• 제목/요약/키워드: Marker Technique

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방풍류의 감별을 위한 분자마커의 탐색과 활용 (Development and Application of PCR-based Markers for the Discrimination of Bang-Poong and Related Species)

  • 홍성미;이미영;고재철;고병섭
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제31권1호
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    • pp.1-6
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    • 2004
  • 한약재로 사용되는 방풍류는 절단되어 유통되므로 외부 형태적인 특징만으로 구분하기가 어려워 방풍류로 사용되는 방풍, 식방풍, 석방풍, 갯방풍 등 4종에 대해 PCR에 기초한 RAPD 마커를 이용하여 SCAR 마커를 개발하고자 하였다. RAPD 분석결과 밴드의 패턴은 다양하게 나타났으며 다형성의 밴드 수는 총 215개로 전체 밴드수의 98%였다. RAPD 분석에서 각 방풍류를 구별 할 수 있는 특이적인 밴드를 나타내는 primer는 방풍에서 4개의 primer, 식방풍은 6개의 primer, 석방풍은 4개의 primer, 갯방풍은 6개의 primer를 선발하였고, 그 중 특히 primer 425는 4종의 방풍류의 감별에 유용하였고, 이를 이용하여 SCAR마커로 전환하는데 이용하였다. 특이적인 단편을 클로닝하여 염기서열 분석으로 특이 primer를 제작하고 제작된 primer로 방풍류 시료 16개에 적용하였을 때, 국내의 야생에서 주로 자생하는 석방풍은 215 bp, 그리고 국내에서 가장 많이 재배 또는 생산되는 갯방풍은 177 bp와 300 bp에서 뚜렷하게 나타났다. 따라서 갯방풍과 석방풍의 감별 가능성을 제시할 수 있으며 개발된 SCAR 마커를 이용하여 시중에 유통되고 있는 방풍류 건조약재의 감별에 유용한 마커로 활용될 수 있을 것이다.

압전 마이크로캔틸레버 질량센서를 이용한 정량적 알파태아단백 검출 (Quantitative Alpha Fetoprotein Detection with a Piezoelectric Microcantilever Mass Sensor)

  • 이상규;조종윤;이열호;전상민;차형준;문원규
    • 비파괴검사학회지
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    • 제31권5호
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    • pp.487-493
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    • 2011
  • 비표지 방식의 압전 마이크로캔틸레버 질량센서를 이용하여 간세포암의 혈청표지물질인 알파태아단백(alpha fetoprotein, AFP)을 정상 농도인 10 ng/ml까지 정량적으로 검출하였다. 압전 마이크로캔틸레버 질량센서는 캔틸레버의 질량변화에 의하여 센서의 공진주파수가 변화되는 원리를 이용하여 센서에 붙은 물질의 질량을 측정하며, 센서의 공진주파수는 컨덕턴스 스펙트럼을 이용하여 전기적으로 측정한다. 제작된 센서는 공진 주파수가 약 1.34 MHz, 질량 민감도가 약 175 Hz/pg이며 단백질이 붙을 때 캔틸레버의 표면 스트레스 변화에 대한 센서의 공진 주파수 변화를 줄일 수 있도록 설계되어 질량센서로써 신뢰도를 높였다. 'Dip and dry' 방법으로 캔틸레버의 프로브 영역을 시약과 반응시켜서 AFP 항체를 고정화하고 AFP 항원을 검출하는 실험을 수행하였다. 10 ng/ml과 50 ng/ml농도의 항원에서 10분간 항원-항체 면역반응을 시켰을 때 센서에 검출된 항원의 질량이 각각 6.02 pg과 10.67 pg이다.

진행된 두경부암 환자에서 혈청 SCC 항원, CA 19-9, CA 125, DNA Microsatellite 변이와 재발 여부와의 관계 (Relationship between SCC Antigen, CA 19-9, CA 125 and DNA Microsatellite Alterations and Recurrence in Advanced Head and Neck Cancer Patients)

  • 최종욱;최정철;주형로
    • 대한두경부종양학회지
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    • 제17권2호
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    • pp.148-154
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    • 2001
  • Objectives: This study was designed to investigate the significance of serum SCC antigen, CA 19-9, CA 125 level and DNA microsatellite alterations (MSA) as prognostic factors and indicators for recurrences in the pre-treatment and post-treatment state, respectively in head and neck cancer patients. Materials and Methods: 120 patients who received curative treatment for head and neck cancer from 1995 to 2000 were followed up successfully, and were analyzed retrospectively. Thirty healthy subjects served as normal controls. Serum SCC Ag levels were measured by microparticle enzyme immunoassay technique via IMX SCC assay, CA 19-9 levels were measured by CA 19-9 RIA test kit, and CA 125 levels were measured by CA 125 IRMA kit. MSA were identified after PCR amplification. Heterozygosity was considered lost if the ratio of one allele was significantly decreased (>50%) in serum DNA compared with normal DNA from lymphocytes. Results: Preoperative tumor markers were higher in cancer patients than control, but not significant. Postoperative SCC Ag levels were lower than preoperative levels. The SCC Ag levels were remained low in no evidence of disease (NED) group, but increased in locoregional recurrence and distant metastasis group. CA 19-9 and CA 125 levels showed no correlation between levels and recurrences and were not decreased significantly after primary tumor removal. MSA were detected in five out of 21 cases, and highly detected in distant metastasis group. Conclusion: SCC Ag seems to be a helpful serum tumor marker for early detection of recurrence and distant metastasis of head and neck cancer after curative treatment. But, CA 19-9 and CA 125 were not reliable markers for head and neck tumors. MSA were not statistically significant because of the small number of study group. However they may be helpful for screening serum molecular markers for early detection of distant metastasis of head and neck cancers.

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PCR-SSCP of Serum Lysozyme Gene (Exon-III) in Riverine Buffalo and Its Association with Lysozyme Activity and Somatic Cell Count

  • Sahoo, Nihar Ranjan;Kumar, Pushpendra;Bhushan, Bharat;Bhattacharya, T.K.;Sharma, Arjava;Dayal, Sanker;Pankaj, Prabhat Kumar;Sahoo, Monalisa
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제23권8호
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    • pp.993-999
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    • 2010
  • Serum lysozyme gene is one of the important genes influencing the immune system as its product can cause lysis of bacterial cell wall by cleaving the peptidoglycan layer. The present investigation on the serum lysozyme gene of Indian riverine buffalo was undertaken with the objectives to identify and characterize single nucleotide polymorphic patterns by PCR-SSCP method as well as to study the effect of different genotypes on serum lysozyme activity and somatic cell count. A total of 280 animals comprising four different famous bubaline breeds (Murrah, Mehsana, Surti and Bhadawari), spread over six different farms across the country were used for this study. A 276 bp (partial intron 2, complete exon 3 and partial intron 3) fragment of lysozyme gene was screened for polymorphism using the SSCP technique. Four genotypes namely AA, AB, BC and AC were observed, out of which BC genotype was found to be the most frequent. Among these three alleles, C allele (0.38) was most prevalent in these populations. Various SSCP allelic variants were cloned for sequencing and sequences were submitted to NCBI Genbank. From the alignment of the nucleotide sequences of various allelic variants, it was found that there were differences in 12 positions among the alleles, out of which maximum variation (at 8 places) was found in the intronic region. The allele A was closer to allele-C than allele-B. Allele B was phylogenetically equidistant from both of the other alleles. Mean lysozyme activity determined in serum samples of different animals of Murrah buffalo was $27.35{\pm}2.42\;{\mu}g$ per ml of serum, whereas the mean somatic cell count was $1.25{\pm}0.13{\times}10^5$ cells per ml of milk. The SSCP pattern-wise effects of various genotypes on lysozyme activity and SCC were analyzed. Although the mean values were apparently different in various genotypes, these differences were statistically non-significant. It can be concluded that the riverine buffaloes are sufficiently polymorphic with respect to serum lysozyme gene. The absence of AA genotype in Bhadawari breed of buffalo can be considered as a marker for breed characterization. The difference of four nucleotides in exon-3 indicates high selection pressure on the gene.

RAPD 방법을 이용한 국내 수집 인삼 (Panax ginseng C. A. Meyer)의 다양성 분석 (Analysis of Diversity of Panax ginseng Collected in Korea by RAPD Technique)

  • 서상덕;육진아;차선경;김현호;성봉재;김선익;최재을
    • 한국약용작물학회지
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    • 제11권5호
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    • pp.377-384
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    • 2003
  • 본 연구는 고려인삼 재래종의 유전적 차이를 RAPD marker로 평가하였다. 재래종은 우리나라 주요 인삼재배 단지인 괴산, 금산, 남원, 포천, 양주, 연천, 영주로부터 수집한 인삼에서 10개체를 임의 선발하여 사용하였다. 9개 지역의 90개체를 대상으로 RAPD분석을 한 결과 48개의 primer 중 OPA 7, OPA 13, URP 2, URP 3, UBC 3의 5개 primer가 재현성이 있고 재래종 내 개체간에도 다형성인 band를 보였다. 재래종 집단간보다 재래종 내에서 유전적 다양성이 낮았다. 재래종 집단 간 또는 재래종 집단내의 유전적 차이가 있다는 것은 이 집단들이 헤테로라는 것을 의미한다. 이러한 결과는 우리나라에서 재배중인 고려 인삼은 유전 자원의 혼합으로 헤테로라는 것을 암시한다. 선발된 5개의 primer를 이용하여 90개체를 집괴분석한 결과 국내 재래종 인삼은 5개군으로 그리고 3개의 아군으로 구분되었다. 국내 재래종 인삼은 유전적 변이가 크므로 인삼 육종을 위한 재료로 이용될 수 있을 것이다.

소형 UAV의 산업 응용을 위한 자동 정밀 착륙에 관한 연구 (A Study on Automatic Precision Landing for Small UAV's Industrial Application)

  • 김종우;하석운;문용호
    • 융합정보논문지
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    • 제7권3호
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    • pp.27-36
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    • 2017
  • 최근 군수 산업, 해양수산업, 농업, 공업, 서비스 등의 거의 모든 산업 분야에서는 소형 무인항공기를 사람이 접근하기 힘들거나 CCTV가 설치되지 않은 영역에 대해 공중 촬영이나 근접 비행 등에 활용하고 있다. 또한 소형 무인기 촬영 정보를 토대로 감시나 통제, 또는 관리를 효율적으로 수행하기 위한 응용 연구가 활발하게 이루어지고 있다. 일련의 설정된 작업을 부여하고 자동으로 그 임무를 수행하도록 하는 임무 기반 형태의 작업을 수행하기 위해서는 소형 무인항공기가 안정적으로 비행해야 할 뿐만 아니라 일정시간마다 에너지를 충전할 수 있어야 하며, 또한 무인항공기가 임무 종료 후에는 특정 지점에 자동으로 그리고 정밀하게 착륙해야 할 필요가 있다. 이를 위해서는 소형 무인항공기 자체에서 촬영하는 동영상으로부터 착륙 지점에 설치되어 있는 마커를 탐지하고 인식하는 과정을 통해 착륙을 유도하는 자동 정밀 착륙 방법이 필요하며, 본 논문에서는 저가의 범용 소형 무인비행체를 사용함에 있어서 고 사양을 요구하는 다른 여러 가지 인식 기법들을 사용하지 않고 단순한 탬플릿 매칭 기법을 적용하여서도 정밀하고 안정된 자동 착륙이 가능함을 나타내고, 시뮬레이션과 실제 실험을 통해서 수 센티미터 이내의 오차를 보이는 정밀 착륙이 가능하며, 이는 산업 현장에 유용하게 활용될 수 있음을 보이고자 한다.

CA 15-3 (Mucin-1) and Physiological Characteristics of Breast Cancer from Lahore, Pakistan

  • Begum, Mumtaz;Karim, Sajjad;Malik, Arif;Khurshid, Rukhshan;Asif, Muhammad;Salim, Asmat;Nagra, Saeed Ahmed;Zaheer, Ahmad;Iqbal, Zafar;Abuzenadah, Adel Mohammed;Alqahtani, Mohammed Hussain;Rasool, Mahmood
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제13권10호
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    • pp.5257-5261
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    • 2012
  • Background: High incidence of breast cancer and its fatal effect has reached an alarming stage across the globe, including the third world countries. Many factors have been reported to be associated with the development of breast cancer but detailed structural and functional information is missing. CA 15-3 is one of the known potential tumor marker of breast cancer; however little is known about structure and functional site of this protein. Present study aims to investigate the functional role of CA 15-3 in breast cancer, especially in development and metastasis. Material and Methods: Hundred female breast cancer patients confirmed by histopathological reports were included in the study. Their physiological characters were recorded in a performa. Enzyme linked immunosorbent assay (ELISA) technique was used to estimate serum CA 15-3 level. Immunohistochemistry was done for estrogen (ER), progesterone (PR) and Her2/neu receptors expression. Results: The study revealed the details of physiological characteristics of female breast cancer. Mean age was $37.72{\pm}5.99$ and $55.05{\pm}7.28$ years and serum CA 15-3 (MUC1) level was $60.47{\pm}8.59$ and $63.17{\pm}4.58$ U/ml in pre and post-menopause respectively, and both groups of women had sedentary life style. Their receptor status especially of progesterone, estrogen and HER-2/neu were positive in 50% of premenopausal women and 65% of postmenopausal women. Conclusion: There are multiple physiological factors promoting breast cancer. High serum CA 15-3 level and hormonal imbalance of ER, PR and Her2/neu appears to be the main cause of breast cancer. It may be possible that the functional sites of these proteins may be altered which may increase the chances of metastasis in breast cancer.

돼지에 있어서 정소 생식세포의 이식 기법 개발 (Development of Techniques for Testicular Germ Cell Transplantation in Pigs)

  • 김병각;이용안;김방진;김기중;민관식;이장희;유재원;김인철;류범용
    • Reproductive and Developmental Biology
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    • 제32권3호
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    • pp.193-198
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    • 2008
  • 본 연구는 돼지에 있어서 정원줄기세포를 포함하는 정소세포를 recipient 돼지의 정소 내로 이식할 수 있는 기법을 개발하기 위하여 시행되었다. 공여세포는 $10{\sim}14$일령의 돼지로부터 채취된 정소에서 효소처리법을 이용하여 회수하였고, recipient의 정소 내로 이식하기 전 형광 마커(PHK26)로 표지하였다. 외과적 수술을 통하여 recipient 돼지부터 정소를 꺼낸 후 초음파 기기와 이식 장치를 이용하여 형광표지된 공여세포를 recipient 정소의 세정관 내로 이식하였다. 14주령의 recipient 정소에 $5{\sim}7ml$의 공여 세포부유액을 주입하여 정소 내 50% 이상의 세정관 내로 새포부유액의 주입이 가능하였고, 세포부유액이 주입된 세정관 내에서 형광표지된 정소세포들이 고루 이식되어짐이 관찰되었다. 본 연구에서 개발한 이식 기법을 이용하여 효율적인 정소세포의 이식이 가능함에 따라 향후 돼지 정원줄기세포의 연구 및 활용법 개발에 획기적인 돌파구가 마련될 것으로 기대된다.

$^{201}Tl$$^{99m}Tc-MIBI$에 의한 생존심근의 진단 비교 -재분포영상에 고정관류결손을 보인 환자에서 $^{201}Tl$ 재주사법 및 $^{99m}Tc-MIBI$ 휴식기스캔에 의한 심근섭취 비교- (Comparison of $^{99m}Tc-MIBI$ Myocardial Uptake at Rest with Reinjection and 24-hour after Reinjection Images of $^{201}Tl$)

  • 범희승;김지열;박주형;안영근;정명호;조정관;박종춘;강정채
    • 대한핵의학회지
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    • 제26권2호
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    • pp.274-279
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    • 1992
  • Clinical role of $^{99m}Tc-MIBI$ myocardial scintigraphy in the diagnosis of coronary artery disease (CAD) is now well accepted, however, the role of it in the identification of viable myocardium in patients with chronic CAD has not yet been clarified. To determine the usefulness of rest-injected $^{99m}Tc-MIBI$ scan as a marker of myocardial viability, the regional uptake of this agent at rest was compared with that of $^{201}Tl$ on reinjection and 24 hours after reinjection images. Subject patients were 13 chronic CAD patients who showed irreversible perfusion defect(s) on standard pharmacologic (dipyridamole) stress-redistribution images. Immediately after the redistribution images were obtained, 37 MBq thallium was injected at rest, and images were reacquired at 10 minutes and 24 hours after reinjection. After then 740 MBq $^{99m}Tc-MIBI$ was injected, and 1 hour later rest MIBI myocardial imaging was performed. Five sets of imagestress, redistribution, reinjection, delayed images of thallium, and rest image of MIBI) were then analyzed qualitatively and quantitatively. Left ventricle was arbitrarily divided into 9 segments (apex, basal and apical portions of anterior, septal, inferior, and lateral walls). Seven patients and 30 regions showed a fixed perfusion defect on the stress-redistribution images. Among 30 regions, 15 showed positive uptakes and 6 showed negative uptakes on both $^{201}Tl$ reinjection/delayed images and $^{99m}Tc-MIBI$ rest images. Five regions showed only thallium uptake and were regarded as viable clinically. Of four regions which showed only $^{99m}Tc-MIBI$ uptake, two were regarded as viable, while the other two were regarded as a nonviable scar tissue clinically. In conclusion, $^{201}Tl$ reinjection technique was more reliable in the identification of viable myocardium. However, the role of $^{99m}Tc-MIBI$ in identification of viable myocardium was still remained to be clarified because 2 of 9 regions showed only $^{99m}Tc-MIBI$ uptake and were regarded as viable tissues.

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SSR 마커에 의한 한국 콩 품종의 판별 (Discrimination of Korean Soybean Cultivars by SSR Markers)

  • 김성훈;정종욱;문중경;우선희;조용구;정승근;김홍식
    • 한국작물학회지
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    • 제51권7호
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    • pp.658-668
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    • 2006
  • SSR 마커를 이용하여 우리나라 콩의 품종판별 기술을 확립하기 위하여 1913년부터 2002년까지 국내에서 육성된 콩 91개 품종에 대하여 5개의 SSR마커(Sat_043, Sat_036, Sat_022, Sat_088 및 Satt045)를 이용하여 판별하였다. 판별용으로 이용된 SSR 5개 마커의 총 대립인자수는 64개이었고, 범위는 $10{\sim}15$개이었으며, 평균 대립인자 수는 12.8개이었다. PIC값은 $0.790(Satt045){\sim}0.905(Sat_043)$의 범위이었으며, 평균 PIC값은 0.857이었다. SSR 마커 5개의 조합으로 5단계의 판별을 통하여 총 91품종 중에서 82품종이 구별되어 약 90%가 판별되었다. 판별 1단계에서 Sat_043으로 판별하였을때 부석의 1품종이, 2단계의 Sat_036으로는 호장콩 등 34품종이, 3단계의 Sat_022로는 단경콩 등 29품종이, 4단계의 Sat_088로는 신팔달콩2호 등 12품종이, 5단계의 Satt045로는 새별콩 등 6품종이 판별되었다. 서로 간에 판별되지 않은 품종들은 형태적 특성에 의하여 구별이 가능하였다.