• 한국작물학회지
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• 제37권5호
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• pp.476-485
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• 1992

1. 옥수수의 자식계 9계통에 화학적 돌연변이 유기제를 처리하여 얻어진 M$_1$, 식물들은 형태적으로 왜성화, 백색화등 다양한 변이체로 나타났고 생식기관의 변이는 자성개체, 웅성개체, 자웅동화, 다수성들을 보였고 부임개체들이 증가하였다. 2. mutagen의 종자침지처리후 이삭에 수분방지대를 씌웠을때는 3.9-11.2%의 이삭착립율이 나타났으나 이삭당 성숙립수는 3.8-4.3게에 불과하였다. 한편 mutagen의 이삭주입처리에서는 5.1-10%의 착립이삭율과 이삭당 성숙립수는 1.7-6.3이었고 자연수분후 4시간만에 웅사를 절단하였던 이삭들은 착립이삭수가 27%로 증가하였다. 3. Mutagen처리와 수분방지처리에서 형성된 종자들의 조직학적 관찰은 aposporous apomictic reproduction이나 adventitious embryony의 가능성을 보여주었고 M2식물의 근단염색체를 조사하였을때 모두 2배체로서 확인되었다. 4. 무배합생식성 종자에서 출현된 식물들은 초장의 변이계수가 4-6%로 비교적 낮았고 외부형태상의 균일성을 보여주었다. 그러나 이들 무배합생식성과 결부된 표식형질을 발견할수는 없었다.

• 식물병연구
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• 제18권2호
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• pp.73-79
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• 2012

Phytophthora katsurae는 밤나무 잉크병의 원인이 되는 병원성 균류이다. P. katsurae를 검출하기 위하여 2개의 duplex PCR primer set을 제작하였다(SOPC 1F/1R+KatI 3F/5R, SOPC 1-1F/1-1R+KatI 3F/5R). SOPC 1F/1R과 SOPC 1-1F/1-1R primer pair는 sequence characteristic amplification regions(SCAR)를 이용하여 제작하였고, KatI 3F/5R primer pair는 internal transcribed spacer(ITS) 부위로부터 제작하였다. 추출한 genomic DNA를 1 mg/ml에서 1 ng/ml까지 10배씩 순차적으로 희석하여 균사량에 따른 Duplex PCR의 민감도를 확인한 결과, 2개의 primer set은 각각 1 ${\mu}g/ml$와 100 ng/ml까지 검출이 가능하였다. 유주포자를 $1{\times}10^6$부터 $1{\times}10^2$ cells/ml까지 10배씩 순차적으로 희석하고 genomic DNA를 추출하여 P. katsurae의 유주포자량에 의한 검출 한계를 확인한 결과, 2개의 primer set 모두 $1{\times}10^5$ cells/ml까지 검출할 수 있었다. 각각의 primer set은 PCR 검출을 실시하였을 때 P. katsurae 균주에서만 PCR 산물이 증폭된 반면에, Phytophthora 16종에서는 P. katsurae에 특이적인 PCR 증폭산물이 생성되지 않았다. 따라서, 2개의 primer set을 이용한 Duplex PCR은 P. katsurae의 신속하고 효과적인 검출에 유용하게 활용될 수 있을 것이다.

• Journal of Ginseng Research
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• 제30권3호
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• pp.106-111
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• 2006

Adverse changes in individual's biochemistry under heavy metal stress are directly linked with its metabolic activity and health status. The present investigation highlights the differences in protecting role of Panax ginseng extract against mercuric chloride induced alterations in serum proteins. The assessment was based on dividing fifty albino rats into two sets, one for acute and the other for sub-acute study. All the sets had five groups with five albino rats in each i.e. control group, mercuric chloride treated group, Panax ginseng extract treated group, mercuric chloride followed by Panax ginseng extract treated group and Panax ginseng extract followed by mercuric chloride treated group. Mercuric chloride was given orally 0.926 mg/kg body weight for acute set and 0.044 mg/kg body weight for sub-acute set after LD50 (9.26 mg/kg body weight) determination by probitt analysis. 10 mg/kg body weight Panax ginseng extract was given in both acute and sub-acute sets after incorporating safety trials. The control group received tween-20 and distilled water only. The result exhibited significantly reduction (P<0.01) in serum protein, albumin and globulin following mercuric chloride intoxication whereas significant (P<0.01) enhancement in other groups with Panax ginseng extract as an ingredient confirming its protective role. All serum samples were also electrophoresed in 10% SDS with standard marker using discontinuous buffering system. Gradual disappearance of alpha-2 and beta-1 globulin bands from electrophoretic pattern was observed, while a single sharp band was observed between beta-2 and gamma globulin in serum protein pattern of acutely mercuric chloride treated rats. However, this band could not be visualized in sub-acute studies. Panax ginseng extract exhibits a better protection after acute intoxication.

• Journal of Crop Science and Biotechnology
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• 제10권2호
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• pp.98-105
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• 2007

Phylogenetic relationships in Korean watermelons were evaluated by genetic similarity coefficients using 15 SSR(simple sequence repeat), 14 SCAR(sequence characterized amplified region) and 14 CAPS(sequence characterized amplified region) markers. The SSR markers were selected from previously reported melon and watermelon SSRs through testing polymorphisms within a set of commercial $F_1$ varieties. The SCAR and CAPS markers were developed from polymorphic AFLP(amplified fragment length polymorphism) markers between inbred lines 'BN4001' and 'BN4002'. From the AFLP analysis, 105 polymorphic fragments were identified between the inbred lines using 1,440 primer combinations of EcoRI+CNNN and XbaI+ANNN. Based on the sequencing data of these polymorphic fragments, we synthesized sequence specific primer pairs and detected clear and reliable polymorphisms in 27 primer pairs by indels(insertion/deletion) or RFLP(restriction fragment length polymorphism). A total of 43 sequence-based PCR markers were obtained and polymorphic information content(PIC) was analyzed to measure the informativeness of each marker in watermelon varieties. The average PIC value of SCAR markers was 0.41, which was similar to that of SSR markers. Genetic diversity was also estimated by using these markers to assess the phylogenetic relationships among commercial varieties of watermelon. These markers differentiated 26 Korean watermelon varieties into two major phylogenetic groups, but this grouping was not significantly correlated with their morphological and physiological characteristics. The mean genetic similarity was 66% within the complete set of 26 commercial varieties. In addition, these sequence-based PCR markers were reliable and useful to identify cultivars and genotypes of watermelon.

• 한국균학회지
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• 제46권2호
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• pp.186-192
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• 2018

PCR 기술을 이용하여 고추와 토마토의 탄저병을 일으키는 Colletotrichum coccodes 균을 빠르고 정확하게 검출하는 방법을 개발하였다. Colletotrichum 13종 22개 균주로 부터 translation elongation factor 1 alpha 유전자를 분석하여 C. coccodes에 특이적인 coccoTef-F/cocco Tef-R primer set를 제작하였다. 제작된 primer를 사용한 결과 일반 PCR 방법으로 10 ng, real-time PCR 방법으로는 10 pg 수준에서 C. coccodes가 특이적으로 검출이 가능하였다. 인공적으로 C. coccodes에 감염시킨 고추와 토마토 종자에서도 일반 PCR 방법과 real-time PCR 방법 모두 C. coccodes검출이 가능하였다. 본 연구에서 개발한 PCR 방법은 수출입되는 종자에서 신속하고 정확하게 탄저병균 C. coccodes를 특이적으로 검출하는데 활용될 수 있을 것이다.

• Mycobiology
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• 제36권3호
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• pp.161-166
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• 2008

The retrotransposon marY1 is a gypsy family retroelement, which is detected ubiquitously within the fungal taxonomic groups in which mushrooms are included. To utilize marY1 as a molecular marker for the DNA fingerprinting of mushrooms, oligonucleotides marY1-LTR-L and marY1-LTR-R were designed on the basis of highly conserved regions from the multiple sequence alignment of 30 marY1 sequences retrieved from a nucleotide sequence database. In accordance with $\underline{Re}trotransposon$ $\underline{M}icrosatellite$ $\underline{A}mplified$ $\underline{P}olymorphism$ (REMAP) fingerprinting methodology, the two oligonucleotides were utilized together with the short sequence repeat primers UBC807 and UBC818 for polymerase chain reaction using templates from different mushroom genomic DNAs. Among the tested oligonucleotides, the marY1-LTR-L and UBC807 primer set yielded the greatest amount of abundance and variation in terms of DNA band numbers and patterns. This method was successfully applied to 10 mushroom species, and the primer set successfully discriminated between different commercial mushroom cultivars of the same strains of 14 Pleurotus ostreatus and 16 P. eryngii. REMAP reproducibility was superior to other popular DNA fingerprinting methodologies including the random amplified polymorphic DNA method.

• 한국정보통신학회논문지
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• 제11권12호
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• pp.2241-2248
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• 2007

본 논문에서는 웹 기반 분산 시스템을 이용하여 전문가들 사이의 가상 협동 시스템을 구현하였다. 토의 이전에 모든 참가자들에게 필요한 정보를 전달하기 위하여 제안된 시스템은 발표 자료에 멀티미디어 자료를 쉽고 효과적으로 첨가할 수 Synchronous Multimedia Integration Language(SMIL)를 사용하여 발표 자료를 쉽게 제작할 수 있다. 참가자들은 제 안된 이미지에 대하여 문자를 이용하여 토의 할 수 있다. 디지털 이미지에서 관심 있는 영역을 나타내기 위하여 참가자들의 의견에 관계된 점 또는 선분 및 다양한 종류의 표식과 같은 공간 요소를 동적으로 지정 또는 삭제 할 수 있다. 토의 동안 디지털 이미지에 관계된 공간 요소는 물론 전문가의 의견을 저장하기 위하여 XML 파일이 사용되며 후에 정보를 접근할 수 있다. 참가자들은 임의의 폐곡선을 이용하여 이미지에 관심 있는 영역을 선택하고 그에 대한 저장된 정보를 접근할 수 있다.

• 대한본초학회지
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• 제29권3호
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• pp.19-26
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• 2014

Objectives : Aucklandiae Radix (Muxiang) one of important herbal medicines in oriental medicine, is defined as the dried root of Aucklandia lappa (Asteraceae). Owing to the similarities in the morphology and name, Inulae Radix (Tu-Muxiang) and Vladimiriae Radix (Chuan-Muxiang) as well as Aristolochiae Radix (Qing-Muxiang) originated from other medicinal plants are often used as substitutes and/or adulterants of Aucklandiae Radix. Therefore, a reliable authentication of these herbal medicines is necessarily for the public health and prevention of misuse. Methods : 32 samples of medicinal plants supplying Aucklandiae Radix, Inulae Radix, Vladimiriae Radix, and Aristolochiae Radix were collected in Korea and China. The ITS (Internal transcribed spacer) nucleotide sequences of samples were determined. The PCR primers to amply DNA marker of each herbal medicine were designed basing on the specific ITS regions showing differences in the sequences among medicinal plants. Results : Primer set Al R/IS F designed in this work amplified 220 bp PCR product only in samples of Aucklandiae Radix. In contrast, primer set Ih F/IS R, Vs R/IS F, and AcR F1/Ac R amplified 250 bp product, 356 bp prouct, and 516 bp product respectively to identify Inulae Radix, Vladimiriae Radix, and Aristolochiae Radix. Conclusions : The primers designed basing on the nucleotide sequences of ITS regions appearing differenced in the sequences among medicinal plants amplified the DNA markers for the identification of Aucklandiae Radix, Inulae Radix, Vladimiriae Radix, and Aristolochiae Radix. These herbal medicines were more efficiently identified by multiplex PCR method using all primers in a single PCR process.

• 한국멀티미디어학회논문지
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• 제15권9호
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• pp.1075-1085
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• 2012

영상분할은 의료 임상연구에서 가장 중요한 과정 중의 하나이다. 특히 뇌 MRI영상에서 해마의 위축은 알츠하이머병 진행과정의 초기 특정 표지자로서 해마의 볼륨은 초기 알츠하이머병의 임상적 진단에 도움이 된다. 정확한 볼륨 측정에 있어서 해마 영역의 분할은 중요한 역할을 한다. 하지만 MRI 영상에서 해마영역은 낮은 대조도, 낮은 신호 대 잡음 비율, 불연속성 경계의 특징을 보이며, 이러한 특징들은 MRI 영상에서 해마의 정확한 분할을 어렵게 만든다. 이 문제를 해결하기 위해 전처리 과정으로 실험영상에서 관심영역을 선택한 후 반전영상과 원본영상과의 차영상 대조도를 향상시킨 후 비등방성 확산(Anisotropic diffusion) 필터링, 가우시안(Gaussian) 필터링을 수행하였다. 마지막으로 두 개의 레벨 셋(Level Set)기반의 동적 윤곽선(Active Contour) 모델을 결합하여 해마를 분할하는 방법을 제안하였다. 제안된 해마분할방법의 유효성을 다양한 방법으로 평가한 결과 제안된 해마분할방법은 분할 속도와 정확도 면에서 뚜렷하게 개선이 되었음을 확인하였다. 결론적으로 제안된 방법이 해마와 같은 특징을 가진 영역을 분할하는데 적합하다고 할 수 있다. 향후 다른 연구 기법들과 결합할 경우 더욱 잠재성이 증대될 수 있을 것이다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제16권10호
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• pp.1397-1401
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• 2003

The aim of this study was to determine genotypes of four genetic markers and to investigate their association with milk production traits in Brown Swiss cattle imported to Slovakia. The bovine $\kappa$-casein, $\beta$-lactoglobulin, growth hormone and prolactin genotypes of 107 cows were identified by polymerase chain reaction. Effects all four genetic markers on milk, fat, protein and lactose yields and fat, protein and lactose percentage were estimated from a data set of 249 lactations. The frequency of desirable B allele of $\kappa$-casein gene to milk production was 0.46, alleles A of $\beta$-lactoglobulin gene was 0.55, allele and L of growth hormone gene was 0.45 and allele A and B of bovine prolactin gene were 0.61 and 0.39. The results of milk production obtained in our work showed that BB genotypes of $\kappa$-CN gene, AA genotypes of $\beta$-LG gene, LL genotypes of bGH gene were significantly associated with better milk production traits, mainly about the fat content. Association of a bovine prolactin genotypes with milk production were not found.