with Raspberry Pi acting as an MQTT and LwM2M client. We utilize the Mosquitto MQTT server and an LwM2M server deployed on AWS IoT. Through rigorous experimentation, we measure various performance metrics, including latency, throughput, and resource utilization. Additionally, security aspects are scrutinized, assessing the resilience of each protocol against common IoT security threats. Our findings highlight the efficacy of ARIA cryptography in bolstering IoT security and reveal insights into the comparative strengths and weaknesses of MQTT and LwM2M protocols. These results contribute to the development of robust and secure IoT systems, paving the way for future research in this domain.
The family Platycephalidae is a taxonomic group of economically important demersal flathead fishes that predominantly occupy tropical or temperate estuaries and coastal environments of the Indo-Pacific oceans and the Mediterranean Sea. In this study, we for the first time analyzed the complete mitochondrial genome (mitogenome) of the flathead Platycephalus cultellatus Richardson, 1846 from Vietnam by Next Generation Sequencing method. Its mitogenome was 16,641 bp in total length, comprising 13 protein-coding genes (PCGs), two ribosomal RNA genes, and 22 transfer RNA genes. The gene composition and order of the mitogenome were identical to those of typical vertebrates. The phylogenetic trees were reconstructed based on the concatenated nucleotide sequence matrix of 13 PCGs and the partial sequence of a DNA barcoding marker, cox1 in order to determine its molecular phylogenetic position among the order Scorpaeniformes. The phylogenetic result revealed that P. cultellatus formed a monophyletic group with species belonging to the same family and consistently clustered with one nominal species, P. indicus, and two Platycephalus sp. specimens. Besides, the cox1 tree confirmed the taxonomic validity of our specimen by forming a monophyletic clade with its conspecific specimens. The mitogenome of P. cultellatus analyzed in this study will contribute valuable information for further study on taxonomy and phylogeny of flatheads.
The applications of DNA barcoding have a wide range of uses, such as in taxonomic studies to help elucidate cryptic species and phylogenetic relationships and analyzing environmental samples for biodiversity monitoring and conservation assessments of species. After obtaining the DNA barcode sequences, sequence similarity-based homology analysis is commonly used. This means that the obtained barcode sequences are compared to the DNA barcode reference databases. This bioinformatic analysis necessarily implies that the overall quantity and quality of the reference databases must be stringently monitored to not have an adverse impact on the accuracy of species identification. With the development of next-generation sequencing techniques, a noticeably large number of DNA barcode sequences have been produced and are stored in online databases, but their degree of validity, accuracy, and reliability have not been extensively investigated. In this study, we investigated the extent to which the amount and types of erroneous barcode sequences were deposited in publicly accessible databases. Over 4.1 million sequences were investigated in three largescale DNA barcode databases (NCBI GenBank, Barcode of Life Data System [BOLD], and Protist Ribosomal Reference database [PR2]) for four major DNA barcodes (cytochrome c oxidase subunit 1 [COI], internal transcribed spacer [ITS], ribulose bisphosphate carboxylase large chain [rbcL], and 18S ribosomal RNA [18S rRNA]); approximately 2% of erroneous barcode sequences were found and their taxonomic distributions were uneven. Consequently, our present findings provide compelling evidence of data quality problems along with insufficient and unreliable annotation of taxonomic data in DNA barcode databases. Therefore, we suggest that if ambiguous taxa are presented during barcoding analysis, further validation with other DNA barcode loci or morphological characters should be mandated.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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